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Solanum lycopersicum

アセンブルされた配列

Solanum lycopersicum , Tomato , トマト , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト , Solanum lycopersicum var. cerasiforme , Cherry tomato , ミニトマト, マメトマト (cerasiforme変種) , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

SL3.00

cv. Heinz 1706

Chromosome

NA

SL4.0

cv. Heinz 1706

Chromosome

NA

SLYcer_r1.1

LA1673

Pseudomolecule

NA

GWHBAUD00000000.genome

Heinz 1706

Chromosome

NA

SollycSweet-100_v2.0

cv. Sweet-100, S100

Chromosome

NA

SollycM82_v1.0

cv. M82, LA3475

Chromosome

NA

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

SL3.00

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Micro-Tom (NBRP)

DRA000311

DRX000455

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Micro-Tom

DRA005966

DRX090990

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Castlerock

DRA005972

DRX091584

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Micro-Tom MM

ERA250272

ERX313253

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Gardeners delight EA06086/PI406760

ERA282888

ERX384341

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Rutgers LA1090/EA00465

ERA282888

ERX384342

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Galina EA00325

ERA282888

ERX384343

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Taxi EA00488

ERA282888

ERX384344

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Katinka Cherry EA00375

ERA282888

ERX384345

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

John's big orange EA00371

ERA282888

ERX384346

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Sonata LYC1969/EA02724

ERA282888

ERX384348

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cross Country LYC1738/EA03701

ERA282888

ERX384349

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Iidi LYC3476/EA03362

ERA282888

ERX384350

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Momatero TR00003

ERA282888

ERX384351

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Rote Beere LYC1343/CGN15465

ERA282888

ERX384352

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Dana EA01155

ERA282888

ERX384354

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Large Pink EA01049

ERA282888

ERX384355

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Jersey devil EA00990

ERA282888

ERX384360

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Polish Joe EA00157

ERA282888

ERX384362

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

The Dutchman PI303721

ERA282888

ERX384364

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Black Cherry LA4451(?)

ERA282888

ERX384365

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Anto EA01835/V710029

ERA282888

ERX384366

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Winter Tipe PC11029

ERA282888

ERX384367

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Chang Li PI93302/EA04243

ERA282888

ERX384368

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Belmonte EA00892/SG16

ERA282888

ERX384369

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Tiffen Mennonite EA1088

ERA282888

ERX384370

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Wheatleys Frost Resistant PI203232/EA04939

ERA282888

ERX384371

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Chih Mu Tao Se PI158760/EA04828

ERA282888

ERX384374

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Dolmalik PI169588/EA04861

ERA282888

ERX384377

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Porter EA00940

ERA282888

ERX384410

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Brandywine EA01019

ERA282888

ERX384412

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Dixie Golden Giant TR00020

ERA282888

ERX384413

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Giant Belgium EA01037

ERA282888

ERX384414

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Kentucky Beefsteak TR00021

ERA282888

ERX384415

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Marmande TR00022/PI647486

ERA282888

ERX384416

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Thessaloniki TR00023

ERA282888

ERX384417

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Watermelon beefsteak EA01640

ERA282888

ERX384418

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Heinz

SRA049823

SRX118405

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Corbarino

SRA432686

SRX1834800

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Lucariello

SRA432686

SRX1834915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Red Pear

SRA500958

SRX2398286

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Old German

SRA500958

SRX2398287

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Great White Beefsteak

SRA500958

SRX2398292

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Wapsipinicon Peach

SRA500958

SRX2398294

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Lemon Drop

SRA500958

SRX2398295

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Nyagous

SRA500958

SRX2398304

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Box Car Willie

SRA500958

SRX2398305

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Black Brandywine

SRA500958

SRX2398311

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Red Fig Tomato

SRA500958

SRX2398315

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Oaxacan Pink

SRA500958

SRX2398318

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Brandywine

SRA500958

SRX2398414

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Abraham Lincoln Original

SRA500958

SRX2398415

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Black Sea Man

SRA500958

SRX2398440

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Caro Rich

SRA500958

SRX2398441

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Matina

SRA500958

SRX2398443

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Gold Currant

SRA500958

SRX2398445

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Yellow Cherry

SRA500958

SRX2398452

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Red_Brandywine

SRA500958

SRX2398454

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Beefsteak

SRA500958

SRX2398456

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Soldacki

SRA500958

SRX2398469

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

German Red Strawberry

SRA500958

SRX2398476

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Green Zebra

SRA500958

SRX2398480

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

German Queen

SRA500958

SRX2398484

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Maglia Rosa Cherry

SRA500958

SRX2398496

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Thai Pink Cherry

SRA500958

SRX2398498

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Paul Robeson

SRA500958

SRX2398500

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Pink Ping Pong

SRA500958

SRX2398501

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Mule Team

SRA500958

SRX2398502

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Tigerella Orange

SRA500958

SRX2398504

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Sub-Arctic Plenty

SRA500958

SRX2398508

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Brown Berry

SRA500958

SRX2398509

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

FL8059

SRA500958

SRX2398510

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Livingston's Stone

SRA500958

SRX2398523

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Giant Oxheart

SRA500958

SRX2398524

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Dr. Wyche's Yellow

SRA500958

SRX2398527

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Mexico Midget

SRA500958

SRX2398528

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

St. Pierre

SRA500958

SRX2398529

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Red_Alert

SRA500958

SRX2398544

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Chocolate Cherry

SRA500958

SRX2398545

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Snowberry

SRA500958

SRX2398550

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Amana Orange

SRA500958

SRX2398551

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Golden Jubilee

SRA500958

SRX2398552

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Micro-Tom/M82

SRA539217

SRX2578849

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Moneymaker

SRA580899

SRX2959040

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Motelle

SRA580899

SRX2964262

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Vesuviano

SRA093573

SRX326414

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

San Marzano

SRA093573

SRX326415

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Gold Ball Livingston

SRA640696

SRX3491660

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Yellow Pear

SRA640696

SRX3491661

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Tegucigalpa

SRA715852

SRX4183116

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Voyage

SRA715852

SRX4183276

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

tie1-1(M82) x Heinz F2s

SRA787543

SRX4781623

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Stupice

SRA861922

SRX5538722

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Bloody Butcher

SRA861922

SRX5538723

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Green Pearl

SRA861922

SRX5538725

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Glacier

SRA861922

SRX5538726

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

M82

SRA861922

SRX5538727

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Jerry's German Pink

SRA861922

SRX5538728

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Silvery Fir Tree

SRA861922

SRX5538729

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Prudens Purple

SRA861922

SRX5538730