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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum var. cerasiforme , Cherry tomato , ミニトマト, マメトマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G003

配列名:SLYcer_r1.1

ゲノム配列の詳細

配列名 SLYcer_r1.1 系統名 LA1673
配列数 14 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 804,485,245 N50長 (bp) 67,222,826
遺伝子の数 75,230 遺伝子数由来ファイル SLYcer_r1.1.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 75,230 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 97x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 770
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 責任著者 Tohru Ariizumi (University of Tsukuba)
データソース名 Plant GARDEN データソースURL https://plantgarden.jp
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.6%[S:96.7%,D:0.9%],F:0.9%,M:1.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:81.7%[S:80.5%,D:1.2%],F:7.5%,M:10.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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