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| Acer truncatum | マンシュウイタヤ | ムクロジ科 | t47965 |
| Acer yangbiense | カエデ | ムクロジ科 | t1000413 |
| Actinidia arguta var. hypoleuca | サルナシ | マタタビ科 | t1837144 |
| Actinidia chinensis | キウイフルーツ (chinensis種) | マタタビ科 | t3625 |
| Actinidia eriantha | キウイフルーツ (eriantha種) | マタタビ科 | t165200 |
| Actinidia polygama | マタタビ | マタタビ科 | t64480 |
| Actinidia rufa | シマサルナシ | マタタビ科 | t165716 |
| Aegilops tauschii | タルホコムギ | イネ科 | t37682 |
| Aegilops tauschii subsp. strangulata | タルホコムギ (strangulata亜種) | イネ科 | t37682 |
| Allium cepa | タマネギ | ヒガンバナ科 | t4679 |
| Allium fistulosum | ネギ | ヒガンバナ科 | t35875 |
| Amaranthus hypochondriacus | アマランサス | ヒユ科 | t28502 |
| Amborella trichopoda | アンボレラ | アンボレラ科 | t13333 |
| Ananas comosus | パイナップル | パイナップル科 | t4615 |
| Ananas comosus var. F153 | パイナップル | パイナップル科 | t4615 |
| Antirrhinum majus | キンギョソウ | オオバコ科 | t4151 |
| Apium graveolens | セロリ | セリ科 | t4045 |
| Arabidopsis thaliana | シロイヌナズナ | アブラナ科 | t3702 |
| Arabis alpina | ヤマハタザオ | アブラナ科 | t50452 |
| Arachis duranensis | ラッカセイ野生種 (duranensis種) | マメ科 | t130453 |
| Arachis hypogaea | ラッカセイ | マメ科 | t3818 |
| Arachis ipaensis | ラッカセイ野生種 (ipaensis種) | マメ科 | t130454 |
| Arachis monticola | ラッカセイ野生種 (monticola種) | マメ科 | t227691 |
| Asparagus kiusianus | ハマタマボウキ | クサスギカズラ科 | t272855 |
| Asparagus officinalis | アスパラガス | キジカクシ科 | t4686 |
| Bathycoccus prasinos | バチコッカス | バチコッカス科 | t41875 |
| Benincasa hispida | トウガン | ウリ科 | t102211 |
| Beta vulgaris subsp. vulgaris | テンサイ | ヒユ科 | t161934 |
| Brachypodium distachyon | セイヨウヤマカモジ | イネ科 | t15368 |
| Brassica juncea | セイヨウカラシナ | アブラナ科 | t3707 |
| Brassica napus | セイヨウアブラナ | アブラナ科 | t3708 |
| Brassica nigra | クロカラシナ | アブラナ科 | t3710 |
| Brassica oleracea | キャベツ, ヤセイカンラン等 | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica oleracea var. alboglabra | チャイニーズケール (alboglabra変種) | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica oleracea var. capitata | キャベツ (capitata変種) | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica oleracea var. italica | ブロッコリー (italica変種) | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica oleracea var. sabauda | チリメンキャベツ (sabauda変種) | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica oleracea var. viridis | ケール (viridis変種) | アブラナ科 | t3712 |
| Brassica rapa | アブラナ, 在来ナタネ, ハクサイ等 | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. campestris | アブラナ (campestris亜種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. chinensis | タイサイ, チンゲンサイ (chinensis亜種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. oleifera | アブラナ (oleifera亜種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. pekinensis | ハクサイ (pekinensis亜種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa var. purpurea | コウサイタイ (purpurea変種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. rapa | カブ (rapa亜種) | アブラナ科 | t3711 |
| Brassica rapa subsp. trilocularis | イエローサルソン | アブラナ科 | t3711 |
| Cajanus cajan | キマメ | マメ科 | t3821 |
| Camelina sativa | ナガミノアマナズナ | アブラナ科 | t90675 |
| Camellia sinensis | チャ, チャノキ | ツバキ科 | t4442 |
| Camellia sinensis var. sinensis | チャ (sinensis変種) | ツバキ科 | t4442 |
| Cannabis sativa | アサ, 大麻 | アサ科 | t3483 |
| Capsella rubella | ルベラナズナ | アブラナ科 | t81985 |
| Capsicum annuum | トウガラシ | ナス科 | t4072 |
| Capsicum annuum var. annuum | トウガラシ (annuum変種) | ナス科 | t4072 |
| Capsicum annuum var. glabriusculum | トウガラシ野生種 (glabriusculum変種) | ナス科 | t4072 |
| Capsicum baccatum | トウガラシ (baccatum種), キイロトウガラシ | ナス科 | t33114 |
| Capsicum chinense | トウガラシ (chinense種) | ナス科 | t80379 |
| Carica papaya | パパイア | パパイア科 | t3649 |
| Carya illinoinensis | ペカン | クルミ科 | t32201 |
| Castanea crenata | ニホングリ | ブナ科 | t103480 |
| Cenchrus americanus | トウジンビエ | イネ科 | t4543 |
| Cerasus x kanzakura | カンザクラ | バラ科 | t1813533 |
| Cerasus x yedoensis | ソメイヨシノ | バラ科 | t3759 |
| Chamaecyparis obtusa | ヒノキ | ヒノキ科 | t13415 |
| Chlamydomonas reinhardtii | コナミドリムシ | クラミドモナス科 | t3055 |
| Chloropicon primus | クロロピコン | クロロピコン科 | t1764295 |
| Chromochloris zofingiensis | クロモクロリス | Chromochloridaceae | t31302 |
| Chrysanthemum morifolium | キク | キク科 | t41568 |
| Chrysanthemum seticuspe | キクタニギク | キク科 | t1111766 |
| Cicer arietinum | ヒヨコマメ | マメ科 | t3827 |
| Citrullus lanatus | スイカ | ウリ科 | t3654 |
| Citrus clementina | クレメンティン, クレメンタイン | ミカン科 | t85681 |
| Citrus kinokuni | キシュウミカン | ミカン科 | t408488 |
| Citrus maxima | ブンタン, ザボン | ミカン科 | t37334 |
| Citrus nobilis | クネンボ | ミカン科 | t481549 |
| Citrus sinensis | オレンジ | ミカン科 | t2711 |
| Citrus unshiu | ウンシュウミカン | ミカン科 | t55188 |
| Coffea arabica | コーヒー アラビカ種 | アカネ科 | t13443 |
| Coffea canephora | コーヒー ロブスタ種 | アカネ科 | t49390 |
| Coffea humblotiana | コーヒー(humblotiana種) | アカネ科 | t59211 |
| Conyza canadensis | ヒメムカシヨモギ | キク科 | t72917 |
| Cryptomeria japonica | スギ | ヒノキ科 | t3369 |
| Cucumis melo | メロン | ウリ科 | t3656 |
| Cucumis melo subsp. agrestis | メロン野生種 (agrestis亜種), ザッソウメロン | ウリ科 | t3656 |
| Cucumis sativus | キュウリ | ウリ科 | t3659 |
| Cucumis sativus var. hardwickii | キュウリ野生種 (hardwickii変種) | ウリ科 | t3659 |
| Cucumis sativus var. sativus | キュウリ (sativus変種) | ウリ科 | t3659 |
| Cucumis sativus var. xishuangbannanesis | キュウリ半野生種 (xishuangbannanesis変種) | ウリ科 | t3659 |
| Cucurbita maxima | カボチャ西洋種, セイヨウカボチャ | ウリ科 | t3661 |
| Cucurbita moschata | カボチャ東洋種, ニホンカボチャ | ウリ科 | t3662 |
| Cucurbita pepo subsp. pepo | ズッキーニ | ウリ科 | t3663 |
| Cunninghamia lanceolata | コウヨウザン | ヒノキ科 | t28977 |
| Cyanidioschyzon merolae | シゾン | イデユコゴメ科 | t45157 |
| Cynara cardunculus | カルドン, チョウセンアザミ | キク科 | t59895 |
| Cynara cardunculus var. scolymus | カルドン (scolymus変種), チョウセンアザミ | キク科 | t59895 |
| Cynodon dactylon | ギョウギシバ | イネ科 | t28909 |
| Datura stramonium | ヨウシュチョウセンアサガオ | ナス科 | t4076 |
| Daucus carota | ニンジン | セリ科 | t4039 |
| Dianthus caryophyllus | オランダナデシコ, カーネーション | ナデシコ科 | t3570 |
| Dioscorea cayenensis | ギニアヤム, ヤムイモ, シロヤムイモ, キイロヤムイモ | ヤマノイモ科 | t55577 |
| Dioscorea cayenensis subsp. rotundata | ギニアヤム, ヤムイモ, シロヤムイモ, キイロヤムイモ (rotundata亜種) | ヤマノイモ科 | t55577 |
| Diospyros kaki | カキ | カキノキ科 | t35925 |
| Echinochloa phyllopogon | タイヌビエ | イネ科 | t45619 |
| Elaeis guineensis | アブラヤシ | ヤシ科 | t51953 |
| Eragrostis curvula | シナダレスズメガヤ | イネ科 | t38414 |
| Eucalyptus camaldulensis | ユーカリ(camaldulensis種), ユーカリーノキ | フトモモ科 | t34316 |
| Eucalyptus globulus | ユーカリ(globulus種), ブルーガム, ユーカリーノキ | フトモモ科 | t34317 |
| Eucalyptus grandis | ユーカリ (grandis種), ローズガム, ユーカリーノキ | フトモモ科 | t71139 |
| Eustoma grandiflorum | トルコギキョウ, ユーストマ | リンドウ科 | t52518 |
| Fagopyrum tataricum | ダッタンソバ | タデ科 | t62330 |
| Ficus carica | イチジク | クワ科 | t3494 |
| Ficus erecta | イヌビワ | クワ科 | t66383 |
| Fragaria vesca | エゾヘビイチゴ | バラ科 | t57918 |
| Fragaria x ananassa | イチゴ, オランダイチゴ | バラ科 | t3747 |
| Glycine max | ダイズ | マメ科 | t3847 |
| Glycine soja | ダイズ野生種 (soja種), ツルマメ | マメ科 | t3848 |
| Gossypium arboreum | ワタ (arboreum種), キダチワタ | アオイ科 | t29729 |
| Gossypium barbadense | ワタ (barbadense種), カイトウメン | アオイ科 | t3634 |
| Gossypium hirsutum | ワタ (hirsutum種), キヌワタ | アオイ科 | t3635 |
| Gossypium raimondii | ワタ野生種 (raimondii種) | アオイ科 | t29730 |
| Helianthus annuus | ヒマワリ | キク科 | t4232 |
| Hevea brasiliensis | パラゴムノキ | トウダイグサ科 | t3981 |
| Hieracium piloselloides subsp. praealtum | ヒエラシウム | キク科 | t221207 |
| Hordeum vulgare | オオムギ, シジョウオオムギ, オオムギ野生種 (spontaneum亜種) | イネ科 | t4513 |
| Hydrangea macrophylla | アジサイ | アジサイ科 | t23110 |
| Ipomoea batatas | サツマイモ | ヒルガオ科 | t4120 |
| Ipomoea nil | アサガオ | ヒルガオ科 | t35883 |
| Ipomoea trifida | サツマイモ野生種 (trifida種) | ヒルガオ科 | t35884 |
| Ipomoea triloba | サツマイモ野生種 (triloba種), ホシアサガオ | ヒルガオ科 | t35885 |
| Jatropha curcas var. Chai Nat (CN) | ナンヨウアブラギリ, ヤトロファ, ジャトロファ | トウダイグサ科 | t180498 |
| Juglans regia | カシグルミ | クルミ科 | t51240 |
| Lactuca sativa | レタス | キク科 | t4236 |
| Lagenaria siceraria | ヒョウタン | ウリ科 | t3668 |
| Larix kaempferi | カラマツ | マツ科 | t54800 |
| Lotus japonicus | ミヤコグサ | マメ科 | t34305 |
| Lupinus albus | シロバナルピナス, シロバナハウチワマメ | マメ科 | t3870 |
| Lupinus angustifolius | カサバルピナス | マメ科 | t3871 |
| Macadamia integrifolia | マカダミア | ヤマモガシ科 | t60698 |
| Macrotyloma uniflorum | ホースグラム | マメ科 | t271171 |
| Malus x domestica | リンゴ | バラ科 | t3750 |
| Mangifera indica | マンゴー | ウルシ科 | t29780 |
| Manihot esculenta | キャッサバ | トウダイグサ科 | t3983 |
| Marchantia polymorpha | ゼニゴケ | ゼニゴケ科 | t3197 |
| Marchantia polymorpha subsp. ruderalis | ゼニゴケ (ruderalis亜種) | ゼニゴケ科 | t3197 |
| Medicago truncatula | タルウマゴヤシ | マメ科 | t3880 |
| Micromonas commoda | ミクロモナス | マニエラ科 | t296587 |
| Mikania micrantha | ツルヒヨドリ | キク科 | t192012 |
| Musa acuminata | バナナ野生種 (acuminata種), マレーヤマバショウ | バショウ科 | t4641 |
| Musa acuminata subsp. malaccensis | バナナ野生種 (acuminata種), マレーヤマバショウ | バショウ科 | t4641 |
| Musa balbisiana | バナナ野生種 (balbisiana種), リュウキュウバショウ | バショウ科 | t52838 |
| Neopyropia yezoensis | スサビノリ | ウシケノリ科 | t2788 |
| Nicotiana attenuata | タバコ野生種 (attenuata種), コヨーテタバコ | ナス科 | t49451 |
| Nicotiana tabacum | タバコ | ナス科 | t4097 |
| Nicotiana tabacum var. K326 (PI552505) | タバコ (K326変種) | ナス科 | t4097 |
| Nymphaea colorata | スイレン | スイレン科 | t210225 |
| Olea europaea | オリーブ | モクセイ科 | t4146 |
| Olea europaea var. europaea | オリーブ野生種 (europaea変種) | モクセイ科 | t4146 |
| Olea europaea var. sylvestris | オリーブ野生種 (sylvestris変種) | モクセイ科 | t4146 |
| Ophiorrhiza pumila | チャボイナモリ | アカネ科 | t157934 |
| Oropetium thomaeum | Oropetium thomaeum | イネ科 | t1148796 |
| Oryza brachyantha | イネ野生種 (brachyantha種) | イネ科 | t4533 |
| Oryza glaberrima | イネ アフリカ種, アフリカイネ | イネ科 | t4538 |
| Oryza sativa | イネ | イネ科 | t4530 |
| Oryza sativa subsp. indica | イネ インディカ亜種 (indica亜種) | イネ科 | t4530 |
| Oryza sativa subsp. japonica | イネ ジャポニカ亜種 (japonica亜種) | イネ科 | t4530 |
| Oryza sativa var. N22 | イネ aus亜種 N22変種 | イネ科 | t4530 |
| Ostreococcus lucimarinus | オストレオコッカス | バチコッカス科 | t242159 |
| Panicum hallii | Hall's panicgrass | イネ科 | t206008 |
| Panicum hallii var. filipes | パニックグラス (filipes変種) | イネ科 | t206008 |
| Panicum virgatum | スイッチグラス | イネ科 | t38727 |
| Papaver somniferum | ケシ | ケシ科 | t3469 |
| Phaseolus vulgaris | インゲンマメ | マメ科 | t3885 |
| Phoenix dactylifera | ナツメヤシ | ヤシ科 | t42345 |
| Phyllostachys edulis | モウソウチク | イネ科 | t38705 |
| Physcomitrella patens | ヒメツリガネゴケ | ヒョウタンゴケ科 | t3218 |
| Picea abies | ドイツトウヒ | マツ科 | t3329 |
| Picea glauca | カナダトウヒ | マツ科 | t3330 |
| Pinus taeda | テーダマツ | マツ科 | t3352 |
| Pisum sativum | エンドウ | マメ科 | t3888 |
| Populus trichocarpa | ポプラ | ヤナギ科 | t3694 |
| Prunus avium | セイヨウミザクラ | バラ科 | t42229 |
| Prunus dulcis | アーモンド, ヘントウ | バラ科 | t3755 |
| Prunus mume | ウメ | バラ科 | t102107 |
| Prunus persica | モモ, ネクタリン | バラ科 | t3760 |
| Punica granatum | ザクロ | ミソハギ科 | t22663 |
| Pyrus betulifolia | ナシ野生種 (betulifolia種), トウマメナシ | バラ科 | t436086 |
| Pyrus communis | セイヨウナシ | バラ科 | t23211 |
| Pyrus pyrifolia | ニホンナシ | バラ科 | t3767 |
| Raphanus sativus | ダイコン | アブラナ科 | t3726 |
| Rhododendron ripense | キシツツジ | ツツジ科 | t224351 |
| Rhododendron simsii | タイワンヤマツツジ | ツツジ科 | t118357 |
| Ricinus communis | トウゴマ | トウダイグサ科 | t3988 |
| Rosa chinensis var. Old Blush | コウシンバラ | バラ科 | t74649 |
| Saccharum spontaneum | サトウキビ野生種 (spontaneum種), ワセオバナ | イネ科 | t62335 |
| Salvia splendens | ヒゴロモソウ | シソ科 | t180675 |
| Schrenkiella parvula | スクレンキエラ | アブラナ科 | t98039 |
| Sesamum indicum | ゴマ | ゴマ科 | t4182 |
| Setaria italica | アワ | イネ科 | t4555 |
| Setaria viridis | カタバエノコログサ | イネ科 | t4556 |
| Solanum chacoense | ジャガイモ野生種 (chacoense種) | ナス科 | t4108 |
| Solanum lycopersicum | トマト | ナス科 | t4081 |
| Solanum lycopersicum var. cerasiforme | ミニトマト, マメトマト (cerasiforme変種) | ナス科 | t4081 |
| Solanum melongena | ナス | ナス科 | t4111 |
| Solanum pennellii | トマト野生種 (pennellii種) | ナス科 | t28526 |
| Solanum pimpinellifolium | トマト野生種 (pimpinellifolium種) | ナス科 | t4084 |
| Solanum tuberosum | ジャガイモ | ナス科 | t4113 |
| Sorghum bicolor | モロコシ, ソルガム, コーリャン | イネ科 | t4558 |
| Spinacia oleracea | ホウレンソウ | ヒユ科 | t3562 |
| Streptocarpus rexii | ストレプトカーパス | イワタバコ科 | t121488 |
| Theobroma cacao | カカオ | アオイ科 | t3641 |
| Tricholoma matsutake | マツタケ | キシメジ科 | t40145 |
| Trifolium pratense | アカクローバー, ムラサキツメクサ | マメ科 | t57577 |
| Trifolium repens | シロツメクサ | マメ科 | t3899 |
| Trifolium subterraneum | サブクローバー | マメ科 | t3900 |
| Tripterygium wilfordii | タイワンクロヅル,ライコウトウ | ニシキギ科 | t458696 |
| Triticum aestivum | コムギ (aestivum種), パンコムギ | イネ科 | t4565 |
| Triticum turgidum | コムギ (turgidum種), デュラムコムギ, マカロニコムギ | イネ科 | t4571 |
| Vicia faba | ソラマメ | マメ科 | t3906 |
| Vicia sativa | ヤハズエンドウ | マメ科 | t3908 |
| Vigna angularis var. angularis | アズキ | マメ科 | t3914 |
| Vigna radiata var. radiata | リョクトウ, ヤエナリ | マメ科 | t157791 |
| Vigna unguiculata | ササゲ | マメ科 | t3917 |
| Vitis labruscana x Vitis vinifera | ブドウ欧米雑種 | ブドウ科 | t2599122 |
| Vitis riparia | ブドウ野生種 (riparia種) | ブドウ科 | t96939 |
| Vitis vinifera | ブドウ欧州種, ヨーロッパブドウ | ブドウ科 | t29760 |
| Zea mays | トウモロコシ | イネ科 | t4577 |
| Zingiber officinale | ショウガ | ショウガ科 | t94328 |
| Ziziphus jujuba | ナツメ | クロウメモドキ科 | t326968 |
| Zoysia japonica | シバ | イネ科 | t309978 |
