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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G004

配列名:GWHBAUD00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBAUD00000000.genome 系統名 Heinz 1706
配列数 83 染色体数 n = 12
配列長 (bp) 799,091,949 N50長 (bp) 66,166,780
遺伝子の数 30,389 遺伝子数由来ファイル GWHBAUD00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C, BioNano 取得した配列量 168.52x(PacBio), 290.24x(BioNano), 179.70x(Hi-C), 61.53x
アセンブリ方法 CANU 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tao Lin (China Agricultural University) データソース名 Chinese National Genomics Data Center
論文 (DOIコード) 10.1186/s12864-021-08212-x データソースURL https://bigd.big.ac.cn/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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