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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G006

配列名:SollycM82_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SollycM82_v1.0 系統名 cv. M82, LA3475
配列数 1,237 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 829,074,230 N50長 (bp) 66,835,077
遺伝子の数 35,695 遺伝子数由来ファイル SollycM82_genes_v1.1.1.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Oxford Nanopore, Illumina, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm v0.15, BWA-MEM v0.7.17, RagTag 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sebastian Soyk (University of Lausanne) データソース名 Sol Genomics Network
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-022-02823-7 データソースURL https://solgenomics.net/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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