配列名:SollycM82_v1.0
ゲノム配列名 | SollycM82_v1.0 | 系統名 | cv. M82, LA3475 |
配列数 | 1,237 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 829,074,230 | N50長 (bp) | 66,835,077 |
遺伝子の数 | 35,695 | 遺伝子数由来ファイル | SollycM82_genes_v1.1.1.proteins.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Oxford Nanopore, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Hifiasm v0.15, BWA-MEM v0.7.17, RagTag | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sebastian Soyk (University of Lausanne) | データソース名 | Sol Genomics Network |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s13059-022-02823-7 | データソースURL | https://solgenomics.net/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |