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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G005

配列名:SollycSweet-100_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SollycSweet-100_v2.0 系統名 cv. Sweet-100, S100
配列数 932 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 846,535,963 N50長 (bp) 66,902,074
遺伝子の数 35,697 遺伝子数由来ファイル SollycSweet-100_genes_v2.1.1.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Oxford Nanopore,Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm v0.13, Flye v2.8.2, RagTag 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sebastian Soyk (University of Lausanne) データソース名 Sol Genomics Network
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-022-02823-7 データソースURL https://solgenomics.net/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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