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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G009

配列名:SLM_r2.0.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SLM_r2.0.pmol 系統名 Micro-Tom TOMJPF00001
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 832,773,323 N50長 (bp) 69,564,429
遺伝子の数 31,429 遺伝子数由来ファイル SLM_r2.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 31,429 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 KatomicsDB
論文 (DOIコード) 10.5511/plantbiotechnology.24.0522a データソースURL https://www.kazusa.or.jp/tomato/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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