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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum lycopersicum , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G001

配列名:SL3.0

ゲノム配列の詳細

配列名 SL3.0 系統名 cv. Heinz 1706
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 828,076,956 N50長 (bp) 66,723,567
遺伝子の数 35,768 遺伝子数由来ファイル ITAG3.2_proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,768 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina 取得した配列量 27x
アセンブリ方法 Newbler v. v2.3, BioNano Irysview v. v2.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 950
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1007/s00122-005-0107-z 責任著者 S. D. Tanksley (Cornell University)
データソース名 Sol Genomics Network データソースURL https://solgenomics.net/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.6%[S:98.0%,D:0.6%],F:0.5%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:91.9%[S:90.4%,D:1.5%],F:5.0%,M:3.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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