配列名:SL3.2
ゲノム配列名 | SL3.2 | 系統名 | cv. Heinz 1706 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 828,076,956 | N50長 (bp) | 66,723,567 |
遺伝子の数 | 35,768 | 遺伝子数由来ファイル | ITAG3.2_proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 35,768 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina | 取得した配列量 | 27x |
アセンブリ方法 | Newbler v. v2.3, BioNano Irysview v. v2.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 950 |
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論文クレジット情報 | 確認中 | データ/DB クレジット情報 | 確認中 |
責任著者 | S. D. Tanksley (Cornell University) | データソース名 | Sol Genomics Network |
論文 (DOIコード) | 10.1007/s00122-005-0107-z | データソースURL | https://solgenomics.net/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:98.0%,D:0.6%],F:0.5%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:91.9%[S:90.4%,D:1.5%],F:5.0%,M:3.1%,n:1614 |