アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Tomato , トマト

Solanum lycopersicum

Genome Assembly ID:t4081.G002

配列名:SL4.0

ゲノム配列の詳細

配列名 SL4.0 系統名 cv. Heinz 1706
配列数 13 染色体数 2n=24
配列長 (bp) 782,520,033 N50長 (bp) 65,269,487
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル ITAG4.0_proteins.fasta
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 80x
アセンブリ方法 Canu v1.5 , Hi-C scaffolding, BioNano,10X linked-read sequences 推定ゲノムサイズ (Mb) 950
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1101/767764 責任著者 Surya Saha (Boyce Thompson Institute)
データソース名 Sol Genomics Network データソースURL https://solgenomics.net/

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する