配列名:SL4.0
ゲノム配列名 | SL4.0 | 系統名 | cv. Heinz 1706 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 782,520,033 | N50長 (bp) | 65,269,487 |
遺伝子の数 | 34,075 | 遺伝子数由来ファイル | ITAG4.0_proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,075 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 80x |
アセンブリ方法 | Canu v1.5, Hi-C scaffolding, BioNano, 10X linked-read sequences | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 950 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Surya Saha (Boyce Thompson Institute) | データソース名 | Sol Genomics Network |
論文 (DOIコード) | 10.1101/767764 | データソースURL | https://solgenomics.net/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:98.0%,D:0.6%],F:0.5%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:91.5%[S:90.4%,D:1.1%],F:5.3%,M:3.2%,n:1614 |