Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID

Os12t0502200-01

CDS Infomation

cds chromosome:IRGSP-1.0:12:19129927:19133740:1 gene:Os12g0502200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLYCINE-RICH RNA-BINDING PROTEIN 6 description:Similar to Low temperature-responsive RNA-binding protein. (Os12t0502200-01)

Sequence

ATGGCGTTGGCTAATAAGATTGGTAATCTGCTCAAGAGAGCCACGAGCTCAAGTCCAGCT
CTCTATCAATCAATCAGATGCATGTCATCCTCAAAGCTTTTTGTTGGAGGCCTTTCGTAC
GGCACAGATGAGCAGAGCCTCAGAGATACTTTTGCCAATTATGGTCAAGTTATTGAAGCT
AAGATCATCAATGACCGTGAAACTGGGAGGTCTAGAGGTTTTGGCTTCATAACTTACGCA
TCAAGTGAAGAGGCTTCAGCTGCAATCACAGCCTTGGATGGAAAGGATCTCGATGGGCGT
AACATCAGGGTTAACACTGCCAATGAGAGAACTGGTGGCTTCCGTAGTGGGGGTGGTGGC
TATGGAGGCGGTGGCTATGGCGGCGGCGGTGGCGGCTATGGTGGTGGTGGCTACAGTGGT
GGTGGTGGCTATGGCGGTGGTGGCTACAGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCTACCAA
GGAGGCGGCGGTGGTTATGGTGGCAACAATGGAGGGTATGGCAACAGGGGTGGTGGTGGA
GGTGGTTATGGAGTTGCAGAAGGATCTGCAGATGCCTTCTCTGGAATCAACTTAGGTGGT
GATGGTAGTTTTGGTGGAAACCCAGCTGGAAGCTTTGGTGATGCTGGAGGTTCCACTGGC
GGTGGTGATTTCTCCGGTGCCGGTGGTGACAGCTTTGGAAGCCGCAAGAACGATGAGCTC
ATGGATGACCTCTTCAAGGATGACGAGCCTGACAACTATGCCAACAAGCAGGGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Os12t0502200-01

PEP Infomation

pep chromosome:IRGSP-1.0:12:19129927:19133740:1 gene:Os12g0502200 transcript:Os12t0502200-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLYCINE-RICH RNA-BINDING PROTEIN 6 description:Similar to Low temperature-responsive RNA-binding protein. (Os12t0502200-01)

Sequence

MALANKIGNLLKRATSSSPALYQSIRCMSSSKLFVGGLSYGTDEQSLRDTFANYGQVIEA
KIINDRETGRSRGFGFITYASSEEASAAITALDGKDLDGRNIRVNTANERTGGFRSGGGG
YGGGGYGGGGGGYGGGGYSGGGGYGGGGYSGGGGGGGGYQGGGGGYGGNNGGYGNRGGGG
GGYGVAEGSADAFSGINLGGDGSFGGNPAGSFGDAGGSTGGGDFSGAGGDSFGSRKNDEL
MDDLFKDDEPDNYANKQG

Transcript Sequence

Transcript ID

Os12t0502200-01

Transcript Infomation

cdna chromosome:IRGSP-1.0:12:19129927:19133740:1 gene:Os12g0502200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLYCINE-RICH RNA-BINDING PROTEIN 6 description:Similar to Low temperature-responsive RNA-binding protein. (Os12t0502200-01)

Sequence

CCCCCCTCGCCGCCGCCTTCTCCATCGTAAACCCTCGTCAGTTTGGAACAATGGCGTTGG
CTAATAAGATTGGTAATCTGCTCAAGAGAGCCACGAGCTCAAGTCCAGCTCTCTATCAAT
CAATCAGATGCATGTCATCCTCAAAGCTTTTTGTTGGAGGCCTTTCGTACGGCACAGATG
AGCAGAGCCTCAGAGATACTTTTGCCAATTATGGTCAAGTTATTGAAGCTAAGATCATCA
ATGACCGTGAAACTGGGAGGTCTAGAGGTTTTGGCTTCATAACTTACGCATCAAGTGAAG
AGGCTTCAGCTGCAATCACAGCCTTGGATGGAAAGGATCTCGATGGGCGTAACATCAGGG
TTAACACTGCCAATGAGAGAACTGGTGGCTTCCGTAGTGGGGGTGGTGGCTATGGAGGCG
GTGGCTATGGCGGCGGCGGTGGCGGCTATGGTGGTGGTGGCTACAGTGGTGGTGGTGGCT
ATGGCGGTGGTGGCTACAGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCTACCAAGGAGGCGGCG
GTGGTTATGGTGGCAACAATGGAGGGTATGGCAACAGGGGTGGTGGTGGAGGTGGTTATG
GAGTTGCAGAAGGATCTGCAGATGCCTTCTCTGGAATCAACTTAGGTGGTGATGGTAGTT
TTGGTGGAAACCCAGCTGGAAGCTTTGGTGATGCTGGAGGTTCCACTGGCGGTGGTGATT
TCTCCGGTGCCGGTGGTGACAGCTTTGGAAGCCGCAAGAACGATGAGCTCATGGATGACC
TCTTCAAGGATGACGAGCCTGACAACTATGCCAACAAGCAGGGCTAATTAATCTACGTCC
TTCGAGCCTCAGTTTGCAGTCTCTTAGTGATGAACCGGCTCACCTGAATGGTCATCACCT
GCTCAAGCATCAAATTCCAGAACAATACACAATGACTGGGTTTTCTTTTTCTTCTGTTCT
TTTTCATAGATGTGGTGTAATAACGTAAACATCACTCAAGGTACTACTTCTAGTTATGTT
ATGTTGAGATGACAATGGAGGTGTTTTAAATGTCTGTTTTTATTCC