Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os12t0289800-00
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:12:11167217:11169327:-1 gene:Os12g0289800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os12t0289800-00)
Sequence	ATGGCAGCTGCGAAGCTCACCGCCTCTGCTGTGTTTAGGAGCAACCAGGAGCTCACGTCG CTGGCGCGCTCGGGCCAGCTGGCCGCCGCGCGCCGCCTGTTCGAGGAGATGCCCCGCCGC AACGTGGTCTCCTACAACGCGATGGTCTCCGCGCTGGCCCACCACGGCCGCCTCGCCGAG GCGCGCAGGCTGTTCGACGAGATGCCGCGCCGCAACCCCGTGTCCTGGAACACCATGATG GTGGCATGCTCTCAGCACGGGCGCGTCGAGGATGCGCGAGGGCTATTCGATGCAATGCCC GCCCGAAACGAGTACTCCTGGACAATCATGGTATCCTGCTACGTGCGGGCTGGTGAGCTC ACCCTCGCAAGGGAGCTGCTCGACCGCATGCCCGGGGAGAAGTGCGCGGCGTGCTACAAC ACCATGATCTCCGGGTATGCCAAGAACGGCAGGTTTGAGGATGCAATTGCTTTGTTGCAG GAGATGCCGGCCCCTGATATTGTTTCATGGAACTCAGTGTTGGGGGGGCTCATCCGGAAT GAGGAAATCTCTCGATCAGTGCAGTTCTTTGATGAGATGCCAGATAAGGACTTGGTGTCC TGGAACTTGATGCTAGAGGGGTATGTGCGTGCTGGGGATTTGGATGTGGCCAGTGCATTC TTTTCAAGGATCCCCTCACCTAATGTTATTTCTTGGGTTAACTTGGTCAATGGGTATTGT CAGGCAGGGAGGATGGGCGAGGCAAGAGAATTGTTTGATAGAATGCCTGAGCGTAATGTT GTGGCTTGGAATGTGCTGCTTTCTGGGTATGTGCAGTTCTCTCAGGTGGAGGCGGCCTAT AATCTGTTTATAGAGATGCCAGAGAAGAATTCAATCTCATGGACAACGATGGTGAGTGGT TTTGTACGTTCTGGGAAGCTCCAAGAAGCGAAGGATGTGCTCAGCAAGATGCCTTCCGAC AATGTCGGAGCAAAGACTGCACTGATGCATGGCTATTTGAAAAGCAACCTGATTGATGAC GCCCGTCAACTATTTGATGGAATTGTGGTTCGGGATGCAGTGTGCTGGAATACAATGATA TCAGGATATGTTCAGTGTGGTATGCTTGATGAGGCCATGGTTTTATTCCAGCAAATGCCG AACAAGGATATGATTTCTTGGAACACCATGATTGCTGGCTGTGCTCAGGGTGGACAAATT CGCAAGGCAGCCAGTATTTTCAGGAAAATGAAGAGGAGAAATACAGTTTCATGGAATTCA ATTATCTCTGGATTTGTTCAAAATGGTCTATTTGTTGAAGCACTGCAGCATTTTATGCTT ATGAGAAGGGATGCAAAGAGCGCTGACTGGTGTACATATGCATGTTGTCTAAGTGCAAGT GCAAATTTGGCTACTCTGCAAATAGGGAGACAATTCCACAGTCTTCTTGTCAGGACTGGG TTTATCAGTGATTCTTCTCCTGGAAATGCCTTGATTTCTGCCTATGCTAAGTGTGGAAGG ATGTTGGAAGCAAGACAAGTCTTTGATGAGATGGTAGTACAAGACATCGTTTCATGGAAT GCACTCATCGATGGCTATGCTTCTAATGGTAATGGGTCTGAGGTGATAGCAGTATTCCGG GAAATGGAAGCTAACAGTGTCAGACCTGATGAGATCACGTTGGTAGTTGTGTTATCAGCT TGCAGTCATGCTGGGTTAATTGATGAAGGATTGCATTTCTTCAATTCGATGATAAAATTG TACTCGTTAAAGCCTGTGGCTGAGCATTATACCTGTATGGTTGATCTTCTTGGAAGAGCT GGGAGACTAAGAGAGGCATTTGAACTTGTTCAGGGAATGCAGATCCAACCAAATGCTGGT GTCTGGGGTGCATTGCTTGGAGCATGCCGCGTACACAAGAATCACGAGATAGCATGGCTT GCAGCTGAGAAGTTATTTGAATTGGAACCTTGCAAGGCCTCAAATTATGTCTTGCTGTCA AACATCTGTGTGGAGGCAGGGAAATGGGATGATGCTGACAAGGTGAGGGTTTTGATGAAA GAGAGGTGTGTATACAAGCCACCTGGATTAGCTGGATCAATGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Os12t0289800-00
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:12:11167217:11169327:-1 gene:Os12g0289800 transcript:Os12t0289800-00 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os12t0289800-00)
Sequence	MAAAKLTASAVFRSNQELTSLARSGQLAAARRLFEEMPRRNVVSYNAMVSALAHHGRLAE ARRLFDEMPRRNPVSWNTMMVACSQHGRVEDARGLFDAMPARNEYSWTIMVSCYVRAGEL TLARELLDRMPGEKCAACYNTMISGYAKNGRFEDAIALLQEMPAPDIVSWNSVLGGLIRN EEISRSVQFFDEMPDKDLVSWNLMLEGYVRAGDLDVASAFFSRIPSPNVISWVNLVNGYC QAGRMGEARELFDRMPERNVVAWNVLLSGYVQFSQVEAAYNLFIEMPEKNSISWTTMVSG FVRSGKLQEAKDVLSKMPSDNVGAKTALMHGYLKSNLIDDARQLFDGIVVRDAVCWNTMI SGYVQCGMLDEAMVLFQQMPNKDMISWNTMIAGCAQGGQIRKAASIFRKMKRRNTVSWNS IISGFVQNGLFVEALQHFMLMRRDAKSADWCTYACCLSASANLATLQIGRQFHSLLVRTG FISDSSPGNALISAYAKCGRMLEARQVFDEMVVQDIVSWNALIDGYASNGNGSEVIAVFR EMEANSVRPDEITLVVVLSACSHAGLIDEGLHFFNSMIKLYSLKPVAEHYTCMVDLLGRA GRLREAFELVQGMQIQPNAGVWGALLGACRVHKNHEIAWLAAEKLFELEPCKASNYVLLS NICVEAGKWDDADKVRVLMKERCVYKPPGLAGSM

Transcript Sequence

Transcript ID	Os12t0289800-00
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:12:11167217:11169327:-1 gene:Os12g0289800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os12t0289800-00)
Sequence	CGGCACCAGCGCCATCACCGCCCCCAATGGCAGCTGCGAAGCTCACCGCCTCTGCTGTGT TTAGGAGCAACCAGGAGCTCACGTCGCTGGCGCGCTCGGGCCAGCTGGCCGCCGCGCGCC GCCTGTTCGAGGAGATGCCCCGCCGCAACGTGGTCTCCTACAACGCGATGGTCTCCGCGC TGGCCCACCACGGCCGCCTCGCCGAGGCGCGCAGGCTGTTCGACGAGATGCCGCGCCGCA ACCCCGTGTCCTGGAACACCATGATGGTGGCATGCTCTCAGCACGGGCGCGTCGAGGATG CGCGAGGGCTATTCGATGCAATGCCCGCCCGAAACGAGTACTCCTGGACAATCATGGTAT CCTGCTACGTGCGGGCTGGTGAGCTCACCCTCGCAAGGGAGCTGCTCGACCGCATGCCCG GGGAGAAGTGCGCGGCGTGCTACAACACCATGATCTCCGGGTATGCCAAGAACGGCAGGT TTGAGGATGCAATTGCTTTGTTGCAGGAGATGCCGGCCCCTGATATTGTTTCATGGAACT CAGTGTTGGGGGGGCTCATCCGGAATGAGGAAATCTCTCGATCAGTGCAGTTCTTTGATG AGATGCCAGATAAGGACTTGGTGTCCTGGAACTTGATGCTAGAGGGGTATGTGCGTGCTG GGGATTTGGATGTGGCCAGTGCATTCTTTTCAAGGATCCCCTCACCTAATGTTATTTCTT GGGTTAACTTGGTCAATGGGTATTGTCAGGCAGGGAGGATGGGCGAGGCAAGAGAATTGT TTGATAGAATGCCTGAGCGTAATGTTGTGGCTTGGAATGTGCTGCTTTCTGGGTATGTGC AGTTCTCTCAGGTGGAGGCGGCCTATAATCTGTTTATAGAGATGCCAGAGAAGAATTCAA TCTCATGGACAACGATGGTGAGTGGTTTTGTACGTTCTGGGAAGCTCCAAGAAGCGAAGG ATGTGCTCAGCAAGATGCCTTCCGACAATGTCGGAGCAAAGACTGCACTGATGCATGGCT ATTTGAAAAGCAACCTGATTGATGACGCCCGTCAACTATTTGATGGAATTGTGGTTCGGG ATGCAGTGTGCTGGAATACAATGATATCAGGATATGTTCAGTGTGGTATGCTTGATGAGG CCATGGTTTTATTCCAGCAAATGCCGAACAAGGATATGATTTCTTGGAACACCATGATTG CTGGCTGTGCTCAGGGTGGACAAATTCGCAAGGCAGCCAGTATTTTCAGGAAAATGAAGA GGAGAAATACAGTTTCATGGAATTCAATTATCTCTGGATTTGTTCAAAATGGTCTATTTG TTGAAGCACTGCAGCATTTTATGCTTATGAGAAGGGATGCAAAGAGCGCTGACTGGTGTA CATATGCATGTTGTCTAAGTGCAAGTGCAAATTTGGCTACTCTGCAAATAGGGAGACAAT TCCACAGTCTTCTTGTCAGGACTGGGTTTATCAGTGATTCTTCTCCTGGAAATGCCTTGA TTTCTGCCTATGCTAAGTGTGGAAGGATGTTGGAAGCAAGACAAGTCTTTGATGAGATGG TAGTACAAGACATCGTTTCATGGAATGCACTCATCGATGGCTATGCTTCTAATGGTAATG GGTCTGAGGTGATAGCAGTATTCCGGGAAATGGAAGCTAACAGTGTCAGACCTGATGAGA TCACGTTGGTAGTTGTGTTATCAGCTTGCAGTCATGCTGGGTTAATTGATGAAGGATTGC ATTTCTTCAATTCGATGATAAAATTGTACTCGTTAAAGCCTGTGGCTGAGCATTATACCT GTATGGTTGATCTTCTTGGAAGAGCTGGGAGACTAAGAGAGGCATTTGAACTTGTTCAGG GAATGCAGATCCAACCAAATGCTGGTGTCTGGGGTGCATTGCTTGGAGCATGCCGCGTAC ACAAGAATCACGAGATAGCATGGCTTGCAGCTGAGAAGTTATTTGAATTGGAACCTTGCA AGGCCTCAAATTATGTCTTGCTGTCAAACATCTGTGTGGAGGCAGGGAAATGGGATGATG CTGACAAGGTGAGGGTTTTGATGAAAGAGAGGTGTGTATACAAGCCACCTGGATTAGCTG GATCAATGTAG