Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID

Os11t0163100-01
CDS Infomation

cds chromosome:IRGSP-1.0:11:3078917:3081342:1 gene:Os11g0163100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Actin 7 (Actin 2). (Os11t0163100-01)
Sequence

ATGGCTGACGGCGAGGACATCCAGCCCCTTGTGTGTGACAATGGAACTGGCATGGTCAAG
GCTGGGTTTGCTGGGGACGATGCGCCCAGGGCTGTTTTCCCTAGTATCGTGGGGCGCCCC
CGTCACACCGGTGTGATGGTTGGTATGGGGCAGAAGGATGCCTATGTTGGTGATGAGGCG
CAGTCCAAGAGAGGTATCCTCACCTTGAAGTACCCGATCGAGCATGGTATTGTTAGCAAC
TGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACCTTCTACAACGAGCTCCGTGTCGCGCCC
GAGGAGCACCCTGTGTTGCTGACTGAGGCCCCGCTCAACCCCAAGGCTAACAGGGAGAAG
ATGACCCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGTGCCAGCTATGTATGTCGCCATCCAGGCC
GTGCTCTCCCTGTATGCCAGTGGACGTACAACTGGTATCGTGTTGGACTCTGGTGATGGT
GTCAGCCACACCGTGCCAATCTATGAAGGATATGCCCTTCCTCATGCCATCCTGCGTCTG
GACCTTGCTGGGCGTGACCTCACTGACAGCTTGATGAAGATTCTTACTGAGAGAGGTTAC
TCCTTCACTACCACTGCTGAACGGGAAATTGTAAGGGACATCAAGGAGAAGCTTGCATAT
GTGGCCCTTGACTATGAGCAGGAGCTGGAGGCTGCAAAGAGCAGCTCATCTGTGGAGAAG
AGCTATGAGCTGCCTGATGGACAGGTGATCACCATTGGGGCAGAGAGGTTCCGATGCCCT
GAGGTCCTCTTCCAGCCCTCTTTCATCGGTATGGAAGCTCCTGGAATCCATGAGACCACT
TACAATTCCATCATGAAGTGTGATGTGGATATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATTGTT
CTCAGTGGTGGATCAACCATGTTCCCTGGTATTGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACT
GCCCTCGCACCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTGGCACCGCCTGAGAGGAAATACAGT
GTCTGGATAGGAGGGTCCATCCTTGCCTCCCTTAGCACCTTCCAACAGATGTGGATCTCA
AAGGGAGAGTATGATGAGTCGGGTCCAGCAATTGTTCACCGGAAGTGCTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Os11t0163100-01
PEP Infomation

pep chromosome:IRGSP-1.0:11:3078917:3081342:1 gene:Os11g0163100 transcript:Os11t0163100-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Actin 7 (Actin 2). (Os11t0163100-01)
Sequence

MADGEDIQPLVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEA
QSKRGILTLKYPIEHGIVSNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREK
MTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRL
DLAGRDLTDSLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDYEQELEAAKSSSSVEK
SYELPDGQVITIGAERFRCPEVLFQPSFIGMEAPGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNIV
LSGGSTMFPGIADRMSKEITALAPSSMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWIS
KGEYDESGPAIVHRKCF

Transcript Sequence

Transcript ID

Os11t0163100-01
Transcript Infomation

cdna chromosome:IRGSP-1.0:11:3078917:3081342:1 gene:Os11g0163100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Actin 7 (Actin 2). (Os11t0163100-01)
Sequence

GCGTCGACTCCACTCTCGCCTCCTCGCGACTCGGAGTTCACCGCCGCCACCGCCTCCGCC
GCCGATCTCCCCGTCCCGCCGCGCCGCCGCCACCGTCCTCCCTCCTCCGGCCGCATCCCC
GGAATTCAGAACCAGTAGGAGGAAATGGCTGACGGCGAGGACATCCAGCCCCTTGTGTGT
GACAATGGAACTGGCATGGTCAAGGCTGGGTTTGCTGGGGACGATGCGCCCAGGGCTGTT
TTCCCTAGTATCGTGGGGCGCCCCCGTCACACCGGTGTGATGGTTGGTATGGGGCAGAAG
GATGCCTATGTTGGTGATGAGGCGCAGTCCAAGAGAGGTATCCTCACCTTGAAGTACCCG
ATCGAGCATGGTATTGTTAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACCTTC
TACAACGAGCTCCGTGTCGCGCCCGAGGAGCACCCTGTGTTGCTGACTGAGGCCCCGCTC
AACCCCAAGGCTAACAGGGAGAAGATGACCCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGTGCCA
GCTATGTATGTCGCCATCCAGGCCGTGCTCTCCCTGTATGCCAGTGGACGTACAACTGGT
ATCGTGTTGGACTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACCGTGCCAATCTATGAAGGATATGCC
CTTCCTCATGCCATCCTGCGTCTGGACCTTGCTGGGCGTGACCTCACTGACAGCTTGATG
AAGATTCTTACTGAGAGAGGTTACTCCTTCACTACCACTGCTGAACGGGAAATTGTAAGG
GACATCAAGGAGAAGCTTGCATATGTGGCCCTTGACTATGAGCAGGAGCTGGAGGCTGCA
AAGAGCAGCTCATCTGTGGAGAAGAGCTATGAGCTGCCTGATGGACAGGTGATCACCATT
GGGGCAGAGAGGTTCCGATGCCCTGAGGTCCTCTTCCAGCCCTCTTTCATCGGTATGGAA
GCTCCTGGAATCCATGAGACCACTTACAATTCCATCATGAAGTGTGATGTGGATATCAGG
AAGGACTTGTATGGTAACATTGTTCTCAGTGGTGGATCAACCATGTTCCCTGGTATTGCT
GACCGTATGAGCAAGGAGATCACTGCCCTCGCACCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTG
GCACCGCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATAGGAGGGTCCATCCTTGCCTCCCTTAGC
ACCTTCCAACAGATGTGGATCTCAAAGGGAGAGTATGATGAGTCGGGTCCAGCAATTGTT
CACCGGAAGTGCTTCTAAGCTCTGGCTTTTTAATCGCTTATCTACAAGGCAGTTTCTTTT
CAGTTTTCACAAGCCCTTGTCATGTAAGCTACTCTGTTTGGGATTGTTGGTGTCCTATCA
GAATGTTGTTGGATTTGTTTCATGGCTGAATATTATGCACCTTCTGAACTCTTGGTATGC
ATTTGTCCGGTGGCTGCTGTATTATACATGGCATGCATGGTCCAACTTTTGTCATGCTAA
GTTTGTGGTTAGTGGTAGGACCAAAAGAAAAATGGGAGATGTACCCACTACCTAGGATCG
TCTATTGTAATCGTACTTGTGCGAGTCATGTTATCATTTATCTTGTACATTCATCTCCAA
GATAAGTGATCTGGTTCTTTGATCGTTTG