Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os10t0321700-01
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:10:8786980:8796460:-1 gene:Os10g0321700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Ribonucleoprotein like protein. (Os10t0321700-01)
Sequence	ATGGCCTTCTTGCGGAAGGTTGGGAACCTCGTCAGGCAGTCCGCAGGCTCGGGCTCGCCG CTGTTCCAGGCGGTCCGATGCATGTCCTCCTCGAAGCTCTTCATCGGAGGAATCTCTTAT GGTACTGATGACCAGAGTCTGAAGGAAGCGTTTGCTAACTACGGTGAAGTCATTGAAGCT AGGGTGATTGTGGACCGTACCACTGGACGGTCGAGGGGATTTGGTTTTGTAACCTACACA TCCACGGATGAGGCTGCAGCTGCCATTACTGGCATGGACGGGAAGGATCTGCAGGGCCGG ATTGTGCGGGTGAGTTATGCTCATGACCGTGGTAGCCGTGCTGGTGGCTATGGTGGTGGA GGCTACAGTGGACAGGGTACGTATGGTGGTGGCGGTGGCTATGGAGGTGGAGGCTATGGT GGACAGGATGCATATGGTGGTCGTGGTGTTGGAGGCTATAGTGAGGGTGGCCGTGGGTAT GTTGGTGGTGGATACGGTGACGGTAACAATTACGGTGGGTATAACACAAGTGGTGGATAT AATTCTGAAGGTGGGCGTGGTGGCTATAGTGTTTTTGAAGGTGGACATGGCTACGGTAGT GGCGGTACTGGTTACACAGGAGGCAGCGGCGGATATAATTCGGCCCCTGGAAATTACAGC AGTGACAACTTCAATCAAGGGGGTGCAGCACCTGGTGCATATGAAGGTGCAAACTACGGT GGAGGCAACAACTACATGAACAATGCAACCAGTGATGATTCCACCGGTAAGCTGGACGAG TTGTTAAATGATCTTAAAGTTGATGGTGATGGCAAAGAGGATGGTGAGGGCAAAGCGGAT GGCGCTGGCCTGGTTAATGAGGATCTGAAAGGAGATGATGGTCAGGATGAATTGCTTCAG AATGATTTCAAAGATGAAGATGTGTCTGATGACTATGCCAACAAAAGACGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Os10t0321700-01
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:10:8786980:8796460:-1 gene:Os10g0321700 transcript:Os10t0321700-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Ribonucleoprotein like protein. (Os10t0321700-01)
Sequence	MAFLRKVGNLVRQSAGSGSPLFQAVRCMSSSKLFIGGISYGTDDQSLKEAFANYGEVIEA RVIVDRTTGRSRGFGFVTYTSTDEAAAAITGMDGKDLQGRIVRVSYAHDRGSRAGGYGGG GYSGQGTYGGGGGYGGGGYGGQDAYGGRGVGGYSEGGRGYVGGGYGDGNNYGGYNTSGGY NSEGGRGGYSVFEGGHGYGSGGTGYTGGSGGYNSAPGNYSSDNFNQGGAAPGAYEGANYG GGNNYMNNATSDDSTGKLDELLNDLKVDGDGKEDGEGKADGAGLVNEDLKGDDGQDELLQ NDFKDEDVSDDYANKRR

Transcript Sequence

Transcript ID	Os10t0321700-01
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:10:8786980:8796460:-1 gene:Os10g0321700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Ribonucleoprotein like protein. (Os10t0321700-01)
Sequence	AGGTAAGAGACGCTTCCAACCCTAATCCCCCCAACACCATCAACGGATCCACCCACTGGT TGTCCGCCTGCTTCTCCCCGCCCCAATCCACCTTAGGAATAGCGCCTGGCTGGATCCCAG GCCGTTTGCTTGTTTGCGTCCGGAGATTGGAGCGCCGATTGGGATGAAACCGATCGGCCC TTAATGTTTATTTTTCCCCATCACGCGATTGTATTTGTTGCCTCCGAGAGATTCTGTGCT GTTGCTGAATCCAATTTTCGTGTGATTTTTGGCAGGGGATTCTGAGATATGGCCTTCTTG CGGAAGGTTGGGAACCTCGTCAGGCAGTCCGCAGGCTCGGGCTCGCCGCTGTTCCAGGCG GTCCGATGCATGTCCTCCTCGAAGCTCTTCATCGGAGGAATCTCTTATGGTACTGATGAC CAGAGTCTGAAGGAAGCGTTTGCTAACTACGGTGAAGTCATTGAAGCTAGGGTGATTGTG GACCGTACCACTGGACGGTCGAGGGGATTTGGTTTTGTAACCTACACATCCACGGATGAG GCTGCAGCTGCCATTACTGGCATGGACGGGAAGGATCTGCAGGGCCGGATTGTGCGGGTG AGTTATGCTCATGACCGTGGTAGCCGTGCTGGTGGCTATGGTGGTGGAGGCTACAGTGGA CAGGGTACGTATGGTGGTGGCGGTGGCTATGGAGGTGGAGGCTATGGTGGACAGGATGCA TATGGTGGTCGTGGTGTTGGAGGCTATAGTGAGGGTGGCCGTGGGTATGTTGGTGGTGGA TACGGTGACGGTAACAATTACGGTGGGTATAACACAAGTGGTGGATATAATTCTGAAGGT GGGCGTGGTGGCTATAGTGTTTTTGAAGGTGGACATGGCTACGGTAGTGGCGGTACTGGT TACACAGGAGGCAGCGGCGGATATAATTCGGCCCCTGGAAATTACAGCAGTGACAACTTC AATCAAGGGGGTGCAGCACCTGGTGCATATGAAGGTGCAAACTACGGTGGAGGCAACAAC TACATGAACAATGCAACCAGTGATGATTCCACCGGTAAGCTGGACGAGTTGTTAAATGAT CTTAAAGTTGATGGTGATGGCAAAGAGGATGGTGAGGGCAAAGCGGATGGCGCTGGCCTG GTTAATGAGGATCTGAAAGGAGATGATGGTCAGGATGAATTGCTTCAGAATGATTTCAAA GATGAAGATGTGTCTGATGACTATGCCAACAAAAGACGTTAAAGTTCGCTCGACCATGAA GTCCAGTCCGGTAACTTTTCATGTGTTGCCGATGGAGGTGCTCTCCACAATCGCGAAATC CAAAGTTAAGACAACGTCCTGTATGCAAATAAGTTTCGTGTTGTAGCCATATATGCTGGA CCATCGGGACTCTTTCGATATGCGGTCATTCAAAACCTGGATTAGTATGGATTCACTGCA CTACAATCGCATCCTCTGTGGATAATCCATTGTTGCTCGGCTGCTCTCTTTGGATACAAT CTACTGATAGACACTCCCTCCGAAGTCCGACCGTGTTATTCTTTTTTGGGTTAATTGGAT CCATGCCATTATAAATTTTTGAGTTTTGAAGTATACCATTACAATTCATCTATTTGCAAT GATACCATTGCAATTTTACAGCTATTTGTG