Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os08t0208400-02
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:8:6319262:6324373:1 gene:Os08g0208400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Conserved hypothetical protein. (Os08t0208400-01);Transposon, En/Spm-like domain containing protein. (Os08t0208400-02)
Sequence	ATGGAAAGAACTTGGATGAATTGTAAGTTGTTTAGCAAGGAGCATCGGGAGGGGGTCACT GAGTTCATGGACTTTGTTTGTAAAAATTTGAGTGGCAGTCAGAAGATATTATGCCCATGT CGTAAGTGTTTGAATCGGTTACATCAATATAAAGGACGTGTGGAGGATGACTTACTTATG TACGGGATGTCTAACACATACACTCGGTGGATACATCATGGAGAACCATTGGTCATTGTC ACTGGAAATGTTGAGCATTTGAATGAAGATATTGGCTGCAATGTTGAGCATTTGAATGAA GATGTTAGCTGCAATGTTGAATTTGAGACGAATGAGCCTCCGGATGACCCAGAAGATGAT CAAATGTACCGTATGGTACAGGATCTGTACCCAGATCAAAATCATGGACCAAGAACAAAG TCAAAGTTTGCCACCATATTAGAAGAGATGAAACAGGTGCTACACCCCGGTGGTCCCTAT ACTAGGTTTTCTTTTGTGGTGAAGTTGCTCCACATCAAGTCATTTTACAGAATCAGCAAT GTTGCATTCAGTGCTTTTTTTGACCTTTTAAGTTCAGCATTTCCAAATTGTTCTCTCCCT GCATCCTATGCTGAAGCGAAGAATTTTATTCGTGCATTAGGACTTGGATATGAGTCAATA CATGTGTGTCCGAATAACTGTGTTCTTTTCCGAAAGGAGTTGGCTAAAAAGGATGCATGC CCAATATGTGGTGCTTCAAGATGGAAGGATGCAGATAGCCGAAGGAAGATTCCAGAAAAG GTTCTAAGGCATTTTCCTTTGATTCCAAGGTTGAAGAGGATGTTTGGATCGAAAGAACTT TCAGCTGAGGCACAATGGCACAAGTTGAAGAGGAAACCAGTGGACAATGAGCTTAGCCAT CCTGCTGATGGTGAGGCATGGAAAGATTTTGATAGAAAGTATGAATGGTTTGCAAATGAT GCACGGAATGTCCGACTTGGCCTCGCTACTGATGGGTTTAATCCATTTGGGAAGATGAGC TCCTCATATAGCATGTGGCCAGTATTTCTTATCCCTTACAACTTTCCTCCGTGGCAATGT ATGGAGCAATCCAACTTCATGATGTGCCTACTTATTCTTGGTCCGACATGCCCTGGAAAG GATATGGATCTCTTCCTGCAGCCACTGGTTGAAGAATTGTTAAATCTTTGGAGTGGTGTC CCTACTTTGGATGCATTGACCGGCAAAGAATTTGATCTTCACGCTGCAATCATATGGTGC ATTCATGATTATCCAGCATTGAGCACACTTTCAGGTAGAGTAACTAGAGGCTACTATGCT TGCGTTTGTTGTGATAAAAATCCTTGCTACAAAAGACTTAGGAACAAGATTTGCTACATT GGCCATCGCCGTTTTCTTCCAGTGGACCATATTTGGAGGAGAAAGAAAGATTTTAATGGT CAGACTGAAGAACGTGCGCAACCGGAAGAATTTACTCAGGATGAGTTGATGCAGCAATTG GCGAGGGTGGAACATGTAAGACCTGGGAACCATCCTAATAACAAAAAGAGAAAGAGGGTA GAAGAAGGTCAATGCTGGAAGCGCAGGTCGACTCTGTGGGATTTGCCATATTGGTCTAAT TTAAAGCTACGACACAATCTTGATGTTATGCATATCGAGAAAAATATATGTGAGGCCCTT CTTGGTACATTTCTCGACATCGCAGGCAAGTCAAAGGACTCTGTTACTGCGAGGCTCGAT TTAGAAGATATGGGCATAAGGAAAAATTTACACTTGAAGGATGATGGGAATTCAACATGC ACTGCTCCACATGCTCCATATGTGATGACTAAAGCCCAGAGAAAAGCTTTCTGTGCTTTC ATAAAAAATGTCAAATTCCCAGATGGATATGCCTCCAACTTAGCAAGGTGTGTTAGTGTT GATGAATGCAAAGTACAGGCATTGAAAACTCACGACTGTCATATCCTTCTGCAAAGGATA TTACCAGCCGGTCTCCGAGGAATCATGCATAAGGAAATATATGAAACAATTGCTGAATTA GGTAACTTTTTCCAGCAAATTTGTGCTAAGAAATTGAAGTTAGATGCTTTGAACAAGATG AGAGGTGAAATCCCAATAATATTGTGCAAGCTTGAGAAGATTTTCCCGCCTGCCTTTTTT GATGTGATGGTGCACTTATGCATTCATTTAATTGATGATGCAATCCTAAGAGGTCCTGTT CAATATGGATGGATGTACCCTGTAGAGCGTAGGTTGCTGACCTTGAAACGCTTTGTAAGG AACATGGCAAGGCCTGAGGGCTCCATTGCAGAGGCATATGTCGCAAATGAGTGCTTGACT GCTTGCTCAAGGTATTTTGCTGATGTTGACACTAGGCACAATCGTGAGGGTAGGAACAAA GAGCGTGTTCCTATGAGTAGATGTGGTTTATCTATTTTCCAGCATGGAGCAAATCTGTTG GGGGCACCAAGGCTTACATATGAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Os08t0208400-02
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:8:6319262:6324373:1 gene:Os08g0208400 transcript:Os08t0208400-02 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Conserved hypothetical protein. (Os08t0208400-01);Transposon, En/Spm-like domain containing protein. (Os08t0208400-02)
Sequence	MERTWMNCKLFSKEHREGVTEFMDFVCKNLSGSQKILCPCRKCLNRLHQYKGRVEDDLLM YGMSNTYTRWIHHGEPLVIVTGNVEHLNEDIGCNVEHLNEDVSCNVEFETNEPPDDPEDD QMYRMVQDLYPDQNHGPRTKSKFATILEEMKQVLHPGGPYTRFSFVVKLLHIKSFYRISN VAFSAFFDLLSSAFPNCSLPASYAEAKNFIRALGLGYESIHVCPNNCVLFRKELAKKDAC PICGASRWKDADSRRKIPEKVLRHFPLIPRLKRMFGSKELSAEAQWHKLKRKPVDNELSH PADGEAWKDFDRKYEWFANDARNVRLGLATDGFNPFGKMSSSYSMWPVFLIPYNFPPWQC MEQSNFMMCLLILGPTCPGKDMDLFLQPLVEELLNLWSGVPTLDALTGKEFDLHAAIIWC IHDYPALSTLSGRVTRGYYACVCCDKNPCYKRLRNKICYIGHRRFLPVDHIWRRKKDFNG QTEERAQPEEFTQDELMQQLARVEHVRPGNHPNNKKRKRVEEGQCWKRRSTLWDLPYWSN LKLRHNLDVMHIEKNICEALLGTFLDIAGKSKDSVTARLDLEDMGIRKNLHLKDDGNSTC TAPHAPYVMTKAQRKAFCAFIKNVKFPDGYASNLARCVSVDECKVQALKTHDCHILLQRI LPAGLRGIMHKEIYETIAELGNFFQQICAKKLKLDALNKMRGEIPIILCKLEKIFPPAFF DVMVHLCIHLIDDAILRGPVQYGWMYPVERRLLTLKRFVRNMARPEGSIAEAYVANECLT ACSRYFADVDTRHNREGRNKERVPMSRCGLSIFQHGANLLGAPRLTYE

Transcript Sequence

Transcript ID	Os08t0208400-02
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:8:6319262:6324373:1 gene:Os08g0208400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Conserved hypothetical protein. (Os08t0208400-01);Transposon, En/Spm-like domain containing protein. (Os08t0208400-02)
Sequence	GCAGGCTGTAGCCCCACCCTGTCCCCAACGTAGCGCCCGGCTGTTGGAGCTCGACGCCGT CGCCCTTCGCCCAACGCGGCTTCTGGAGCCCGGCACCGCCGGCTGGATCCCAAGCCCCAC CCCATCCCCAGGAGCTCGATGCCAGCTTGCTGCAGCTCCAGGACGCCGGGCTTCATGGGC ACAACTGCTGGGAACGCCCCCAAGAGCCCGACGCCGACGACAGTAGCCCGCCCCCGCCTC TAGGATCTCGACGGCTGGGCCGGCTGGCTGCAGATCCTGGCCGCTGGGCTTCACGGGCTC AACCGCTAGGAAGCCCCCAAGAGCTCTAGCCTGGGATCACTGCCGACGGCGGGTGAGGTC GACCAGAGACTGCCCCATCCCCTTCAATTAGGAAGGAAAGATGGAAAGAACTTGGATGAA TTGTAAGTTGTTTAGCAAGGAGCATCGGGAGGGGGTCACTGAGTTCATGGACTTTGTTTG TAAAAATTTGAGTGGCAGTCAGAAGATATTATGCCCATGTCGTAAGTGTTTGAATCGGTT ACATCAATATAAAGGACGTGTGGAGGATGACTTACTTATGTACGGGATGTCTAACACATA CACTCGGTGGATACATCATGGAGAACCATTGGTCATTGTCACTGGAAATGTTGAGCATTT GAATGAAGATATTGGCTGCAATGTTGAGCATTTGAATGAAGATGTTAGCTGCAATGTTGA ATTTGAGACGAATGAGCCTCCGGATGACCCAGAAGATGATCAAATGTACCGTATGGTACA GGATCTGTACCCAGATCAAAATCATGGACCAAGAACAAAGTCAAAGTTTGCCACCATATT AGAAGAGATGAAACAGGTGCTACACCCCGGTGGTCCCTATACTAGGTTTTCTTTTGTGGT GAAGTTGCTCCACATCAAGTCATTTTACAGAATCAGCAATGTTGCATTCAGTGCTTTTTT TGACCTTTTAAGTTCAGCATTTCCAAATTGTTCTCTCCCTGCATCCTATGCTGAAGCGAA GAATTTTATTCGTGCATTAGGACTTGGATATGAGTCAATACATGTGTGTCCGAATAACTG TGTTCTTTTCCGAAAGGAGTTGGCTAAAAAGGATGCATGCCCAATATGTGGTGCTTCAAG ATGGAAGGATGCAGATAGCCGAAGGAAGATTCCAGAAAAGGTTCTAAGGCATTTTCCTTT GATTCCAAGGTTGAAGAGGATGTTTGGATCGAAAGAACTTTCAGCTGAGGCACAATGGCA CAAGTTGAAGAGGAAACCAGTGGACAATGAGCTTAGCCATCCTGCTGATGGTGAGGCATG GAAAGATTTTGATAGAAAGTATGAATGGTTTGCAAATGATGCACGGAATGTCCGACTTGG CCTCGCTACTGATGGGTTTAATCCATTTGGGAAGATGAGCTCCTCATATAGCATGTGGCC AGTATTTCTTATCCCTTACAACTTTCCTCCGTGGCAATGTATGGAGCAATCCAACTTCAT GATGTGCCTACTTATTCTTGGTCCGACATGCCCTGGAAAGGATATGGATCTCTTCCTGCA GCCACTGGTTGAAGAATTGTTAAATCTTTGGAGTGGTGTCCCTACTTTGGATGCATTGAC CGGCAAAGAATTTGATCTTCACGCTGCAATCATATGGTGCATTCATGATTATCCAGCATT GAGCACACTTTCAGGTAGAGTAACTAGAGGCTACTATGCTTGCGTTTGTTGTGATAAAAA TCCTTGCTACAAAAGACTTAGGAACAAGATTTGCTACATTGGCCATCGCCGTTTTCTTCC AGTGGACCATATTTGGAGGAGAAAGAAAGATTTTAATGGTCAGACTGAAGAACGTGCGCA ACCGGAAGAATTTACTCAGGATGAGTTGATGCAGCAATTGGCGAGGGTGGAACATGTAAG ACCTGGGAACCATCCTAATAACAAAAAGAGAAAGAGGGTAGAAGAAGGTCAATGCTGGAA GCGCAGGTCGACTCTGTGGGATTTGCCATATTGGTCTAATTTAAAGCTACGACACAATCT TGATGTTATGCATATCGAGAAAAATATATGTGAGGCCCTTCTTGGTACATTTCTCGACAT CGCAGGCAAGTCAAAGGACTCTGTTACTGCGAGGCTCGATTTAGAAGATATGGGCATAAG GAAAAATTTACACTTGAAGGATGATGGGAATTCAACATGCACTGCTCCACATGCTCCATA TGTGATGACTAAAGCCCAGAGAAAAGCTTTCTGTGCTTTCATAAAAAATGTCAAATTCCC AGATGGATATGCCTCCAACTTAGCAAGGTGTGTTAGTGTTGATGAATGCAAAGTACAGGC ATTGAAAACTCACGACTGTCATATCCTTCTGCAAAGGATATTACCAGCCGGTCTCCGAGG AATCATGCATAAGGAAATATATGAAACAATTGCTGAATTAGGTAACTTTTTCCAGCAAAT TTGTGCTAAGAAATTGAAGTTAGATGCTTTGAACAAGATGAGAGGTGAAATCCCAATAAT ATTGTGCAAGCTTGAGAAGATTTTCCCGCCTGCCTTTTTTGATGTGATGGTGCACTTATG CATTCATTTAATTGATGATGCAATCCTAAGAGGTCCTGTTCAATATGGATGGATGTACCC TGTAGAGCGTAGGTTGCTGACCTTGAAACGCTTTGTAAGGAACATGGCAAGGCCTGAGGG CTCCATTGCAGAGGCATATGTCGCAAATGAGTGCTTGACTGCTTGCTCAAGGTATTTTGC TGATGTTGACACTAGGCACAATCGTGAGGGTAGGAACAAAGAGCGTGTTCCTATGAGTAG ATGTGGTTTATCTATTTTCCAGCATGGAGCAAATCTGTTGGGGGCACCAAGGCTTACATA TGAGTAGAAGGAGTATGATAGGATGGTTTGGTATGTCCTCAACAATACTAAGGAGGTCGA GCCATTTATAGAGATTTACATGAAGGATTTACAAACTGCTGGCAGTCATGATGTTGAGGG GAACCTTGCTAAGGAATTTCCAGGATGGTTTAGGAAACATCTTGCTACTCGGAGGTTTGT GAATGGAGAACAAATCGATGAAGACCTATATGCATTGGCAAGTCTACCACTTCTTAGAGT TCGTATATTTTCAGGATGTATTGTTGATGGTGTCCGATATCACACCGTGGAACGTGAGAG CAGTAGAAGAACACAAAACAGTGGAGTTATGGTTGAGGGCACACATAATGGAGAAGATAT AGACTTTTATGGTCAGCTAAAAGAAGTAATACAGTTGCAGTACAACTCTGACGCTGACAG TCAAAGGACAGTGGTGTTATTCAAGTGTGATTGGTTTGATACCTGTAGCAAAAAGTCTAG GATGAAGAATGATGGATATTTCAAAAGCATCAGCCATGGAAGTTGTTGGTACAAGGATGA TGCTTTCATTCTTGCCACACAGGCAACAAAGGTTTTCTACTTGGATGATAACAAGCATGG TGAACCCTGGAAAGTTGTTCAAAAATTTTCGCATCGGCACTTGTGGAATGTGAATGAGGA GGAAAATGATGACAGGCAAGAGGGAGGGGTTGATCTGACATACCAAGATGATGAGCAGGA AATATCTCGAGTTGAAACCATGGAAGGATCTCTGGTCGACAAACAACCAGTCAACGAAGA TGGTATAAGTGTACCAAAGTCCCTAGTTGATCAGATTCGCAGGCAACGGGATCTGGAAGT TGAAGAAGATGACCTGTACAATGATGATGACGATGATGATACCTTAGGGCAGTATGATAG TGAAAATGAATGTACAATTATGATCCCTAATGATGATGGTGAGTATAGTGATGTCGAGTA ATTGAGATATGTGAATCTGAGTTGTGATGAAATTGTTGTTTTTAAACAGCTCCTAATGTG TTAGCCGTGAAATAATTATGAATTGTGAACTCAATTGTGTAAACTCCTTAATTGAGATAT GCGAATTCCAGCTGTTCTTGGTGCCTGGAATTGTACTG