Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os07t0602600-01
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:7:24611198:24614117:-1 gene:Os07g0602600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to RNA binding protein. (Os07t0602600-01)
Sequence	ATGGCTTTCGCTGGTAGAGTTGTGAATGCGCTCAGGAGGACTTCGGTCTCGTCCAACCCG TCGCTGCTCCAGGCAGTAAGATGCATGTCCTCAAAGCTTTTCGTTGGAGGACTTTCGTAT GCCACAGACGACACCACCCTCAAGGATGTGTTTTCTCACTACGGCGATGTTCTTGAAGCT AGGATCATCATTGATAGGGACACAGGAAAGTCAAAAGGGTATGGATTTATAACTTACACA TCAAGCGAGGAAGCTGCGGCTGCCGTTACTGCCATGGATGGCAAGGATCTTCAAGGACGA ATTGTAAGGGTCAGCACCGCCAATGACCGTGCTGGTGGAATACGTGGAGGTGGTGGATTT GGCGCTGGTGGTTATGGAAGTGGCGGTGGATATAGCAGTGGTGGTGGATATGGTACTGGT GAGTATGGCAGAGGTGGTGGATATGCTGGCAATGGTGGATACGGTGGCAGGGCTTCTGAA TATGGTGGTTATGGTGCTGGGGGATACAGCAGTAGTGGAGGCTATAATGCTACCAGTGTT CTTCATGGAAATGCTGGTGGCTACGGTAGCTCTGGTGTGTCCCATGGAAATGCTGGTGAC TACAGAAGCTCTGATGTTTACAATACTACCAACACCTATGGCGCTGGCAACTTCAGCCAT AGTGGTCAGTCCGGTGGCAGCTTCGGTGGAAACAACGGTGGAATTAGTGGTGGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Os07t0602600-01
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:7:24611198:24614117:-1 gene:Os07g0602600 transcript:Os07t0602600-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to RNA binding protein. (Os07t0602600-01)
Sequence	MAFAGRVVNALRRTSVSSNPSLLQAVRCMSSKLFVGGLSYATDDTTLKDVFSHYGDVLEA RIIIDRDTGKSKGYGFITYTSSEEAAAAVTAMDGKDLQGRIVRVSTANDRAGGIRGGGGF GAGGYGSGGGYSSGGGYGTGEYGRGGGYAGNGGYGGRASEYGGYGAGGYSSSGGYNATSV LHGNAGGYGSSGVSHGNAGDYRSSDVYNTTNTYGAGNFSHSGQSGGSFGGNNGGISGG

Transcript Sequence

Transcript ID	Os07t0602600-01
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:7:24611198:24614117:-1 gene:Os07g0602600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to RNA binding protein. (Os07t0602600-01)
Sequence	GATCCGGAGCAGCAGGTGAGGCTGCGTGGGGTTTCTCTCGTCGTCCCCGCCGCGCCGCCG CCGCCGCATCCTCCGGGTGGGTTGCCGCCGCCGTCGGTCACCGATCCTCCCAGTCGAGTG CTTGAACCAAACGCCGCCTTGGTTGAGAGATGGCTTTCGCTGGTAGAGTTGTGAATGCGC TCAGGAGGACTTCGGTCTCGTCCAACCCGTCGCTGCTCCAGGCAGTAAGATGCATGTCCT CAAAGCTTTTCGTTGGAGGACTTTCGTATGCCACAGACGACACCACCCTCAAGGATGTGT TTTCTCACTACGGCGATGTTCTTGAAGCTAGGATCATCATTGATAGGGACACAGGAAAGT CAAAAGGGTATGGATTTATAACTTACACATCAAGCGAGGAAGCTGCGGCTGCCGTTACTG CCATGGATGGCAAGGATCTTCAAGGACGAATTGTAAGGGTCAGCACCGCCAATGACCGTG CTGGTGGAATACGTGGAGGTGGTGGATTTGGCGCTGGTGGTTATGGAAGTGGCGGTGGAT ATAGCAGTGGTGGTGGATATGGTACTGGTGAGTATGGCAGAGGTGGTGGATATGCTGGCA ATGGTGGATACGGTGGCAGGGCTTCTGAATATGGTGGTTATGGTGCTGGGGGATACAGCA GTAGTGGAGGCTATAATGCTACCAGTGTTCTTCATGGAAATGCTGGTGGCTACGGTAGCT CTGGTGTGTCCCATGGAAATGCTGGTGACTACAGAAGCTCTGATGTTTACAATACTACCA ACACCTATGGCGCTGGCAACTTCAGCCATAGTGGTCAGTCCGGTGGCAGCTTCGGTGGAA ACAACGGTGGAATTAGTGGTGGATGATTTGGTGCCGCCGGTAGCAGCAACCTCCACAACT CTGCCAACTTCAGCCATGGTGGTCAGTCCAGTGATGGTGGCAGCAACGGCGGCAACTCTG CTAGCAACTTTGGCCAAGGTGGTGGCTTTGGTGAAAACAGTGGTGGATATAACAGCGGAC AATTTGGTGCCGCGGGTCACAGCAATGGCGGCTACTCTGCCAGCAACTTCAGTAATGCTA GCTTTGGTGCAAACAGTAGTGTATTTAGCAGTGGACAATCTGGTGCCACCGGTCGCAACA ACGGTGGCAACTCGGCCAGCAACTTCAGCCTCGGTGGCAGCTTTGGTGCAAACAATGGTG GAATTAGCAGTGGACAATTTGGTGCCGTGGGTCACAGCAATGGAGGCTACTCTACCAGCA ACTTCAGCCGTGGTAGCGGCTTTGGTGCAAACAGTGGTGGATCCAGCAATGGACAATATG GTGCCGCGCATGGCAACAACGGCAGCAACTTCAGCCACGGTGGCGGCTTTGGTGCACAAA TGGTGGGTATAGCAGCGGACAATTTGGTGTTGCGGGTGTTGGAAATATGGTCATAAATCG GCATATTTTAATCCAAAATGTTAAGACAATAATCATGGCATAAACAGTGTAGGGTGATCT AGTGAGAACATGTAACAGTAGCAAACTATCATGCGCATCATGAATATCAGGAACAAGAGC ATAGCATATCAGG