Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os05t0574800-00
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:5:28632991:28636150:1 gene:Os05g0574800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os05t0574800-00)
Sequence	ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCC CACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGCCGCGGAAG CGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCG GAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTG GCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTC GCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCG CGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATG CTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGG GACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAG GCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTC CCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCAT GCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACC ATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCGTG ACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAG GCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACA ATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATG CATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATT CAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAA ACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCA GATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTCCTGATGATGTT ACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAA TTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTC CTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATG GCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGG AGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTT ACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAA ATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTT CTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCAT AGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTT GGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAA GTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGG GAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCA TGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAAT CGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATC CACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAAT GATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAA GTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGC TGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAG ATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTT GCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCAC AGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCT GTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAA ATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGA GATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Os05t0574800-00
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:5:28632991:28636150:1 gene:Os05g0574800 transcript:Os05t0574800-00 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os05t0574800-00)
Sequence	MPPPPARTHPNPPLLHLLASHRAPQPLPLTPAHGHLPPRKRPRGVGSAAAPPPPRAAASA EATYSDRSAALRALCSHGQLAQALWLLESSPEPPDEGAYVALFRLCEWRRAVDAGMRACA RADAEHPSFGLRLGNAMLSMLVRFGEIWHAWRVFAKMPERDVFSWNVMVGGYGKVGFLEE ALDLYYRMLWAGMRPDVYTFPCVLRTCGGIPDWRMGREVHAHVLRFGFGDEVDVLNALVT MYAKCGDIVAARKVFDGMAVTDCISWNAMIAGHFENHECEAGLELFLTMLENEVQPNLMT ITSVTVASGMLSEVGFAKEMHGFAVKRGFAIDVAFCNSLIQMYTSLGRMGDAGKIFSRME TKDAMSWTAMISGYEKNGFPDKALEVYALMELHNVSPDDVTIASALAACACLGRLDVGIK LHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHIDKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHR SFEALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSACAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNAL LDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVVSWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMVEMGEHPDE VTFVALLCACSRAGMVIQGWELFHMMTEKFSIVPNLKHYACMVDLLSRVGKLTEAYNLIN RMPIKPDAAVWGALLNGCRIHRHVELGELAAKVILELEPNDVAYHVLLCDLYTDAGKWAQ VARVRKTMREKGLEQDNGCSWVEVKGVTHAFLTDDESHPQIKEINVVLHGIYERMKACGF APVESLEDKEVSEDDILCGHSERLAVAFGLINTTPGTTISVTKNRYTCQSCHVIFKAISE IVRREITVRDTKQLHCFKDGDCSCGDIGYG

Transcript Sequence

Transcript ID	Os05t0574800-00
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:5:28632991:28636150:1 gene:Os05g0574800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os05t0574800-00)
Sequence	GGCCACCGAGGCGCCAAACCTCTCCTAAACCCCCGCGTCTCTCACCGCCATGCTCGTGGC CGCCTCCCGCGATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACC TCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCC CGCCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCG CCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCC ATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGG GCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGC GGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTA TGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAA TGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCT TCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATG TCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGA GGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATG CTCTGGTGACCATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATG GAATGGCCGTGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATC ATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGA ATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTG CAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTA ACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCT CAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAA ATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTC CTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATG TAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTG CTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTAT TTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCT TTAACCACAGGAGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAAC CCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGAT CTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTAC CCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAAT TCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAG CTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGC ATCCGGATGAAGTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTA TTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCA AGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACA ACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATG GATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGT TGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCA AATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATA ATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAAT CACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAG CATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCT TGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTA CCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGG CAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCT TTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGAAAAACTTATAGAAAGA GGGCTGTATAACAATACAAGATGTGGCCATGCATTATTATGCATCTGCTGCAAGCACTGC TACAGAAATCCTTTGCAACAACAGTTATTAACCACGTCTAACAATACAAATACTCACTAG CAGTTTGGATATAGGCATATAGCAAGAAGCCCCAGCAACCCTGCATGGATCAACAAAGTT AAAATTTTCAGTTATATGTATTAGGTTTGTGCAAGTATTCAGCTTGGTACATGACAAAAA ATGTTGAAAATCTAGCTCAGATACTGGCACTCCAGCTTTTGTCATTTCTTATTGCACAGA AGTCCCCTTAAGTGGTGCTTCATGCAGATGATCTTTGCGTCCAATAATGTCCAAAAGAAA TATCCAAGTAAGATTA