Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os05t0153400-01
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:5:3083807:3085504:1 gene:Os05g0153400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os05t0153400-01)
Sequence	ATGTCACGTCGGGGTCTCCCGTGGCAGAGCCCTGCGGGGGAGCGGTGGGACGCCACCTCC CTCGCCGGCGCCCTGAAGGCCGCCGCCGGCGTGCGCTCGGCGACGCACGTCATGCCACTC TACGCGGTGCTCCTCAAGCTCGGTCTCTCGGCCTCCGCCATCCTGGCCACCTCCCTCGCC CACCTCGCGCTCCGGTGCGGGCTCCCTGGCTACGCCCGGAGGGTGTTCGACGAAATGCCC CACCGGGATGTGGTCTCCTGGACGTCCCTCATCACCGGCCACGCGCATCAGGGCCTGTAC CAGGATTCACTCGCCCTTCTCCGCCGCATGGTGATATCTGGTGTAGTGCCCAATGGATAT TCCCTGTCAGGTGCATTGCTTGCTTGTGCCGGAATTGGGCCAGGCGCTCTCGCTGCTGGG AAGGAAATACATGCCAGGGTTGTCAAGATGAGTTTGCATGGGTCGGTTGATGCGGTTGTG GAGAATGGGGTTCTCGACATGTACACGAGATGCGGGAAAATCGACTATGCGAGGAAATTG TTTGGGGTGATGCTGGTGAGGGACATTGTTGCATGGAACTCGATGATGGCTGGGTGTCTC AGGAGTGGGCAGGCTGAGGAGGCTCTTGGTTTATTCTCGTCGATGGTGTCTTCTGGGGTT GACGCAGATGGCTTCTCGTTTGCCATATCTGTGGATGCATGTGGGGAGCTAGCATTGTTG AAGCAAGGGATGCAAGCACATGCACGGGTAATTCGCGGTGGATTTGATTCAGATGTGGTC GTCAGGAATTCCTTAGTGGATATGTATGCAAAATGTGGGTGTGTTGATTCAGCAGGGCTT GTCTTTAGGGATGCACTGTCGTCGGATGCTGTTCTTTGGACCACAATGATCTCAGCTTAT GGCAAGTTTGGCCGTGTACATGATGCAATCTGCATGTTTGATAGGATGTCACAATTGGGA ATAAAACGAGATGGTGTCGCATATCTTGCAGTGCTATCAGCTTGTAGCCATAGCGGACTT GTGAAAGAAGGCTGGAACTACTTCAAGTTGATGTTTCATGGTCAGAACTCAGTTAAGATG CAGCCTGAGCACTATGGTTGTATGGCAGATCTCTTATGCAGGAGCGGTTACCTAGAAGAA GCTCTTGATTTCATTACAAATATGCCATTTGAGTCCAGTATTGCTGCTTGGAGTGCTCTA CTCAATTCATGTAGAATCCACGGGAATGCTAAACTTGGTCAACTTGCGGCATCCCGTCTG GTCCAGCTTGATCCAGAGAATCACAGCAACTGGGTTGCTCTATCAAATGTACATGCATCG GAAAGCGATTGGCATGAGACCTGGATGATCAGAGAGAGCATGAGCATAGAGTGTGTGAAG AAAGAGCCTGGATGTAGTTGGGTTGAGTTGCATGATGGAGTCCATGTCTTTCTAATGGCT GACCAATCTCAGCCTGAATTAGTTGATGTATTGCAGACTCTTGATTCACTAAAAGAGGAT ATATATTGGTTGATGCCTACATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Os05t0153400-01
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:5:3083807:3085504:1 gene:Os05g0153400 transcript:Os05t0153400-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os05t0153400-01)
Sequence	MSRRGLPWQSPAGERWDATSLAGALKAAAGVRSATHVMPLYAVLLKLGLSASAILATSLA HLALRCGLPGYARRVFDEMPHRDVVSWTSLITGHAHQGLYQDSLALLRRMVISGVVPNGY SLSGALLACAGIGPGALAAGKEIHARVVKMSLHGSVDAVVENGVLDMYTRCGKIDYARKL FGVMLVRDIVAWNSMMAGCLRSGQAEEALGLFSSMVSSGVDADGFSFAISVDACGELALL KQGMQAHARVIRGGFDSDVVVRNSLVDMYAKCGCVDSAGLVFRDALSSDAVLWTTMISAY GKFGRVHDAICMFDRMSQLGIKRDGVAYLAVLSACSHSGLVKEGWNYFKLMFHGQNSVKM QPEHYGCMADLLCRSGYLEEALDFITNMPFESSIAAWSALLNSCRIHGNAKLGQLAASRL VQLDPENHSNWVALSNVHASESDWHETWMIRESMSIECVKKEPGCSWVELHDGVHVFLMA DQSQPELVDVLQTLDSLKEDIYWLMPT

Transcript Sequence

Transcript ID	Os05t0153400-01
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:5:3083807:3085504:1 gene:Os05g0153400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os05t0153400-01)
Sequence	AGCTGACGTCACGCTGCTCGCGCAGCCGCGGCTATCTCGTCGACTCGTCGCCGGCGACCG CCGCCGCCGCCGCGTAGACGGGTTCCACGGAGAGATCAGCCGCACAGGCTGAGACATACC TGCCGTTGCCGCCTTGCCGGCATGTCACGTCGGGGTCTCCCGTGGCAGAGCCCTGCGGGG GAGCGGTGGGACGCCACCTCCCTCGCCGGCGCCCTGAAGGCCGCCGCCGGCGTGCGCTCG GCGACGCACGTCATGCCACTCTACGCGGTGCTCCTCAAGCTCGGTCTCTCGGCCTCCGCC ATCCTGGCCACCTCCCTCGCCCACCTCGCGCTCCGGTGCGGGCTCCCTGGCTACGCCCGG AGGGTGTTCGACGAAATGCCCCACCGGGATGTGGTCTCCTGGACGTCCCTCATCACCGGC CACGCGCATCAGGGCCTGTACCAGGATTCACTCGCCCTTCTCCGCCGCATGGTGATATCT GGTGTAGTGCCCAATGGATATTCCCTGTCAGGTGCATTGCTTGCTTGTGCCGGAATTGGG CCAGGCGCTCTCGCTGCTGGGAAGGAAATACATGCCAGGGTTGTCAAGATGAGTTTGCAT GGGTCGGTTGATGCGGTTGTGGAGAATGGGGTTCTCGACATGTACACGAGATGCGGGAAA ATCGACTATGCGAGGAAATTGTTTGGGGTGATGCTGGTGAGGGACATTGTTGCATGGAAC TCGATGATGGCTGGGTGTCTCAGGAGTGGGCAGGCTGAGGAGGCTCTTGGTTTATTCTCG TCGATGGTGTCTTCTGGGGTTGACGCAGATGGCTTCTCGTTTGCCATATCTGTGGATGCA TGTGGGGAGCTAGCATTGTTGAAGCAAGGGATGCAAGCACATGCACGGGTAATTCGCGGT GGATTTGATTCAGATGTGGTCGTCAGGAATTCCTTAGTGGATATGTATGCAAAATGTGGG TGTGTTGATTCAGCAGGGCTTGTCTTTAGGGATGCACTGTCGTCGGATGCTGTTCTTTGG ACCACAATGATCTCAGCTTATGGCAAGTTTGGCCGTGTACATGATGCAATCTGCATGTTT GATAGGATGTCACAATTGGGAATAAAACGAGATGGTGTCGCATATCTTGCAGTGCTATCA GCTTGTAGCCATAGCGGACTTGTGAAAGAAGGCTGGAACTACTTCAAGTTGATGTTTCAT GGTCAGAACTCAGTTAAGATGCAGCCTGAGCACTATGGTTGTATGGCAGATCTCTTATGC AGGAGCGGTTACCTAGAAGAAGCTCTTGATTTCATTACAAATATGCCATTTGAGTCCAGT ATTGCTGCTTGGAGTGCTCTACTCAATTCATGTAGAATCCACGGGAATGCTAAACTTGGT CAACTTGCGGCATCCCGTCTGGTCCAGCTTGATCCAGAGAATCACAGCAACTGGGTTGCT CTATCAAATGTACATGCATCGGAAAGCGATTGGCATGAGACCTGGATGATCAGAGAGAGC ATGAGCATAGAGTGTGTGAAGAAAGAGCCTGGATGTAGTTGGGTTGAGTTGCATGATGGA GTCCATGTCTTTCTAATGGCTGACCAATCTCAGCCTGAATTAGTTGATGTATTGCAGACT CTTGATTCACTAAAAGAGGATATATATTGGTTGATGCCTACATGAGGTCCATAAGGACCA CACTGTGGGTAATTTCTT