Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os04t0316800-00
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:4:14492627:14494063:1 gene:Os04g0316800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to OSIGBa0113K06.4 protein. (Os04t0316800-00)
Sequence	ATGCATCTTTGCTTGTCGGAACAAGGATCCCCGCGGACCCAGTCGCCGGCGGCGGTGGAT CCCAGCTTGGACAGATCCGGTGTGGTGCTCGGCGGAATGCCCAAGAAGATGTCAAGGTTG GAGTTGGACGCGGGGGTGTCGCTGTGGGCAGGCCTTCAACCGGACATACTGGGAATCGTG CTCCACTTCCTTCCATGCCTTGCCGACCGTGCGAGGGTGCGCGCGAACGGCCACGTCCTG CCACCGCCGCTGCCCCTGCTGGTGCTTCCTGGTTTCAAGTTCTCGAGCCTATCAGACAAG GGGGATTTCATGCCTGTGCGGTGCGTGCCGGTGCCTAAGGAGGTTGCAGCTGATGATCTC CGATGTGTGGGTTCTTTTCATGGATGGCTTGTAGGTGTGACTCCTAACAAGGATCGCAGC GACGAGTACAACAGAGATGCCGATGGTGACTGCTTCCTGGTGAATGTTTTCTCTCGCAAG GTCATTCGCCTACCGCAGCTGTGCCATATGCGTTACAATTTTCCTGCTTACTCCAGTAAG ACCCTCCGCATCGTCAATGGTTCTGGTGAGGTCCATTTTGGTGTCAATGATATATACACA ATGTCACTATGTAATGTGGCACTATCTGCTTCACCTGAGTCATCCAAGTACATTGTGGCT GCTTCCTCAGACCACAAGGGTGCACCAGTACCAGCTCTCTGGCAGCCTGGGATGATTTCA TGGCAGGTTTGCTCTGGAGTTGAGATTGATGGCCCAAGAGATCTCTCCTTCTACCAGGGG AAGCTTTATATGCTCATGAGGCACAGGACACGCCTATTCACTTGTGAACTTGAGGAGGAT GATCGTGGGTTCATGGTCTCTCGTATTGAGCTCTCTCTCACTGAGCTGCCTCGCAATCAT CCCTACCAGGAAGGTGGTGCAATAAGTTGCAATATGGTTGTGTGGCGTGGAGAGCTATTA TTAATCATCAGACACTACAATGGCGATTACCGTAAGAGACAACTTCATAAAGTTGAAGTG TTTGCACTGGATGTTGACACAAACCCTTATGGACTAACTGAGATTCACAGCTTGAATGGT GACTGTATCTTTGTTGGCTTAGGTGGCTGCAAGTCCTTTCCTGCTGGTCTACATCATGGA GTTGAAGGTGACCATATCTACTTTGTCCCTGATGATTGGAGGCCTTATGATACATTTGTG TATAGCATGAGAGATGGTAAGATGAGGTCCTTTGCCGTCAAACTATTAGCTTCCGAATTT GATGTGGACCAGTTGAGTCGTGATTTCCCGGTGTGGTTACTTCCTACCGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Os04t0316800-00
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:4:14492627:14494063:1 gene:Os04g0316800 transcript:Os04t0316800-00 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to OSIGBa0113K06.4 protein. (Os04t0316800-00)
Sequence	MHLCLSEQGSPRTQSPAAVDPSLDRSGVVLGGMPKKMSRLELDAGVSLWAGLQPDILGIV LHFLPCLADRARVRANGHVLPPPLPLLVLPGFKFSSLSDKGDFMPVRCVPVPKEVAADDL RCVGSFHGWLVGVTPNKDRSDEYNRDADGDCFLVNVFSRKVIRLPQLCHMRYNFPAYSSK TLRIVNGSGEVHFGVNDIYTMSLCNVALSASPESSKYIVAASSDHKGAPVPALWQPGMIS WQVCSGVEIDGPRDLSFYQGKLYMLMRHRTRLFTCELEEDDRGFMVSRIELSLTELPRNH PYQEGGAISCNMVVWRGELLLIIRHYNGDYRKRQLHKVEVFALDVDTNPYGLTEIHSLNG DCIFVGLGGCKSFPAGLHHGVEGDHIYFVPDDWRPYDTFVYSMRDGKMRSFAVKLLASEF DVDQLSRDFPVWLLPTE

Transcript Sequence

Transcript ID	Os04t0316800-00
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:4:14492627:14494063:1 gene:Os04g0316800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to OSIGBa0113K06.4 protein. (Os04t0316800-00)
Sequence	ATGCATCTTTGCTTGTCGGAACAAGGATCCCCGCGGACCCAGTCGCCGGCGGCGGTGGAT CCCAGCTTGGACAGATCCGGTGTGGTGCTCGGCGGAATGCCCAAGAAGATGTCAAGGTTG GAGTTGGACGCGGGGGTGTCGCTGTGGGCAGGCCTTCAACCGGACATACTGGGAATCGTG CTCCACTTCCTTCCATGCCTTGCCGACCGTGCGAGGGTGCGCGCGAACGGCCACGTCCTG CCACCGCCGCTGCCCCTGCTGGTGCTTCCTGGTTTCAAGTTCTCGAGCCTATCAGACAAG GGGGATTTCATGCCTGTGCGGTGCGTGCCGGTGCCTAAGGAGGTTGCAGCTGATGATCTC CGATGTGTGGGTTCTTTTCATGGATGGCTTGTAGGTGTGACTCCTAACAAGGATCGCAGC GACGAGTACAACAGAGATGCCGATGGTGACTGCTTCCTGGTGAATGTTTTCTCTCGCAAG GTCATTCGCCTACCGCAGCTGTGCCATATGCGTTACAATTTTCCTGCTTACTCCAGTAAG ACCCTCCGCATCGTCAATGGTTCTGGTGAGGTCCATTTTGGTGTCAATGATATATACACA ATGTCACTATGTAATGTGGCACTATCTGCTTCACCTGAGTCATCCAAGTACATTGTGGCT GCTTCCTCAGACCACAAGGGTGCACCAGTACCAGCTCTCTGGCAGCCTGGGATGATTTCA TGGCAGGTTTGCTCTGGAGTTGAGATTGATGGCCCAAGAGATCTCTCCTTCTACCAGGGG AAGCTTTATATGCTCATGAGGCACAGGACACGCCTATTCACTTGTGAACTTGAGGAGGAT GATCGTGGGTTCATGGTCTCTCGTATTGAGCTCTCTCTCACTGAGCTGCCTCGCAATCAT CCCTACCAGGAAGGTGGTGCAATAAGTTGCAATATGGTTGTGTGGCGTGGAGAGCTATTA TTAATCATCAGACACTACAATGGCGATTACCGTAAGAGACAACTTCATAAAGTTGAAGTG TTTGCACTGGATGTTGACACAAACCCTTATGGACTAACTGAGATTCACAGCTTGAATGGT GACTGTATCTTTGTTGGCTTAGGTGGCTGCAAGTCCTTTCCTGCTGGTCTACATCATGGA GTTGAAGGTGACCATATCTACTTTGTCCCTGATGATTGGAGGCCTTATGATACATTTGTG TATAGCATGAGAGATGGTAAGATGAGGTCCTTTGCCGTCAAACTATTAGCTTCCGAATTT GATGTGGACCAGTTGAGTCGTGATTTCCCGGTGTGGTTACTTCCTACCGAATGA