Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os03t0849700-01
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:3:35741831:35748174:1 gene:Os03g0849700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os03t0849700-01)
Sequence	ATGTCTGTCATCATCGACGTCCGCAACTGCATCCAACTCCTCCGCTCCTGCAGTGCCGTG GCCGGCCAGCAGCTGCACCAGCTCCTTCTCAAGTCTGGCCATGTCCCATCATCGCTGCCG CCCTCTAACTCCTTGCTCCTCATGTATGCGCGCTGCTCCCCACTCCACCAGCACGACGCC CGCCGCCTGTTTGACGAAATGCCCGTCAAGAACTGCTTCTCCTACAACTCTGTTATCACC TCCCACCTCAATTCCAGAGACCACCATGCAGCGCTTAATATCTTCCGATCCATGCCCGAG AGGAACACCTTCTCATGGAATACAATCATAACTGGCATTGTGTCCACAGGCAATCTCGAC ATGGCCCGTTCACTGCTGATTGAAATGCCTGTCAAGGATCCTGTGGCTTGCAATGCTGTT TTGCATAGGTATGTCCGGCGTGGCCGGGCGGATGAGGCGTTTGCATTACTCAGGACGGTT GGTCAATGCAGTGGTGCAGATGCCTCTTCTCCATGGAATGACCCTTTTGTGCTTGCGACA ATTGTTGGTGCTTGTGCTGATTGGATGAAGTATGATTTTGGGAGGCAGGCTCATGCTCGG ATGGTGGTTTCCAAGATTGAACAGGATTTGGTGTTGAGTTGCGCATTAGTTAACATGTAC TGCAAATGTGGGGATTTGGATTCTGCTCGCTATGTCCTTAATGGTTTAACTCAGGTTGAT GAGTTCTCACTTTCTGCACTCATATATGGCTATGCTTCTTGTGGACATTTGCATGAGGCG ATACGACTTTTTGACAGAAAGGAGGAACCAAGCATTGCTATGTGGAATTCTCTTATCAGT GGCTGTGCATTTGCCTGTTGTGGAAATGATGCTTTTGCTCTTTTTGCAAGGATGATGCGA TCAGATGTGTTACCTGATTCTTCAACTTATGCCAGCATTTTGAATGTATGTGGTTTTTCA GTCATGGTGAATCCTGGGCAACAGATTCATGGGTGTGGTCTAAAATGTGGAGCAGTCAAT GACATAATAGTAGCAAGTGCACTCATTGATTTCTACTCAAAATGTGGCCTCTGGGAGGAT GCTTGCAGAGCTTTTAGAGAGCTTAGGTTTCATGATACCATAGTGCTCAACTCAATGATC ACTGTTTACTCAAACTGTGGGCAGATAGAAGAGGCGAGAAGAATTTTTGATATGATCACT GGTAAGAGTGTGATCTCATGGAATTCTATGGTGGTTGGGTTGAGCCAGAATGGGCATGCT AGGGATGCACTTGGGTTATTCTGTGAGATGCATCGGCTTGGTTTGCGGCTTGACAAGGTT GCTATAGCCAGTGCTCTGAGTGCATCGAGCAGCATTTGCTCTATCAGTTTTGGAGAGCAG ATCTTTTCTCTAGCCACTGTTCTTGGTTTGCAATCTGATCATGTTGTTGCGTCTTCACTC ATTGATCTGTATTGCAAATGTGGAAGCCTAGCAAATGGGTGCAGGATCTTTGAAGAAATC GATAAGCCAGACGAGGTCTTATGGAACTCAATGCTGATTGGTCATGCTTCCAATGGGTAT GGACATGAAGCATTGGAACTCTTGGAGTTGATGAAAACTAAGGGCATAAAACCAAGTGAA CGAACATTTATTGCTGTCCTTTCTGCATGCTGCCACTCTGGACTCGTGAAAGAGGGACTG ACATGGTTTCACCGGATGCAAGCGGACTTCAGTGTGAGTCCATCAGCTGAGCATTACGCA TGTGTGACTGATCTCTTAGTCCGCGCAGGTCGGCTAGAGGAATCAGTTGAATTCATTGAA AATATGCCCTTTGAAGCTGATGCGGTTAGCTGGACAACTGTTATTGGTGGATGCAAAGCT CAGGGCAATGAGGCCATGATGCGGAAGGTGGCGAAGAAGCTGATGGAGATGGAATCGTCA CATCCCAGCTTGTATGTGCAACTGTCCAGTGGGCTTGCTTCTCTAGGGGATTGGACTAAA TCAGCAGAAATAAGGAGTATGATGTATGAGAGAAGAATTACAAAGAATCCTGGTTACAGT TGGATTGACTCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Os03t0849700-01
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:3:35741831:35748174:1 gene:Os03g0849700 transcript:Os03t0849700-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os03t0849700-01)
Sequence	MSVIIDVRNCIQLLRSCSAVAGQQLHQLLLKSGHVPSSLPPSNSLLLMYARCSPLHQHDA RRLFDEMPVKNCFSYNSVITSHLNSRDHHAALNIFRSMPERNTFSWNTIITGIVSTGNLD MARSLLIEMPVKDPVACNAVLHRYVRRGRADEAFALLRTVGQCSGADASSPWNDPFVLAT IVGACADWMKYDFGRQAHARMVVSKIEQDLVLSCALVNMYCKCGDLDSARYVLNGLTQVD EFSLSALIYGYASCGHLHEAIRLFDRKEEPSIAMWNSLISGCAFACCGNDAFALFARMMR SDVLPDSSTYASILNVCGFSVMVNPGQQIHGCGLKCGAVNDIIVASALIDFYSKCGLWED ACRAFRELRFHDTIVLNSMITVYSNCGQIEEARRIFDMITGKSVISWNSMVVGLSQNGHA RDALGLFCEMHRLGLRLDKVAIASALSASSSICSISFGEQIFSLATVLGLQSDHVVASSL IDLYCKCGSLANGCRIFEEIDKPDEVLWNSMLIGHASNGYGHEALELLELMKTKGIKPSE RTFIAVLSACCHSGLVKEGLTWFHRMQADFSVSPSAEHYACVTDLLVRAGRLEESVEFIE NMPFEADAVSWTTVIGGCKAQGNEAMMRKVAKKLMEMESSHPSLYVQLSSGLASLGDWTK SAEIRSMMYERRITKNPGYSWIDS

Transcript Sequence

Transcript ID	Os03t0849700-01
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:3:35741831:35748174:1 gene:Os03g0849700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Hypothetical conserved gene. (Os03t0849700-01)
Sequence	ACCTTCCCTGCTCGGGGAGGTCGGGGTCGCTGGTTGGATCCAAGAAACGGTAGCTTTCGT TGTTGGTTCTTGTTTTGAGGGAATCGTATGCGTGTGCAGAGGAAGGGGATTTCTTCATCT GGACAGTCGAGGAACTAAACACACCCTTAGTGCACTTCCCCACTGCAAGAGTCCATCATA AGTAATGTTTTGTCCTAGGTCCTCCATGGCAGCTATGATCTCGACAAGGTGGTGGCCAGT GGCTAAGGATATGGTGATTCAGTGAAGGCAGAACAACAGCTTGCTTCCAGGGCCTCCTGT CCTGTTCAGTTTCTCCATGTCTGTCATCATCGACGTCCGCAACTGCATCCAACTCCTCCG CTCCTGCAGTGCCGTGGCCGGCCAGCAGCTGCACCAGCTCCTTCTCAAGTCTGGCCATGT CCCATCATCGCTGCCGCCCTCTAACTCCTTGCTCCTCATGTATGCGCGCTGCTCCCCACT CCACCAGCACGACGCCCGCCGCCTGTTTGACGAAATGCCCGTCAAGAACTGCTTCTCCTA CAACTCTGTTATCACCTCCCACCTCAATTCCAGAGACCACCATGCAGCGCTTAATATCTT CCGATCCATGCCCGAGAGGAACACCTTCTCATGGAATACAATCATAACTGGCATTGTGTC CACAGGCAATCTCGACATGGCCCGTTCACTGCTGATTGAAATGCCTGTCAAGGATCCTGT GGCTTGCAATGCTGTTTTGCATAGGTATGTCCGGCGTGGCCGGGCGGATGAGGCGTTTGC ATTACTCAGGACGGTTGGTCAATGCAGTGGTGCAGATGCCTCTTCTCCATGGAATGACCC TTTTGTGCTTGCGACAATTGTTGGTGCTTGTGCTGATTGGATGAAGTATGATTTTGGGAG GCAGGCTCATGCTCGGATGGTGGTTTCCAAGATTGAACAGGATTTGGTGTTGAGTTGCGC ATTAGTTAACATGTACTGCAAATGTGGGGATTTGGATTCTGCTCGCTATGTCCTTAATGG TTTAACTCAGGTTGATGAGTTCTCACTTTCTGCACTCATATATGGCTATGCTTCTTGTGG ACATTTGCATGAGGCGATACGACTTTTTGACAGAAAGGAGGAACCAAGCATTGCTATGTG GAATTCTCTTATCAGTGGCTGTGCATTTGCCTGTTGTGGAAATGATGCTTTTGCTCTTTT TGCAAGGATGATGCGATCAGATGTGTTACCTGATTCTTCAACTTATGCCAGCATTTTGAA TGTATGTGGTTTTTCAGTCATGGTGAATCCTGGGCAACAGATTCATGGGTGTGGTCTAAA ATGTGGAGCAGTCAATGACATAATAGTAGCAAGTGCACTCATTGATTTCTACTCAAAATG TGGCCTCTGGGAGGATGCTTGCAGAGCTTTTAGAGAGCTTAGGTTTCATGATACCATAGT GCTCAACTCAATGATCACTGTTTACTCAAACTGTGGGCAGATAGAAGAGGCGAGAAGAAT TTTTGATATGATCACTGGTAAGAGTGTGATCTCATGGAATTCTATGGTGGTTGGGTTGAG CCAGAATGGGCATGCTAGGGATGCACTTGGGTTATTCTGTGAGATGCATCGGCTTGGTTT GCGGCTTGACAAGGTTGCTATAGCCAGTGCTCTGAGTGCATCGAGCAGCATTTGCTCTAT CAGTTTTGGAGAGCAGATCTTTTCTCTAGCCACTGTTCTTGGTTTGCAATCTGATCATGT TGTTGCGTCTTCACTCATTGATCTGTATTGCAAATGTGGAAGCCTAGCAAATGGGTGCAG GATCTTTGAAGAAATCGATAAGCCAGACGAGGTCTTATGGAACTCAATGCTGATTGGTCA TGCTTCCAATGGGTATGGACATGAAGCATTGGAACTCTTGGAGTTGATGAAAACTAAGGG CATAAAACCAAGTGAACGAACATTTATTGCTGTCCTTTCTGCATGCTGCCACTCTGGACT CGTGAAAGAGGGACTGACATGGTTTCACCGGATGCAAGCGGACTTCAGTGTGAGTCCATC AGCTGAGCATTACGCATGTGTGACTGATCTCTTAGTCCGCGCAGGTCGGCTAGAGGAATC AGTTGAATTCATTGAAAATATGCCCTTTGAAGCTGATGCGGTTAGCTGGACAACTGTTAT TGGTGGATGCAAAGCTCAGGGCAATGAGGCCATGATGCGGAAGGTGGCGAAGAAGCTGAT GGAGATGGAATCGTCACATCCCAGCTTGTATGTGCAACTGTCCAGTGGGCTTGCTTCTCT AGGGGATTGGACTAAATCAGCAGAAATAAGGAGTATGATGTATGAGAGAAGAATTACAAA GAATCCTGGTTACAGTTGGATTGACTCTTAGAAATTGTTGCTCAATCAGTTGATCAGTGG AAAACTGGAATATTTGGCTTCTGTATTTTTGTTGGAGTTGTTTTCCAACCACAAGCTTTA CAACAGCTGAACAGGAAAACTGTTGTCCCTGGATGAGCCAAACATATGCAGAAATGTTAG TTTTCCCATATGTCTGATTATCTCACACATATGTGACATTAAATCGGTTTCCTTCCTCTG TGGCAAGTAACATCGTCCTCCATCCCCAAAGGCTGTGTTCAAGCCCATGCTATGCACAGC TTACTTTTTGATATTTTCCTTCTTACTCAAATTATATCTTGTATACTGAACCCTGTGTTA ATGGTAGCACACTTAGTTACTTCCATGTGTTGTGTTGTCAACCTATTCCTGGCCCCCATG TTGGTGGAAGTGCTGCAGCAAAGGATGTGAACAAGTGGCTTGATGAGATTATTGGAGGCT ATGATTCCTCTATCAGGGAGTTCCATGGAGGAGATGATCAGAAGTTGCTTATTTCACTGC TTAAAATATTGTGCCGACACTATGGAAGCTCCGTTCACCTTTTGGGTCTGATCCATCGCA GGAGGGTATAGCTGGTCCAGAGATGGCAGTGACAAAACTTTTCTCATCTTGTAAGAGCAG TGGTGCTCATAAGGGAGAGTATGGAGCCATTGTCCATTGCATGAAAAACATTCCGTCAGA AAACCAGATTCAGGCTACTGCTAAGGAGGTTCAAAATCCCCTAGTTTCTGGTAGAAGGAA AGAGGCTCTTCAGTGAAGAAAATGGCTTACCACCATTTTGTATCTGGATCACCTTTGAGG ACGTTGTGCCTTCTTATTGCTGGACAACCTGCAGATGTTTTCAATGTTGAGAACCCTACT GTTGATGGCAATTATGGTAATTTGCATTATGGTAAATTATGGTATCAATATACCTCCGGC TAATATTATGACAATTATATC