Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Oryza sativa subsp. japonica) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID	Os02t0738400-02
CDS Infomation	cds chromosome:IRGSP-1.0:2:30823545:30829439:1 gene:Os02g0738400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYTOKININ TOLERANT 1 description:Similar to Histidine kinase. (Os02t0738400-01);Histidine kinase, Cytokinin signaling (Os02t0738400-02)
Sequence	ATGGGGAAGCCGGAGGCGAGGAGTGGGTGGAGGAACGCGGCGGCGGCGGCGTGGGTGCTG GTGGCCGTGGCGTGCGCGGCGTACATGCACTGGCACCTGCGGCGGGAGACCATGGACCGC GCCGAGGAGCGGCTCGTCAGCATGTGCGAGGAGCGGGCGAGGATGCTGCAGGAGCAGTTC GGCGTCACCGTCAACCACGTCCACGCCCTCGCCATCCTCATCTCCACCTTCCATTTCGAG AAGTTCCCGTCCGCCATCGACCAGGATACATTTGCAAAGTACACGGCAAGGACATCGTTT GAGCGCCCACTGCTGAATGGAGTGGCATATGCGCAGCGTATCTTCCATCACGAGAGGGAA ATGTTTGAGAACCAGCAGGGATGGATTATGAAGACGATGAAGCGACAGGCTGCGCCTCCA CAGGATGAGTATGCCCCAGTGATTTTTTCACAGGATACGGTTTCCTACCTTGCACGTATC GACATGATGTCTGGGGAGGAGGACCGGGAAAACATCTTACGTGCAAGGGCTACCGGCAAA GCTGTGTTGACAAACCCATTCAGGTTGCTTGGGTCAAACCACTTGGGGGTAGTTCTCACT TTTGCTGTGTATCGCCCTGGTCTAGCTGCTGATGCATCAGTTGAGGAGCGTGTGGAAGCA ACTGCTGGATATCTTGGTGGAGCTTTTGATGTGGAGTCACTCGTGGAAAATTTGCTGAGT AAACTTGCTGGCAATCAGGATATTGTAGTGAATGTGTATGATGTCACAAATGCTTCTGAA CCTATGGCCATGTATGGTCCTCAAAGTCCAGATGGTAAAGTGTCCCTCTTCCATGTGAGC ACGCTTGACTTTGGTGATCCTTTCAGGGCGCATGAAATGAGGTGCAGGTATAGGCAAAAG CCTCCTCTGCCATGGTCTGCTATCACTAATCCTTTGGGAACTTTTGTTATATGGATGCTT GTGGGGTATATAATTTGTGCCGCATGGTCTCGCTATGATAAAGTTTCAGAGGATTGTAGA AAGATGGAAGAGCTCAAAACTCAAGCGGAAGCTGCTGATGTTGCTAAGTCCCAGTTTCTG GCAACTGTATCCCATGAGATCAGAACACCTATGAATGGCGTCCTTGGAATGCTCGACATG CTCTTGGGGACAGATCTGAGTATGACTCAGAAGGATTATGCTCAGACAGCCCAGATGTGT GGCAGAGCATTGATAACACTGATAAATGATGTACTTGATCGGGCTAAGATTGAAGCAGGG AAATTGGAGCTTGAGGCAGTGCCATTTGACCTGCGGTCTCTCATGGATGATGTGATCTCC TTATTTTCTTCAAAATCAAGAGAGAAGTGCATTGAGCTTGCAGTGTTTGTATGTGATGAT GTTCCAAAAGTTGTTATTGGAGATCCATGGAGATATCGACAAATACTGACAAATTTGGTG GGAAATGCAGTCAAATTCACAGAACGGGGCCATGTATTTGTGCGAGTCTGCCTGGCTGAG AACTCAAAAGTGGAAGCTAATCAAGTCCTTAATGGAACCATGAATGGGAAAGACGGCAAA GTTGAGACTACAGCTAATGGCGCCTTCAATACTTTGAGTGGTTTTCAAGCCGCAGATGAG CGCAATAACTGGGATTATTTTAAGCTGCTGCTATCTGATAAAGAGCCCCATATGGATGAG CTTGAGTGCGACAGATCTTATCAAAATGATTGTGACTGTGTGACCTTGATGATAAGTATT GAGGATACAGGTGTTGGGATCCCATTACATGCACAAGATCGTGTTTTTACGCCTTTCATG CAGGCTGATAGTTCAACTTCAAGGAACTATGGTGGAACTGGCATTGGTTTAAGCATCAGC AAATGTTTAGCTGAACTTATGGGCGGTCAAATAAGTTTCACTAGCCGTCCATTTGTTGGG AGTACATTTACATTCTCAGCTGTCCTCAAGCGCTCATGCAAAGATACTTCAAGTGATTCA AAGAGGAGCTTATCTGAGGCACTACCAACTGCCTTTAAGGGAATGAAGGCTATTTTAGTA GATGGGAGACCTGTACGTGGAGCTGTCACACGATATCACCTTAACAGGTTGGGAATAGTT GTTAAAGTTGTGAATAATTTGAGTATGGGGCTTCAGACTTTAGCTGGACAAAATGGTGTG AAAGAGTCCAGGGAGAAACTGTCTATGCTTTTTATAGAGAGTGACATCTGGAGGCCTGAG ACAGATATCCTATTATTGAATCGTCTGCATGAGCTAAAGAATAATGGTCAGGTGCATGAG TTGCCGAAGCTAGTTCTTTTGGTAACATCAGAAGCTGACAAGGACAGATATGGATCCGCA TTTGATATTGTGATGTATAAACCTATAAGGGCAAGCACAATTGCTTCTTGCCTTCAACAG TTGCTAAAAGTAGTGATGCCTGAAAGGAAAGACAATCAAAATAGGCCCTCATTTCTCCGC AGCTTGCTGATTGGGAAGAATATATTGATTGTAGATGATAATAAAGTCAATCTCAGGGTT GCTGCAGCTGCGCTCAAGAAATATGGTGCCAAAGTTCATTGTGTTGAAAGCGGCAAAGAT GCAGTCTCCTTACTTCAACAACCACACTGCTTTGATGCATGCTTTATGGATGTTCAGATG CCAGAGATGGATGGGTTTGAGGCAACTAGACAAATAAGGCAAATGGAGGTAAAAGCAAAC GAGGAAAGGAAGGCGTTGGATTTAATGGAGGGTTCAACATTCGTCGAGTCCCATTTGCCT GTTCTGGCAATGACCGCGGATGTCATTCAGGCGACATATGAAGAATGTATAAAATCGGGA ATGGATGGTTATGTGTCCAAACCTTTCGACGAGGAGCAGTTATACCAAGCTGTCTCCAGA TTAGTGGTGGGAACGAAGGAATCAGCGGTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Os02t0738400-02
PEP Infomation	pep chromosome:IRGSP-1.0:2:30823545:30829439:1 gene:Os02g0738400 transcript:Os02t0738400-02 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYTOKININ TOLERANT 1 description:Similar to Histidine kinase. (Os02t0738400-01);Histidine kinase, Cytokinin signaling (Os02t0738400-02)
Sequence	MGKPEARSGWRNAAAAAWVLVAVACAAYMHWHLRRETMDRAEERLVSMCEERARMLQEQF GVTVNHVHALAILISTFHFEKFPSAIDQDTFAKYTARTSFERPLLNGVAYAQRIFHHERE MFENQQGWIMKTMKRQAAPPQDEYAPVIFSQDTVSYLARIDMMSGEEDRENILRARATGK AVLTNPFRLLGSNHLGVVLTFAVYRPGLAADASVEERVEATAGYLGGAFDVESLVENLLS KLAGNQDIVVNVYDVTNASEPMAMYGPQSPDGKVSLFHVSTLDFGDPFRAHEMRCRYRQK PPLPWSAITNPLGTFVIWMLVGYIICAAWSRYDKVSEDCRKMEELKTQAEAADVAKSQFL ATVSHEIRTPMNGVLGMLDMLLGTDLSMTQKDYAQTAQMCGRALITLINDVLDRAKIEAG KLELEAVPFDLRSLMDDVISLFSSKSREKCIELAVFVCDDVPKVVIGDPWRYRQILTNLV GNAVKFTERGHVFVRVCLAENSKVEANQVLNGTMNGKDGKVETTANGAFNTLSGFQAADE RNNWDYFKLLLSDKEPHMDELECDRSYQNDCDCVTLMISIEDTGVGIPLHAQDRVFTPFM QADSSTSRNYGGTGIGLSISKCLAELMGGQISFTSRPFVGSTFTFSAVLKRSCKDTSSDS KRSLSEALPTAFKGMKAILVDGRPVRGAVTRYHLNRLGIVVKVVNNLSMGLQTLAGQNGV KESREKLSMLFIESDIWRPETDILLLNRLHELKNNGQVHELPKLVLLVTSEADKDRYGSA FDIVMYKPIRASTIASCLQQLLKVVMPERKDNQNRPSFLRSLLIGKNILIVDDNKVNLRV AAAALKKYGAKVHCVESGKDAVSLLQQPHCFDACFMDVQMPEMDGFEATRQIRQMEVKAN EERKALDLMEGSTFVESHLPVLAMTADVIQATYEECIKSGMDGYVSKPFDEEQLYQAVSR LVVGTKESAV

Transcript Sequence

Transcript ID	Os02t0738400-02
Transcript Infomation	cdna chromosome:IRGSP-1.0:2:30823545:30829439:1 gene:Os02g0738400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYTOKININ TOLERANT 1 description:Similar to Histidine kinase. (Os02t0738400-01);Histidine kinase, Cytokinin signaling (Os02t0738400-02)
Sequence	ATGGGGAAGCCGGAGGCGAGGAGTGGGTGGAGGAACGCGGCGGCGGCGGCGTGGGTGCTG GTGGCCGTGGCGTGCGCGGCGTACATGCACTGGCACCTGCGGCGGGAGACCATGGACCGC GCCGAGGAGCGGCTCGTCAGCATGTGCGAGGAGCGGGCGAGGATGCTGCAGGAGCAGTTC GGCGTCACCGTCAACCACGTCCACGCCCTCGCCATCCTCATCTCCACCTTCCATTTCGAG AAGTTCCCGTCCGCCATCGACCAGGATACATTTGCAAAGTACACGGCAAGGACATCGTTT GAGCGCCCACTGCTGAATGGAGTGGCATATGCGCAGCGTATCTTCCATCACGAGAGGGAA ATGTTTGAGAACCAGCAGGGATGGATTATGAAGACGATGAAGCGACAGGCTGCGCCTCCA CAGGATGAGTATGCCCCAGTGATTTTTTCACAGGATACGGTTTCCTACCTTGCACGTATC GACATGATGTCTGGGGAGGAGGACCGGGAAAACATCTTACGTGCAAGGGCTACCGGCAAA GCTGTGTTGACAAACCCATTCAGGTTGCTTGGGTCAAACCACTTGGGGGTAGTTCTCACT TTTGCTGTGTATCGCCCTGGTCTAGCTGCTGATGCATCAGTTGAGGAGCGTGTGGAAGCA ACTGCTGGATATCTTGGTGGAGCTTTTGATGTGGAGTCACTCGTGGAAAATTTGCTGAGT AAACTTGCTGGCAATCAGGATATTGTAGTGAATGTGTATGATGTCACAAATGCTTCTGAA CCTATGGCCATGTATGGTCCTCAAAGTCCAGATGGTAAAGTGTCCCTCTTCCATGTGAGC ACGCTTGACTTTGGTGATCCTTTCAGGGCGCATGAAATGAGGTGCAGGTATAGGCAAAAG CCTCCTCTGCCATGGTCTGCTATCACTAATCCTTTGGGAACTTTTGTTATATGGATGCTT GTGGGGTATATAATTTGTGCCGCATGGTCTCGCTATGATAAAGTTTCAGAGGATTGTAGA AAGATGGAAGAGCTCAAAACTCAAGCGGAAGCTGCTGATGTTGCTAAGTCCCAGTTTCTG GCAACTGTATCCCATGAGATCAGAACACCTATGAATGGCGTCCTTGGAATGCTCGACATG CTCTTGGGGACAGATCTGAGTATGACTCAGAAGGATTATGCTCAGACAGCCCAGATGTGT GGCAGAGCATTGATAACACTGATAAATGATGTACTTGATCGGGCTAAGATTGAAGCAGGG AAATTGGAGCTTGAGGCAGTGCCATTTGACCTGCGGTCTCTCATGGATGATGTGATCTCC TTATTTTCTTCAAAATCAAGAGAGAAGTGCATTGAGCTTGCAGTGTTTGTATGTGATGAT GTTCCAAAAGTTGTTATTGGAGATCCATGGAGATATCGACAAATACTGACAAATTTGGTG GGAAATGCAGTCAAATTCACAGAACGGGGCCATGTATTTGTGCGAGTCTGCCTGGCTGAG AACTCAAAAGTGGAAGCTAATCAAGTCCTTAATGGAACCATGAATGGGAAAGACGGCAAA GTTGAGACTACAGCTAATGGCGCCTTCAATACTTTGAGTGGTTTTCAAGCCGCAGATGAG CGCAATAACTGGGATTATTTTAAGCTGCTGCTATCTGATAAAGAGCCCCATATGGATGAG CTTGAGTGCGACAGATCTTATCAAAATGATTGTGACTGTGTGACCTTGATGATAAGTATT GAGGATACAGGTGTTGGGATCCCATTACATGCACAAGATCGTGTTTTTACGCCTTTCATG CAGGCTGATAGTTCAACTTCAAGGAACTATGGTGGAACTGGCATTGGTTTAAGCATCAGC AAATGTTTAGCTGAACTTATGGGCGGTCAAATAAGTTTCACTAGCCGTCCATTTGTTGGG AGTACATTTACATTCTCAGCTGTCCTCAAGCGCTCATGCAAAGATACTTCAAGTGATTCA AAGAGGAGCTTATCTGAGGCACTACCAACTGCCTTTAAGGGAATGAAGGCTATTTTAGTA GATGGGAGACCTGTACGTGGAGCTGTCACACGATATCACCTTAACAGGTTGGGAATAGTT GTTAAAGTTGTGAATAATTTGAGTATGGGGCTTCAGACTTTAGCTGGACAAAATGGTGTG AAAGAGTCCAGGGAGAAACTGTCTATGCTTTTTATAGAGAGTGACATCTGGAGGCCTGAG ACAGATATCCTATTATTGAATCGTCTGCATGAGCTAAAGAATAATGGTCAGGTGCATGAG TTGCCGAAGCTAGTTCTTTTGGTAACATCAGAAGCTGACAAGGACAGATATGGATCCGCA TTTGATATTGTGATGTATAAACCTATAAGGGCAAGCACAATTGCTTCTTGCCTTCAACAG TTGCTAAAAGTAGTGATGCCTGAAAGGAAAGACAATCAAAATAGGCCCTCATTTCTCCGC AGCTTGCTGATTGGGAAGAATATATTGATTGTAGATGATAATAAAGTCAATCTCAGGGTT GCTGCAGCTGCGCTCAAGAAATATGGTGCCAAAGTTCATTGTGTTGAAAGCGGCAAAGAT GCAGTCTCCTTACTTCAACAACCACACTGCTTTGATGCATGCTTTATGGATGTTCAGATG CCAGAGATGGATGGGTTTGAGGCAACTAGACAAATAAGGCAAATGGAGGTAAAAGCAAAC GAGGAAAGGAAGGCGTTGGATTTAATGGAGGGTTCAACATTCGTCGAGTCCCATTTGCCT GTTCTGGCAATGACCGCGGATGTCATTCAGGCGACATATGAAGAATGTATAAAATCGGGA ATGGATGGTTATGTGTCCAAACCTTTCGACGAGGAGCAGTTATACCAAGCTGTCTCCAGA TTAGTGGTGGGAACGAAGGAATCAGCGGTATGATGATGGTCTGGCTAGTGGAACAGATCT GATGTGCCATCAGTTGAAAGCATTGCCATCTCGCTGCTGTCAAGCTGACTCTAACTCATA CATACATCTGACATGAGAATTTTTCACCGAGAGTAGATGAAAGGTTGCAAGCACTTTGAG CTAGTGAACTTCGTTCAACCAAGGCAGGTGCATGACAGTTGAGGTTTCTGGTGCAGCTCA AGGGAGTGGAGTGAGTGATAGTAGATAGATCCCTGTAGTTTTGTTTTTCCTTTGCTGTTG ATAGGTAGAGGTGTTGTATGTTCATTCTTTGGAAATATCTCGTCTTTGTGCCATACTGTC AAGTTCCAGAAACCCCTGGGAGGAAAAAAAAAAGTGCTCGACCACCATTTGAGCTGTCT