Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID

Os02t0670700-01

CDS Infomation

cds chromosome:IRGSP-1.0:2:27237052:27241155:-1 gene:Os02g0670700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os02t0670700-01)

Sequence

ATGGTTGATTATTTTAGAGCTGGTTATCCAGAGGAAGTTATTATCTTGTACAAAAGGTTG
AAATTACACCAGATTGGTTTGGATGGGAAAACTATTACTTTTGTTTTGAAAAGCTGCACT
GAGCTTGAGAATCTGTACTTGGGTAAAGGAATGCATGTGGATTCACTTAAATTTGGTCTG
TCTGGGGATAAATTCATCGGTTCCTCCCTCATTGTGTTGTACTCCAAGCTTCATAGGATG
GACGATTCACAGGGAGTGTTTAAAGAGATCATTGACAAGGACGTTGTTGCTTACACTTCG
ATGATCACTGGTTATTCAGAAATTGTGGATTCAGTTGCATGGAATGCATTTGATATTGCC
ATTGATATGCTGCAGGGCAACTTGGAAGTAAACCGTGTGACTATGATAAGCTTACTGCAA
ATAGCTGGGAATTTGGGAGCACTTAAAGAGGGCAAATCACTCCATTGCTATTCCATAAGG
AGAGCACTTGTTGTCTCAGATTATATTCTAGAGACCTGCATTGTGAACTTGTATACTCGA
TGTGGAGCTTATCAATCAGCAGTTGCTACTTTACAGAATTCAAAGGGAACTGCAGCTTCA
TGGAATGCTATGCTTTCTGGTCTTACTAGAGCTGGACAGAGTTTTGATGCAATCCACTAT
TTGTCTGTGATGCTGCATGAGCATAAAATAACTCCAGATTCTGTCACCTTCGCAAACGTG
ATTTCTGCTTGTGTTGAGGTATGCTATTTCGGCTATGCTGCTAGTATTCATACCTACTTA
ATAAGAAGATATATACCTCTGGATGTTGTTTTGGCGACTGCTCTTGTTAAGGTGTACTCC
AAATGCAAAAAAATCACGATATCAAGACATCTCTTTAATCAACTGATTGTTAAAGATGCA
GTCTCCTATAATGCAATGATGTACGGTTACCTACATAACGGCATGGCCAATGAGGCCACC
TCCTTACTCAATTACATGATGGCAGAAGGTATTGTTCCAGATTTTGCAACTGTTCTTAGT
CTGCTTGCTGCTTTTGCTGATCAAAGAGATTTAGTGAGAGGGAGGTGGATCCATGGATTT
GGGATTAGGCATGGGTTTTGTTCGGATGGTGACGTTGAAAATCATATTCTTTATATGTAC
TCAGTTTGCGGAAAACCTGCAGCAGCAAGGGTTATATTTGATTTACTGGAACAGAAAAGC
TTGGTTTCATGGACAGCCATGATGAAGGGTTGCTTACCCTATGGACATGGAGATGAGGTG
GTTCAATTATTTCACTTGATGCAGAAACATGGGGAGAAACCTGATTCCATGTCTCTTGTA
ACTGCTGTTCAAGCTGTCTCTGAGCTTGGCCATCTAAATGGTCTAAAACAAATCCATTGT
TTTGTTTACCGTTCCCTGTTAGAGAAAGATAAGATTACTGCAAATTCATTGATAAGTGCA
TATGCCAAATGTGGAAGACTGGATTTGTCAGTAGGTTTGTTCTTTAGTTTGGAATACAGA
AACTTGGATACTTGGAATGCAATTATCAGTGCTTATGCGATGCATGGATTCTATATTAAT
ATGCTTGAAATGTTTAAGCAAATGGAAGAAGAAAACATTCAGCCTGATGAGTTAACATTC
TCTACTGTGCTTACTGCTTGCAGCCATGCTGGTCTTGTCAAGGATGGTTGGCGTATGTTC
AATTCCATGACCTCAGTATATTCAGTTCTTCCACAGGAAGAGCATTATGGTTGCATGGTT
GATTTATTGGGTCGTGCTGGGCATCTGGAAGATGGATACAAATTTATAAAGCTATCTACC
TTGAAGGATAAATCCACTATATTTTGTGTTTTGATCTCTGCTTGCAGAACGCATAGAAAT
ACACAACTGGCACTTGCTATTAGCAAAGAGCTCCTTGAGCATGGACCACAGAAACCAGGT
ATTTATGCTCTGATTTCAGAAGTGTATGCTCAGGAAGGGCAGTGGAATGAATTTACCAAT
ACAAGGGCCAGAGCTAATTTAAGTGGGTTAAAGAAACATCCTGGTTCTAGTTTCATTGAA
TTAATGGAGCAAGGCATGTGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Os02t0670700-01

PEP Infomation

pep chromosome:IRGSP-1.0:2:27237052:27241155:-1 gene:Os02g0670700 transcript:Os02t0670700-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os02t0670700-01)

Sequence

MVDYFRAGYPEEVIILYKRLKLHQIGLDGKTITFVLKSCTELENLYLGKGMHVDSLKFGL
SGDKFIGSSLIVLYSKLHRMDDSQGVFKEIIDKDVVAYTSMITGYSEIVDSVAWNAFDIA
IDMLQGNLEVNRVTMISLLQIAGNLGALKEGKSLHCYSIRRALVVSDYILETCIVNLYTR
CGAYQSAVATLQNSKGTAASWNAMLSGLTRAGQSFDAIHYLSVMLHEHKITPDSVTFANV
ISACVEVCYFGYAASIHTYLIRRYIPLDVVLATALVKVYSKCKKITISRHLFNQLIVKDA
VSYNAMMYGYLHNGMANEATSLLNYMMAEGIVPDFATVLSLLAAFADQRDLVRGRWIHGF
GIRHGFCSDGDVENHILYMYSVCGKPAAARVIFDLLEQKSLVSWTAMMKGCLPYGHGDEV
VQLFHLMQKHGEKPDSMSLVTAVQAVSELGHLNGLKQIHCFVYRSLLEKDKITANSLISA
YAKCGRLDLSVGLFFSLEYRNLDTWNAIISAYAMHGFYINMLEMFKQMEEENIQPDELTF
STVLTACSHAGLVKDGWRMFNSMTSVYSVLPQEEHYGCMVDLLGRAGHLEDGYKFIKLST
LKDKSTIFCVLISACRTHRNTQLALAISKELLEHGPQKPGIYALISEVYAQEGQWNEFTN
TRARANLSGLKKHPGSSFIELMEQGMC

Transcript Sequence

Transcript ID

Os02t0670700-01

Transcript Infomation

cdna chromosome:IRGSP-1.0:2:27237052:27241155:-1 gene:Os02g0670700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat domain containing protein. (Os02t0670700-01)

Sequence

TCATTTAACTGAACTGTCATCGTATGTCTATGAATTCGGAGTCAATTAGTTACCTATTTT
TGTTTTTCTTGCGTCAACAACCATGATGATGCTACCAATTCTTTTGAGGGGAATTTAGCT
GGAAACACTAGTTCAAAGTTTGATAAAATTGCAGTGCTGAAGCTGCGTTGGAGACTATCA
GCATCCACTGCCGATGCAAATTCATGCTCTAATAAGATACTTAATTTTGACAAGTTTGCT
CCATTGTTCCAAGGCTGTGCAGATATTAGGTCTCTAAAGAAGATCCATTGTCATGTTTTC
ACACATGGATTGTGCTGGGATGTGATTCTTGGCTCTAAGATTGTGAGTTGTTATGCTAAT
TTAGGGGCCCTGTCTGAGTCAAGACTTGTTTTCCAGAAAATTGTAAATGATGAGCTTTCC
CTGTGGAATTCAACCATGGTTGATTATTTTAGAGCTGGTTATCCAGAGGAAGTTATTATC
TTGTACAAAAGGTTGAAATTACACCAGATTGGTTTGGATGGGAAAACTATTACTTTTGTT
TTGAAAAGCTGCACTGAGCTTGAGAATCTGTACTTGGGTAAAGGAATGCATGTGGATTCA
CTTAAATTTGGTCTGTCTGGGGATAAATTCATCGGTTCCTCCCTCATTGTGTTGTACTCC
AAGCTTCATAGGATGGACGATTCACAGGGAGTGTTTAAAGAGATCATTGACAAGGACGTT
GTTGCTTACACTTCGATGATCACTGGTTATTCAGAAATTGTGGATTCAGTTGCATGGAAT
GCATTTGATATTGCCATTGATATGCTGCAGGGCAACTTGGAAGTAAACCGTGTGACTATG
ATAAGCTTACTGCAAATAGCTGGGAATTTGGGAGCACTTAAAGAGGGCAAATCACTCCAT
TGCTATTCCATAAGGAGAGCACTTGTTGTCTCAGATTATATTCTAGAGACCTGCATTGTG
AACTTGTATACTCGATGTGGAGCTTATCAATCAGCAGTTGCTACTTTACAGAATTCAAAG
GGAACTGCAGCTTCATGGAATGCTATGCTTTCTGGTCTTACTAGAGCTGGACAGAGTTTT
GATGCAATCCACTATTTGTCTGTGATGCTGCATGAGCATAAAATAACTCCAGATTCTGTC
ACCTTCGCAAACGTGATTTCTGCTTGTGTTGAGGTATGCTATTTCGGCTATGCTGCTAGT
ATTCATACCTACTTAATAAGAAGATATATACCTCTGGATGTTGTTTTGGCGACTGCTCTT
GTTAAGGTGTACTCCAAATGCAAAAAAATCACGATATCAAGACATCTCTTTAATCAACTG
ATTGTTAAAGATGCAGTCTCCTATAATGCAATGATGTACGGTTACCTACATAACGGCATG
GCCAATGAGGCCACCTCCTTACTCAATTACATGATGGCAGAAGGTATTGTTCCAGATTTT
GCAACTGTTCTTAGTCTGCTTGCTGCTTTTGCTGATCAAAGAGATTTAGTGAGAGGGAGG
TGGATCCATGGATTTGGGATTAGGCATGGGTTTTGTTCGGATGGTGACGTTGAAAATCAT
ATTCTTTATATGTACTCAGTTTGCGGAAAACCTGCAGCAGCAAGGGTTATATTTGATTTA
CTGGAACAGAAAAGCTTGGTTTCATGGACAGCCATGATGAAGGGTTGCTTACCCTATGGA
CATGGAGATGAGGTGGTTCAATTATTTCACTTGATGCAGAAACATGGGGAGAAACCTGAT
TCCATGTCTCTTGTAACTGCTGTTCAAGCTGTCTCTGAGCTTGGCCATCTAAATGGTCTA
AAACAAATCCATTGTTTTGTTTACCGTTCCCTGTTAGAGAAAGATAAGATTACTGCAAAT
TCATTGATAAGTGCATATGCCAAATGTGGAAGACTGGATTTGTCAGTAGGTTTGTTCTTT
AGTTTGGAATACAGAAACTTGGATACTTGGAATGCAATTATCAGTGCTTATGCGATGCAT
GGATTCTATATTAATATGCTTGAAATGTTTAAGCAAATGGAAGAAGAAAACATTCAGCCT
GATGAGTTAACATTCTCTACTGTGCTTACTGCTTGCAGCCATGCTGGTCTTGTCAAGGAT
GGTTGGCGTATGTTCAATTCCATGACCTCAGTATATTCAGTTCTTCCACAGGAAGAGCAT
TATGGTTGCATGGTTGATTTATTGGGTCGTGCTGGGCATCTGGAAGATGGATACAAATTT
ATAAAGCTATCTACCTTGAAGGATAAATCCACTATATTTTGTGTTTTGATCTCTGCTTGC
AGAACGCATAGAAATACACAACTGGCACTTGCTATTAGCAAAGAGCTCCTTGAGCATGGA
CCACAGAAACCAGGTATTTATGCTCTGATTTCAGAAGTGTATGCTCAGGAAGGGCAGTGG
AATGAATTTACCAATACAAGGGCCAGAGCTAATTTAAGTGGGTTAAAGAAACATCCTGGT
TCTAGTTTCATTGAATTAATGGAGCAAGGCATGTGTTAGCGAAGAGCCTGCGGACGGCAT
GCTACTCTTTATAGAATGGACTCCTCCCTTTGCATGAAGAACAGAAGCGCACAACTGCCC
ATCTCGCATCTCTCTCCTCTCAAATCCTTCTCAAATTGGCCTGAAATCAAAGGTTTTTCC
GTGGGACGTGTGGACATCGTCTAGGAAGAATCCTTGCATTGGAGGGAAAAGAACAAGTAA
TCCAACATGCTTCATCCTATATAAGATGCCTGACTGGAATCGAGAACTGATGCTTGCATG
CAAGCAGCAAAATCATTGAAGATTGTTCAGGCCATCACTTTGCTATCAGGTTACTTAGCC
GAGAGCAATTGGGCAATGGTTCAAGAAATGGGAGAGAAGACACCACAATGGTTCCTTCGC
TATGGCCAGTTCTCCACGTGCAGCAAGTATAACTTTAAAAAGAACAGCAGCCAGGAATAC
ATTTGCCATAATATTGAGGAGATTGGAGGTACTAATGCTGCCACATTGGAGATAAACAAC
TCTTCAAGTTGGGGACTGGGATTCTTGGGACTGGACAGAGAAGAACATGTTTGATCTTGA
GGAGCTTGATCGCAGTGACGTAGTCAGCAACCTCGAGTGTCATCTGCTATATTCTCATCG
CCCAACTTAAGATCCAAGGAGAAGGATTGCTCTAAATAATGTACTTACAATATTATCTAA
AAGAATATATCTAGTTATTAGGGCCGTATGCATTGCTTGATGCATATGCTGGAGAATTTT
TTACTCTACTATCTTAAAAGGTATGTATGGATACTTTTGATTAGTTTAGGTTGGTTATAT
GCATTTAGTGAGGAATTTACTTTT