Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Oryza sativa

CDS Sequence

CDS ID

Os01t0771900-01

CDS Infomation

cds chromosome:IRGSP-1.0:1:32580716:32586143:-1 gene:Os01g0771900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Exo-beta-glucanase. (Os01t0771900-01)

Sequence

ATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACG
GGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAG
GACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGT
GGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGT
GGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTC
CAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTT
CATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCT
ACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCA
ACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGC
CGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATA
CTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGG
AAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGA
ATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCA
TATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAAT
GGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCAT
TTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGAT
GCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTG
CCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACATCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATC
AATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGC
CTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCAC
AGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCT
CCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGC
CATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGT
GGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCA
ACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCA
TTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAA
CTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGT
GCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAA
GCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTT
GGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTG
CCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACA
ATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGG
ATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATA
GGTATATTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Os01t0771900-01

PEP Infomation

pep chromosome:IRGSP-1.0:1:32580716:32586143:-1 gene:Os01g0771900 transcript:Os01t0771900-01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Exo-beta-glucanase. (Os01t0771900-01)

Sequence

MICPKISLACVLLLLWFTSTGDAAYMKYLDPKQPTNTRIKDLISRMTLAEKIGQMTQIER
GVASADVMKNYFIGSVLSGGGSVPAPQATPAVWVNMVNEFQKGALSTRLGIPMIYGIDAV
HGNNNVYNATLFPHNIGLGATRDPDLVRRIGEATALEVRATGIPYTFAPCIAVCRDPRWG
RCYESYSEDHRVVQQMTDIILGLQGDIPINHTKGVPYIAGKDKVAACAKHFVGDGGTHNG
INENNTITDEHGLLGIHMPPYYDSIIKGVATVMVSYSSLNGVKMHANHDLVTGYLKSKLH
FRGFVISDWLGIDRITSPPDANYTYSVQAGINAGIDMVMVPFNYTQYIDDVTSLVKKGII
NMSRIDDAVRRILRVKFIMGLFENPLADLSFADQLGKKEHRDLAREAVRKSLVLLKNGNS
PNQQFLPLPKKARSILVAGSHASNLGYQCGGWSIEWIGGSGDITVGTTILEAIKSTVADS
THVVYSENPDESFMKNNDFSFAIVVVGERTYAETTGDDPELTILDPGTDTIRTVCSTAKC
AVVIISGRPVVIEPYLPMMEALVAAWLPGTEGQGVADVLFGDYGFTGKLPRTWFKSVDQL
PMNVGDLHYDPLFPFGFGLTINSSQPGFSGADRLRDRNGGMIYVVLSLVLSVILMHASGI
GIF

Transcript Sequence

Transcript ID

Os01t0771900-01

Transcript Infomation

cdna chromosome:IRGSP-1.0:1:32580716:32586143:-1 gene:Os01g0771900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Similar to Exo-beta-glucanase. (Os01t0771900-01)

Sequence

GGTGCGCGTTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCT
CTCCCTGAGCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAG
CAGCTCAGGCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTT
TCGCTGCTCCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGA
TTATTTCCACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAG
AATTCGGGAGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCAT
GCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGG
ATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAG
AAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAA
ACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTC
CTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAG
GAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCA
CCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGA
TCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCAT
GTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACC
ACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAA
ATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGC
ACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATG
AACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTG
CTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATC
TGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGC
TAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTG
GAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATG
ATGTGACATCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCA
GGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTA
GCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGA
AATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAA
AGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTG
GCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTC
TTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTG
ATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAA
CATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACA
CAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTG
TTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAA
CAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCC
CACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATG
ATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTG
GTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTAC
TGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTC
CTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGT
ACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGT
CAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAAT
AGAGCATTTTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGG
CCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATT
AAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTG