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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g099840.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K338_CYNCS)

Sequence

ATGCTTAAGCTCCATCGTGCTTTCAAATTTGCCGGCACCGGTAATCAACATTTACTCTGC
AAATTTTTCCGTTCAACTCCATTTCTACACCAAGAACAACTACTCAGTTCAATCAACAAT
GAAAATCCCACAGATAGTCCATCCCAAAATCTTGTAGAACAGCTCCGGCAGCTTCGGATT
CTAATTCAACAACGTCGTATGGAAAATGCCAAAGGAATCTTGGGTACCCTTATTCATACA
AGTTCAGTTTCTCAACTCTACTCTCTCTTTTCACCTTCCCCTGCAAAACCCCTTCTCTCA
GATTTGCTATTTTCACTGTATTTAGAGTCGAAACTCATTAACCAAGCTGAAGAGCTTTAT
TCATTGATAAGGGAAGAGAAAAAGTTTCCATCTTTATCAGCTATAAATGTGTTTCTTGAA
TCTTTGAATAGTTTAAGGAAGTATAAAAAGACCCTTGAAGTTTTCTCTGATGTAATGAAT
TGGGGTATAAGGGTTGATAAGGCTAGTTATGGAAAAGCTATACTATCGGCCGTGAAAATT
GGGGATTTGGGTAAAGCTTTGGAGCTGTTGGATTGTATGAGAAGTGGTAAGGTGGGTATG
GATAAGTTTGTGTATAATGTAGTGATGGGTGGGTTATGTAAAGAGAAGAGAGTTGTGGAA
GCGCGGAAACTGTTTGATGAAATGCTTGAGAGAAGAGTGGCGCGGAGTATGGTGACGTAT
AATATTCTTATGGATGGTTATTGTAAGATGGGGAAGGTAGAGGAGGCTTTTGAGTTGAGG
GAAACGATGAAGAATGATAATGTGGAGCCTAATATTGTGACGTTTAATACGTTGCTTAGT
GGACTTTGTAAGTCCGGGAAGATGGAGGAAGCTAATTGCATAGTGGAGGAAATGAAGAGT
TACGGATTTGTACCCGATGGGTTTACTTTTAGTATACTTTTTGATGGTCTTTCGCGATCT
GATGATGTTAATTCCTCTTTAGCGTTGTATGAAGAAGTCGTTAAGACAGGGGTGAAGTTG
AATGAGTATACGAGTAGTGTTTTATTGAATGGACTGTGCAAGAAAGGGAAGACGGATAAG
GCTGCAGAGATTTTGAAGAAGATGCTGGGAAATGGGCTTACTCCTACAGATGTGTTGTTT
AATACCATTTTGAGTGGCTATTGCAAAGAGGGCAATATGGAGAAGGCTTATTTAACTATT
GATGAAATGGAGATTTCTGGGGTGAAGCCGAGTTGTGTCACATTTAATACTCTGATCACG
AAATTCTGTGAATTGGGTATGATGGAAGAGGCAAACAAGTGGTTAAGGAAAATGCTTGAG
AAGTCAGTTTCCCCTAATGTGCAGACGTATAACATCTTAATTGACGGATATGGGCGCAAG
CAGGAATTCGTGAGGTGTTTTGAGATTCTCGAGGAGATGGAAAATAACGGATTGAATCCT
AATGTAATTACCTATGGTTCTCTAATCAATTCTTTGTGCAAGGATGGTAGGCTTCTTGAA
GCTGATGTAGTCCTAAGTGATATGATCAGTAGAGGGGTTAAACCAAATGCGCAGGTCTAT
AATATGCTTATAGATGGACATTGTATGAGAGGAAGGATGACTGATGCTTTTAGATGCTTG
GAGAAGATGCTACAAAGTGATGCGGAAACAACACTCGTTACATACAATACTCTATTAAAT
GGGCTTTGCAAAAAGGGTAAGACCAAAGAAGCTGAGGAGTTGGTCGCGGATATTCAACTC
AAAGGTTTCGTTCCAGATGTTATCACATACAATTCTTTAATCTCTGCGTATTCAGATGCA
CGGGACAGTGAAAAGTGTTATGAAATGTATGAGAAGATGAAAACCTCTGGCATAAAACCT
ACAATCAACACAATTCATCCTCTAATTAGAGTGTCCAAAGAGGGAAAGAATGGACTGGTG
TCAATTGACAAAATTGTTGAAGAAATGTCCCAGATGGATCTTTCTCCTGACCGAGTTGTA
TATAACGAGCTCGTCCATTGCTATGCTCTACACGGAGAAGTTCAAAAGTCACTTGCTATG
CACCAAGAGATGGTGGAACGAGGAATTCCTTCTGACAAAAGGACATACAATAGCTTGATT
ATGGTGCATTTGAAAGAGGGAAGATGTCAAGAAGCCAAGAATTTTGTTGATCAGATGAAG
GCTAACAGTATCGTTCCGAGTGATGAAACTTATAATATTTTGGTTGAAGGGCATTGCAAG
CTTAAAGATTTTTCCGGTGCATACATTTGGTACAGAGAGATGGTTGACAATGGTTATACC
CCACCAGCCAATATTTGCGAGGAGTTATTATCTGGTCTTCTAGAGGAAGGAAGATTGGAA
GAGACACAGAGAAATGAGTTCTCAAGGAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g099840.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K338_CYNCS)

Sequence

MLKLHRAFKFAGTGNQHLLCKFFRSTPFLHQEQLLSSINNENPTDSPSQNLVEQLRQLRI
LIQQRRMENAKGILGTLIHTSSVSQLYSLFSPSPAKPLLSDLLFSLYLESKLINQAEELY
SLIREEKKFPSLSAINVFLESLNSLRKYKKTLEVFSDVMNWGIRVDKASYGKAILSAVKI
GDLGKALELLDCMRSGKVGMDKFVYNVVMGGLCKEKRVVEARKLFDEMLERRVARSMVTY
NILMDGYCKMGKVEEAFELRETMKNDNVEPNIVTFNTLLSGLCKSGKMEEANCIVEEMKS
YGFVPDGFTFSILFDGLSRSDDVNSSLALYEEVVKTGVKLNEYTSSVLLNGLCKKGKTDK
AAEILKKMLGNGLTPTDVLFNTILSGYCKEGNMEKAYLTIDEMEISGVKPSCVTFNTLIT
KFCELGMMEEANKWLRKMLEKSVSPNVQTYNILIDGYGRKQEFVRCFEILEEMENNGLNP
NVITYGSLINSLCKDGRLLEADVVLSDMISRGVKPNAQVYNMLIDGHCMRGRMTDAFRCL
EKMLQSDAETTLVTYNTLLNGLCKKGKTKEAEELVADIQLKGFVPDVITYNSLISAYSDA
RDSEKCYEMYEKMKTSGIKPTINTIHPLIRVSKEGKNGLVSIDKIVEEMSQMDLSPDRVV
YNELVHCYALHGEVQKSLAMHQEMVERGIPSDKRTYNSLIMVHLKEGRCQEAKNFVDQMK
ANSIVPSDETYNILVEGHCKLKDFSGAYIWYREMVDNGYTPPANICEELLSGLLEEGRLE
ETQRNEFSRN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g099840.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K338_CYNCS)

Sequence

ATGCTTAAGCTCCATCGTGCTTTCAAATTTGCCGGCACCGGTAATCAACATTTACTCTGC
AAATTTTTCCGTTCAACTCCATTTCTACACCAAGAACAACTACTCAGTTCAATCAACAAT
GAAAATCCCACAGATAGTCCATCCCAAAATCTTGTAGAACAGCTCCGGCAGCTTCGGATT
CTAATTCAACAACGTCGTATGGAAAATGCCAAAGGAATCTTGGGTACCCTTATTCATACA
AGTTCAGTTTCTCAACTCTACTCTCTCTTTTCACCTTCCCCTGCAAAACCCCTTCTCTCA
GATTTGCTATTTTCACTGTATTTAGAGTCGAAACTCATTAACCAAGCTGAAGAGCTTTAT
TCATTGATAAGGGAAGAGAAAAAGTTTCCATCTTTATCAGCTATAAATGTGTTTCTTGAA
TCTTTGAATAGTTTAAGGAAGTATAAAAAGACCCTTGAAGTTTTCTCTGATGTAATGAAT
TGGGGTATAAGGGTTGATAAGGCTAGTTATGGAAAAGCTATACTATCGGCCGTGAAAATT
GGGGATTTGGGTAAAGCTTTGGAGCTGTTGGATTGTATGAGAAGTGGTAAGGTGGGTATG
GATAAGTTTGTGTATAATGTAGTGATGGGTGGGTTATGTAAAGAGAAGAGAGTTGTGGAA
GCGCGGAAACTGTTTGATGAAATGCTTGAGAGAAGAGTGGCGCGGAGTATGGTGACGTAT
AATATTCTTATGGATGGTTATTGTAAGATGGGGAAGGTAGAGGAGGCTTTTGAGTTGAGG
GAAACGATGAAGAATGATAATGTGGAGCCTAATATTGTGACGTTTAATACGTTGCTTAGT
GGACTTTGTAAGTCCGGGAAGATGGAGGAAGCTAATTGCATAGTGGAGGAAATGAAGAGT
TACGGATTTGTACCCGATGGGTTTACTTTTAGTATACTTTTTGATGGTCTTTCGCGATCT
GATGATGTTAATTCCTCTTTAGCGTTGTATGAAGAAGTCGTTAAGACAGGGGTGAAGTTG
AATGAGTATACGAGTAGTGTTTTATTGAATGGACTGTGCAAGAAAGGGAAGACGGATAAG
GCTGCAGAGATTTTGAAGAAGATGCTGGGAAATGGGCTTACTCCTACAGATGTGTTGTTT
AATACCATTTTGAGTGGCTATTGCAAAGAGGGCAATATGGAGAAGGCTTATTTAACTATT
GATGAAATGGAGATTTCTGGGGTGAAGCCGAGTTGTGTCACATTTAATACTCTGATCACG
AAATTCTGTGAATTGGGTATGATGGAAGAGGCAAACAAGTGGTTAAGGAAAATGCTTGAG
AAGTCAGTTTCCCCTAATGTGCAGACGTATAACATCTTAATTGACGGATATGGGCGCAAG
CAGGAATTCGTGAGGTGTTTTGAGATTCTCGAGGAGATGGAAAATAACGGATTGAATCCT
AATGTAATTACCTATGGTTCTCTAATCAATTCTTTGTGCAAGGATGGTAGGCTTCTTGAA
GCTGATGTAGTCCTAAGTGATATGATCAGTAGAGGGGTTAAACCAAATGCGCAGGTCTAT
AATATGCTTATAGATGGACATTGTATGAGAGGAAGGATGACTGATGCTTTTAGATGCTTG
GAGAAGATGCTACAAAGTGATGCGGAAACAACACTCGTTACATACAATACTCTATTAAAT
GGGCTTTGCAAAAAGGGTAAGACCAAAGAAGCTGAGGAGTTGGTCGCGGATATTCAACTC
AAAGGTTTCGTTCCAGATGTTATCACATACAATTCTTTAATCTCTGCGTATTCAGATGCA
CGGGACAGTGAAAAGTGTTATGAAATGTATGAGAAGATGAAAACCTCTGGCATAAAACCT
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TCAATTGACAAAATTGTTGAAGAAATGTCCCAGATGGATCTTTCTCCTGACCGAGTTGTA
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CCACCAGCCAATATTTGCGAGGAGTTATTATCTGGTCTTCTAGAGGAAGGAAGATTGGAA
GAGACACAGAGAAATGAGTTCTCAAGGAATTGA