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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g099620.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JVA8_CYNCS)

Sequence

ATGTTTACCCGCCGTCTAACTGCTCAAAATTTGTGTTCATTTCACTATGCACACCAACTG
TTTGATACAATTACTAAACCAGCTCTTATCTCCATTCACCATTCCATGCTCAATTATATA
CAGCAAAACCGCAAAATTGAAGCTTTTAAGCTCTTCAAGAATCAGCTACAAATGGGTATA
TCAGAAATTGATGAAGTTGTTGTAGCTTTAGCTCTAAAGGGTTGTCGAGAAGATGTAAAT
CTTGGAACTCAAGTTCATAGCTTGGCGATAAGGAGTGGTTTCATTGAGCATGTAACTGTT
CCAAATTCATTGATGAGTATGTATAGTAAAACTGGAAACTTTAATAATGCTATGTGTGTG
TTTGATGGCTTGAAGTTCCCAGATAGAGTTTCATATAATACCCTGCTTTCGGGGTTCGAA
AATAGTAAGGAGGCCTTGTGTTTTGTTCATTGGATGCATTCCGTTGGGGTTGTTTTCGAT
GCTGTAAGTTATACTACTGCTATTAGTCATTGTACAGATGAAGAGGATATTCTTGTTGGT
AGTCAGTTGCATTCTCTTGTGATGAGGTTTGGAGTTGATAACGATGTTTTCGTTGGAAAT
GCACTTGTTACTATGTATTCAAAGTGTGGTTATATAGTAGAAGGTGAAAGAGTGTTTCTT
GAAATGTCGTGTAAGGATTTGGTTTCGTGGAATGCATTGCTCTCGGGGTATGCACAGGAA
GGGGGTTATTCATGGGAAGCTGCCTCGGGATTTAGGGAAATGATGAGGGAAGGGGTGAAA
CCTGATCATGTGTCGTTTACTAGTGCTGTATCTGCTTGTGGACAGGAGATGTGTTTGGAG
CTTGCGAAGCAGATACATGGTTTGGTCATTAAAATGGCGTATGGTACTCATGTTTCGGTG
TGTAATGTTTTGATATCATTGTATTACAAGTGCGATGTGACTGAAGATGCGGACAAGGTT
TTCCAAAGTATGAATGAACGTAACGTTGTGTCTTGGACAACAATGCTTTCCATGAATAAT
GAGAATGTTATATCTATTTTCAATGGGATGCGGAGAGATGGGGTTTACCCCAATCACGTT
ACGTTTGTTGGATTAGTTCATTCTATAACTGTCAAGAATTCGTTGACAGAAGGCAAAATG
GTTCACGGATTTTGTTTAAAGACAAACTTCTTCTCTGAACTGAATGTTGCTAATAGCTTC
GTTACCATGTATGCTAAGTTTGAATTAATGGAAGACGTGTTAAAGGTTTTTGAAGAGCTC
GACCAGAGAGATCTCATATCATGGAACGCTTTAATTTCTGGATATGCTCAAAATGGAATG
TCTCGAGAAGCTTTACAAACATTCTTGTCAGCGTCAATGGAGTTACCACCAAATGAATAC
ACGTTTGGCAGTGTCTTGAGCGCAATTGCCTCATCTGAGTGTATTTCATTGAAGCATGGC
CAGCGATGCCATGCTTGTTTGATAAAGCGGGGATTAAACAGCAATCCAATTGTTTCAGGT
GCTCTCCTTGACATGTACGCAAAACGTGGGAGTATCTCTGAATCTCAAGGAGTTTTCAAT
GAGGTCTCAGACAGGAGTCAAGTTTCATGGACTGCGATTATATCTGCTCATTCAAGGCAT
GGTGATTATGAATCAGTTATGGCTTTGTTTGAGGAGATGAAGAAGAAAGGTGTGAGTCCT
GACTCAATAACGTTTCTTTCTATACTAACAGCATGTGGTCGAAAAGGAATGGTTGATACG
GGAATAGATATCTTCAATTCCATGGTTAGAGATTACTCCATCGAACCATCTTCAGAGCAC
TACGCGTGTATGGTGGACATGTTTGGTCGGGCAGGGAGGCTACAGGAAGCTGAATTTTTC
CTGGCTCAGATTCCCGGAGGACCTGGATTATCTGTGCTGCAAAGCTTACTTGGTGCTTGT
AGGATTTACGGAAATGTTGACATGGCAACAAGAGTAGCCAATACATTGATCGCGTTAGAA
CCAGAGCAGTCAGGCTCATATGTCTTGATGTCGAATTTGTTTGCAGAGAAGGGGCAGTGG
GATGAGGTAGCGAACATCAGAAAAGGAATGCGAGACAAGGGAGTGAAGAAAGAGATAGGA
TTCAGCTGGGTAGATGTAGGTAGCATTGAGCATTCTTTAAATTTGCACGGATTTTCATCG
GATGACAAGTCTCACCCGCGGACTGAGGAGATATATTGGATGGCGGAATGTATAGGTTCA
GAGCTGAAACATTTGGAGCACGACAAAGAAGAAAGTGAGTTCGTGACATTAGCCTATATC
ATATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g099620.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JVA8_CYNCS)

Sequence

MFTRRLTAQNLCSFHYAHQLFDTITKPALISIHHSMLNYIQQNRKIEAFKLFKNQLQMGI
SEIDEVVVALALKGCREDVNLGTQVHSLAIRSGFIEHVTVPNSLMSMYSKTGNFNNAMCV
FDGLKFPDRVSYNTLLSGFENSKEALCFVHWMHSVGVVFDAVSYTTAISHCTDEEDILVG
SQLHSLVMRFGVDNDVFVGNALVTMYSKCGYIVEGERVFLEMSCKDLVSWNALLSGYAQE
GGYSWEAASGFREMMREGVKPDHVSFTSAVSACGQEMCLELAKQIHGLVIKMAYGTHVSV
CNVLISLYYKCDVTEDADKVFQSMNERNVVSWTTMLSMNNENVISIFNGMRRDGVYPNHV
TFVGLVHSITVKNSLTEGKMVHGFCLKTNFFSELNVANSFVTMYAKFELMEDVLKVFEEL
DQRDLISWNALISGYAQNGMSREALQTFLSASMELPPNEYTFGSVLSAIASSECISLKHG
QRCHACLIKRGLNSNPIVSGALLDMYAKRGSISESQGVFNEVSDRSQVSWTAIISAHSRH
GDYESVMALFEEMKKKGVSPDSITFLSILTACGRKGMVDTGIDIFNSMVRDYSIEPSSEH
YACMVDMFGRAGRLQEAEFFLAQIPGGPGLSVLQSLLGACRIYGNVDMATRVANTLIALE
PEQSGSYVLMSNLFAEKGQWDEVANIRKGMRDKGVKKEIGFSWVDVGSIEHSLNLHGFSS
DDKSHPRTEEIYWMAECIGSELKHLEHDKEESEFVTLAYII*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g099620.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JVA8_CYNCS)

Sequence

ATGTTTACCCGCCGTCTAACTGCTCAAAATTTGTGTTCATTTCACTATGCACACCAACTG
TTTGATACAATTACTAAACCAGCTCTTATCTCCATTCACCATTCCATGCTCAATTATATA
CAGCAAAACCGCAAAATTGAAGCTTTTAAGCTCTTCAAGAATCAGCTACAAATGGGTATA
TCAGAAATTGATGAAGTTGTTGTAGCTTTAGCTCTAAAGGGTTGTCGAGAAGATGTAAAT
CTTGGAACTCAAGTTCATAGCTTGGCGATAAGGAGTGGTTTCATTGAGCATGTAACTGTT
CCAAATTCATTGATGAGTATGTATAGTAAAACTGGAAACTTTAATAATGCTATGTGTGTG
TTTGATGGCTTGAAGTTCCCAGATAGAGTTTCATATAATACCCTGCTTTCGGGGTTCGAA
AATAGTAAGGAGGCCTTGTGTTTTGTTCATTGGATGCATTCCGTTGGGGTTGTTTTCGAT
GCTGTAAGTTATACTACTGCTATTAGTCATTGTACAGATGAAGAGGATATTCTTGTTGGT
AGTCAGTTGCATTCTCTTGTGATGAGGTTTGGAGTTGATAACGATGTTTTCGTTGGAAAT
GCACTTGTTACTATGTATTCAAAGTGTGGTTATATAGTAGAAGGTGAAAGAGTGTTTCTT
GAAATGTCGTGTAAGGATTTGGTTTCGTGGAATGCATTGCTCTCGGGGTATGCACAGGAA
GGGGGTTATTCATGGGAAGCTGCCTCGGGATTTAGGGAAATGATGAGGGAAGGGGTGAAA
CCTGATCATGTGTCGTTTACTAGTGCTGTATCTGCTTGTGGACAGGAGATGTGTTTGGAG
CTTGCGAAGCAGATACATGGTTTGGTCATTAAAATGGCGTATGGTACTCATGTTTCGGTG
TGTAATGTTTTGATATCATTGTATTACAAGTGCGATGTGACTGAAGATGCGGACAAGGTT
TTCCAAAGTATGAATGAACGTAACGTTGTGTCTTGGACAACAATGCTTTCCATGAATAAT
GAGAATGTTATATCTATTTTCAATGGGATGCGGAGAGATGGGGTTTACCCCAATCACGTT
ACGTTTGTTGGATTAGTTCATTCTATAACTGTCAAGAATTCGTTGACAGAAGGCAAAATG
GTTCACGGATTTTGTTTAAAGACAAACTTCTTCTCTGAACTGAATGTTGCTAATAGCTTC
GTTACCATGTATGCTAAGTTTGAATTAATGGAAGACGTGTTAAAGGTTTTTGAAGAGCTC
GACCAGAGAGATCTCATATCATGGAACGCTTTAATTTCTGGATATGCTCAAAATGGAATG
TCTCGAGAAGCTTTACAAACATTCTTGTCAGCGTCAATGGAGTTACCACCAAATGAATAC
ACGTTTGGCAGTGTCTTGAGCGCAATTGCCTCATCTGAGTGTATTTCATTGAAGCATGGC
CAGCGATGCCATGCTTGTTTGATAAAGCGGGGATTAAACAGCAATCCAATTGTTTCAGGT
GCTCTCCTTGACATGTACGCAAAACGTGGGAGTATCTCTGAATCTCAAGGAGTTTTCAAT
GAGGTCTCAGACAGGAGTCAAGTTTCATGGACTGCGATTATATCTGCTCATTCAAGGCAT
GGTGATTATGAATCAGTTATGGCTTTGTTTGAGGAGATGAAGAAGAAAGGTGTGAGTCCT
GACTCAATAACGTTTCTTTCTATACTAACAGCATGTGGTCGAAAAGGAATGGTTGATACG
GGAATAGATATCTTCAATTCCATGGTTAGAGATTACTCCATCGAACCATCTTCAGAGCAC
TACGCGTGTATGGTGGACATGTTTGGTCGGGCAGGGAGGCTACAGGAAGCTGAATTTTTC
CTGGCTCAGATTCCCGGAGGACCTGGATTATCTGTGCTGCAAAGCTTACTTGGTGCTTGT
AGGATTTACGGAAATGTTGACATGGCAACAAGAGTAGCCAATACATTGATCGCGTTAGAA
CCAGAGCAGTCAGGCTCATATGTCTTGATGTCGAATTTGTTTGCAGAGAAGGGGCAGTGG
GATGAGGTAGCGAACATCAGAAAAGGAATGCGAGACAAGGGAGTGAAGAAAGAGATAGGA
TTCAGCTGGGTAGATGTAGGTAGCATTGAGCATTCTTTAAATTTGCACGGATTTTCATCG
GATGACAAGTCTCACCCGCGGACTGAGGAGATATATTGGATGGCGGAATGTATAGGTTCA
GAGCTGAAACATTTGGAGCACGACAAAGAAGAAAGTGAGTTCGTGACATTAGCCTATATC
ATATGA