Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g098810.2.1

CDS Infomation

Chitinase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G05850.2)

Sequence

ATGTCAGCTTTAAAGATGAAAGTGTTAGGATTTATGGTAATAATGCTTTCAATTTCTGCA
ATTGCAAAAGGGGATGAAAATGAAAATGAAAATGAATCATCATCTAAGCCACCAATATTA
GTGAAAATGGTAAAGGGTAAAAAAATGTGTGTTAAAGATTGGGAATGTAATGTATTGTCA
AGATTTTGTTGTAATTTGACAATTTCTGATTTTTTTGAAACTTATCAGTTTGAGAATTTG
TTTTCAAAGAGGAATTCACCTGTAGCTCATTCTGCTGGTTTTTGGGATTATAAATCTTTT
ATAATTGCTTCAGCTCTTTTTCAACCTCTTGGTTTTGGTACTACTGGTGGTAAATTTATG
CAGATGAAAGAAATTGCTGCTTTTCTTGGTCATGTTGGTAGCAAAACTTCTTGTGGTTAC
GGAGTTGCCACCGGTGGACCATTGGCTTGGGGCCTTTGCTATAACAAGGAATTGAGTCCT
AGCCAAGATTACTGTGATGACTACTTCAAATTAACTTACCCGTGCTCTCCCGGAGTCGAA
TATTATGGTCGTGGTGCCTTGCCTATCTACTGGAACTACAACTACGGAAAAATAGGCGAA
GCATTGAAGGTAGATCTGTTGAATCATCCCGAATACATTGAACAAAACGCAACCTTGGCA
TTCCAAGCTGCAATGTGGCAGTGGATGAACCCAGTAAAAAAGGGACAGCCTTCAGCTCAC
GATGCCTTCGTTGGCAACTGGAAGCCAACAAAGAATGATACTTTGTCTAAACGAGTCCCC
GGTTTTGGCACCACCATGAACATCCTCTATGGTGACAATGTCTGTAACCAAGGTGATATT
GACTCCATGAACAACATCATCTCACACTACCTCTATTACCTCGACTTGATGGGCATTGGT
CGGGAGGAGGCAGGGCCTCACGAACTACTCACCTGCGCGGAACAAAAACCTTTCAATCCA
TCTTCCTCCCCTGCTGCTTCTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g098810.2.1

PEP Infomation

Chitinase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G05850.2)

Sequence

MSALKMKVLGFMVIMLSISAIAKGDENENENESSSKPPILVKMVKGKKMCVKDWECNVLS
RFCCNLTISDFFETYQFENLFSKRNSPVAHSAGFWDYKSFIIASALFQPLGFGTTGGKFM
QMKEIAAFLGHVGSKTSCGYGVATGGPLAWGLCYNKELSPSQDYCDDYFKLTYPCSPGVE
YYGRGALPIYWNYNYGKIGEALKVDLLNHPEYIEQNATLAFQAAMWQWMNPVKKGQPSAH
DAFVGNWKPTKNDTLSKRVPGFGTTMNILYGDNVCNQGDIDSMNNIISHYLYYLDLMGIG
REEAGPHELLTCAEQKPFNPSSSPAASS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g098810.2.1

Transcript Infomation

Chitinase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G05850.2)

Sequence

TTTTTTTTAAGTATTGCTTCCTTCTTGGTTAATAAAGATAGTCTCTTTCACTTGCACACC
CAAAGAAAAAAACTTCACCAAAACCCCAAGAAAATATATAAAAAGAGCAAAAAATCCAAT
TTTGATCCATACCCAAATCTCAAAAACCACAAATTCATCTTCCCAATTCACTAAATTCTC
AATTTTTTCAGTTTTCAAATTTCAAAATTTTCATTTTGAGTGATAAAAATGTCAGCTTTA
AAGATGAAAGTGTTAGGATTTATGGTAATAATGCTTTCAATTTCTGCAATTGCAAAAGGG
GATGAAAATGAAAATGAAAATGAATCATCATCTAAGCCACCAATATTAGTGAAAATGGTA
AAGGGTAAAAAAATGTGTGTTAAAGATTGGGAATGTAATGTATTGTCAAGATTTTGTTGT
AATTTGACAATTTCTGATTTTTTTGAAACTTATCAGTTTGAGAATTTGTTTTCAAAGAGG
AATTCACCTGTAGCTCATTCTGCTGGTTTTTGGGATTATAAATCTTTTATAATTGCTTCA
GCTCTTTTTCAACCTCTTGGTTTTGGTACTACTGGTGGTAAATTTATGCAGATGAAAGAA
ATTGCTGCTTTTCTTGGTCATGTTGGTAGCAAAACTTCTTGTGGTTACGGAGTTGCCACC
GGTGGACCATTGGCTTGGGGCCTTTGCTATAACAAGGAATTGAGTCCTAGCCAAGATTAC
TGTGATGACTACTTCAAATTAACTTACCCGTGCTCTCCCGGAGTCGAATATTATGGTCGT
GGTGCCTTGCCTATCTACTGGAACTACAACTACGGAAAAATAGGCGAAGCATTGAAGGTA
GATCTGTTGAATCATCCCGAATACATTGAACAAAACGCAACCTTGGCATTCCAAGCTGCA
ATGTGGCAGTGGATGAACCCAGTAAAAAAGGGACAGCCTTCAGCTCACGATGCCTTCGTT
GGCAACTGGAAGCCAACAAAGAATGATACTTTGTCTAAACGAGTCCCCGGTTTTGGCACC
ACCATGAACATCCTCTATGGTGACAATGTCTGTAACCAAGGTGATATTGACTCCATGAAC
AACATCATCTCACACTACCTCTATTACCTCGACTTGATGGGCATTGGTCGGGAGGAGGCA
GGGCCTCACGAACTACTCACCTGCGCGGAACAAAAACCTTTCAATCCATCTTCCTCCCCT
GCTGCTTCTTCTTGATTAACTCATATGGGATTCTAGACATCCTAGCTATGATTGCTGAAC
ATCCAATAAGTGGAGCAAGATAGACGTTGTCGTCCAGCTCCCGGTGTAAACTGTCTGTTT
GGGTGTCATATATATAAGGATTAAGGTTGTGTTGCCCCTTTCTTGTTGTGTCTTATTGAA
GTGAATCTTGATCAGTGCAATACATGCAGTGTGTGTGAAGCTTTAGTCTGTAATAATCTT
TGGTTTAGGCGCATGTCACGAGTTCGAATTTGGTCAAAGAGCAAAGGAGTGTGCCTATTA
TCAGACCTGGATGTAGAATGTCCATTGTCGG