Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g096680.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G03880.1)

Sequence

ATGAAAACCTTATTGAGATTCAAAGAAAACGTCATATCAGTACATGGATTGGTTATTTCT
GGTCCATTGTTACCACTTCTGTTTCAGCATCTGCGTTGTTGCTCTGGTGCAACAATTCAG
TGGAAGAATGAGAGAGTACCAATCAAATGTAGTGATTTGCTCGATGAGTTCACTACTTAT
TGCTATGCGAGGGATCTTCCAAGGGCAATGAACGCATTGAATGCCTTGCAAATTCAAAAG
ATATGGGCTGATGCTGTCACCTACTCTGAACTCATCAAGTGTTGTTTGGCTCGTGGCGCA
GTGGAACATGGTAAACGTGTCCACCAGCATGTGTTCTCGAATGGTTATGAGCCTAAAACT
TTCCTTGTTAACACACTTATGAATATGTATGTGAAGTTTAACATGTTGGAGGAAGCGCAG
GCTTTGTTTGATCAAATGTCTGAGAGGAATGTTGTTTCCTGGACTACCATGATAGCTGCC
TACTCTAGTGCTAAGATCAATAACAAGGCTTTGGAGTTTTTGATCTTCATGATGAGAGAT
GGCGTGAAACCTAATATGTTTACTTACTCCTCTGTTCTGAGAGCTTGTGATGACCTTTCC
AATCTTAGGCAGCTCCACTGTAGCTTACTTAAAGTTGGTCTGGAGTCTGATGTATTTGTC
CGAAGTGCTCTTATTGACGTTTACTCCAAAATGGGTCAACTCGAGTGTGCAATGTGCACC
TTTAATGAGATGGTGACTGGGGATCTTGTTGTGTGGAATTCCATTATTGGTGGATTTGCG
CAAAACAGTGATGGGGATGAAGCCTTGACTCTCTTTAAAAGAATGAAGAGAGCTGGATTC
TCAGCTGATCAGTCGACCTTGACAAGTGCTCTTAGAGCTTGTACTAGTTTAGCACTTTTA
GAAGTTGGAAGGCAGGTCCATGTTCATGTACTCAAGTTCAAGCGGGACCTAATCCTTGAT
AATGCACTTTTGGACATGTATTGCAAGTGTGGCAATTTGGAAGATGCCCACCAAATATTT
AGTCAGATGGTAGAGAAGGACGTAATCTCCTGGAGTACCATGATCATAGGCTACGCTCAG
AATGGTTTCAGCAGAAAAGCACTCGAATTGTTCAAGGAGATGAAAGTCTCAGGGATCAGA
CCAAACTACATCACTGTTCTTGGAGTTCTATTCGCTTGTAGCCATGCAGGACTCGTAGAA
GATGGACAATTTTACTTCCACTCAATGAAGAAGCTCTTTGGTATTGATCCAGGAAGAGAA
CACTATGGCTGCATGGTTGATCTTCTTGGAAGATCTGGAAAGCTAGATGAAGCGGTGAAA
CTAATCCATGAAATGGGATGTGAACCAGATGCAGTGACATGGAGAACATTGCTTGGTGCC
TGCAGAGTACATCGTAACATGGATTTAGCTGAGTATGCCGCCAAACAAATTATAAAGCTG
GATCCAAGTGACGCGGGAACTTACATATTACTATCTAACATATATGCTCGTACTCAAAAA
TGGGAAGACGTTATGGACCTGAGAAGGTCCATGAAGGAAAGAGGAGTAAAGAAGGAACCA
GGGTGCAGCTGGATTGAAGTAAACAAACAAATCCATGCTTTTATAATGGGAGACAACTCT
CATCCACAAAAAGAGGAAATCAACAAAGAGCTAAATCAGATTATTTGGAGATTAAAAGAG
GTGGGATATGTTCCAGATACAAACTTTGTCTTGCAAGATCTTGAAGATGAACAGATGGAA
GACTCACTTCTGTATCACAGTGAGAAAATAGCTGTTGCCTTTGGTATACTAAGCCTGTCT
AGAGAGAAGACCATTAGAATCAGGAAAAATCTAAGGATATGTGGGGATTGTCATTTATTT
GTGAAACTTTTGGCACAGATAGAGCATAGAAGCATTGTCATAAGAGATCCAATCAGGTAT
CATCATTTTCAGGATGGTATTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g096680.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G03880.1)

Sequence

MKTLLRFKENVISVHGLVISGPLLPLLFQHLRCCSGATIQWKNERVPIKCSDLLDEFTTY
CYARDLPRAMNALNALQIQKIWADAVTYSELIKCCLARGAVEHGKRVHQHVFSNGYEPKT
FLVNTLMNMYVKFNMLEEAQALFDQMSERNVVSWTTMIAAYSSAKINNKALEFLIFMMRD
GVKPNMFTYSSVLRACDDLSNLRQLHCSLLKVGLESDVFVRSALIDVYSKMGQLECAMCT
FNEMVTGDLVVWNSIIGGFAQNSDGDEALTLFKRMKRAGFSADQSTLTSALRACTSLALL
EVGRQVHVHVLKFKRDLILDNALLDMYCKCGNLEDAHQIFSQMVEKDVISWSTMIIGYAQ
NGFSRKALELFKEMKVSGIRPNYITVLGVLFACSHAGLVEDGQFYFHSMKKLFGIDPGRE
HYGCMVDLLGRSGKLDEAVKLIHEMGCEPDAVTWRTLLGACRVHRNMDLAEYAAKQIIKL
DPSDAGTYILLSNIYARTQKWEDVMDLRRSMKERGVKKEPGCSWIEVNKQIHAFIMGDNS
HPQKEEINKELNQIIWRLKEVGYVPDTNFVLQDLEDEQMEDSLLYHSEKIAVAFGILSLS
REKTIRIRKNLRICGDCHLFVKLLAQIEHRSIVIRDPIRYHHFQDGICSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g096680.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G03880.1)

Sequence

ATGAAAACCTTATTGAGATTCAAAGAAAACGTCATATCAGTACATGGATTGGTTATTTCT
GGTCCATTGTTACCACTTCTGTTTCAGCATCTGCGTTGTTGCTCTGGTGCAACAATTCAG
TGGAAGAATGAGAGAGTACCAATCAAATGTAGTGATTTGCTCGATGAGTTCACTACTTAT
TGCTATGCGAGGGATCTTCCAAGGGCAATGAACGCATTGAATGCCTTGCAAATTCAAAAG
ATATGGGCTGATGCTGTCACCTACTCTGAACTCATCAAGTGTTGTTTGGCTCGTGGCGCA
GTGGAACATGGTAAACGTGTCCACCAGCATGTGTTCTCGAATGGTTATGAGCCTAAAACT
TTCCTTGTTAACACACTTATGAATATGTATGTGAAGTTTAACATGTTGGAGGAAGCGCAG
GCTTTGTTTGATCAAATGTCTGAGAGGAATGTTGTTTCCTGGACTACCATGATAGCTGCC
TACTCTAGTGCTAAGATCAATAACAAGGCTTTGGAGTTTTTGATCTTCATGATGAGAGAT
GGCGTGAAACCTAATATGTTTACTTACTCCTCTGTTCTGAGAGCTTGTGATGACCTTTCC
AATCTTAGGCAGCTCCACTGTAGCTTACTTAAAGTTGGTCTGGAGTCTGATGTATTTGTC
CGAAGTGCTCTTATTGACGTTTACTCCAAAATGGGTCAACTCGAGTGTGCAATGTGCACC
TTTAATGAGATGGTGACTGGGGATCTTGTTGTGTGGAATTCCATTATTGGTGGATTTGCG
CAAAACAGTGATGGGGATGAAGCCTTGACTCTCTTTAAAAGAATGAAGAGAGCTGGATTC
TCAGCTGATCAGTCGACCTTGACAAGTGCTCTTAGAGCTTGTACTAGTTTAGCACTTTTA
GAAGTTGGAAGGCAGGTCCATGTTCATGTACTCAAGTTCAAGCGGGACCTAATCCTTGAT
AATGCACTTTTGGACATGTATTGCAAGTGTGGCAATTTGGAAGATGCCCACCAAATATTT
AGTCAGATGGTAGAGAAGGACGTAATCTCCTGGAGTACCATGATCATAGGCTACGCTCAG
AATGGTTTCAGCAGAAAAGCACTCGAATTGTTCAAGGAGATGAAAGTCTCAGGGATCAGA
CCAAACTACATCACTGTTCTTGGAGTTCTATTCGCTTGTAGCCATGCAGGACTCGTAGAA
GATGGACAATTTTACTTCCACTCAATGAAGAAGCTCTTTGGTATTGATCCAGGAAGAGAA
CACTATGGCTGCATGGTTGATCTTCTTGGAAGATCTGGAAAGCTAGATGAAGCGGTGAAA
CTAATCCATGAAATGGGATGTGAACCAGATGCAGTGACATGGAGAACATTGCTTGGTGCC
TGCAGAGTACATCGTAACATGGATTTAGCTGAGTATGCCGCCAAACAAATTATAAAGCTG
GATCCAAGTGACGCGGGAACTTACATATTACTATCTAACATATATGCTCGTACTCAAAAA
TGGGAAGACGTTATGGACCTGAGAAGGTCCATGAAGGAAAGAGGAGTAAAGAAGGAACCA
GGGTGCAGCTGGATTGAAGTAAACAAACAAATCCATGCTTTTATAATGGGAGACAACTCT
CATCCACAAAAAGAGGAAATCAACAAAGAGCTAAATCAGATTATTTGGAGATTAAAAGAG
GTGGGATATGTTCCAGATACAAACTTTGTCTTGCAAGATCTTGAAGATGAACAGATGGAA
GACTCACTTCTGTATCACAGTGAGAAAATAGCTGTTGCCTTTGGTATACTAAGCCTGTCT
AGAGAGAAGACCATTAGAATCAGGAAAAATCTAAGGATATGTGGGGATTGTCATTTATTT
GTGAAACTTTTGGCACAGATAGAGCATAGAAGCATTGTCATAAGAGATCCAATCAGGTAT
CATCATTTTCAGGATGGTATTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTAG