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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g096510.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K2D4_CYNCS)

Sequence

ATGTCGAAACTCAAACAGTTCCATGCGCAAATTGTTAAGCATGGCCTCTCCCATGACAAT
GACGCAATGGGTCGAGTTATTAAGTTCTGTGCAATATCTGAATTGGGCGATTTGAGTTAT
GCCCTCCAAGTGTTTGATAAATTGCCTGAACCAGACCCTTTTATCTACAATACTGTTATT
AGGGGTTTATTGAAATCTCAAATGCTGAGAGATTCTTTGCTTTTTTACCTGTGTATGTTA
GAAAGTTCAGTTCGGCCTAATAGTTTCACTTTTCCACCTCTTATTAGAGTTTGTTGTATT
GACAATGCTGTGGAAGAAGGTAAACAGATTCATGGACATGTGGTGAAGTTTGGGTTCGGA
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GAAGCGAAGAGGGTGTTTGATAATATGTGTGAGAGAGATGATGTTTCATTGACTACATTG
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AGGGAGAAAAGTTGTGTTATTTGGAATGCTATGATATCAGCTTATGTGCAGAGTAACCGG
TTTCATGAGGCGTTTGCTTTGTTCGAAAGGATGGGGTGTGAGGGTGTTGTGGTTGATAAG
TTTCTTGCTGCGAGTATGTTGTCAGCTTGTACGCGACTTGGAGCGTTGAAGCAAGGTGAG
TGGATAGTTGAACATGTCAAGAAGAGTGGGATTGAGTTAGACTCGAAATTGAGTGCTACG
ATTGTTGATATGTATTGCAAATGTGGCTGCTTAGATAAGGCTGTGGAGTTCTTTCAAGGT
TTGTCAAGAAAAGGAATATCGTCGTGGAATTGTATGATTGGAGGGTTGGCGATGCACGGG
GAAGGTGAGGCTGCCATTGAGGTTTTGAAGGAAATGGAGAGTGAGAGGGTAGCTCCAGAC
TATATAACGTTTGTGAATCTACTTAGTGCTTGTGCTCATTCCGGGTTGGTTGAAGAAGGA
AAACACTATTTTCGTTACATGAAAGAAACGTATGGCATTGAACCTGGCATGGAGCATTAC
GGATGTCTGGTTGATTTGCTCGGACGAGCTGGATTACTGGTAGAAGCAAGAAGGGTCGTA
AACGATATGCCTATGAGTCCTGATGTAGGTGTATTGGGTGCTTTTGTTGGTGCATGTAGG
ATTCACAAGAACGTAGAGCTCGGAGAGAAGATAGGGAAGCAAGTGATCGAGTTAGAACCC
CAGAACAGTGGTCGATACGTGTTGTTAGCTAACTTGTATGCTAATGCAGGTAGATGGGAA
GATGTTGCCAGTATAAGAAAGTTGATGAATGACAGGGGAGTGAAGAAGGTACCTGGCTTC
TCCATCGTTGAATTAGAAGGCGTTGTTAACGAGTTCATTGCAGGAGGAAGAACTCATCCT
CAAGCCGAAGAGATATATGTAAAAGCAAACGAAATGCTGGAGTGTATAAAATCTGCAGGC
TATTCTCCAGATTCTGATGGAATGCAATATGACATCGATGAGGAAGAAACAGAGAATCCA
TTGAACTATCATAGTGAGAAACTAGCTATTGCTTTCGGGTTATTAAAGAGCAAACCTGGG
GATATTCTTCGAATCACAAAGAATTTACGCGTTTGCAAGGACTGTCATCAAGCAAGTAAG
TTCATCTCAAAAGTTTATAATCTCGAAATCATCGTTAGAGATAGGAACAGGTTTCATCAC
TTTAAAGGTGGAGAGTGTTCTTGTAAAGACTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g096510.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K2D4_CYNCS)

Sequence

MSKLKQFHAQIVKHGLSHDNDAMGRVIKFCAISELGDLSYALQVFDKLPEPDPFIYNTVI
RGLLKSQMLRDSLLFYLCMLESSVRPNSFTFPPLIRVCCIDNAVEEGKQIHGHVVKFGFG
FDRFSQNNLIHMYVSFRCLEEAKRVFDNMCERDDVSLTTLISGYAQLGYVDEAFQVFDSI
REKSCVIWNAMISAYVQSNRFHEAFALFERMGCEGVVVDKFLAASMLSACTRLGALKQGE
WIVEHVKKSGIELDSKLSATIVDMYCKCGCLDKAVEFFQGLSRKGISSWNCMIGGLAMHG
EGEAAIEVLKEMESERVAPDYITFVNLLSACAHSGLVEEGKHYFRYMKETYGIEPGMEHY
GCLVDLLGRAGLLVEARRVVNDMPMSPDVGVLGAFVGACRIHKNVELGEKIGKQVIELEP
QNSGRYVLLANLYANAGRWEDVASIRKLMNDRGVKKVPGFSIVELEGVVNEFIAGGRTHP
QAEEIYVKANEMLECIKSAGYSPDSDGMQYDIDEEETENPLNYHSEKLAIAFGLLKSKPG
DILRITKNLRVCKDCHQASKFISKVYNLEIIVRDRNRFHHFKGGECSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g096510.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K2D4_CYNCS)

Sequence

ATGTCGAAACTCAAACAGTTCCATGCGCAAATTGTTAAGCATGGCCTCTCCCATGACAAT
GACGCAATGGGTCGAGTTATTAAGTTCTGTGCAATATCTGAATTGGGCGATTTGAGTTAT
GCCCTCCAAGTGTTTGATAAATTGCCTGAACCAGACCCTTTTATCTACAATACTGTTATT
AGGGGTTTATTGAAATCTCAAATGCTGAGAGATTCTTTGCTTTTTTACCTGTGTATGTTA
GAAAGTTCAGTTCGGCCTAATAGTTTCACTTTTCCACCTCTTATTAGAGTTTGTTGTATT
GACAATGCTGTGGAAGAAGGTAAACAGATTCATGGACATGTGGTGAAGTTTGGGTTCGGA
TTTGATCGATTTTCGCAGAACAATTTGATTCATATGTATGTGAGTTTTCGATGTTTGGAG
GAAGCGAAGAGGGTGTTTGATAATATGTGTGAGAGAGATGATGTTTCATTGACTACATTG
ATTAGTGGTTATGCTCAATTGGGGTATGTTGATGAAGCTTTTCAAGTGTTTGATTCGATT
AGGGAGAAAAGTTGTGTTATTTGGAATGCTATGATATCAGCTTATGTGCAGAGTAACCGG
TTTCATGAGGCGTTTGCTTTGTTCGAAAGGATGGGGTGTGAGGGTGTTGTGGTTGATAAG
TTTCTTGCTGCGAGTATGTTGTCAGCTTGTACGCGACTTGGAGCGTTGAAGCAAGGTGAG
TGGATAGTTGAACATGTCAAGAAGAGTGGGATTGAGTTAGACTCGAAATTGAGTGCTACG
ATTGTTGATATGTATTGCAAATGTGGCTGCTTAGATAAGGCTGTGGAGTTCTTTCAAGGT
TTGTCAAGAAAAGGAATATCGTCGTGGAATTGTATGATTGGAGGGTTGGCGATGCACGGG
GAAGGTGAGGCTGCCATTGAGGTTTTGAAGGAAATGGAGAGTGAGAGGGTAGCTCCAGAC
TATATAACGTTTGTGAATCTACTTAGTGCTTGTGCTCATTCCGGGTTGGTTGAAGAAGGA
AAACACTATTTTCGTTACATGAAAGAAACGTATGGCATTGAACCTGGCATGGAGCATTAC
GGATGTCTGGTTGATTTGCTCGGACGAGCTGGATTACTGGTAGAAGCAAGAAGGGTCGTA
AACGATATGCCTATGAGTCCTGATGTAGGTGTATTGGGTGCTTTTGTTGGTGCATGTAGG
ATTCACAAGAACGTAGAGCTCGGAGAGAAGATAGGGAAGCAAGTGATCGAGTTAGAACCC
CAGAACAGTGGTCGATACGTGTTGTTAGCTAACTTGTATGCTAATGCAGGTAGATGGGAA
GATGTTGCCAGTATAAGAAAGTTGATGAATGACAGGGGAGTGAAGAAGGTACCTGGCTTC
TCCATCGTTGAATTAGAAGGCGTTGTTAACGAGTTCATTGCAGGAGGAAGAACTCATCCT
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TATTCTCCAGATTCTGATGGAATGCAATATGACATCGATGAGGAAGAAACAGAGAATCCA
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TTCATCTCAAAAGTTTATAATCTCGAAATCATCGTTAGAGATAGGAACAGGTTTCATCAC
TTTAAAGGTGGAGAGTGTTCTTGTAAAGACTACTGGTGA