Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g095910.2.1

CDS Infomation

cysteine protease

Sequence

ATGGTTCACGTCGCCGGAGTTTTCATCCTCGTCGGAATCGCCGTGCTTGCCGCCGTCGAA
GGACGTAATGTTTTGAAACTTCCGTCGGAAGCTTCCAGATTCTTCGATGACGCAGATGAC
TCTGTTGGAACCAGATGGGCCGTCCTTCTCGCCGGATCAAATGGTTATTGGAATTATAGA
CATCAGGCTGATGTATGCCATGCGTATCAGCTATTGAGAAAAGGTGGTCTCAAAGATGAA
AATATTATTGTCTTCATGTATGATGACATTGCTCACCATGAAGAGAACCCAAGACCAGGA
GTTATTATTAATAGTCCTGCCGGTGAGGATGTTTACGAAGGAGTTCCTAAGGATTACACG
GGAGATGATGTTAATGTGCACAACTTTTTAGCTGTTCTCCTTGGTAACAAAACTGCTCTT
ACTGGAGGTAGCGGAAAGGTGGTGAATAGTGGTCCAAATGATCATATTTTCATATTCTAT
AGTGATCATGGTGGCCCTGGCGTGCTTGGGATGCCTACCAATCCTTATCTATATGCCGAT
GATCTAATTGCTGTGTTGAAAAAGAAGCATGCCGCTGGGACATATAAAAGCTTGGTATTG
TACATTGAAGCTTGCGAGTCTGGAAGTATATTTGAGGGACTTCTTCCTAATGGTCTAAAT
ATTTATGCCACAACAGCTTCAAATGCTGAAGAAAGCAGCTGGGGAACCTATTGTCCTGGA
GAATATCCTAGTCCTCCTCCTGAATATGAGACTTGCTTGGGTGATTTGTATGCTGTTTCC
TGGATGGAGGACAGTGAAATGCACAACTTGCGGACTGAAAATTTGAGGCAGCAGTATCAC
TTGGTCAAAAAGAGAACTGCAAATGGAAATACTGCCTATGGTTCCCATGTCATGCAATTT
GGTGATCTACAACTGAGTATGGAGTCTCTATTCAGGTTTATGGGTACAAATCCTGCAAAT
GATAACTACACTTATGTAGATGACAATTCCTTGTTGGCATCATCAAAGGCTGTCAACCAG
CGTGATGCAGATCTTTTACATTTCTGGGACAAGTTCCGCAAGGCTCCTGAAGGCTCTGCT
CGGAAAGTTGAAGCTCAGAAACAATTCACTGAAGCTATGTCACACAGAATGCACCTAGAT
GAACGCATTGCCCTTGTTGGTAAGCTTCTGTTTGGAATTCAAAAAGGTCCTGAGGTGCTG
AAGCATGTTCGATCTGCGGGTCAGCCTCTTGTTGATGATTGGGCCTGCCTTAAATCTTTT
GTAAGAACATTTGAGTCGCACTGCGGATCGTTATCCCAATATGGAATGAAACACATGCGT
TCCATTGCCAATATCTGCAATGCTGGAATTCAGATGGAGCAGATGGTGGAGGCATCAGCA
CAAGCTTGTCCTAGCATCCCTTCCAATATTTGGAGTTCCCTCCACAGGGGCTTTAGTGCG
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g095910.2.1

PEP Infomation

cysteine protease

Sequence

MVHVAGVFILVGIAVLAAVEGRNVLKLPSEASRFFDDADDSVGTRWAVLLAGSNGYWNYR
HQADVCHAYQLLRKGGLKDENIIVFMYDDIAHHEENPRPGVIINSPAGEDVYEGVPKDYT
GDDVNVHNFLAVLLGNKTALTGGSGKVVNSGPNDHIFIFYSDHGGPGVLGMPTNPYLYAD
DLIAVLKKKHAAGTYKSLVLYIEACESGSIFEGLLPNGLNIYATTASNAEESSWGTYCPG
EYPSPPPEYETCLGDLYAVSWMEDSEMHNLRTENLRQQYHLVKKRTANGNTAYGSHVMQF
GDLQLSMESLFRFMGTNPANDNYTYVDDNSLLASSKAVNQRDADLLHFWDKFRKAPEGSA
RKVEAQKQFTEAMSHRMHLDERIALVGKLLFGIQKGPEVLKHVRSAGQPLVDDWACLKSF
VRTFESHCGSLSQYGMKHMRSIANICNAGIQMEQMVEASAQACPSIPSNIWSSLHRGFSA
*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g095910.2.1

Transcript Infomation

cysteine protease

Sequence

TACTACATTATTGCAAATCCCGATAATAATGGTTCACGTCGCCGGAGTTTTCATCCTCGT
CGGAATCGCCGTGCTTGCCGCCGTCGAAGGACGTAATGTTTTGAAACTTCCGTCGGAAGC
TTCCAGATTCTTCGATGACGCAGATGACTCTGTTGGAACCAGATGGGCCGTCCTTCTCGC
CGGATCAAATGGTTATTGGAATTATAGACATCAGGCTGATGTATGCCATGCGTATCAGCT
ATTGAGAAAAGGTGGTCTCAAAGATGAAAATATTATTGTCTTCATGTATGATGACATTGC
TCACCATGAAGAGAACCCAAGACCAGGAGTTATTATTAATAGTCCTGCCGGTGAGGATGT
TTACGAAGGAGTTCCTAAGGATTACACGGGAGATGATGTTAATGTGCACAACTTTTTAGC
TGTTCTCCTTGGTAACAAAACTGCTCTTACTGGAGGTAGCGGAAAGGTGGTGAATAGTGG
TCCAAATGATCATATTTTCATATTCTATAGTGATCATGGTGGCCCTGGCGTGCTTGGGAT
GCCTACCAATCCTTATCTATATGCCGATGATCTAATTGCTGTGTTGAAAAAGAAGCATGC
CGCTGGGACATATAAAAGCTTGGTATTGTACATTGAAGCTTGCGAGTCTGGAAGTATATT
TGAGGGACTTCTTCCTAATGGTCTAAATATTTATGCCACAACAGCTTCAAATGCTGAAGA
AAGCAGCTGGGGAACCTATTGTCCTGGAGAATATCCTAGTCCTCCTCCTGAATATGAGAC
TTGCTTGGGTGATTTGTATGCTGTTTCCTGGATGGAGGACAGTGAAATGCACAACTTGCG
GACTGAAAATTTGAGGCAGCAGTATCACTTGGTCAAAAAGAGAACTGCAAATGGAAATAC
TGCCTATGGTTCCCATGTCATGCAATTTGGTGATCTACAACTGAGTATGGAGTCTCTATT
CAGGTTTATGGGTACAAATCCTGCAAATGATAACTACACTTATGTAGATGACAATTCCTT
GTTGGCATCATCAAAGGCTGTCAACCAGCGTGATGCAGATCTTTTACATTTCTGGGACAA
GTTCCGCAAGGCTCCTGAAGGCTCTGCTCGGAAAGTTGAAGCTCAGAAACAATTCACTGA
AGCTATGTCACACAGAATGCACCTAGATGAACGCATTGCCCTTGTTGGTAAGCTTCTGTT
TGGAATTCAAAAAGGTCCTGAGGTGCTGAAGCATGTTCGATCTGCGGGTCAGCCTCTTGT
TGATGATTGGGCCTGCCTTAAATCTTTTGTAAGAACATTTGAGTCGCACTGCGGATCGTT
ATCCCAATATGGAATGAAACACATGCGTTCCATTGCCAATATCTGCAATGCTGGAATTCA
GATGGAGCAGATGGTGGAGGCATCAGCACAAGCTTGTCCTAGCATCCCTTCCAATATTTG
GAGTTCCCTCCACAGGGGCTTTAGTGCGTAAAACGCCATGGACTGTGCGGTTTCTCACTT
TGATGCTGGTAATAATAATAATTGCTGTTATCAGTGTCATTTCATGTCCTATTTGTAAAT
TGCAATTTGATCCTGTTATTACTGAAGTCTACTATTATTGATTATCAGGATTCACGTAAT
GTTTGTAAATTGGTGCTCTGTAAATACAGCTGAACAAGCACGACTTATCATCTTTGATTA
TATTTGAAAGCACATTTCTCATTGCAAGTAAACAGTAAGTCCTCTATACATTGGGATTTT
TCCCTCGAATAAATTAAAGGGAACTCATTAATCAAAGTCATATTGCGAAAACAAAGCATC
TAACTAGTAGCT