Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g088920.2.1
CDS Infomation	Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G11800.1)
Sequence	ATGGGGATCGATAAGCAGCCGAGTGGTATTCTTGATACTCTGAAAATGGAGACAGTCAGG ACAATATTTCCCTCGTATCGCTACCCCCACGAGCATTCACGTCATTTTGTGATTGCTGTG GTTGTGGGATGCTTGTTTTTCATATCATCAGATAACATGCACTCACTTATTCAGAAATTC GATATCAAATGGTGGTCTATGTATGCTTGTTTGCTAGGATTCTTTTACTTCTTTTCGTCT CCATTTATTGGGAAAACAATTAAACCAAGTTACTCAAATTTCAGTCGCTGGTATATTGCC TGGATATTAGTGGCAGCTTTATACCACCTTCCAAGTTTTCAATCAATGGGAGTAGATTTA AGGATGAACCTCTCTTTGTTTCTGACGTTATACGTATCATCCATTTTGTTTCTTCTTGTT TTCCATGTGATATTTATCGGGCTTTGGTATCTTGGACTTGTTGCTCGTGTGGCAGGAAGG AGGCCTGAGATTATGAAAGTCTTTCAAAATTGTGTTGTCATAAGTATAGCCTGCTGTGTT TTCTATAGCCACTGTGGGAACCTCGCTATAGTAAGGGAGAAGACATTCGACTGGAGGAAT TCTATATGGTTTTCCTTGTGGAATAAGGGAGAGGGAAATGCATGGCTTGTGAAATTCATC CGCATGACGGAATTTAAAGATCAAGTTTGCAAATCTTGGTTTGCTCCAGTTGGGTCTGCT AGTGATTACCCATTCTTGTCCAAATGGGTCATCTATGGAGAGTTGACTTGCGGCGGCTCA TGCGCAGAATCATCAGATGAAATTTCTCCAATTTATTCATTGTGGGCCACTTTTATTGGC CTATATATGGCAAATTTCGTTGTGGAAAGGTCATCTGGATGGGCTCTATCACGCCCTTTA TCACTCAAGGAGTTTGAGAAATTGAAGAAAAAGCAGATGAAACCAGAGTTTTTGGATATG GTTCCTTGGTATTCAGGGACATCTGCTGACTTGTTCAAGACAGTGTTTGACCTTCTGGTC TCTGTAACTGTATTTGTTGGGCGTTTTGACATGCGCATGATGCAGGCTGCTATGAGCAAG ATTGAAGACGGAGCTAAGCAGGACGATCTTTTGTATGATCAGTTTAGTGAAGAGGATGGT ATCTGGTTTGATTTCATGGCCGATACTGGTGATGGCGGAAATTCCTCCTACACTGTGGCA CGCCTTCTTGCTCAACCTTCAATCCGCGCCCAAAATAATGATTCCAAGCTTACACTGCCA CGTGGACGCCTGCTTCTTATTGGGGGTGACCTTGCGTATCCGAACCCATCAGCATTTACA TATGAGAAGCGTCTTTTTCGTCCCTTTGAATATGCTCTTCAGCCTCCAATCTGGTATAAG GAAGACCATATTGCCGTTAAGAAGCCCGAATTACCTTCCGGCGTGACTGAACTCAAGCAG TATGTTGGACCTCAGTGTTTTGTCATCCCTGGAAATCATGACTGGTTTGATGGACTTCAG ACTTTCATGAGGTACATTTGTCACAAGAGCTGGTTGGGTGGGTGGTTTATGCCTCAAAAG AAGAGCTATTTTGCCTTGCAGCTTCCTAAAGGGTGGTGGATATTTGGTCTTGATCTTGCT CTACATTCTGATATTGATATATACCAGTTCAAGTTCTTCTCAGAATTAATAAGGGACAAG GTGGGCGAGAATGATTCTGTGATCATTATGACACATGAACCTAATTGGCTTCTCGATTGG TACTTCGATCAAGTTACTGGAAAGAATGTCACGTACTTGATACGTGACCACTTAAACGGG AGATGTAGACTTCGAATTGCTGGGGATGTGCATCATTATATGCGCCATAAGTTTGTTGAA TCGAAATCGGATGAACAGGTTTATGTCCAGCACTTACTTGTTAATGGTTGTGGGGGTGCT TTTTTGCATCCGACACATGTCTTCAAGAATTTCAACAGTTTATATGGAACAACTTATGAG TGCAAAAATCCTTACCCAACTTTTGAAGACTCAAGTAGGATTGCTTTGGGAAATATATTG AAATTTAGGAAGAAAAATTGGCAGTTTGATTTTATTGGTGGAATCATATACTTCATGTTG GCCTTTTCTATGTTCCCCCAGTGTCGGCTTGATCACATTTTCAAGGATGATACATTTTCG GGTCACATGGGAACCTTCTTCGACACAGTGTGGGGCTTATTTATGTATATATTTGGACGC TCATATGTCTCCTTGACCGGTGCAGTGCTGCTATTAATAATTGCAATATCCTTTGTGCCA TCCAAGGTGCCTTGGAAAAAGAAAGTGGTAATTGGGATTCTTCATGTGTCTGCACACCTA GCTGCAGCTGTGATTCTTATGCTCTTGCTCGAATTAGGCATTGAGACATGTATTCGCCAT AAACTACTTGCAACTTCTGGTTATCATACTTTATATGAATGGTACAAATCAGTGGAGAGT GAACATTTTCCAGACCCAACGGGTCTTAAGGAACGAATTGAACACTGGACATTTGGCCTT TATCCGGCATGTATTAAATATCTCATGTCTGCTTTTGATGTTCCTGAGGTAATGGCAGTT ACTAGGAATACTATCTGCAAGAATGGGATGGATTCACTATCTCGAGGGGGTGCTGTAATT TATTATGCATCCGTCTTCCTTTATTTTTGGGTCTTTTCAACTCCGGTGGTTTCTTTGGTA TTCGGAAGCTACCTATACATTTGCATTAACTGGCTTCATATACATTTCGACGAAGCCTTT TCATCACTTCGTATTGCTAACTACAAGTCATTTACACGGTTTCATATCAACAACAAAGGC GATCTTGAAGTTTTTACCCTTGCAGTTGATAAGGTTCCGAAAGAGTGGAAACTAGATCCT AAATGGGACGGAGAGTCAAAACATCCGCAGGATCCAAGTTACCTTCAGAAATTCCCGAGC AAATGGAGAGCGTCTTCCCCTAATCAAGATCCTGTAGATACTGTTCGGATTATCGATCAA TTTGTGATTGAAAAGACTGAAAAACATGATTCAGAATTAGCAAACGGGTCAGTTAATCAA TAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g088920.2.1
PEP Infomation	Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G11800.1)
Sequence	MGIDKQPSGILDTLKMETVRTIFPSYRYPHEHSRHFVIAVVVGCLFFISSDNMHSLIQKF DIKWWSMYACLLGFFYFFSSPFIGKTIKPSYSNFSRWYIAWILVAALYHLPSFQSMGVDL RMNLSLFLTLYVSSILFLLVFHVIFIGLWYLGLVARVAGRRPEIMKVFQNCVVISIACCV FYSHCGNLAIVREKTFDWRNSIWFSLWNKGEGNAWLVKFIRMTEFKDQVCKSWFAPVGSA SDYPFLSKWVIYGELTCGGSCAESSDEISPIYSLWATFIGLYMANFVVERSSGWALSRPL SLKEFEKLKKKQMKPEFLDMVPWYSGTSADLFKTVFDLLVSVTVFVGRFDMRMMQAAMSK IEDGAKQDDLLYDQFSEEDGIWFDFMADTGDGGNSSYTVARLLAQPSIRAQNNDSKLTLP RGRLLLIGGDLAYPNPSAFTYEKRLFRPFEYALQPPIWYKEDHIAVKKPELPSGVTELKQ YVGPQCFVIPGNHDWFDGLQTFMRYICHKSWLGGWFMPQKKSYFALQLPKGWWIFGLDLA LHSDIDIYQFKFFSELIRDKVGENDSVIIMTHEPNWLLDWYFDQVTGKNVTYLIRDHLNG RCRLRIAGDVHHYMRHKFVESKSDEQVYVQHLLVNGCGGAFLHPTHVFKNFNSLYGTTYE CKNPYPTFEDSSRIALGNILKFRKKNWQFDFIGGIIYFMLAFSMFPQCRLDHIFKDDTFS GHMGTFFDTVWGLFMYIFGRSYVSLTGAVLLLIIAISFVPSKVPWKKKVVIGILHVSAHL AAAVILMLLLELGIETCIRHKLLATSGYHTLYEWYKSVESEHFPDPTGLKERIEHWTFGL YPACIKYLMSAFDVPEVMAVTRNTICKNGMDSLSRGGAVIYYASVFLYFWVFSTPVVSLV FGSYLYICINWLHIHFDEAFSSLRIANYKSFTRFHINNKGDLEVFTLAVDKVPKEWKLDP KWDGESKHPQDPSYLQKFPSKWRASSPNQDPVDTVRIIDQFVIEKTEKHDSELANGSVNQ *

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g088920.2.1
Transcript Infomation	Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G11800.1)
Sequence	ATTAACACATTAAATAACAAAAAGAAAACATTACATAACATTCAAAGATAACGATTACAA AATAACACAATCAAAGCACAAAAAATAATGAATAGTAACATAAAATCGAAGGACAAGAAA TTGCGTTTCTATCTATACTTGTGGTCTGGGGAGGATTAAATCTGACTTTTAAAACTTATC CTAAGGTGAAACTTTACTCCAATCAAACTTAAGGGGTAAAATCACAATTTACCAAAGATT CAAGAACAGCAAAAAAGAAAAAACATTTCCTGTTTTGCCACTTGTATCAACAAACAACAA ACTGGCAAAACTTCAATCCATCTGTCTTTAATCCACAAAGTTCCAAATATAGAAAAGTAA AAATTAATTTTTTTTTCCAAATCCCATAAAAAAAGATTCAATTTTGTGTAATAATTTGTG TAGTTTGTCCTCAAAAAAAGTCAAGAGGAATATGCTGTACATGTTCCGTGAAAAAAAAGG TTTCTTGCAGACATCCTCACATAATAAATGTTGCTGAGTCGGTTCCTTAATCCAAACATA TATTTATATTCCATATTTAAGCAGACCCAAGTTGCTGTTTTTGCTGTCTGTCTTTCTATT TCTGTATTGGCTTTTGTTTCTTAAATTCAGTTGTCTCTTGGGATCTAGAATTAATCAGCT ATAACTCTTATCACGTAAAGTGGCGTGAAGCCAAGGCTGCTTAATGGGGATCGATAAGCA GCCGAGTGGTATTCTTGATACTCTGAAAATGGAGACAGTCAGGACAATATTTCCCTCGTA TCGCTACCCCCACGAGCATTCACGTCATTTTGTGATTGCTGTGGTTGTGGGATGCTTGTT TTTCATATCATCAGATAACATGCACTCACTTATTCAGAAATTCGATATCAAATGGTGGTC TATGTATGCTTGTTTGCTAGGATTCTTTTACTTCTTTTCGTCTCCATTTATTGGGAAAAC AATTAAACCAAGTTACTCAAATTTCAGTCGCTGGTATATTGCCTGGATATTAGTGGCAGC TTTATACCACCTTCCAAGTTTTCAATCAATGGGAGTAGATTTAAGGATGAACCTCTCTTT GTTTCTGACGTTATACGTATCATCCATTTTGTTTCTTCTTGTTTTCCATGTGATATTTAT CGGGCTTTGGTATCTTGGACTTGTTGCTCGTGTGGCAGGAAGGAGGCCTGAGATTATGAA AGTCTTTCAAAATTGTGTTGTCATAAGTATAGCCTGCTGTGTTTTCTATAGCCACTGTGG GAACCTCGCTATAGTAAGGGAGAAGACATTCGACTGGAGGAATTCTATATGGTTTTCCTT GTGGAATAAGGGAGAGGGAAATGCATGGCTTGTGAAATTCATCCGCATGACGGAATTTAA AGATCAAGTTTGCAAATCTTGGTTTGCTCCAGTTGGGTCTGCTAGTGATTACCCATTCTT GTCCAAATGGGTCATCTATGGAGAGTTGACTTGCGGCGGCTCATGCGCAGAATCATCAGA TGAAATTTCTCCAATTTATTCATTGTGGGCCACTTTTATTGGCCTATATATGGCAAATTT CGTTGTGGAAAGGTCATCTGGATGGGCTCTATCACGCCCTTTATCACTCAAGGAGTTTGA GAAATTGAAGAAAAAGCAGATGAAACCAGAGTTTTTGGATATGGTTCCTTGGTATTCAGG GACATCTGCTGACTTGTTCAAGACAGTGTTTGACCTTCTGGTCTCTGTAACTGTATTTGT TGGGCGTTTTGACATGCGCATGATGCAGGCTGCTATGAGCAAGATTGAAGACGGAGCTAA GCAGGACGATCTTTTGTATGATCAGTTTAGTGAAGAGGATGGTATCTGGTTTGATTTCAT GGCCGATACTGGTGATGGCGGAAATTCCTCCTACACTGTGGCACGCCTTCTTGCTCAACC TTCAATCCGCGCCCAAAATAATGATTCCAAGCTTACACTGCCACGTGGACGCCTGCTTCT TATTGGGGGTGACCTTGCGTATCCGAACCCATCAGCATTTACATATGAGAAGCGTCTTTT TCGTCCCTTTGAATATGCTCTTCAGCCTCCAATCTGGTATAAGGAAGACCATATTGCCGT TAAGAAGCCCGAATTACCTTCCGGCGTGACTGAACTCAAGCAGTATGTTGGACCTCAGTG TTTTGTCATCCCTGGAAATCATGACTGGTTTGATGGACTTCAGACTTTCATGAGGTACAT TTGTCACAAGAGCTGGTTGGGTGGGTGGTTTATGCCTCAAAAGAAGAGCTATTTTGCCTT GCAGCTTCCTAAAGGGTGGTGGATATTTGGTCTTGATCTTGCTCTACATTCTGATATTGA TATATACCAGTTCAAGTTCTTCTCAGAATTAATAAGGGACAAGGTGGGCGAGAATGATTC TGTGATCATTATGACACATGAACCTAATTGGCTTCTCGATTGGTACTTCGATCAAGTTAC TGGAAAGAATGTCACGTACTTGATACGTGACCACTTAAACGGGAGATGTAGACTTCGAAT TGCTGGGGATGTGCATCATTATATGCGCCATAAGTTTGTTGAATCGAAATCGGATGAACA GGTTTATGTCCAGCACTTACTTGTTAATGGTTGTGGGGGTGCTTTTTTGCATCCGACACA TGTCTTCAAGAATTTCAACAGTTTATATGGAACAACTTATGAGTGCAAAAATCCTTACCC AACTTTTGAAGACTCAAGTAGGATTGCTTTGGGAAATATATTGAAATTTAGGAAGAAAAA TTGGCAGTTTGATTTTATTGGTGGAATCATATACTTCATGTTGGCCTTTTCTATGTTCCC CCAGTGTCGGCTTGATCACATTTTCAAGGATGATACATTTTCGGGTCACATGGGAACCTT CTTCGACACAGTGTGGGGCTTATTTATGTATATATTTGGACGCTCATATGTCTCCTTGAC CGGTGCAGTGCTGCTATTAATAATTGCAATATCCTTTGTGCCATCCAAGGTGCCTTGGAA AAAGAAAGTGGTAATTGGGATTCTTCATGTGTCTGCACACCTAGCTGCAGCTGTGATTCT TATGCTCTTGCTCGAATTAGGCATTGAGACATGTATTCGCCATAAACTACTTGCAACTTC TGGTTATCATACTTTATATGAATGGTACAAATCAGTGGAGAGTGAACATTTTCCAGACCC AACGGGTCTTAAGGAACGAATTGAACACTGGACATTTGGCCTTTATCCGGCATGTATTAA ATATCTCATGTCTGCTTTTGATGTTCCTGAGGTAATGGCAGTTACTAGGAATACTATCTG CAAGAATGGGATGGATTCACTATCTCGAGGGGGTGCTGTAATTTATTATGCATCCGTCTT CCTTTATTTTTGGGTCTTTTCAACTCCGGTGGTTTCTTTGGTATTCGGAAGCTACCTATA CATTTGCATTAACTGGCTTCATATACATTTCGACGAAGCCTTTTCATCACTTCGTATTGC TAACTACAAGTCATTTACACGGTTTCATATCAACAACAAAGGCGATCTTGAAGTTTTTAC CCTTGCAGTTGATAAGGTTCCGAAAGAGTGGAAACTAGATCCTAAATGGGACGGAGAGTC AAAACATCCGCAGGATCCAAGTTACCTTCAGAAATTCCCGAGCAAATGGAGAGCGTCTTC CCCTAATCAAGATCCTGTAGATACTGTTCGGATTATCGATCAATTTGTGATTGAAAAGAC TGAAAAACATGATTCAGAATTAGCAAACGGGTCAGTTAATCAATAACTCATTTGATTACA AGACTCTTCTACTGTCAGTTTTGTACATATAGGATTTTAGAATTTAGATGGTAAATGATA TCATAACCTTTTTCAAAACAAAATCGAATATGTGAAGAGCTGTGACAGATGTTCATTTGA AATCTTATACATAGGTTGAAATTTTTCATCTTTGCTTTGCTTCATTAGCCATTTCAGATC AAATATATACAGTACTGTATACTACTACGCGAAATGGACTAATGTTCATCTTTGCTTTTC GTCATTAGACACTTCACATCATATATATAATATATATATGTATATATACAGTACTGTATA TTACGCGAAATGGTCTAATGTTTCTCATTTCATCAGTAAAAGTAGTATTAGTTGCTTTTA GATGCTGGGAAGATGAGAAAAACCAGCGTTGCATGACTTAGTTGGAACATGTTCAACTTG AATTAAACGCTACGTTGAAGAGTTAGCATCTTGCACATTGTAAAAGTTCTCCGCGGTGTT TTAAGGAATGAATTCTATCTATGTTTTGGTATTGGACAATCCTCTCCTCGCATGAGCTAA AACTTTTGATGAGTTAGCCTAATGTCACGGACTTTGCAAAATTTGACTGGCAAAGTGGCG GGACATGACACTAAGGTCCATTTTTGGGAAGGGAAGTGTTAAAAGGCGCCCCTCGATTAG TGGAACATCTTTAACTCTTGGTTTATCGTCTTTTGATCGCGTTGCTAATACTTAAATAAG TGAAGTAGTCGTCGTCTGTTAGGTTGCATATTATTTGAGAAAAACACTCAAATGTATTTG ATTTCCTGTATGATGCATATGTGAATGACAAATATAAATGTTCTATAACTAAATGTAACA AAAAAATAGCTACTCAAAATTTGATAATAATTGAGTCTTTTCATTTACAAGATTGATAAA TAGGGGCATGATATCTTACGATCTCGATTCGTTCTTTTTTCTCTCATAGATGTCAAACTT CATTCAACTTCGAATTCTATCATGGTCCATTATCGAAACACTTTGTCGATTAATTTCTGA CCGCGCTGAATCTCCATCTATCAAATATGTTTTATGTGGTATCACTATATATTTTTAGTA TATAGTTAGTCTTTTGTAAGAAATGTCTCATATTTTGTTCCTTTGAGCTTTTTTTGCACT TCATCCCAATTTTCTATTT