Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g088290.2.1

CDS Infomation

Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7LGL1_MEDTR)

Sequence

ATGCTTGAAGTTTACAGAAGCAGTTCAGTTGAGTGGAAACCGTCGCCGGTGGTAGCTTTA
GCTACTAGCGTCGATGATTCTCAGGTCGCCGCTGCTCGAGAGGATGGTTCTCTTGAGATT
TGGCTTGTTTCACCTGGCTCCAATGGATGGCACTGTCAACTCATAATACATGGAAATCCT
AATTCAAGGGTTTCCTCGTTAGTTTGGTATCAGTCAGGATCGAGAAAATTACCTGCAGGC
CGGTTATTTTCATCCAGCATTGATGGATCAGTTTACGAGTGGGATCTTTTCGATTTGACT
CAGAAGGCTGTGCTCGATTCTATTGGTGTTTCAATATGGCAGATGGCTGTGGAGCCCTGC
AATAATGCACAGCTTCATCAGAATCCTCCAAAGAAGTATGAGAATGGCCATGTTAGTTTT
ACAAGTGGTGTTAGTAGCGATAGTGAGAGCAGTGACGGGGAAGAGGATGATGACTCAGTT
GTTCTTCACGTGGATGATGTTAATGAAAATGGTCGAATTGCATTTGCTTGTGATGATGGT
CGTGTTCGTATCTGCGCTATTTCGGATGAGATGAATTTGTCTTACGAAAGATTGTTTCCT
AAGGTCAATGGGCGTACGTTGAGTGTCACTTGGAGTTCTGATGCAAAGAGGATATATTCT
GGTAGTAGTGACGGGTTTATAAGATGTTGGGATGCCAAGCTTGCATATGAAATCTACAGG
ATAACAGTGGGTCTTGGAGGTTTGGGTAGCGGATCTGATCTATGCATATGGTCATTACTT
GCATTGAGATGTGGTACCCTGGTTAGTGCAGATAGTAGTGGGAGTGTTCAATTCTGGGAC
TCCCGGCATGGAACTCTTCTACAGTCACATTCCAGTCATAAGGGTGATGTGAATGCTTTA
GCAGCATCTCCCAGCCATAGTAGTGTATTTTCTGCTGGTTCTGATGGTCAGGTTATACTT
TATAAGCTCGCAGCCAATGAGGTGGGGTCTCACAATGGAGACATTTCTTCTGTAGTCGTG
AAGCAATGGGTTTATGTTAGTCATGTGAGGGCCCATACACATGATGTAAGAGCCTTGGCA
GTTGCTGTACCCATTGCTCATGAAGAACCCATAGTCGAACAGAAGACAAAGAAGCGGCGC
TTTAAGGAGAAGGCCCTTGAGTTTAGTTATCATAAATGGGCACATTTTGGTGTGCCGATG
CTTATCTCAGGTGGTGATGACACTAAACTTTTTGCATACTCTGCAAAGGAATTCACCAAA
TTTTCTCCACATGATATTTGTCCCTCACCTCAGAGACCACCCATACAAATTGCAGTAAAT
ACAACCTTCAGTCAGGTTTCTTTACTCTTGGTCCAGGCTTCGTACTGGATAGATATTTTT
TGTGTTGGTGTGAAAAACGGGGTTGTGTCTGACAGCTGCGGGCCATCTGGTGGGGCTGCG
AGGACAGATCTAGTGGCTCGTGTTAAGTGCAAAACTTCGAGGAAGATCACATGCAGTGCA
ATTTCTCCTTCAGGTGTACTGTTTGCTTATTCTGACCATGTAAGACCCTGCCTTTTTGAA
CTTAAGAAGAGTGGCGCTGGCAAGAGTGCATGGACTGTCAGCAAAAGGAAGCTCCCTTCG
GGACTTCCATTTGCCCATTCAATTGAATTCAGTGCAGATTCTTCTCGAATGATTATATCT
GGGTGTGACAGAAGGATCTATGTGGTTGATGCAGTAAGCTTGGAACTAGTTCATGTTTTT
ACCCCTCGGCATAAAGATCAACGCGAAGAATTTCCACCAAATGAACCTCCCGTTACGAGA
ATGTTCACTAGTGCAGATGGGAAATGGTTAGGTGCTGTAAACTGCTCTGGAGATGTGTAT
ATATTTAATCTAGATAAACAGAGGCAACATTGGTTTATATCAAGATTGAATGGTTCTCCC
GTTACAGCTGGTGGCTTTACTCCTAGAAATAGCAATGTGCTTATAGTATCCACATCTTCG
AACCAGGTATATGCCTTTGATGTTGAAGCAAAACAACTAGGAGAATGGTCCAACCGGAAT
ACATTCTCTCTGCCGGGAAGATTTCAAGAATTTCCTGGAGAAGTGATTGGGCTTTCTTTT
GCTCCTTCTACTAATTCATCATCTGTCATTGTCTACAGTTCAAGGGCAATGTGCTTGATT
GACTTTGGGTTGCCAGTTGGTGATGACGACGACACTGATTTAGCTAATAGTCAAGATTTA
GCTTTAAAGAAGCTACATAATAGTTCTCCTGCAAATGGGACGTTAAAGCGCAAGTTGAAA
GGGAACGACTTAGATTTGAAACAAATCGGTAGAAAGAATTTTGAATTCTGTGCTTTCAGG
GATCCTGTTTTATTTGTTGGACATCTTTCGAAAACTTCCACCTTGATCATAGATAAACCT
TGGATTCAAGTGGTTAAAACTCTTGATGCTCAACCAGTTCACAGACGTATTTTTGGGACA
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g088290.2.1

PEP Infomation

Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7LGL1_MEDTR)

Sequence

MLEVYRSSSVEWKPSPVVALATSVDDSQVAAAREDGSLEIWLVSPGSNGWHCQLIIHGNP
NSRVSSLVWYQSGSRKLPAGRLFSSSIDGSVYEWDLFDLTQKAVLDSIGVSIWQMAVEPC
NNAQLHQNPPKKYENGHVSFTSGVSSDSESSDGEEDDDSVVLHVDDVNENGRIAFACDDG
RVRICAISDEMNLSYERLFPKVNGRTLSVTWSSDAKRIYSGSSDGFIRCWDAKLAYEIYR
ITVGLGGLGSGSDLCIWSLLALRCGTLVSADSSGSVQFWDSRHGTLLQSHSSHKGDVNAL
AASPSHSSVFSAGSDGQVILYKLAANEVGSHNGDISSVVVKQWVYVSHVRAHTHDVRALA
VAVPIAHEEPIVEQKTKKRRFKEKALEFSYHKWAHFGVPMLISGGDDTKLFAYSAKEFTK
FSPHDICPSPQRPPIQIAVNTTFSQVSLLLVQASYWIDIFCVGVKNGVVSDSCGPSGGAA
RTDLVARVKCKTSRKITCSAISPSGVLFAYSDHVRPCLFELKKSGAGKSAWTVSKRKLPS
GLPFAHSIEFSADSSRMIISGCDRRIYVVDAVSLELVHVFTPRHKDQREEFPPNEPPVTR
MFTSADGKWLGAVNCSGDVYIFNLDKQRQHWFISRLNGSPVTAGGFTPRNSNVLIVSTSS
NQVYAFDVEAKQLGEWSNRNTFSLPGRFQEFPGEVIGLSFAPSTNSSSVIVYSSRAMCLI
DFGLPVGDDDDTDLANSQDLALKKLHNSSPANGTLKRKLKGNDLDLKQIGRKNFEFCAFR
DPVLFVGHLSKTSTLIIDKPWIQVVKTLDAQPVHRRIFGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g088290.2.1

Transcript Infomation

Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7LGL1_MEDTR)

Sequence

ATTAAAACCCTTGTTCTTCGATAAACCTAGCCCCTCTTTTTGCCTCGCCTCCATTGCTGC
ATTTGGGGTATTGTGATGCTTTATGCATCTCTCTTCTCTGAAAAACTTGTAAAGATTGCT
TTTTGAGCTTCTGGAAAATGCTTGAAGTTTACAGAAGCAGTTCAGTTGAGTGGAAACCGT
CGCCGGTGGTAGCTTTAGCTACTAGCGTCGATGATTCTCAGGTCGCCGCTGCTCGAGAGG
ATGGTTCTCTTGAGATTTGGCTTGTTTCACCTGGCTCCAATGGATGGCACTGTCAACTCA
TAATACATGGAAATCCTAATTCAAGGGTTTCCTCGTTAGTTTGGTATCAGTCAGGATCGA
GAAAATTACCTGCAGGCCGGTTATTTTCATCCAGCATTGATGGATCAGTTTACGAGTGGG
ATCTTTTCGATTTGACTCAGAAGGCTGTGCTCGATTCTATTGGTGTTTCAATATGGCAGA
TGGCTGTGGAGCCCTGCAATAATGCACAGCTTCATCAGAATCCTCCAAAGAAGTATGAGA
ATGGCCATGTTAGTTTTACAAGTGGTGTTAGTAGCGATAGTGAGAGCAGTGACGGGGAAG
AGGATGATGACTCAGTTGTTCTTCACGTGGATGATGTTAATGAAAATGGTCGAATTGCAT
TTGCTTGTGATGATGGTCGTGTTCGTATCTGCGCTATTTCGGATGAGATGAATTTGTCTT
ACGAAAGATTGTTTCCTAAGGTCAATGGGCGTACGTTGAGTGTCACTTGGAGTTCTGATG
CAAAGAGGATATATTCTGGTAGTAGTGACGGGTTTATAAGATGTTGGGATGCCAAGCTTG
CATATGAAATCTACAGGATAACAGTGGGTCTTGGAGGTTTGGGTAGCGGATCTGATCTAT
GCATATGGTCATTACTTGCATTGAGATGTGGTACCCTGGTTAGTGCAGATAGTAGTGGGA
GTGTTCAATTCTGGGACTCCCGGCATGGAACTCTTCTACAGTCACATTCCAGTCATAAGG
GTGATGTGAATGCTTTAGCAGCATCTCCCAGCCATAGTAGTGTATTTTCTGCTGGTTCTG
ATGGTCAGGTTATACTTTATAAGCTCGCAGCCAATGAGGTGGGGTCTCACAATGGAGACA
TTTCTTCTGTAGTCGTGAAGCAATGGGTTTATGTTAGTCATGTGAGGGCCCATACACATG
ATGTAAGAGCCTTGGCAGTTGCTGTACCCATTGCTCATGAAGAACCCATAGTCGAACAGA
AGACAAAGAAGCGGCGCTTTAAGGAGAAGGCCCTTGAGTTTAGTTATCATAAATGGGCAC
ATTTTGGTGTGCCGATGCTTATCTCAGGTGGTGATGACACTAAACTTTTTGCATACTCTG
CAAAGGAATTCACCAAATTTTCTCCACATGATATTTGTCCCTCACCTCAGAGACCACCCA
TACAAATTGCAGTAAATACAACCTTCAGTCAGGTTTCTTTACTCTTGGTCCAGGCTTCGT
ACTGGATAGATATTTTTTGTGTTGGTGTGAAAAACGGGGTTGTGTCTGACAGCTGCGGGC
CATCTGGTGGGGCTGCGAGGACAGATCTAGTGGCTCGTGTTAAGTGCAAAACTTCGAGGA
AGATCACATGCAGTGCAATTTCTCCTTCAGGTGTACTGTTTGCTTATTCTGACCATGTAA
GACCCTGCCTTTTTGAACTTAAGAAGAGTGGCGCTGGCAAGAGTGCATGGACTGTCAGCA
AAAGGAAGCTCCCTTCGGGACTTCCATTTGCCCATTCAATTGAATTCAGTGCAGATTCTT
CTCGAATGATTATATCTGGGTGTGACAGAAGGATCTATGTGGTTGATGCAGTAAGCTTGG
AACTAGTTCATGTTTTTACCCCTCGGCATAAAGATCAACGCGAAGAATTTCCACCAAATG
AACCTCCCGTTACGAGAATGTTCACTAGTGCAGATGGGAAATGGTTAGGTGCTGTAAACT
GCTCTGGAGATGTGTATATATTTAATCTAGATAAACAGAGGCAACATTGGTTTATATCAA
GATTGAATGGTTCTCCCGTTACAGCTGGTGGCTTTACTCCTAGAAATAGCAATGTGCTTA
TAGTATCCACATCTTCGAACCAGGTATATGCCTTTGATGTTGAAGCAAAACAACTAGGAG
AATGGTCCAACCGGAATACATTCTCTCTGCCGGGAAGATTTCAAGAATTTCCTGGAGAAG
TGATTGGGCTTTCTTTTGCTCCTTCTACTAATTCATCATCTGTCATTGTCTACAGTTCAA
GGGCAATGTGCTTGATTGACTTTGGGTTGCCAGTTGGTGATGACGACGACACTGATTTAG
CTAATAGTCAAGATTTAGCTTTAAAGAAGCTACATAATAGTTCTCCTGCAAATGGGACGT
TAAAGCGCAAGTTGAAAGGGAACGACTTAGATTTGAAACAAATCGGTAGAAAGAATTTTG
AATTCTGTGCTTTCAGGGATCCTGTTTTATTTGTTGGACATCTTTCGAAAACTTCCACCT
TGATCATAGATAAACCTTGGATTCAAGTGGTTAAAACTCTTGATGCTCAACCAGTTCACA
GACGTATTTTTGGGACATAACTCTTGTCACAGTTTTTGTTACACAGCTTACTAGGGAATG
TTTCGTTGGGAGTATTCAACCCCTTTTCACTCAATAGATTCTTCTTTGTTGTTAGTTGGA
GTTTTGGTGCAGAAACGTTTGAAATCAATTCTCAAGTTTCAGTATAGCTTCACTTCATCT
GCAGGAGTTCTATGGTAATCGCGTGGACCTGTAAATATAACTTGTGAGCTTTACAAAGTG
TTCGTTAGCTTCTTCAGATATCGACTGAAGTTTTCATGTATCAATTGCTTCTTCCAAGTT
TCTGTAGCAAATCAGTTTTGCCCCTTGAAACAAACATTTTGATCTGCAATGTTAAAAGTC
ATTTTCTTTTATTGTGAAGGTAGTGGGTACGTAGTCTGATTCCTACCTAGATTGTTTTCG
TCTTTTCGATTTCATTTCTTGGAGCAAACCTTATTATTAGTTATTACAGATGAATTATTT
TGTTACATGCAAAA