Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g056820.2.1
CDS Infomation

Laccase (AHRD V3.3 *** A0A022RU64_ERYGU)
Sequence

ATGGCTATGAAAACATATACTTTATTTTTCATACTTCTTCTTGCCAATGTAGCTTTTGCT
AACCACTATCAATTCATTGTTAAAGAAACTTCGATCGAAAGACTTTGCAAATCAAAAAAA
ATTCTCACTGTGAATGGCAAGTTTCCTGGTCCAACAATTTATGCCAACAAAGGATCCACT
CTTATTGTTCATGTCTACAACAAAAGCAAGTATAATATCACTATTCATTGGCATGGAGTG
AAACAACCGCGAAATCCATGGTCAGATGGTCCAGTGTATATCACTCAATGTCCAATTCAA
CCAGGCTCCCAATTCAAGCAAACAATCATACTTTCTGATGAAGAAGGCACTATCTGGTGG
CACGCGCACAACAAGTGGGCGCGTGCCACAGTTCATGGCGCCATTATTGTTTATCCAAAT
CCCGGACATAGTTATCCTTTCCCTAAGCCTCATGCTGAAATACCAATTATTTTAGGTGAG
TGGTGGAAGGATAGTGTTGTGGAGGTTTTAAAGGAATTTGTTGGATCAGGAGGTCAACCA
CAGACTTCTGATGCTTTTTTAATTAATGGTCAGCCTGGTGATTATTACCCATGTTCAAAG
CATGGAACTTTCAAGCTAGAAATTAAATCTGGAAAAACTTACCTACTAAGAATTTTAAAT
GCAGCAATGCATGAAATTCTTTTTTTTGCAATTAGAAATCACAAATTAACAATTGTTGGA
ACAGATGGAAGTTACACAAAGCCATTAACAAGAGATTTTATAGCCATAAGTCCTGGTCAA
ACATTTGATTGTCTATTAAAAGCCAATCAAAATCCAAATAATTTTTATTATATGGCTGCT
AGAGCATATACTAATGGTACAAATGTCCAATTTAATAACTCAACAACAACAGCCATAATA
AAATATCAAGAAAATAATTACAATTTTAATAATTCACCAATTTCACTTCCTTATTTACCT
TCTTATTATGATACGCCTTCAACAGTTAATTTCAGTGTTAGTCTAAGGAGTTTAGCTTCG
AAAATCCGTCCAATATCCGTTCCCACTAAAGTTAAAACAAGGTTGGTTTCAACTGTCTCA
ATCAACTTATTACCATGCCCAAAAAATAATACTAGGTCATGTCAAGGTCCAAACGGAACG
CGATTATCGGCTAGTATGAATAATATAAGCTTCTTGACACCACCAAGGTATAATATACTC
GAGGCATATTATTATAATCGCGTTAAGGGCGTGTTTGGGGCGGATTTTCCCGATTTTCCG
CCTTATGTTTTTAATTATACTGATGATGTTTTGCCTTTGGAGCTTGAATTGCCTAAATTT
GGGACACAAGTGAAAGTATTGGAGTATAATACAACAGTTGAATTGGTGTTACAAGGGACA
AATTTGGTAACTGGATTAGATCATCCTATGCATCTACATGGTTACAATTTTTATGTTGTT
GGTTGGGGATTAGGTAATTTTGATGAAAAATATGATCCTAAGAATTATAATCTTGTTGAT
CCACCTAGAAGGAACAATGTTGCTGTGCCTAAAAATGGTTGGGTTGCTATTAGATTCCGA
GCTGATAATCCAGGAGTTTGGACTATGCATTGTCATATAGAGAGACATCTTACATGGGGA
ATGCAGACTGTATTTATAGTGAAAAATGGGCACAAACCAGAAGAACATATTTTGCCTCCT
CCTCATTACATGCCACCATGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g056820.2.1
PEP Infomation

Laccase (AHRD V3.3 *** A0A022RU64_ERYGU)
Sequence

MAMKTYTLFFILLLANVAFANHYQFIVKETSIERLCKSKKILTVNGKFPGPTIYANKGST
LIVHVYNKSKYNITIHWHGVKQPRNPWSDGPVYITQCPIQPGSQFKQTIILSDEEGTIWW
HAHNKWARATVHGAIIVYPNPGHSYPFPKPHAEIPIILGEWWKDSVVEVLKEFVGSGGQP
QTSDAFLINGQPGDYYPCSKHGTFKLEIKSGKTYLLRILNAAMHEILFFAIRNHKLTIVG
TDGSYTKPLTRDFIAISPGQTFDCLLKANQNPNNFYYMAARAYTNGTNVQFNNSTTTAII
KYQENNYNFNNSPISLPYLPSYYDTPSTVNFSVSLRSLASKIRPISVPTKVKTRLVSTVS
INLLPCPKNNTRSCQGPNGTRLSASMNNISFLTPPRYNILEAYYYNRVKGVFGADFPDFP
PYVFNYTDDVLPLELELPKFGTQVKVLEYNTTVELVLQGTNLVTGLDHPMHLHGYNFYVV
GWGLGNFDEKYDPKNYNLVDPPRRNNVAVPKNGWVAIRFRADNPGVWTMHCHIERHLTWG
MQTVFIVKNGHKPEEHILPPPHYMPPC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g056820.2.1
Transcript Infomation

Laccase (AHRD V3.3 *** A0A022RU64_ERYGU)
Sequence

CTAGGTTGGAGCTATCATTATAGTTATAAGTTCGGAAAGACTCATGAGCTTGAACGTTCA
ATATATCCTTGTATTTGTATTGAGTATTTTATCTAATACATGAGTAATTTATCAAAAACC
TACTAAATATAAATAATTATATGTATTTCAAAATTTATAAATTAAAAATTCTGACTCCAT
CAATCCGTGAGAGTATTTTAGCTAAAATGTAATTTATATACTAAGAGAAGTCCCAATAAC
TCATTATATATATATGTAATGACCTTAACATTTTCTTGATACTATTTCTAGTGTGCAACA
TTTAACTAATCCTTAAATTTGTTGTCTACTTTTCATTAATTACTTCTTTAATTAATTACT
CCCACCACCATTATAAATTCCTTGATCAAACAAAGTTAAAAAGTATTTGAGTCTTCAAAA
AAGAATGGCTATGAAAACATATACTTTATTTTTCATACTTCTTCTTGCCAATGTAGCTTT
TGCTAACCACTATCAATTCATTGTTAAAGAAACTTCGATCGAAAGACTTTGCAAATCAAA
AAAAATTCTCACTGTGAATGGCAAGTTTCCTGGTCCAACAATTTATGCCAACAAAGGATC
CACTCTTATTGTTCATGTCTACAACAAAAGCAAGTATAATATCACTATTCATTGGCATGG
AGTGAAACAACCGCGAAATCCATGGTCAGATGGTCCAGTGTATATCACTCAATGTCCAAT
TCAACCAGGCTCCCAATTCAAGCAAACAATCATACTTTCTGATGAAGAAGGCACTATCTG
GTGGCACGCGCACAACAAGTGGGCGCGTGCCACAGTTCATGGCGCCATTATTGTTTATCC
AAATCCCGGACATAGTTATCCTTTCCCTAAGCCTCATGCTGAAATACCAATTATTTTAGG
TGAGTGGTGGAAGGATAGTGTTGTGGAGGTTTTAAAGGAATTTGTTGGATCAGGAGGTCA
ACCACAGACTTCTGATGCTTTTTTAATTAATGGTCAGCCTGGTGATTATTACCCATGTTC
AAAGCATGGAACTTTCAAGCTAGAAATTAAATCTGGAAAAACTTACCTACTAAGAATTTT
AAATGCAGCAATGCATGAAATTCTTTTTTTTGCAATTAGAAATCACAAATTAACAATTGT
TGGAACAGATGGAAGTTACACAAAGCCATTAACAAGAGATTTTATAGCCATAAGTCCTGG
TCAAACATTTGATTGTCTATTAAAAGCCAATCAAAATCCAAATAATTTTTATTATATGGC
TGCTAGAGCATATACTAATGGTACAAATGTCCAATTTAATAACTCAACAACAACAGCCAT
AATAAAATATCAAGAAAATAATTACAATTTTAATAATTCACCAATTTCACTTCCTTATTT
ACCTTCTTATTATGATACGCCTTCAACAGTTAATTTCAGTGTTAGTCTAAGGAGTTTAGC
TTCGAAAATCCGTCCAATATCCGTTCCCACTAAAGTTAAAACAAGGTTGGTTTCAACTGT
CTCAATCAACTTATTACCATGCCCAAAAAATAATACTAGGTCATGTCAAGGTCCAAACGG
AACGCGATTATCGGCTAGTATGAATAATATAAGCTTCTTGACACCACCAAGGTATAATAT
ACTCGAGGCATATTATTATAATCGCGTTAAGGGCGTGTTTGGGGCGGATTTTCCCGATTT
TCCGCCTTATGTTTTTAATTATACTGATGATGTTTTGCCTTTGGAGCTTGAATTGCCTAA
ATTTGGGACACAAGTGAAAGTATTGGAGTATAATACAACAGTTGAATTGGTGTTACAAGG
GACAAATTTGGTAACTGGATTAGATCATCCTATGCATCTACATGGTTACAATTTTTATGT
TGTTGGTTGGGGATTAGGTAATTTTGATGAAAAATATGATCCTAAGAATTATAATCTTGT
TGATCCACCTAGAAGGAACAATGTTGCTGTGCCTAAAAATGGTTGGGTTGCTATTAGATT
CCGAGCTGATAATCCAGGAGTTTGGACTATGCATTGTCATATAGAGAGACATCTTACATG
GGGAATGCAGACTGTATTTATAGTGAAAAATGGGCACAAACCAGAAGAACATATTTTGCC
TCCTCCTCATTACATGCCACCATGCTAATTTTTCCTTTCATTATAAATTACAATTAATAT
ATACTATATAGTTATCCTAATTATTATAAGTAGAATTTGTGGAAAATTCAATAGTGTGCT
TGTGTATATATAGTACTTGAATTAAAATTAATTGTTATGATCAGAAGCATATTCAGGAAT
TTAAATGAATAGGTATATTTAACTATCGTTTGATCTTATTTCATAAAATTTTTTTACGAG
AATATATAACTTGATAAGTAAATTATACGTAAATAGTATACGTCTTCTAAAGATCGTAGT
ATCTTTATAATACTAAAATTTGTAGTTTATAAAATATGAATAATCTCTTTAATATACAAG
AGGAAAAACTAGAGAATATATACAATCTATAAATTTGTTGTTTACAAATTAAACCACCCT
AAAACATTAAAATGTAATTATCTCTACTTGGGCCGATTACTATCCATCCTTTAGTGGACC
TGTTCAATCCGGTTAATGGGCCCAAAAAAGGGAAGAACGGTATGAAATAGCAAACA