Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g056580.2.1
CDS Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1AQH6_SOLTU)
Sequence	ATGGATACTAAAGGGAGACTTATTGCTGGTTCACATAATAGGAATGAGTTTGTTCTCATC AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTGAGTGGACAGATTTGCCAG ATTTGTGGAGATGAGCTCGAAATAACGGTAGATGGGGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGAA TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAGGGGAATCAAGCT TGTCCTCAATGTAAAACTAGGTATAAGCGAATTAAAGGAAGTCCTCGAGTTGAAGGGGAT GATGAAGAAGATGAATTTGATGATCTAGACAATGAGTTTGACCCTCATCAAACTGCTGAA GCTGCCCTTTCAGCTCGCCTTAACGTTGGCCGGGGTAATCCTAATGCTTCTGGATATGCT ACCCCATCAGAGATGGATCCTGCTGCCCTTGGCACAGAGATCCCTCTACTTACTTATGGT CAAGAGGAGGATGGAATTTCAGCTGACAAACATGCTCTTATAGTCCCACCATTTATGAGT CGTGGTAAGAGAGTTCATCCAGTCGCGGATTCCTCCATGTCTTTTCCTCCTCGCCCCATG GATCCTAAGAAAGACTTGGCTGTTTATGGGTATGGTAGTGTTGCATGGAAGGAAAGAATG GAAGACTGGAAGAAAAAACAGAACGATAAATTACTGATGATTAAGCACGAAGGAGGTGGT AACAATGATGGAGATGAGCTGGATCCTGACTTGCCCAAGATGGATGAAGGCAGACAACCA CTTTCCAGAAAGAAGCCTATTGCTTCTAGCAAGCTAAGCCCATACAGATTAGTCATTTTA CTTCGACTTGTAATTCTTGGGCTCTTTTTCCACTATAGAATAATGCATCCTGTCCATGAT GCTTATGGATTGTGGTTGACATCTATTATATGTGAAATATGGTTTGCCGTATCCTGGATA TTCGATCAGTTTCCAAAATGGGTTCCCATTCAGCGAGAGACATACCTAGATAGGTTATCA CTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGAGTTGGCCCATATTGACGTTTTTGTTAGT ACAGTGGATCCTTTGAAAGAGCCTCCACTTATTACTGCAAATACCGTTCTCTCCATTCTT GCTGTGGATTATCCGGTGGATAAGGTTTCATGCTATGTCTCTGATGATGGTGCTGCCATG CTTACTTTTGAGGCACTCTCTGAAACATCCGAGTTTGCAAGGAAATGGGTCCCATTTTGC AAGAAATTCAGTATAGAGCCTCGAGCCCCAGAGTGGTATTTTGCTCAGAAGGTTGATTAT TTGAAGAACACAGTAGATCCATCATTTGTGAGGGAACGCCGTGCCATGAAGAGAGACTAT GAAGAATTTAAGGTTCGGATAAATGGATTGGTTTCCATTGCACAAAAGGTTCCTGAGGAT GGTTGGACCATGCAAGACGGAACTCCTTGGCCAGGAAACAATGTTAGGGATCATCCAGGA ATGATTCAGGTCTTTCTAGGCCATGATGGTGTCCGTGATATTGAAGGGAAGGTACTTCCT CGCCTTATTTATGTTTCTCGTGAGAAGAGGCCAGGATTTGATCACCACAAAAAGGCTGGT GCCATGAATGCTTTGATGCGGGTTTCAGCGGTCATCTCAAATGCTCCTTATTTACTCAAT GTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAAGCACTGCGAGAATCTATGTGCTTTATG ATGGATCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAATTTCCTCAGAGATTTGATGGC ATTGATCGACATGATAGATACTCAAATCGCAATGTGGTCTTCTTTGATATAAACATGAAA GGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTGGGAACTGGATGCGTCTTCAGGAGGCAA GCACTTTATGGGTATGATGCTCCAAAGAAGGCAAAACCTCCAGGAAAAACATGCAATTGT TGGCCGAACTGGTGTTGCTTTTGTTGTAAAGCGCGAAAGAAGCATAAGAAGGGGAAAACG ACCAAGGATAAAAAGAAGATAAAAGGAAAGGATGCTTCAACTCAGGTTCATGCTCTTGAG AATATCGAGGAAGGAATTGAAGGAATTGATAGCGAAAAAGCTTCCATCATGCCGCAAATA AAACTCGAGAAGAAATTTGGACAATCACCGGTATTTGTTGCTTCAACACTTCTAGAAGAT GGTGGTGTTCCTCCAGGAGCATCGTCAGCATCTCTCCTGAAAGAAGCCATCCATGTTATT AGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGTAAAGAGGTTGGATGGATTTATGGATCG GTTACTGAAGATATCTTAACTGGGTTCAAGATGCACTGCCATGGTTGGAGGTCTGTGTAT TGTATCCCCAAAAGGCCTGCATTCAAAGGGTCCGCTCCTATCAATCTTTCAGATCGTTTG CATCAGGTTCTGCGGTGGGCCTTGGGATCCGTTGAGATTTTCTTTAGTAGACATTGTCCC ATTTGGTATGGATATGGATGTGGTCTTAAACCATTGGAGCGGTTTTCGTACATAAACTCA ATTGTCTATCCATTGACCGCCCTCCCTCTGATTGCATATTGTACATTGCCAGCCATCTGT TTGCTTACTGGGAAATTCATTGTTCCTGAGCTTACCAACTATGCTAGCCTTGTATTCATG GCCCTTTTTATATCAATTGCTGCCACTACTATTCTGGAGATACGATGGGGAGGTGTTAGC CTCGAGGACATGTGGAGAAATGAGCAATTTTGGGTTATTGGTGGTGTTTCATCCCATTTC TTTGCTCTTCTCCAAGGTCTTTTTAAAGTTTTGGCTGGTGTCAACACTAGCTTCACCGTC ACATCAAAAGCAGCAGATGACGGGGAGTTTTCTGAGCTTTACGTCTTCAAGTGGACATCC TTGTTGATTCCCCCATTGACCTTGTTGATTATGAACATCATTGGAGTTGTCGTTGGAGTT TCAGATGCAATCAATAACGGGTATGAGTCATGGGGTCCTTTATTCGGAAAGCTTTTCTTC GCCTTATGGGTCATTGTTCATTTGTACCCCTTCCTCAAAGGTATGATGGGGAGACAAAGC AACGTTCCCACTATCATTATTGTGTGGTCTATCCTTCTAGCTTCTATCCTTTCGTTATTG TGGGTCCGAATCAACCCATTCTTGTCAAAAGGTGGACTCTCGTTAGAAGTATGTGGGTTG GATTGCGACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g056580.2.1
PEP Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1AQH6_SOLTU)
Sequence	MDTKGRLIAGSHNRNEFVLINADEVGRVTSVKELSGQICQICGDELEITVDGEPFVACNE CAFPVCRPCYEYERREGNQACPQCKTRYKRIKGSPRVEGDDEEDEFDDLDNEFDPHQTAE AALSARLNVGRGNPNASGYATPSEMDPAALGTEIPLLTYGQEEDGISADKHALIVPPFMS RGKRVHPVADSSMSFPPRPMDPKKDLAVYGYGSVAWKERMEDWKKKQNDKLLMIKHEGGG NNDGDELDPDLPKMDEGRQPLSRKKPIASSKLSPYRLVILLRLVILGLFFHYRIMHPVHD AYGLWLTSIICEIWFAVSWIFDQFPKWVPIQRETYLDRLSLRYEKEGKPSELAHIDVFVS TVDPLKEPPLITANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFARKWVPFC KKFSIEPRAPEWYFAQKVDYLKNTVDPSFVRERRAMKRDYEEFKVRINGLVSIAQKVPED GWTMQDGTPWPGNNVRDHPGMIQVFLGHDGVRDIEGKVLPRLIYVSREKRPGFDHHKKAG AMNALMRVSAVISNAPYLLNVDCDHYINNSKALRESMCFMMDPTSGKKICYVQFPQRFDG IDRHDRYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQALYGYDAPKKAKPPGKTCNC WPNWCCFCCKARKKHKKGKTTKDKKKIKGKDASTQVHALENIEEGIEGIDSEKASIMPQI KLEKKFGQSPVFVASTLLEDGGVPPGASSASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGKEVGWIYGS VTEDILTGFKMHCHGWRSVYCIPKRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVEIFFSRHCP IWYGYGCGLKPLERFSYINSIVYPLTALPLIAYCTLPAICLLTGKFIVPELTNYASLVFM ALFISIAATTILEIRWGGVSLEDMWRNEQFWVIGGVSSHFFALLQGLFKVLAGVNTSFTV TSKAADDGEFSELYVFKWTSLLIPPLTLLIMNIIGVVVGVSDAINNGYESWGPLFGKLFF ALWVIVHLYPFLKGMMGRQSNVPTIIIVWSILLASILSLLWVRINPFLSKGGLSLEVCGL DCD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g056580.2.1
Transcript Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1AQH6_SOLTU)
Sequence	CCCACCCCCCACACATAAAAAGAATTAATTTTTCTACTAAATGTGTATTTGTACCTCATT TTCTGTCATTCTTTAAGTTAAAAGGGGAAAAGGGGTTGTTGTTTCTTGTATTGGGTGTTC AAGAACCCATTTCTCTTGATGTGTAGTGTAATGGGGTTTTGGGTATGTTGATAAGTGAAG TGGGTTTGTGTTTCTTGTATTGAAGTTGATTTTTTGGTAATGGATACTAAAGGGAGACTT ATTGCTGGTTCACATAATAGGAATGAGTTTGTTCTCATCAATGCTGATGAAGTTGGAAGA GTAACTTCTGTGAAAGAATTGAGTGGACAGATTTGCCAGATTTGTGGAGATGAGCTCGAA ATAACGGTAGATGGGGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGAATGTGCATTTCCTGTTTGCAGA CCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAGGGGAATCAAGCTTGTCCTCAATGTAAAACTAGG TATAAGCGAATTAAAGGAAGTCCTCGAGTTGAAGGGGATGATGAAGAAGATGAATTTGAT GATCTAGACAATGAGTTTGACCCTCATCAAACTGCTGAAGCTGCCCTTTCAGCTCGCCTT AACGTTGGCCGGGGTAATCCTAATGCTTCTGGATATGCTACCCCATCAGAGATGGATCCT GCTGCCCTTGGCACAGAGATCCCTCTACTTACTTATGGTCAAGAGGAGGATGGAATTTCA GCTGACAAACATGCTCTTATAGTCCCACCATTTATGAGTCGTGGTAAGAGAGTTCATCCA GTCGCGGATTCCTCCATGTCTTTTCCTCCTCGCCCCATGGATCCTAAGAAAGACTTGGCT GTTTATGGGTATGGTAGTGTTGCATGGAAGGAAAGAATGGAAGACTGGAAGAAAAAACAG AACGATAAATTACTGATGATTAAGCACGAAGGAGGTGGTAACAATGATGGAGATGAGCTG GATCCTGACTTGCCCAAGATGGATGAAGGCAGACAACCACTTTCCAGAAAGAAGCCTATT GCTTCTAGCAAGCTAAGCCCATACAGATTAGTCATTTTACTTCGACTTGTAATTCTTGGG CTCTTTTTCCACTATAGAATAATGCATCCTGTCCATGATGCTTATGGATTGTGGTTGACA TCTATTATATGTGAAATATGGTTTGCCGTATCCTGGATATTCGATCAGTTTCCAAAATGG GTTCCCATTCAGCGAGAGACATACCTAGATAGGTTATCACTGAGGTATGAGAAAGAAGGG AAGCCTTCTGAGTTGGCCCATATTGACGTTTTTGTTAGTACAGTGGATCCTTTGAAAGAG CCTCCACTTATTACTGCAAATACCGTTCTCTCCATTCTTGCTGTGGATTATCCGGTGGAT AAGGTTTCATGCTATGTCTCTGATGATGGTGCTGCCATGCTTACTTTTGAGGCACTCTCT GAAACATCCGAGTTTGCAAGGAAATGGGTCCCATTTTGCAAGAAATTCAGTATAGAGCCT CGAGCCCCAGAGTGGTATTTTGCTCAGAAGGTTGATTATTTGAAGAACACAGTAGATCCA TCATTTGTGAGGGAACGCCGTGCCATGAAGAGAGACTATGAAGAATTTAAGGTTCGGATA AATGGATTGGTTTCCATTGCACAAAAGGTTCCTGAGGATGGTTGGACCATGCAAGACGGA ACTCCTTGGCCAGGAAACAATGTTAGGGATCATCCAGGAATGATTCAGGTCTTTCTAGGC CATGATGGTGTCCGTGATATTGAAGGGAAGGTACTTCCTCGCCTTATTTATGTTTCTCGT GAGAAGAGGCCAGGATTTGATCACCACAAAAAGGCTGGTGCCATGAATGCTTTGATGCGG GTTTCAGCGGTCATCTCAAATGCTCCTTATTTACTCAATGTGGATTGTGATCACTATATA AATAACAGTAAAGCACTGCGAGAATCTATGTGCTTTATGATGGATCCCACTTCAGGAAAG AAAATATGCTACGTACAATTTCCTCAGAGATTTGATGGCATTGATCGACATGATAGATAC TCAAATCGCAATGTGGTCTTCTTTGATATAAACATGAAAGGACTTGATGGGATCCAGGGT CCAATTTATGTGGGAACTGGATGCGTCTTCAGGAGGCAAGCACTTTATGGGTATGATGCT CCAAAGAAGGCAAAACCTCCAGGAAAAACATGCAATTGTTGGCCGAACTGGTGTTGCTTT TGTTGTAAAGCGCGAAAGAAGCATAAGAAGGGGAAAACGACCAAGGATAAAAAGAAGATA AAAGGAAAGGATGCTTCAACTCAGGTTCATGCTCTTGAGAATATCGAGGAAGGAATTGAA GGAATTGATAGCGAAAAAGCTTCCATCATGCCGCAAATAAAACTCGAGAAGAAATTTGGA CAATCACCGGTATTTGTTGCTTCAACACTTCTAGAAGATGGTGGTGTTCCTCCAGGAGCA TCGTCAGCATCTCTCCTGAAAGAAGCCATCCATGTTATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAA ACAGAATGGGGTAAAGAGGTTGGATGGATTTATGGATCGGTTACTGAAGATATCTTAACT GGGTTCAAGATGCACTGCCATGGTTGGAGGTCTGTGTATTGTATCCCCAAAAGGCCTGCA TTCAAAGGGTCCGCTCCTATCAATCTTTCAGATCGTTTGCATCAGGTTCTGCGGTGGGCC TTGGGATCCGTTGAGATTTTCTTTAGTAGACATTGTCCCATTTGGTATGGATATGGATGT GGTCTTAAACCATTGGAGCGGTTTTCGTACATAAACTCAATTGTCTATCCATTGACCGCC CTCCCTCTGATTGCATATTGTACATTGCCAGCCATCTGTTTGCTTACTGGGAAATTCATT GTTCCTGAGCTTACCAACTATGCTAGCCTTGTATTCATGGCCCTTTTTATATCAATTGCT GCCACTACTATTCTGGAGATACGATGGGGAGGTGTTAGCCTCGAGGACATGTGGAGAAAT GAGCAATTTTGGGTTATTGGTGGTGTTTCATCCCATTTCTTTGCTCTTCTCCAAGGTCTT TTTAAAGTTTTGGCTGGTGTCAACACTAGCTTCACCGTCACATCAAAAGCAGCAGATGAC GGGGAGTTTTCTGAGCTTTACGTCTTCAAGTGGACATCCTTGTTGATTCCCCCATTGACC TTGTTGATTATGAACATCATTGGAGTTGTCGTTGGAGTTTCAGATGCAATCAATAACGGG TATGAGTCATGGGGTCCTTTATTCGGAAAGCTTTTCTTCGCCTTATGGGTCATTGTTCAT TTGTACCCCTTCCTCAAAGGTATGATGGGGAGACAAAGCAACGTTCCCACTATCATTATT GTGTGGTCTATCCTTCTAGCTTCTATCCTTTCGTTATTGTGGGTCCGAATCAACCCATTC TTGTCAAAAGGTGGACTCTCGTTAGAAGTATGTGGGTTGGATTGCGACTAAGAAGACACA AAATAGAGACACATAAATGTATATGAGAACGGAAAGTTCATATCGTGGGGAGAACTTTAA GTTCATTCCCCTAACTCTGTTGTTTGATCAACGATGAATATGAGGAAGAGCATGTGATGG TTTTGTATAGATTATAAAATGCAGGTAGCAGCAGCAGCAGCAGACACATTGATATTCGTT TTGCAAAGTGTTTCTTGATTCTTTTTCGATACGTTTTTTTTGGGATTTGTGGCTTGCATT CTGTGGAGTTTCAATATCTGCAATCCCAATAGAACATAAGATTATTTGTCACAAGTTATA TCCCCTTCTCAATAAGGGATTTTCACACTGAAAGCAAGTGTGTTATTGATTTCTGATGTT TCATTCTGTATGCTGTAGTTGATGGTCTGAACTGGTAAAATCTGTTTGTTTATCAACTTT GGTATTAGTTAGTAGTTGCCTATGAAGTTGCAATTTGATTTTCAGAAATGTTAATGTTTT TGTACTGTTCATTCAATTTTTGCTACTTGCATTTGAATGCTGCTGCTCTAATAAGTCTAG TTATCATACTGATACTGTGTTGGACTTTATTTGCTTCTTACCCTACATAGATTTTTCTTT TCGAGTATAGTCCTTTCCTGGTAGGAAGACTCTATAAATATAGGTTCGTCCTTTTTTCGT AGGAAAAGTTTTAGACTCAACATTCACAACGTAAT