Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g049570.2.1
CDS Infomation	ARID/BRIGHT DNA-binding domain-containing protein (AHRD V3.3 *** AT3G43240.1)
Sequence	ATGTGGCGTAGATCAGCTTCTTTCATTCTCGACAAAAACCAAAACGACGTCTCTGGAAGT CACCATCTTTCTCCTCTTTCAGCTCAAGCTGCCGTAGACCAACCATCTGAAGACGTTGTA TCCTCGAATGTTTCTTCTAAGTCTGGAGATTTGAGTGGGAAATTTAATGTGATTGATGAG TTTAATAATTGGCGTAAACAACCTGATTTGGCTGAGGCTGTTGCTGCTATTAGGGCTTTG GCTTCAGTTATAAGGTCTAGTGAAGCTACTACTATGATGGAACTTGAAATTGAACTCAAA AAAGCTTCTGATTCTCTCAAGTCATGGGATAAAACCTCCATCTCTTTGACAGCTGGTTGT GATTTGTTCATGCGCTATGTAACAAGAACTTCAGCATTGGAATATGAGGACTTTAATTCA GCCAAGTCTCGCTTTCTTGAACGTGCGGAGAAGTTTGGGGAAATATCTTATAAGGCTCGG AAGATAATTGCAATGCTCAGCCAAGAATTTATTTTTGATGGTTGCACCATTTTAGTACAT GGCTTCTCCAGAGTTGTGTTTGAGGTTCTGAAAACAGCTGCTCAGAATAGGAAGAATTTT CGAGTTCTTTGCACTGAAGGGAGGCCAGACAGGAGTGGGTTACGATTGTCTAATGAGCTA GCGAAGCTTGATGTTCCTGTAAAACTCTTAATAGATTCTGCTGTGGCATACAACATGGAT GAAATTGACATGGTTTTTGTTGGGGCAGACGGTGTGGTTGAAAGCGGAGGCGTTATCAAC ATGATGGGAACCTACCAAATTGCTTTGGTAGCGAAGAGCATGAATAAACCAGTCTATGTA GCTGCTGAAAGCTACAAGTTTGCTCGTCTCTATCCACTGGACCAAAAAGATATGTTTCCA GCTTTACGTCCAATTGATTTTGGGGTGCCAATTCCGTCCAAGGTGGAGGTTGAAACATCT GCTCGCGATTATACACCACCCCAGTATCTTACACTGCTATTCACAGATTTGGGCGTTCTA ACACCATCTGTAGGTTCGCTAAAGAGTTTAGATTCAGGGTGTAAGATTATAGTGGAGTGG AGTTTAGCTGCTGCAAAGAAAGATGTACATGATGGTAAGCCGAGATATTGCTTCCCGGAG ATTGTATCATCAGGGCGTTTGGAGGTGCAAGTGTTGAAAAACCCAAGTACCGATGAATTT CATAAAGTTTTAGATTCATGGCAGCCAAATATTGTATATTTGCAAGGAGAACATCTTTCG AATGATGAAGTTGGTTCACTTGTTTGGGGAGGTCTTGATTTGTCTTCTGCGGAGGCCATT TCTGGACTTTTTAGTTCCGTACTGCCAACTGCTGTCTATTTGGAGCTCCCAAATGGAGAA AAATTGGCTGAAGCACTTCATGCTAAGGGAATTCCTTATGTGATGTACTGGAAGAGTGCA TTTTCCTGCTATGCAGCATCCCATTTCCGACATGCATTTTTATGTGTGGCACAGAGTTCA ACTTGTCATGTTTGGGATGCTTTCCAACTTGCACATGCATCCTTCAGGCTTTACTGTGTA CGAAATAATTTTGCTCTCTCTGAGATGAGTCAGAGGGACAGTGATAATGTGGGTCCTCAC CTGCTTGGTGATCCTCCAAACATTGATGTCCCTCTACCTGAGGCAGGTCCGGAAGATGAT GAAGAAAGCAATTCTGATGCTCTTCCTGCCATAAAGATCTATGATGATGATGTGACCATG AGATTTCTTGTCTGTGGATTGCCATGCTCATTGGATGAATGCTTGTTGGGATCTATAGCC GATGGTCTGAATGCCCTCTTAAACATAGAAATGCGAGGGAGTAAGCTGCATAACCGGGTC AGTGCCCTTCCACCTCCTCTTCAGGCTGGTACATTTTCCCGTGGTGTTGTGACTATGCGG TGTGATCTGTCAACCAGTAGTTCTGCTCATATTTCACTTCTAGTTTCAGGCAGTGCTCAA ACATGTTTTGATGATCTGCTATTAGAGAATCACATAAAAAGTGAAATCATTGAAAATAGT ACGCTGGTTCATGTACTGCCAAGTGATGAGGAAAATAGACCACCTATATCTGCACCTCGC AGATCAATGTCTGTAGCTTGTGGATCAGAAGTATTTGAAGTTTGCATGAAGGTTCCGATG TGGGCTTCACAGGTTTTGAGACAATTGGCTCCTGATGTTTCATATCGTAGTTTAGTTGCA CTTGGCATTGCTAGCATTCAGGGACTAGCTGTAGCTTCTTTTGAGAAAGATGATGCTCAA CGACTTCTTTTCTTCTGCACAAAGCAAGGGAAGGATGGGTTTTTTGGTAATTTTAAGATG GGCAATCCTCCAGCATGGTTAAGACCGCCTGCTCCTAGTAGAAAGAGGTCTGATTTTTAC CAGGGAGCGAGTTATATATGCCAAAATGGGTTAACACCTGGAAATCATGTGGCTGTGAAA GAAGAGAAAGAAAGTCGATTAGGGAATGGTGTTGCCACACCTCTGGTGACTGCTAGACAA AAACTCAAAGTTGCTGCTATGAGGCCCATTCCTCATGTCCGTCACCAGAAAATGCTACCA TTTTCACGAATTTCGGAGCTGGATAGCCTTGATGGGAACCAGGTGAAAACGAATCTGCCC ATCATTCCTTCTTCAACTAAGGGTAGCAATGTTGGAGTAACTCCGGCCACCCATCGAAAA TCAGCATCAAGCTCACATCAGGCTAAGCAAATTATATCCTTGAATCCTCTTCCACTGAAG AAACATGGTTGTGGGCGAAGCCCAATACATGTGTGTTCTGAGGAGGAATTTCTGAAAGAT GTAATGCAGTTTTTAATTCTTCGTGGGCATACTCGTCTCATTCCTCAAAGTGGCATTGCT GAGTTTCCAGACGCTATTCTCAATGCCAAACGCCTTGACCTCTTTAACTTGTATAGGGAG GTGGTTTCAAGGGGTGGGTTTCATGTTGGCAACGGCATCAATTGGAAAGGGCAAGTTTTC TCAAAGATGCGAAATCACACAGTAACCAATAGGATGACTGGTGTTGGGAATACACTTAAA AGACATTATGAAACTTACCTTTTGGAGTATGAATTGGCTCATGATGATGTTGATGGAGAG TGCTGCTTGTTATGTAACAGTAGTGCTGCTGGAGATTGGGTTAACTGTGGGATTTGTGGT GAGTGGGCACATTTTGGCTGTGATAGAAGACCAGGTCTCGGCGCCTTCAAGGACTATGCA AAGACAGATGGACTGGAATACATATGTCCGCAATGCAGCGTGACTAATTTTAAAAAGAAG AGGAAGACGCGGAGGCGTATATTGAACAGAAGTGAAAAGGCGTTGGAAGGCGCCAGGCGG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g049570.2.1
PEP Infomation	ARID/BRIGHT DNA-binding domain-containing protein (AHRD V3.3 *** AT3G43240.1)
Sequence	MWRRSASFILDKNQNDVSGSHHLSPLSAQAAVDQPSEDVVSSNVSSKSGDLSGKFNVIDE FNNWRKQPDLAEAVAAIRALASVIRSSEATTMMELEIELKKASDSLKSWDKTSISLTAGC DLFMRYVTRTSALEYEDFNSAKSRFLERAEKFGEISYKARKIIAMLSQEFIFDGCTILVH GFSRVVFEVLKTAAQNRKNFRVLCTEGRPDRSGLRLSNELAKLDVPVKLLIDSAVAYNMD EIDMVFVGADGVVESGGVINMMGTYQIALVAKSMNKPVYVAAESYKFARLYPLDQKDMFP ALRPIDFGVPIPSKVEVETSARDYTPPQYLTLLFTDLGVLTPSVGSLKSLDSGCKIIVEW SLAAAKKDVHDGKPRYCFPEIVSSGRLEVQVLKNPSTDEFHKVLDSWQPNIVYLQGEHLS NDEVGSLVWGGLDLSSAEAISGLFSSVLPTAVYLELPNGEKLAEALHAKGIPYVMYWKSA FSCYAASHFRHAFLCVAQSSTCHVWDAFQLAHASFRLYCVRNNFALSEMSQRDSDNVGPH LLGDPPNIDVPLPEAGPEDDEESNSDALPAIKIYDDDVTMRFLVCGLPCSLDECLLGSIA DGLNALLNIEMRGSKLHNRVSALPPPLQAGTFSRGVVTMRCDLSTSSSAHISLLVSGSAQ TCFDDLLLENHIKSEIIENSTLVHVLPSDEENRPPISAPRRSMSVACGSEVFEVCMKVPM WASQVLRQLAPDVSYRSLVALGIASIQGLAVASFEKDDAQRLLFFCTKQGKDGFFGNFKM GNPPAWLRPPAPSRKRSDFYQGASYICQNGLTPGNHVAVKEEKESRLGNGVATPLVTARQ KLKVAAMRPIPHVRHQKMLPFSRISELDSLDGNQVKTNLPIIPSSTKGSNVGVTPATHRK SASSSHQAKQIISLNPLPLKKHGCGRSPIHVCSEEEFLKDVMQFLILRGHTRLIPQSGIA EFPDAILNAKRLDLFNLYREVVSRGGFHVGNGINWKGQVFSKMRNHTVTNRMTGVGNTLK RHYETYLLEYELAHDDVDGECCLLCNSSAAGDWVNCGICGEWAHFGCDRRPGLGAFKDYA KTDGLEYICPQCSVTNFKKKRKTRRRILNRSEKALEGARR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g049570.2.1
Transcript Infomation	ARID/BRIGHT DNA-binding domain-containing protein (AHRD V3.3 *** AT3G43240.1)
Sequence	ATGTGGCGTAGATCAGCTTCTTTCATTCTCGACAAAAACCAAAACGACGTCTCTGGAAGT CACCATCTTTCTCCTCTTTCAGCTCAAGCTGCCGTAGACCAACCATCTGAAGACGTTGTA TCCTCGAATGTTTCTTCTAAGTCTGGAGATTTGAGTGGGAAATTTAATGTGATTGATGAG TTTAATAATTGGCGTAAACAACCTGATTTGGCTGAGGCTGTTGCTGCTATTAGGGCTTTG GCTTCAGTTATAAGGTCTAGTGAAGCTACTACTATGATGGAACTTGAAATTGAACTCAAA AAAGCTTCTGATTCTCTCAAGTCATGGGATAAAACCTCCATCTCTTTGACAGCTGGTTGT GATTTGTTCATGCGCTATGTAACAAGAACTTCAGCATTGGAATATGAGGACTTTAATTCA GCCAAGTCTCGCTTTCTTGAACGTGCGGAGAAGTTTGGGGAAATATCTTATAAGGCTCGG AAGATAATTGCAATGCTCAGCCAAGAATTTATTTTTGATGGTTGCACCATTTTAGTACAT GGCTTCTCCAGAGTTGTGTTTGAGGTTCTGAAAACAGCTGCTCAGAATAGGAAGAATTTT CGAGTTCTTTGCACTGAAGGGAGGCCAGACAGGAGTGGGTTACGATTGTCTAATGAGCTA GCGAAGCTTGATGTTCCTGTAAAACTCTTAATAGATTCTGCTGTGGCATACAACATGGAT GAAATTGACATGGTTTTTGTTGGGGCAGACGGTGTGGTTGAAAGCGGAGGCGTTATCAAC ATGATGGGAACCTACCAAATTGCTTTGGTAGCGAAGAGCATGAATAAACCAGTCTATGTA GCTGCTGAAAGCTACAAGTTTGCTCGTCTCTATCCACTGGACCAAAAAGATATGTTTCCA GCTTTACGTCCAATTGATTTTGGGGTGCCAATTCCGTCCAAGGTGGAGGTTGAAACATCT GCTCGCGATTATACACCACCCCAGTATCTTACACTGCTATTCACAGATTTGGGCGTTCTA ACACCATCTGTAGGTTCGCTAAAGAGTTTAGATTCAGGGTGTAAGATTATAGTGGAGTGG AGTTTAGCTGCTGCAAAGAAAGATGTACATGATGGTAAGCCGAGATATTGCTTCCCGGAG ATTGTATCATCAGGGCGTTTGGAGGTGCAAGTGTTGAAAAACCCAAGTACCGATGAATTT CATAAAGTTTTAGATTCATGGCAGCCAAATATTGTATATTTGCAAGGAGAACATCTTTCG AATGATGAAGTTGGTTCACTTGTTTGGGGAGGTCTTGATTTGTCTTCTGCGGAGGCCATT TCTGGACTTTTTAGTTCCGTACTGCCAACTGCTGTCTATTTGGAGCTCCCAAATGGAGAA AAATTGGCTGAAGCACTTCATGCTAAGGGAATTCCTTATGTGATGTACTGGAAGAGTGCA TTTTCCTGCTATGCAGCATCCCATTTCCGACATGCATTTTTATGTGTGGCACAGAGTTCA ACTTGTCATGTTTGGGATGCTTTCCAACTTGCACATGCATCCTTCAGGCTTTACTGTGTA CGAAATAATTTTGCTCTCTCTGAGATGAGTCAGAGGGACAGTGATAATGTGGGTCCTCAC CTGCTTGGTGATCCTCCAAACATTGATGTCCCTCTACCTGAGGCAGGTCCGGAAGATGAT GAAGAAAGCAATTCTGATGCTCTTCCTGCCATAAAGATCTATGATGATGATGTGACCATG AGATTTCTTGTCTGTGGATTGCCATGCTCATTGGATGAATGCTTGTTGGGATCTATAGCC GATGGTCTGAATGCCCTCTTAAACATAGAAATGCGAGGGAGTAAGCTGCATAACCGGGTC AGTGCCCTTCCACCTCCTCTTCAGGCTGGTACATTTTCCCGTGGTGTTGTGACTATGCGG TGTGATCTGTCAACCAGTAGTTCTGCTCATATTTCACTTCTAGTTTCAGGCAGTGCTCAA ACATGTTTTGATGATCTGCTATTAGAGAATCACATAAAAAGTGAAATCATTGAAAATAGT ACGCTGGTTCATGTACTGCCAAGTGATGAGGAAAATAGACCACCTATATCTGCACCTCGC AGATCAATGTCTGTAGCTTGTGGATCAGAAGTATTTGAAGTTTGCATGAAGGTTCCGATG TGGGCTTCACAGGTTTTGAGACAATTGGCTCCTGATGTTTCATATCGTAGTTTAGTTGCA CTTGGCATTGCTAGCATTCAGGGACTAGCTGTAGCTTCTTTTGAGAAAGATGATGCTCAA CGACTTCTTTTCTTCTGCACAAAGCAAGGGAAGGATGGGTTTTTTGGTAATTTTAAGATG GGCAATCCTCCAGCATGGTTAAGACCGCCTGCTCCTAGTAGAAAGAGGTCTGATTTTTAC CAGGGAGCGAGTTATATATGCCAAAATGGGTTAACACCTGGAAATCATGTGGCTGTGAAA GAAGAGAAAGAAAGTCGATTAGGGAATGGTGTTGCCACACCTCTGGTGACTGCTAGACAA AAACTCAAAGTTGCTGCTATGAGGCCCATTCCTCATGTCCGTCACCAGAAAATGCTACCA TTTTCACGAATTTCGGAGCTGGATAGCCTTGATGGGAACCAGGTGAAAACGAATCTGCCC ATCATTCCTTCTTCAACTAAGGGTAGCAATGTTGGAGTAACTCCGGCCACCCATCGAAAA TCAGCATCAAGCTCACATCAGGCTAAGCAAATTATATCCTTGAATCCTCTTCCACTGAAG AAACATGGTTGTGGGCGAAGCCCAATACATGTGTGTTCTGAGGAGGAATTTCTGAAAGAT GTAATGCAGTTTTTAATTCTTCGTGGGCATACTCGTCTCATTCCTCAAAGTGGCATTGCT GAGTTTCCAGACGCTATTCTCAATGCCAAACGCCTTGACCTCTTTAACTTGTATAGGGAG GTGGTTTCAAGGGGTGGGTTTCATGTTGGCAACGGCATCAATTGGAAAGGGCAAGTTTTC TCAAAGATGCGAAATCACACAGTAACCAATAGGATGACTGGTGTTGGGAATACACTTAAA AGACATTATGAAACTTACCTTTTGGAGTATGAATTGGCTCATGATGATGTTGATGGAGAG TGCTGCTTGTTATGTAACAGTAGTGCTGCTGGAGATTGGGTTAACTGTGGGATTTGTGGT GAGTGGGCACATTTTGGCTGTGATAGAAGACCAGGTCTCGGCGCCTTCAAGGACTATGCA AAGACAGATGGACTGGAATACATATGTCCGCAATGCAGCGTGACTAATTTTAAAAAGAAG AGGAAGACGCGGAGGCGTATATTGAACAGAAGTGAAAAGGCGTTGGAAGGCGCCAGGCGG TGACTAGGAGTGGTGCCACTCTCATTAGGAGGAAGAATTGTAGAGATACAGAAAGAGTTG AGACTGCAGGCAGGCAGGCTCATGGCAAGTCTTTGTAATATATATAATCCTCTGTTGAGG ATGTGACATTTTGTAGCTTGGTTGGTGGAATTCATATTTCTGAAATTTCACACATCTTTT TTTTGTCTTCTTTTCTGCCCACCTTGAATTTTCTTCTACTTTATTTTCCTAGTATGCGAG CTGGGAATTTTAGTAGCTTAGTTGATTGGTTACTTGAACTCTCACCGATTTAGCACACCA CCTTGAATTTTCTTCTACTTTATTTTTCTAGTTTGCAAGCCGAAAATTTTAGTAGCTTAG TTAATTGGTTACTTGAACTTTCACCGATTTACCACACCACCTTGAATTTTCTTCTACTTT ATTTTTCTATTCTACAAGCCGAAAATTTTAGTAGCTTAGTTAATTGGTTACTTGAACTTT TATCGATTTACCACACCACCTTGAATTTTCTTCTACTTTATTTTTCTATTCTGCAAGCCG AAAATTTTAGTAGCTTAGTTAATTGGTTACTTGAACTTTCATCGATTTACCACATCACTT TGAATTTTCTTCTACTTTATTTTTCTAGTCTGCAAGTCAAAAATTTTAATTGTTTAGTTG ATTGGTTACTTGAACTTTCACTTATTTACCGCCTTATAATTCCTTTTTCTTCTTTCAATT ATCCTCATTTCCTTTTTATAGAAAAAAAGTCAAAAAGAGTAATTAATACTAATTAAACTT GTTTAACCAAAGTGATCTTTAATAAACTATAAAAAATAAACCAAATAGAAGGAAGAGAAA TTGCGATAAATGCAACAAGCAAAGAAGTTATACACGTTAGATTAACTTAGTGACCATTTG TCTGTGGATATATTTTTTTTTGCTTTCTTTTGGAATTAAATTCTGAAAATCATTTTTTAT TATAAAATTTTTGAAACTGAACTCCAACATTTTAAAACATCAAAAAAATATTTTCACAAA GATTTAAAAGTAATTCAATAATTTGTATTCATGGAGAAACATAACTTAAGCCGATGAGAA ATGGTTACGCCTAGGAACATTG