Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g043020.2.1

CDS Infomation

Dihydroxy-acid dehydratase (AHRD V3.3 *** A0A1D1YZH9_9ARAE)

Sequence

ATGCAAGCCCATTTGCTCTCCCCCACCATATACCCCGCCACCACCACCACCAGCCCCCTT
TTCCCCAAATGTAGGACCCACTTAAGAAAACCACCCACTCTCACCATCCGAGCTTCCTCA
ACGGAAACATCGACTCCACCACCACAGACCTCTACCTCAACAGACCCATCTCAGCAACTC
AACAAATACAGCAGCCGCATTACTCAACCCAAGTCACAGGGTGGTTCACAGGCGATTCTC
TATGGAGTAGGATTAACTGATGAGGATATGAACAAACCCCAAATTGGGATATCCTCTGTT
TGGTATGAAGGCAACACTTGTAATATGCATTTGTTAAAGCTTGCTGAAGCTGTTAAAGAA
GGGGTTACAGAAGCTGGCATGGTGGGGTTCAGGTTTAATACCATTGGTGTTAGTGATGCT
ATTTCCATGGGGACTAGAGGCATGTGTTTTAGTTTGCAGTCAAGAGATTTGATTGCTGAT
AGTATTGAAACTGTCATGTCTGCTCAGTGGTATGATGGGAATATTGCCATTCCTGGTTGT
GATAAAAATATGCCAGGTACAATTATGGCGATGGGAAGACTAAACAGGCCAAGTATCATG
ATATATGGTGGAACCATTAAGCCTGGTCATTTCCAAGGGCACACATTCGATATAGTGTCC
GCTTTCCAGGTGTATGGAGAGTATGTTAGTGGTGCTGTTAGTGATGAACAGAGGATGAAT
GTAGTTCGTAATTCATGTCCTGGTGCGGGGGCTTGTGGTGGAATGTATACAGCAAATACC
ATGGCATCTGCTATTGAGGCAATGGGCATGTCACTGCCTTATAGCTCTTCCACACCCGCT
GAAGACTCACTAAAGTTGGATGAGTGTCGCCTAGCGGGAAAATATCTTATGGAATTATTA
AAGATGGACTTGAAACCTCGAGATATCATCACAAAAAAGTCCCTTCGAAATGCAATGGTA
GTTGTCATGGCACTTGGTGGATCTACCAATGCCGTACTACATTTAATTGCTATTGCAAGG
TCTGTTGGTTTGGAATTAACTCTAGATGACTTCCAAAAGGTTAGCGATGAGGTTCCTTTC
CTTGCAGATCTGAAGCCTAGTGGAAAATATGTTATGGAGGATGTGCACAAGATTGGAGGT
ACACCCGCAGTCATTCGCCACCTGTTGGAGCTTGGGTATATGGATGGGGACTGTATGACT
GTCACAGGAAAGACTCTGGCTGAAAATGCAAAGCTATTTCCTTCTTTAGCTGAAGGTCAG
CAAATTATAAGACCACTATCAAACCCCATCAAAGAAACAGGCCACATCCAGATATTGTAT
GGGAATCTTGCACCAGAGGGGAGCGTGGCAAAGATCACTGGAAAAGAAGGGCTATACTTT
TCTGGCCCCGCCTTAGTGTTTGAAGGAGAGGAGGCTATGCTTGCAGCTATCTCAGAAGAT
CCTTTAAGTTTTAAGGGAAAAGTTGTAGTCATTAGAGGAGAGGGACCTAAGGGAGGACCA
GGTATGGCTGAAATGCTGACACCCACAAGTGCAATTATGGGTGCAGGTCTTGGGAAGGAT
GTTGCTTTACTTACTGATGGAAGATTTTCTGGAGGTTCTCATGGATACGTTGTGGGGCAT
ATATGTCCTGAAGCACAGGAAGGAGGTCCAATTGGTCTTGTTCAAAATGGAGACATAATA
ACAATAGACATTCAGAAAAAGAAAATGGATGTTCAGTTATCAGACGAGGTGTTGGAACAG
CGTAGAAAGAATTGGACACCCCCTGCATATAAGGCTGACCGAGGGGTTCTCTACAAGTAT
ATAAAAAATGTGCAATCCGCTTCCAAGGGATGTGTTACCGATGAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g043020.2.1

PEP Infomation

Dihydroxy-acid dehydratase (AHRD V3.3 *** A0A1D1YZH9_9ARAE)

Sequence

MQAHLLSPTIYPATTTTSPLFPKCRTHLRKPPTLTIRASSTETSTPPPQTSTSTDPSQQL
NKYSSRITQPKSQGGSQAILYGVGLTDEDMNKPQIGISSVWYEGNTCNMHLLKLAEAVKE
GVTEAGMVGFRFNTIGVSDAISMGTRGMCFSLQSRDLIADSIETVMSAQWYDGNIAIPGC
DKNMPGTIMAMGRLNRPSIMIYGGTIKPGHFQGHTFDIVSAFQVYGEYVSGAVSDEQRMN
VVRNSCPGAGACGGMYTANTMASAIEAMGMSLPYSSSTPAEDSLKLDECRLAGKYLMELL
KMDLKPRDIITKKSLRNAMVVVMALGGSTNAVLHLIAIARSVGLELTLDDFQKVSDEVPF
LADLKPSGKYVMEDVHKIGGTPAVIRHLLELGYMDGDCMTVTGKTLAENAKLFPSLAEGQ
QIIRPLSNPIKETGHIQILYGNLAPEGSVAKITGKEGLYFSGPALVFEGEEAMLAAISED
PLSFKGKVVVIRGEGPKGGPGMAEMLTPTSAIMGAGLGKDVALLTDGRFSGGSHGYVVGH
ICPEAQEGGPIGLVQNGDIITIDIQKKKMDVQLSDEVLEQRRKNWTPPAYKADRGVLYKY
IKNVQSASKGCVTDE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g043020.2.1

Transcript Infomation

Dihydroxy-acid dehydratase (AHRD V3.3 *** A0A1D1YZH9_9ARAE)

Sequence

CATGTTTCCTATATAATTTTATTATTTCTCTCTATCCTTTGTCTTGAATTCTTACTTGTC
TCACTCAAGAGTCCAACTCTACCCACCCTGACAAGTGACAATATCTATTTTTGTCTCAAA
TCCCCTACAAAACCCTCTGAACAGCTTCTCCGCCGTCACTTACAGTCAATCTCCGCCACT
ATGCAAGCCCATTTGCTCTCCCCCACCATATACCCCGCCACCACCACCACCAGCCCCCTT
TTCCCCAAATGTAGGACCCACTTAAGAAAACCACCCACTCTCACCATCCGAGCTTCCTCA
ACGGAAACATCGACTCCACCACCACAGACCTCTACCTCAACAGACCCATCTCAGCAACTC
AACAAATACAGCAGCCGCATTACTCAACCCAAGTCACAGGGTGGTTCACAGGCGATTCTC
TATGGAGTAGGATTAACTGATGAGGATATGAACAAACCCCAAATTGGGATATCCTCTGTT
TGGTATGAAGGCAACACTTGTAATATGCATTTGTTAAAGCTTGCTGAAGCTGTTAAAGAA
GGGGTTACAGAAGCTGGCATGGTGGGGTTCAGGTTTAATACCATTGGTGTTAGTGATGCT
ATTTCCATGGGGACTAGAGGCATGTGTTTTAGTTTGCAGTCAAGAGATTTGATTGCTGAT
AGTATTGAAACTGTCATGTCTGCTCAGTGGTATGATGGGAATATTGCCATTCCTGGTTGT
GATAAAAATATGCCAGGTACAATTATGGCGATGGGAAGACTAAACAGGCCAAGTATCATG
ATATATGGTGGAACCATTAAGCCTGGTCATTTCCAAGGGCACACATTCGATATAGTGTCC
GCTTTCCAGGTGTATGGAGAGTATGTTAGTGGTGCTGTTAGTGATGAACAGAGGATGAAT
GTAGTTCGTAATTCATGTCCTGGTGCGGGGGCTTGTGGTGGAATGTATACAGCAAATACC
ATGGCATCTGCTATTGAGGCAATGGGCATGTCACTGCCTTATAGCTCTTCCACACCCGCT
GAAGACTCACTAAAGTTGGATGAGTGTCGCCTAGCGGGAAAATATCTTATGGAATTATTA
AAGATGGACTTGAAACCTCGAGATATCATCACAAAAAAGTCCCTTCGAAATGCAATGGTA
GTTGTCATGGCACTTGGTGGATCTACCAATGCCGTACTACATTTAATTGCTATTGCAAGG
TCTGTTGGTTTGGAATTAACTCTAGATGACTTCCAAAAGGTTAGCGATGAGGTTCCTTTC
CTTGCAGATCTGAAGCCTAGTGGAAAATATGTTATGGAGGATGTGCACAAGATTGGAGGT
ACACCCGCAGTCATTCGCCACCTGTTGGAGCTTGGGTATATGGATGGGGACTGTATGACT
GTCACAGGAAAGACTCTGGCTGAAAATGCAAAGCTATTTCCTTCTTTAGCTGAAGGTCAG
CAAATTATAAGACCACTATCAAACCCCATCAAAGAAACAGGCCACATCCAGATATTGTAT
GGGAATCTTGCACCAGAGGGGAGCGTGGCAAAGATCACTGGAAAAGAAGGGCTATACTTT
TCTGGCCCCGCCTTAGTGTTTGAAGGAGAGGAGGCTATGCTTGCAGCTATCTCAGAAGAT
CCTTTAAGTTTTAAGGGAAAAGTTGTAGTCATTAGAGGAGAGGGACCTAAGGGAGGACCA
GGTATGGCTGAAATGCTGACACCCACAAGTGCAATTATGGGTGCAGGTCTTGGGAAGGAT
GTTGCTTTACTTACTGATGGAAGATTTTCTGGAGGTTCTCATGGATACGTTGTGGGGCAT
ATATGTCCTGAAGCACAGGAAGGAGGTCCAATTGGTCTTGTTCAAAATGGAGACATAATA
ACAATAGACATTCAGAAAAAGAAAATGGATGTTCAGTTATCAGACGAGGTGTTGGAACAG
CGTAGAAAGAATTGGACACCCCCTGCATATAAGGCTGACCGAGGGGTTCTCTACAAGTAT
ATAAAAAATGTGCAATCCGCTTCCAAGGGATGTGTTACCGATGAATAGAGAAGAAGCATA
TTTACCAAAACCAAAGAGTGAACCTGGGAAAGCCTGATGTTGCTTGCAACTGCAATTGGG
GCATCTGCACGGCTCGTAGCCCTTTTATTATAGAGGTATCACATTTATGTTTTCAGGTGT
AACTTTATATATTTTGTTTCTTTGAAAGTTGAGAGCTATGTTTTTCTTTTCCCATTTCCC
CATTTTTCCTGCTCTGTATTTCTGGCACTCCCAGCTTGTTGATCTGTAGTGATTAAAATT
GTACAATGCTTGGTGAAATAATATTTGGTAGTAGAGCAATCACTTCTACTTTGGAAATTC
CCAAAAGTTTGTAATAATCTCTGAGATTGGTCACTGGCTTGGAGGTTTTCCAGACTTGCT
CCAAGTTTATTGATCAAGTTTCTCAGTATTCATTCCAAGTTCATT