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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g042400.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UJF3_ANACO)

Sequence

ATGGTGAGGCTTCCCTCCAAATTCAAACCTCCAAAACCCAAAACCCTAATCTCTCTTCTT
ACATCTCAAACTCAAAAATCACTTCACCACACATTCTCTCCATCTCTTTTGCAAACCCAT
AAACTCTTCAATCATTTCACCCAAATCCTCTCTCATGCCATTACTTCAGGCTACTTCACA
AATCCATTCATTTCCAGCCAACTCCTCCAACATTGTCTAACAAATTCTGATTTCACTCTC
ACTTTTTCTCACACCCTTTTCACTCAAATCCCTAACCACAATGTCTTCTCTTGGAATTTC
CTCATCCGTGCATACTGCCACAGTTCATTTCCCCAAGAAGCCGTTAGTCTTTACAATCAA
ATGATGCGGGAAAGTTTGAGTCTTGATAATTTTACTTTCCCTTTTGTACTGAAAGCTTGT
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GTTTGTTGGACTTCTATGATTGCAGGTTATTTGAAATGTGATATGTGTAAGGAAGCGATA
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ATTCAGCGGGATGCTGTCATTTGGCGATCTCTGCTTTTTGCTTGTAGCAGACACGGTAAT
GTAGAGTTGGCCGAGGTTGCTGCCAAAAAGATTAATGAATTGGAACCAGAGAAGTGTGGG
GCACATGTACTGTTGTCTAATGCCTATGCCTCTGCATCTAGGTGGAAAGATGTGAAGATG
GTAAGGAGGAATATGGGTGCTGAGGGAATCCAAAAGCAACCTGGATGCTCTTTTATTGAA
ATAGATGGTTTTGTTCATGAATTTCTTGTTGCTGATAGAGCGCACTGTCAGATTGACATC
ATATGTGATACACTTCTGGCAATGAATGTCGTTCTAAAATCAAGAGCACCTGAGCTTGTT
TTCCTGGATTTCTTTCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g042400.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UJF3_ANACO)

Sequence

MVRLPSKFKPPKPKTLISLLTSQTQKSLHHTFSPSLLQTHKLFNHFTQILSHAITSGYFT
NPFISSQLLQHCLTNSDFTLTFSHTLFTQIPNHNVFSWNFLIRAYCHSSFPQEAVSLYNQ
MMRESLSLDNFTFPFVLKACGRLVSFHKGREVHCVSLKMGFEFDVFVQNSLIYMYFQCGV
VEFAQKVFDFIPDSVRDVVTWNSMISGYLQGGCCYQAVKVFGKLLRESDVRLNDVSIVSA
LTACARTELLDVGKRIHGLIVVYGVVMDVFLGSSLVDMYTKCGCLEDAKTVFDQLIDKNI
VCWTSMIAGYLKCDMCKEAIELFREMLIAGVMAEPATIACVVSACGHSGALDLGRWVHNY
SERSGIEMNLIVKNSLIDMYSKCGLVDKALEVFHSLTNKDVYSWSMMISGLAMNARSKEA
LQLFSLMEGSSEVSPNEVTFLGILSACSHGGFVDEGFYFFEKMTTRYKIFPGIEHYGCLV
DLLGRANLLVEAMDLIGSMSIQRDAVIWRSLLFACSRHGNVELAEVAAKKINELEPEKCG
AHVLLSNAYASASRWKDVKMVRRNMGAEGIQKQPGCSFIEIDGFVHEFLVADRAHCQIDI
ICDTLLAMNVVLKSRAPELVFLDFFH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g042400.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199UJF3_ANACO)

Sequence

ATGGTGAGGCTTCCCTCCAAATTCAAACCTCCAAAACCCAAAACCCTAATCTCTCTTCTT
ACATCTCAAACTCAAAAATCACTTCACCACACATTCTCTCCATCTCTTTTGCAAACCCAT
AAACTCTTCAATCATTTCACCCAAATCCTCTCTCATGCCATTACTTCAGGCTACTTCACA
AATCCATTCATTTCCAGCCAACTCCTCCAACATTGTCTAACAAATTCTGATTTCACTCTC
ACTTTTTCTCACACCCTTTTCACTCAAATCCCTAACCACAATGTCTTCTCTTGGAATTTC
CTCATCCGTGCATACTGCCACAGTTCATTTCCCCAAGAAGCCGTTAGTCTTTACAATCAA
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GTTGAGTTTGCACAGAAGGTGTTTGATTTTATTCCTGATTCAGTTCGTGATGTTGTTACT
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CTTACAGCTTGTGCAAGAACTGAGTTGCTTGACGTGGGGAAGAGGATTCACGGGTTGATT
GTGGTCTATGGAGTTGTAATGGATGTCTTCTTAGGTTCTTCTTTGGTTGATATGTACACG
AAATGTGGGTGTTTAGAAGATGCTAAAACTGTTTTTGACCAATTGATAGATAAAAATATA
GTTTGTTGGACTTCTATGATTGCAGGTTATTTGAAATGTGATATGTGTAAGGAAGCGATA
GAGTTATTCAGGGAGATGCTCATAGCTGGGGTTATGGCCGAACCTGCCACAATTGCTTGT
GTTGTTTCTGCATGTGGACATTCAGGTGCACTGGATCTCGGAAGGTGGGTGCATAATTAT
AGCGAAAGGAGTGGAATAGAAATGAACCTTATAGTGAAGAATTCTTTGATTGATATGTAC
TCTAAATGTGGACTTGTTGATAAAGCTCTCGAAGTTTTTCATTCGTTAACTAATAAGGAT
GTTTATTCGTGGAGTATGATGATTTCTGGGCTAGCTATGAATGCAAGGTCCAAAGAGGCT
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GAGAAAATGACAACGAGATACAAAATTTTCCCAGGGATTGAGCACTACGGTTGCCTGGTT
GATCTTTTGGGTCGTGCAAATCTTCTGGTTGAGGCTATGGATTTGATAGGTTCCATGTCC
ATTCAGCGGGATGCTGTCATTTGGCGATCTCTGCTTTTTGCTTGTAGCAGACACGGTAAT
GTAGAGTTGGCCGAGGTTGCTGCCAAAAAGATTAATGAATTGGAACCAGAGAAGTGTGGG
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ATAGATGGTTTTGTTCATGAATTTCTTGTTGCTGATAGAGCGCACTGTCAGATTGACATC
ATATGTGATACACTTCTGGCAATGAATGTCGTTCTAAAATCAAGAGCACCTGAGCTTGTT
TTCCTGGATTTCTTTCATTGA