Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g017570.2.1
CDS Infomation

Rab GDP dissociation inhibitor (AHRD V3.3 *** C0LSK7_NICBE)
Sequence

ATGGATGAAGAGTATGATGTGATTGTGCTTGGTACTGGTCTCAAGGAATGTATCCTCAGT
GGTCTTCTCTCTGTTGATGGTCTCAAGGTCCTGCACATGGACAGAAATGACTATTATGGA
GGAGAATCAACGTCTCTCAATCTTGTCCAGCTCTGGAAGAGGTTCAGGGGAAGTGATAAG
CCTCCAGCTCAATTGGGTTCTAGCAGGGACTATAATGTTGACATGATCCCTAAGTTCATT
ATGGCTAATGGTGCTCTTGTACGAGTTCTAATCCACACCGATGTCACAAAATACTTATAC
TTCAAAGCTGTTGATGGAAGCTTTGTGTATAATAAAGGAAAGGTCCACAAGGTGCCTGCC
ACTGATATGGAGGCACTTAAATCTCCTTTAATGGGCATTTTTGAGAAACGCCGTGCTCGG
AAGTTCTTCATCTATGTTCAGGATTATAAGGAGAGTGACCCAAAGACACATGAGGGGATG
GATCTAACAAGAGTGACAGCAAGAGAGCTTATTGCAAAATATGGTCTTGATGACAATACT
GTGGACTTCATTGGTCATGCATTGGCATTACACAGAGATGACCGCTACTTAGACAAACCT
GCGTTGGATACAGTGAAGAGAATGAAGTTGTATGCTGAGTCTCTTGCACGTTTTCAAGGA
GGATCACCATATATCTATCCTTTATATGGATTAGGAGAGCTTCCCCAGGCGTTTGCTCGA
CTTAGTGCTGTGTATGGTGGGACCTATATGCTGAACAAACCTGAATGCAAGGTAGAGTTT
GATGAAGAAGGAAAAGTCTGTGGTGTCACTTCAGAAGGAGAGACAGCTAAGTGCAAGAAA
GTTGTATGTGATCCTTCTTACTTGAACAACAAGGTTAGAAAGGTTGGAAAAGTTGCAAGA
GCTATTGCAATTATGAGCCACCCAATTCCAAATACCAATGATTCACACTCAGTGCAAATT
ATTTTACCCCAAAAACAATTGGGCCGTAAATCTGATCTGTACCTGTTCTGTTGTTCTTAC
ACTCATAATGTTGCTCCAAAGGGCAAATTTATTGCATTTGTCTCAACAGAGGCAGAAACT
GATAATCCGGAGAGTGAGCTGAAGCCTGGCATTGATCTTCTAGGACAAGTGGATGAGATC
TTCTTTGAAGCATATGACAGATTTGAGCCTGTCAATGAGCCCTCTTTAGATAATTGTTTT
ATTTCTACTAGCTATGATGCTACAACTCACTTTGAGTCGACTGTTGATGATGTCCTCAAT
ATGTATACCTTGATTACTGGAAAGGTTCTGGACCTCAATGTGGATCTAAGTGCTGCGAGT
GCCGCTGAAGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g017570.2.1
PEP Infomation

Rab GDP dissociation inhibitor (AHRD V3.3 *** C0LSK7_NICBE)
Sequence

MDEEYDVIVLGTGLKECILSGLLSVDGLKVLHMDRNDYYGGESTSLNLVQLWKRFRGSDK
PPAQLGSSRDYNVDMIPKFIMANGALVRVLIHTDVTKYLYFKAVDGSFVYNKGKVHKVPA
TDMEALKSPLMGIFEKRRARKFFIYVQDYKESDPKTHEGMDLTRVTARELIAKYGLDDNT
VDFIGHALALHRDDRYLDKPALDTVKRMKLYAESLARFQGGSPYIYPLYGLGELPQAFAR
LSAVYGGTYMLNKPECKVEFDEEGKVCGVTSEGETAKCKKVVCDPSYLNNKVRKVGKVAR
AIAIMSHPIPNTNDSHSVQIILPQKQLGRKSDLYLFCCSYTHNVAPKGKFIAFVSTEAET
DNPESELKPGIDLLGQVDEIFFEAYDRFEPVNEPSLDNCFISTSYDATTHFESTVDDVLN
MYTLITGKVLDLNVDLSAASAAEE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g017570.2.1
Transcript Infomation

Rab GDP dissociation inhibitor (AHRD V3.3 *** C0LSK7_NICBE)
Sequence

AGTTGACATAGCCCTTTTGCTAGCGTTTCATCAATCATCAAAACAATACTTGTCTTCTTC
TCCTGGAGAGCTCTACCATTTTATAACACTAGAATTTGTAAACCCTAGTTTTGCTGTAAC
AGAAAGATGGATGAAGAGTATGATGTGATTGTGCTTGGTACTGGTCTCAAGGAATGTATC
CTCAGTGGTCTTCTCTCTGTTGATGGTCTCAAGGTCCTGCACATGGACAGAAATGACTAT
TATGGAGGAGAATCAACGTCTCTCAATCTTGTCCAGCTCTGGAAGAGGTTCAGGGGAAGT
GATAAGCCTCCAGCTCAATTGGGTTCTAGCAGGGACTATAATGTTGACATGATCCCTAAG
TTCATTATGGCTAATGGTGCTCTTGTACGAGTTCTAATCCACACCGATGTCACAAAATAC
TTATACTTCAAAGCTGTTGATGGAAGCTTTGTGTATAATAAAGGAAAGGTCCACAAGGTG
CCTGCCACTGATATGGAGGCACTTAAATCTCCTTTAATGGGCATTTTTGAGAAACGCCGT
GCTCGGAAGTTCTTCATCTATGTTCAGGATTATAAGGAGAGTGACCCAAAGACACATGAG
GGGATGGATCTAACAAGAGTGACAGCAAGAGAGCTTATTGCAAAATATGGTCTTGATGAC
AATACTGTGGACTTCATTGGTCATGCATTGGCATTACACAGAGATGACCGCTACTTAGAC
AAACCTGCGTTGGATACAGTGAAGAGAATGAAGTTGTATGCTGAGTCTCTTGCACGTTTT
CAAGGAGGATCACCATATATCTATCCTTTATATGGATTAGGAGAGCTTCCCCAGGCGTTT
GCTCGACTTAGTGCTGTGTATGGTGGGACCTATATGCTGAACAAACCTGAATGCAAGGTA
GAGTTTGATGAAGAAGGAAAAGTCTGTGGTGTCACTTCAGAAGGAGAGACAGCTAAGTGC
AAGAAAGTTGTATGTGATCCTTCTTACTTGAACAACAAGGTTAGAAAGGTTGGAAAAGTT
GCAAGAGCTATTGCAATTATGAGCCACCCAATTCCAAATACCAATGATTCACACTCAGTG
CAAATTATTTTACCCCAAAAACAATTGGGCCGTAAATCTGATCTGTACCTGTTCTGTTGT
TCTTACACTCATAATGTTGCTCCAAAGGGCAAATTTATTGCATTTGTCTCAACAGAGGCA
GAAACTGATAATCCGGAGAGTGAGCTGAAGCCTGGCATTGATCTTCTAGGACAAGTGGAT
GAGATCTTCTTTGAAGCATATGACAGATTTGAGCCTGTCAATGAGCCCTCTTTAGATAAT
TGTTTTATTTCTACTAGCTATGATGCTACAACTCACTTTGAGTCGACTGTTGATGATGTC
CTCAATATGTATACCTTGATTACTGGAAAGGTTCTGGACCTCAATGTGGATCTAAGTGCT
GCGAGTGCCGCTGAAGAATGAGATGGTCTCTGGTCCCTGTGTACTTCTATGTACTTGTTC
TTTGGTTTATTACTTGTATTGTTCTCTCTGCTGTGTTTTCTTATAAAAAATATGCTTTGT
AATGCACGATGAGATAATGTTTGTTGAAGTTGTTGATATGTGTACTGTGGGTTATCTTGC
ACTTGGCTCCTTTTTCCCTTGTTGACTATCCGAGGTTTGATTTCTTCTTTGTAGTTGACT
GTCATATCATTTCTCATATTTGATGTGATGG