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EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g017260.2.1

CDS Infomation

Topoisomerase II-associated protein PAT1 (AHRD V3.3 *** A0A103YJG9_CYNCS)

Sequence

ATGGACGGATTTGAAGGCGGTGGTGGGAGTAGTAGGAGTTTTATGGAATTCGGTGACGAC
CGACCTGCAGAAGAAAAATTTGATGCTTCGCAGTATGCATTCTTTGGTAATGATGTTGTT
GAAGAAGTTGAACTGGGTGGATTGGAAGATGAAGAGGATGATAGTTTTCCTCCGGTTGGG
TTTGATGATGAAGAGTATCAATTAGGCCGAGAAGAGGGTGGAGCTTTTGGATCTTTATCT
GAGATTGATGACCTTAACAACACATTTTCCAAGTTTAACAAGGATGATGGTGGTGCCATA
AGGCCAGGATTTATTGGTGATCGGGAATACAGAGAGAGCTCATCAGCTGTTGAGTGGTCA
CAAGATGCAGAATTTCGTAGTTGGATTGACCGGAAAGCTCTTGATGGGGGTGAAATCAAT
GACAGCAAAAGATGGCCATCAGTGCCATATTCTTCTGCTGCTCACCTTTTGGAATCAAAT
ACTTTGTACAGGACTTCCTCATACCCTGAGCAACAACAGCAACATGAATATCAGCAGCAA
ACCCTGAACCAACACTACTCCAGTGAACCAGGACTCATCCCAGAATTGCCTTTCCCTTCA
TTCCCTCCTAGTGCAAGGCATCCACAAGCCTCCACAAATAACCAGTTACGGAACCCAAAT
GGTCCAAATCATCCCGGTGGACAGCAAATGCCAGTTTCCTCTCCGAACTTTTCTCCCTTC
TTAAACACTGCAAATCAATTAGCTGCCTCGCATCTTGGCCCGCAGTATGGTGGAAAGTTT
GCTCAGGGCACGCCTGCTGGGCTTCCCCTTCATAATCAAATTCCAAGCCAATGGTTGAAG
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GGCCAACAGCACCCCTTGCGTCCACCCTATGGCCGTTTGCCAGGGTTGCAATCTCAACTT
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GCTGATTTAAGAGATCAAAAGGCAAAACTAATGCTGAGAGGCAGACAGGGCATGCATTAC
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TCCAAGTACATGTCAACAGATGAATTAGAGAATATTCTTAGAGCACAGCTGGCTGCTACC
CATAGCAATGATCCTTATGTTGATGATTATTATCACCAAGCTTGTCTGGCCAAAAAGTCT
GCTGGTGCAAAGTTGAAGCACCATTTCTGCCCAAATAATTTGAGGGATGGTAGTGCTCGA
AGTCGTGCTAATACTGATCCACATCCTTTTCTCCAGGTTGATGCTCTTGGAAGAGTTGCT
TTCTCTTCTATTCGCAGGCCCCGACCGCTTCTTGAAGTTGATCCACCAAAATCATGTGCT
ACTGGATGCATTGAACAGAAAATGTCTGAGAAACCCCTGGAGCAAGAGCCAATGCTAGCA
GCTAGGGTGACTATTGAGGATGGACTTAGTCTTCTTCTCGATGTTGATGATATTGACCGG
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CTGCTTGAGGATTTGGCCTCATCACTTCAGCTAGTTGACCCTCTTGGCAAAAGTGTCCAC
ACTGTGAATTTGGCTGCTAAAGATGATGTTGTCTTCTTGAGGATCGTCTCACTTCCCAAG
GGCCGGAAACTGCTAGTACGGTACCTTCAGCTTCTTTTCCCTGGAAGTGAACTGACCAGG
GTGGTTTGCATGGCTATTTTCCGTCATCTAAGGTTCTTGTTTGGTGTGATTCCAAGTGAT
CACGGTGCAACCGAGACTACTGTGAACCTTGGAAGGACCGTGTCGCTTTGTATTTGTGAA
ATGGAGCTCAAAGCACTCGCTGCTTGTCTTGCATCAGTGGTTTGTTCAGCAGAGCCTCCT
CCGCTCCGTCCTGTTGGAAGCCCTGCTGGAGATGGGGCATCTGTTGTTCTAAAATCTATT
CTTGAGAGGGCGACTGAGCTCTTAAGAGATCCCCATGCAGCTGGCAAGTGCAGCATGCCT
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TTCAGCAAATACGACACTGTAATGCAATGTTTCTTGACACAAGGCCCACCGGATGTGGCT
GTTAGTGGATCTGATGCAGCCAAAGCTATTAGTAGGGAGATGCCTGTTGAACTTTTGCGT
GCGAGTCTTCCTCACACTAGTGAACAACAGAGAAAGGTCCTGTTAGAATTTGCACATAGG
TCCATGCCTGTGCTAGGTGTTGGTAGCCAAAGTGGGGCAAGTGGTGGTACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g017260.2.1

PEP Infomation

Topoisomerase II-associated protein PAT1 (AHRD V3.3 *** A0A103YJG9_CYNCS)

Sequence

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FDDEEYQLGREEGGAFGSLSEIDDLNNTFSKFNKDDGGAIRPGFIGDREYRESSSAVEWS
QDAEFRSWIDRKALDGGEINDSKRWPSVPYSSAAHLLESNTLYRTSSYPEQQQQHEYQQQ
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SHRQNGFATPHGGLQLPQQPGQQHPLRPPYGRLPGLQSQLINHHMSPPSQMMNNFDMLGL
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FLQFNQLPDGGDQLKRRRQVLLEDLASSLQLVDPLGKSVHTVNLAAKDDVVFLRIVSLPK
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NRAFWQASFDAFFGLLTKYCFSKYDTVMQCFLTQGPPDVAVSGSDAAKAISREMPVELLR
ASLPHTSEQQRKVLLEFAHRSMPVLGVGSQSGASGGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g017260.2.1

Transcript Infomation

Topoisomerase II-associated protein PAT1 (AHRD V3.3 *** A0A103YJG9_CYNCS)

Sequence

CACACTAATTTTATCACTTATAATTCAAGACAAGTAAATTTGTAATAATTAATTATTGTT
TAGTCGAATATAAACAAACGACTAAATGTATTTTTTGTATTAAAAGATTTAGACAAATAT
TAAGTATTTAATGAGCTTAACATGATTTATGATAATCTATGCATATTATTGATATATTCT
TCTATTATGAACATTGTTCTAGAATAATGAACATGCTAATTTTGACCCTTATAATTCAAG
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TATTGGTGGACTTAAATTACTTATATTGCTCCAAAATAATTGGTTATTGTTATTTAAAGT
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AGATGACTAATGTAGGTTATGCACGTTTTTTGATGGACATTATATGATGAATACTAATTT
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TTTTATATCAAAATTTAAGCTACTTAATCCATATTAACTTTTCATTGCTCTAAAAAATTT
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GAAAGGAAAAATTTTCCCAGATTGATTGATTGTTTTATATATGGACGGATTTGAAGGCGG
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TGATGCTTCGCAGTATGCATTCTTTGGTAATGATGTTGTTGAAGAAGTTGAACTGGGTGG
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ATTAGGCCGAGAAGAGGGTGGAGCTTTTGGATCTTTATCTGAGATTGATGACCTTAACAA
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TTGGATTGACCGGAAAGCTCTTGATGGGGGTGAAATCAATGACAGCAAAAGATGGCCATC
AGTGCCATATTCTTCTGCTGCTCACCTTTTGGAATCAAATACTTTGTACAGGACTTCCTC
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CAGTGAACCAGGACTCATCCCAGAATTGCCTTTCCCTTCATTCCCTCCTAGTGCAAGGCA
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GCTTCCCCTTCATAATCAAATTCCAAGCCAATGGTTGAAGCAGTCTACTTTATATCCAGG
GGAGCAATCAAGCATGACCAGTAATATGATGCCCCAGCAGTCACATCGCCAAAATGGTTT
CGCAACACCACATGGGGGGCTGCAGCTACCCCAGCAACCTGGCCAACAGCACCCCTTGCG
TCCACCCTATGGCCGTTTGCCAGGGTTGCAATCTCAACTTATTAATCACCATATGTCTCC
ACCCTCGCAGATGATGAACAATTTTGATATGCTTGGGTTGGCTGATTTAAGAGATCAAAA
GGCAAAACTAATGCTGAGAGGCAGACAGGGCATGCATTACCCTCAACTAGGCTTTGATAT
CAGTAGCCAGAGAAATGTTAGCGCATGGACAAGATTTAGATCCAAGTACATGTCAACAGA
TGAATTAGAGAATATTCTTAGAGCACAGCTGGCTGCTACCCATAGCAATGATCCTTATGT
TGATGATTATTATCACCAAGCTTGTCTGGCCAAAAAGTCTGCTGGTGCAAAGTTGAAGCA
CCATTTCTGCCCAAATAATTTGAGGGATGGTAGTGCTCGAAGTCGTGCTAATACTGATCC
ACATCCTTTTCTCCAGGTTGATGCTCTTGGAAGAGTTGCTTTCTCTTCTATTCGCAGGCC
CCGACCGCTTCTTGAAGTTGATCCACCAAAATCATGTGCTACTGGATGCATTGAACAGAA
AATGTCTGAGAAACCCCTGGAGCAAGAGCCAATGCTAGCAGCTAGGGTGACTATTGAGGA
TGGACTTAGTCTTCTTCTCGATGTTGATGATATTGACCGGTTCCTACAGTTTAACCAGCT
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ATCACTTCAGCTAGTTGACCCTCTTGGCAAAAGTGTCCACACTGTGAATTTGGCTGCTAA
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CCGTCATCTAAGGTTCTTGTTTGGTGTGATTCCAAGTGATCACGGTGCAACCGAGACTAC
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CCCTGCTGGAGATGGGGCATCTGTTGTTCTAAAATCTATTCTTGAGAGGGCGACTGAGCT
CTTAAGAGATCCCCATGCAGCTGGCAAGTGCAGCATGCCTAATAGGGCATTCTGGCAGGC
CTCGTTTGATGCATTTTTTGGGTTACTCACGAAATACTGTTTCAGCAAATACGACACTGT
AATGCAATGTTTCTTGACACAAGGCCCACCGGATGTGGCTGTTAGTGGATCTGATGCAGC
CAAAGCTATTAGTAGGGAGATGCCTGTTGAACTTTTGCGTGCGAGTCTTCCTCACACTAG
TGAACAACAGAGAAAGGTCCTGTTAGAATTTGCACATAGGTCCATGCCTGTGCTAGGTGT
TGGTAGCCAAAGTGGGGCAAGTGGTGGTACATGACTTTTATTGGAGATTGATATCAGGTA
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TTAATCTGGAGTTTTATCGTATGCTGTTTTCTCATCCATGATAGTCCTATTTTCTGAGGG
ATTTTTTAGTATAACTTTGTACAGTGTTCAACTAGAGAAAACATTCAGCTTCTAGTTTTG
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GGC