Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g014090.2.1

CDS Infomation

TAF RNA polymerase I subunit A (AHRD V3.3 *** AT1G53200.1),Pfam:PF14929

Sequence

ATGGAGGTAGCAGAAGATGCATCAAAGGCCCGAAAATCCCGTACGAGGAAACGTAATAAT
GCCGAAGATGATTATAATTGTGGAATTAATCCATCTACAGAAGCTAGAAGGATTAACTCT
GTCATATTAGCAAATACTAAACCAAGTTTTTGTCTAAAACGGGGAATCGGCAGTTTACAC
AAAGATCATCGGAGTTTACAGTCTGAACATAGGAGAAGACTTCGACGTTTGCTGGAAAAA
TTGATGCGGCAACATAAATATGCTGAGGCTAGTGGTGTACTGAGTGTTCTTCTTAAAGGA
ACTACAAAAGAATCAGCCGTATTCAAAACTCGCACAAAGTTTATGGCAATTTTGGAGCTC
ATTGAGCATATAAAAGGTGACACTATCAGTTCAAAGAGGATACAAGATATTTATGAACTT
TGGATGAAGAAGCTTGGACCTATGAAAAACAGGCCCCCAAAGGACCGTTTTGCTGTTCAT
TTGGAATTCATCCTTTTCTGTCTCAAACGCGGGAACACACAGGATGCACATCAGGGTGCC
TTATCGCTCATGCAGCAACGTGGTTTTGGTAGTGATCCAGTCTCTAATTTAGTTGTGGGC
TTAGTCTTTTATCAGTTATGGTATTCTACTATCCCAAAGGAGTTGCATTTGCAAGAGTTG
GACAGATTTGATAGCACGGTGCAGTCAGAGACCTTTGAGGACAGAATATTTATGTCCATT
TTAAATTCAGAGGAGCATGATGCTGTTGAAGGCGAAGAGGCTAATTCTCCATTCAATTGT
GATTCAAACACCTCTATTAGGAATGATAAAGAGATCTTGGGAGTTGATGTCAGTCAACAG
AGAGAAGTTGCCATGGTTGATGATGATAATGTGCCGGGAGAAACGCAAAATGACAATTTT
CAGCCACAAGACTTTTACATGAATTCTTCTGAAAGAAGTGACCGTGAAGGTTCTTCTATG
GATCAGAGTGGTGATGATCCCTATCATTCCATATTCTATAATCGTGGTCTTCCATTGTGG
TTATTGCCTTTACAATTGCCTTCCTCAGATGAAAATTTAGAGGATGTTCTCAATATGCAT
CGGGCCCTGCGTAATGACAACTATAAGAATGCAATAAAGTATTTACGACATGCTCTGCAT
TCCAGTCCACCAGTACTAGAGGCTTTTCATCCTTTAATACAGATGCTGCTGCTCGGGGAT
CAGGTGAAGGAGGCTCTTGATGAGGTGGAAAAATTTACTCCATACACCAACACATCATTT
CAGTTGAGGTTGAAAGCTACTATCTTGGAGCATTTTGACAGCGGTAACTATGTCAAACTT
TCAGCAATCCATGAGGAAAATTTGGAGAAAGATCCTGCTTGTAGCCACTCATTGGGGAGA
CTCATCATCTTGCATAGAAGGGGAGAGTATAGCACTGAAAAGCTGATGGAAATGATAGCT
TTGCATTTGGATGCTACTCATGCAAATTGTGACACATGGAAGGAGTTAGCTTGTTGCTTC
CTGAGGCTTTTTCAATGTGAAGAAGATTGCATGTCTGTGTGCTCCAACGGTGAAGATAGT
GAGAAGCAAAAATTCACAAAATGGATTAGTCAGATTCCAAAAATATTTAGCGATTATGAG
TCTAGCAAGTCATGGAGGCTCCGTTGCAGATGGTGGCTGACTCATTACTTCAGCCAGACT
ATACTCACTTCAGATATTGCTTCAGGTGACTGGGAACTGCTGACTTACAAGGCCGCCGTG
GCATGTTACCTTTATGGGCGAGAATTTAAGTATGTTGTGAAGGCTAGGGAGTGTTTGGAA
GGAGACCCAATTAACAAGAATTTGTATTCCATATTGTGCATGCATGCCAATAGTTGTACT
GGATTTTACTTTAACGTTAAGAAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g014090.2.1

PEP Infomation

TAF RNA polymerase I subunit A (AHRD V3.3 *** AT1G53200.1),Pfam:PF14929

Sequence

MEVAEDASKARKSRTRKRNNAEDDYNCGINPSTEARRINSVILANTKPSFCLKRGIGSLH
KDHRSLQSEHRRRLRRLLEKLMRQHKYAEASGVLSVLLKGTTKESAVFKTRTKFMAILEL
IEHIKGDTISSKRIQDIYELWMKKLGPMKNRPPKDRFAVHLEFILFCLKRGNTQDAHQGA
LSLMQQRGFGSDPVSNLVVGLVFYQLWYSTIPKELHLQELDRFDSTVQSETFEDRIFMSI
LNSEEHDAVEGEEANSPFNCDSNTSIRNDKEILGVDVSQQREVAMVDDDNVPGETQNDNF
QPQDFYMNSSERSDREGSSMDQSGDDPYHSIFYNRGLPLWLLPLQLPSSDENLEDVLNMH
RALRNDNYKNAIKYLRHALHSSPPVLEAFHPLIQMLLLGDQVKEALDEVEKFTPYTNTSF
QLRLKATILEHFDSGNYVKLSAIHEENLEKDPACSHSLGRLIILHRRGEYSTEKLMEMIA
LHLDATHANCDTWKELACCFLRLFQCEEDCMSVCSNGEDSEKQKFTKWISQIPKIFSDYE
SSKSWRLRCRWWLTHYFSQTILTSDIASGDWELLTYKAAVACYLYGREFKYVVKARECLE
GDPINKNLYSILCMHANSCTGFYFNVKK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g014090.2.1

Transcript Infomation

TAF RNA polymerase I subunit A (AHRD V3.3 *** AT1G53200.1),Pfam:PF14929

Sequence

AATTCACCCAAGGGCGCGAATAAACCGAAAAAGTAAAGTGACTATTTAGGTGTTTTCCTC
TCTGTAAAACCCCTAATTTCTTCTTCTTCTTAAACCCTGAAAAACTGGAAGTAAAGCTTT
AACCTCCAAACGAAGCCATCAATGGAGGTAGCAGAAGATGCATCAAAGGCCCGAAAATCC
CGTACGAGGAAACGTAATAATGCCGAAGATGATTATAATTGTGGAATTAATCCATCTACA
GAAGCTAGAAGGATTAACTCTGTCATATTAGCAAATACTAAACCAAGTTTTTGTCTAAAA
CGGGGAATCGGCAGTTTACACAAAGATCATCGGAGTTTACAGTCTGAACATAGGAGAAGA
CTTCGACGTTTGCTGGAAAAATTGATGCGGCAACATAAATATGCTGAGGCTAGTGGTGTA
CTGAGTGTTCTTCTTAAAGGAACTACAAAAGAATCAGCCGTATTCAAAACTCGCACAAAG
TTTATGGCAATTTTGGAGCTCATTGAGCATATAAAAGGTGACACTATCAGTTCAAAGAGG
ATACAAGATATTTATGAACTTTGGATGAAGAAGCTTGGACCTATGAAAAACAGGCCCCCA
AAGGACCGTTTTGCTGTTCATTTGGAATTCATCCTTTTCTGTCTCAAACGCGGGAACACA
CAGGATGCACATCAGGGTGCCTTATCGCTCATGCAGCAACGTGGTTTTGGTAGTGATCCA
GTCTCTAATTTAGTTGTGGGCTTAGTCTTTTATCAGTTATGGTATTCTACTATCCCAAAG
GAGTTGCATTTGCAAGAGTTGGACAGATTTGATAGCACGGTGCAGTCAGAGACCTTTGAG
GACAGAATATTTATGTCCATTTTAAATTCAGAGGAGCATGATGCTGTTGAAGGCGAAGAG
GCTAATTCTCCATTCAATTGTGATTCAAACACCTCTATTAGGAATGATAAAGAGATCTTG
GGAGTTGATGTCAGTCAACAGAGAGAAGTTGCCATGGTTGATGATGATAATGTGCCGGGA
GAAACGCAAAATGACAATTTTCAGCCACAAGACTTTTACATGAATTCTTCTGAAAGAAGT
GACCGTGAAGGTTCTTCTATGGATCAGAGTGGTGATGATCCCTATCATTCCATATTCTAT
AATCGTGGTCTTCCATTGTGGTTATTGCCTTTACAATTGCCTTCCTCAGATGAAAATTTA
GAGGATGTTCTCAATATGCATCGGGCCCTGCGTAATGACAACTATAAGAATGCAATAAAG
TATTTACGACATGCTCTGCATTCCAGTCCACCAGTACTAGAGGCTTTTCATCCTTTAATA
CAGATGCTGCTGCTCGGGGATCAGGTGAAGGAGGCTCTTGATGAGGTGGAAAAATTTACT
CCATACACCAACACATCATTTCAGTTGAGGTTGAAAGCTACTATCTTGGAGCATTTTGAC
AGCGGTAACTATGTCAAACTTTCAGCAATCCATGAGGAAAATTTGGAGAAAGATCCTGCT
TGTAGCCACTCATTGGGGAGACTCATCATCTTGCATAGAAGGGGAGAGTATAGCACTGAA
AAGCTGATGGAAATGATAGCTTTGCATTTGGATGCTACTCATGCAAATTGTGACACATGG
AAGGAGTTAGCTTGTTGCTTCCTGAGGCTTTTTCAATGTGAAGAAGATTGCATGTCTGTG
TGCTCCAACGGTGAAGATAGTGAGAAGCAAAAATTCACAAAATGGATTAGTCAGATTCCA
AAAATATTTAGCGATTATGAGTCTAGCAAGTCATGGAGGCTCCGTTGCAGATGGTGGCTG
ACTCATTACTTCAGCCAGACTATACTCACTTCAGATATTGCTTCAGGTGACTGGGAACTG
CTGACTTACAAGGCCGCCGTGGCATGTTACCTTTATGGGCGAGAATTTAAGTATGTTGTG
AAGGCTAGGGAGTGTTTGGAAGGAGACCCAATTAACAAGAATTTGTATTCCATATTGTGC
ATGCATGCCAATAGTTGTACTGGATTTTACTTTAACGTTAAGAAATAAGAGTAATATTTA
TGCGGAATTGCCATCTTTTTATGTTCTCTCTAATTGGCATTGCTCTTACTGGCAGTGATT
GTTTAGTCCATGGTTCATTTGAGATCAATGCATGACTGAAGAAATGAAATATATCGATGT
CTTCGTCTGTGTCCTTCCTTCGTCGAGGTCCCTTGGATTCTGAGTTTTAGAACTATTTGG
TGCGAGTGATCAGCCAAGGGAGTTAGTTGGCATAAAGATTTCCTATTTCTTTTTGAAAAT
ACCAAAATGAACTTGAATGACCTTCATAGTGATTGTATGATTTTAAAATGCACTTTTACC
CTTTTTACCCTTCTTTAGCTATAATTACTTGATAG