Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g011200.2.1
CDS Infomation	WRKY transcription factor 28
Sequence	ATGACAAAGAGTGAGATTGATAATCTTGAAGATGGTTATCGATGGAGAAAATATGGACAA AAGGCAGTGAAGAACAGCCCTTTTCCTAGGAACTATTATAAATGCACAACTCAAAAGTGC AATGTGAAGAAACGTGTTGAAAGGTCATATGAAGATTCATCAATTGTGATAACAACATAT GAAGGCCAACACAATCATCATTGTCCAGCAACTCTTAGGGGAAATGCATCTTTTTTATCT TCATCACATTTTATGCCTAATTTTCCTCCACAACTATTTTCCCAAATGCTAAATATTCCA CCAAACAACCAAAATCTCCTCATTACTTCTTCGACCTATAATTATAATAATAATAATAAC AATTATTATTATCAACAACAACAACATCAAGGTTCAGAATATACCCTATTTGGTGGAGGC ACAAATAATGGTGATGCTTCATGGGTCCAAAAACAAGAGCCATCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g011200.2.1
PEP Infomation	WRKY transcription factor 28
Sequence	MTKSEIDNLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRNYYKCTTQKCNVKKRVERSYEDSSIVITTY EGQHNHHCPATLRGNASFLSSSHFMPNFPPQLFSQMLNIPPNNQNLLITSSTYNYNNNNN NYYYQQQQHQGSEYTLFGGGTNNGDASWVQKQEPS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g011200.2.1
Transcript Infomation	WRKY transcription factor 28
Sequence	TCAATTAAACCTTCTAAACAAAATAAAGAGTTAAGAGAAAAAAAAATTAAGTTCACAATC TTAACGATTAAAATCATTATAGATATACTTTGGCTTTCAAAGTTTTTGGTCAAATAAGCT ATTTGACTATTCACAAAATATTTAACTTTAATTTTAATTTTGTTTCATTTTATTGTCCAT GAAAAGTGTAATTCATATTAAGTTCACTCTAAAAAAAATACATTTACACACTTGGAAAAA ATATCTAGTATTATTATATATACCAATTTGCTAGGTAATGACAAAGACATCAAAATCCTA TATATTCAAATCTACCTAATGAAAGGAACATTATTCAATTTAAATATTGTTTGTTATTTG GAAATTTACTTACAATATAATTTAAAATCTTTTCACATGACTTCTATGAAAGGTAATTTT TGAAGTGTTTAATTTTAACCATATTATATGGAAGATGATGTACTTATGTAGCTAAACCAA AATCATTTTTATAGCTAGGTTGATCAAATTTGAGAAATCGAAAGTACTTTTATAAAAGAA ATTTAAAAGTGCTTATTTTAGATAATTAGGTTCCCCTCTATGTATTTTAAGTAGCTATAG AATTTAATTTTCACAAGTTAAAAAAGTTTTTTTTTCCCTCTCTATTGAAATCTTGACCAA GCATAAATTAATGTTCTAATAATGCTGCATATGACAAATGTGTTTTTCAAATCTAATAGT CAAACTCAAAATATATTATTTTTAAAAAAATTAAATATACTTCGTTAAAAAATGATTTTC AAAATAAATAAATTTAAAAATTTTAACCAAATTCATACACATAAAAACTTCATAACGAGT GCCCTCAAATTCATATTTTCTTCGCCAAGGACCATCCATTTGCTATTACCTATCAAGCTA CATACTCTTTTTTTTTCTCTCTCCAAAACATTTCTCATCTATCATATCTATTTTTTTATT GCACAAAACTATAGTGTTAATGTAATTTAAGAATTCGAAATAATATTTTTCTCCAATATG TCTGATAATCCTTTTTATCATGATTACATGGGAATTGGTGGAGGGATCAATAATACATTC CCTTTTTTGGTTGAAAATCCTTCAAATTATAATAACCAACCAATAACTCCAAATATTCAA AATCAACAATTTGTTCCTTCTTCTTATATGACTCTCACTGAGTGTTTACATGGCTCTATG GACTACAACACACTATCAAATGCTTTTGGTATGTCTTGTTCATCATCATCTGAAGTTGTT TGTCCACATATCGATAATCAAGACTCTACTGAAAAATATAACGTCTCTACTACTGCAGAA GAACCTGTCTTAGATTCACCTCTAGGAGATAATCAAACGAGCGTTGAAGTTCCACCAACG CCAAATTCTTCGATATCTTCTACTTCTAATGAGGTTGGAGAGCAAGAAGATTCTTCCAAA ATCAAGAAACATGTTCAAGTAAAAGGGAGCCAAGAAGAAGGAGAAGACAAGTCTAAGAAA GATATTTCAGGTGCATAGCAAAAAAGAAAGGAGAAAAAAAGATAAAAGAACCAAGATTTG CCTTCATGACAAAGAGTGAGATTGATAATCTTGAAGATGGTTATCGATGGAGAAAATATG GACAAAAGGCAGTGAAGAACAGCCCTTTTCCTAGGAACTATTATAAATGCACAACTCAAA AGTGCAATGTGAAGAAACGTGTTGAAAGGTCATATGAAGATTCATCAATTGTGATAACAA CATATGAAGGCCAACACAATCATCATTGTCCAGCAACTCTTAGGGGAAATGCATCTTTTT TATCTTCATCACATTTTATGCCTAATTTTCCTCCACAACTATTTTCCCAAATGCTAAATA TTCCACCAAACAACCAAAATCTCCTCATTACTTCTTCGACCTATAATTATAATAATAATA ATAACAATTATTATTATCAACAACAACAACATCAAGGTTCAGAATATACCCTATTTGGTG GAGGCACAAATAATGGTGATGCTTCATGGGTCCAAAAACAAGAGCCATCTTAGTTCACTA CAAGGTTTTCGTGACGAATCGACTATTCTTATCCATCAAGAATTTTTGTACAAGTTTCTT GTAGCATTGACTATTTTTATATATACAGACATGGTTGAATTTAATTTGAATTTCATGGTG ATTGTTTCACAAGTGTTTGCGATAATAGGTGATAGTTTTAGTGGCGATCCTCATGGTCGC TACCAAAAGTAACATTATAGTGGCGACTACTTTTAGTCT