Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc12g010730.2.1
CDS Infomation

Plant/F9H3-4 protein (AHRD V3.3 *** A0A072VLR0_MEDTR)
Sequence

ATGGAGAAAGGCTCAATGCAATCAAATCTTGAGTCTTTTTTGGGTTCTACAACACCATTA
GTTGCATCACAGTTCCTTGCCAAGAGTGAAATTAGAAACCTTAATAAGCTTTGGCATCCT
AAAGAAAGAGAGGAAATTGAATACTTCACATTGTCTGATCTTTGGAATTGTTTTGATGAA
TGGAGTGCTTATGGTGCTGGAGTTCCAATCAGATTAGATTCTGGTGAAACTTTAGTTCAA
TATTATGTGCCTTATCTTTCAGCAATTCAAATTTTCACCAGCAGTTCATCTGTAAGCATT
TTAAGGGAGGAGACTGAGTCTGCGTGGGAAATGAGGGATTCTTGCAGTGATTCGTTCAGT
GAAGAGAGTGAGAGTGAAAAGCTTTCGAGATCGGATGGGGGTTCATCGGAGGAAGGTTTA
TTTGAGCAAGATAATCAGTTACAAATGAATAATAGATTGGGTTACCTTTATTATCAATAC
TTTGAAAGATCTTCTCCATATGGAAGAGTACCTCTGGTGGATAAGATTAGTAGCTTAGCT
GAAAGACACCCCGGATTAATGTCATTGAGAAGCGTAGATCTTTCACCAGCTAGTTGGATG
TCAGTTGCTTGGTACCCGATATATCACATTCCCATGGGAAGAACCATTAAGGACTTGTCG
ACCTGCTTTCTCACATTCCACACCCTTTCTTCTTCTTTTCAAGATATGGACCTTGAAGAT
AACACAGAGAAAGGTATTAGGAAACGTAACGAAGGGGAAGCAATCCCACTTCCACCTTTC
GGTTTGGGAACTTACAAGATGCAGGGTAATGTTTGGATTTCAGACAGAAGTGGGAGGGAC
CAAGAGAGGATGGTGTCACTATTAAGCGTGGCCGACTCTTGGCTAAAGCAATTAGGGGTC
CAGCACCATGACTTTAACTACTTCTTGGGCATTCGTCATGGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc12g010730.2.1
PEP Infomation

Plant/F9H3-4 protein (AHRD V3.3 *** A0A072VLR0_MEDTR)
Sequence

MEKGSMQSNLESFLGSTTPLVASQFLAKSEIRNLNKLWHPKEREEIEYFTLSDLWNCFDE
WSAYGAGVPIRLDSGETLVQYYVPYLSAIQIFTSSSSVSILREETESAWEMRDSCSDSFS
EESESEKLSRSDGGSSEEGLFEQDNQLQMNNRLGYLYYQYFERSSPYGRVPLVDKISSLA
ERHPGLMSLRSVDLSPASWMSVAWYPIYHIPMGRTIKDLSTCFLTFHTLSSSFQDMDLED
NTEKGIRKRNEGEAIPLPPFGLGTYKMQGNVWISDRSGRDQERMVSLLSVADSWLKQLGV
QHHDFNYFLGIRHG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc12g010730.2.1
Transcript Infomation

Plant/F9H3-4 protein (AHRD V3.3 *** A0A072VLR0_MEDTR)
Sequence

AAAAAATTTCAAGTAACTTGAGTGTATTACTCAAAAAAAGGGAAAACTAAGAGAGATGTC
ATTCACGTATTGGTGCATGGTGAATGAAGTAGAGGATCACATCTAGAGTCTTGTAAGATT
AGAAAGTGTCACTAATATTTAAAAGTTAATTTTTACAGGGTAATAGTTAGATCAATTATA
TTATATGGACGAAAAGATTGCATAAACAAATTAAGTGTCTATATGAAACAATTCCTCTAT
ATCTAAAATAAGATTATGGTATTGCATATATTCTACACTTATAGGCTTCATCTTGTGTCA
CTATTCATTCGATAAGTAAAATAAATATTATTTTCCGAATTCAAATACTCAAAGAAGTTA
AAAGTAATTTTGCTAAAAAGCATTTTTCTCTTTAATAAATCTTATATAATGTGAATTTGA
AATAAGACCCTTTATTGTGAATTTAGATTAATTGAACCCTTCGAAGTTCAAACAGACGAC
GAACACAAATTGAAAAAAAAACACAAAAAAGAGCTAAATATTAATATCTTCTATCCTCGT
GCCTTAATTATAGCCCCGCCACTCCCTCCCTCCCTCTGTCTTGTGTGTCTCTATCCACAT
TCTCAGCCTCTTCAACAGCTTACAAAAAATCTAGTGATCGATCATATCAATTATCAAACA
ACACAAATAATGGTTTTTTCCCTTTAAAGTCGATTCCTTTTCATGGAATTCTTTTGTGTT
TAGCTCTTTCTTGACGTGACACTAACTTCTTCTCTCTCAAAAAGTCCAAACTTTTTCTCA
TAGTTTTCTTGATTCTTCATCTTTCTTAACCCCCCCCCCCCAACCCACAACAACCCCTCT
TCCTGCGGGAAACACGGGTTTTTTTTTTTTGTTGAATTTTTTGGTTAAGGGGTGTGTCAT
TTTCCAAAAATGAACACATTTGTGTTGAAAAGTTTGTAGCTTTATTGAATTTCAAAGAAG
GGTCTTTGGTTTTCTTGAGTTTTTGAGTTTTGGGGGTTTGAAATTTTTGGCTTGTTTGTG
TTCTTGATTGAGGGGTTATTTTAGAAAAAAGAGATCTGTTTCCTTTTATTTCTTTTTTAA
AAGTTTTCTTGTTAGGTAAAAGGGTAATAAAATCCTGTTATTGTCTCTTCCCCTCTCTAC
ATTTCCCTTTTTTCTTCTGTTTTGTGTTTGTTTTCTTTGTGGGGTATCCTTTTTTTTTTA
TCATCATATAGTTAGAAAGAGAGAGAGAAGCAATCAGTTTCATTTCTCTTTCTCTCTTGC
TCTCTTTGTGTTTGTTCATTTTCCCCTTTGAAAACAATGGAGAAAGGCTCAATGCAATCA
AATCTTGAGTCTTTTTTGGGTTCTACAACACCATTAGTTGCATCACAGTTCCTTGCCAAG
AGTGAAATTAGAAACCTTAATAAGCTTTGGCATCCTAAAGAAAGAGAGGAAATTGAATAC
TTCACATTGTCTGATCTTTGGAATTGTTTTGATGAATGGAGTGCTTATGGTGCTGGAGTT
CCAATCAGATTAGATTCTGGTGAAACTTTAGTTCAATATTATGTGCCTTATCTTTCAGCA
ATTCAAATTTTCACCAGCAGTTCATCTGTAAGCATTTTAAGGGAGGAGACTGAGTCTGCG
TGGGAAATGAGGGATTCTTGCAGTGATTCGTTCAGTGAAGAGAGTGAGAGTGAAAAGCTT
TCGAGATCGGATGGGGGTTCATCGGAGGAAGGTTTATTTGAGCAAGATAATCAGTTACAA
ATGAATAATAGATTGGGTTACCTTTATTATCAATACTTTGAAAGATCTTCTCCATATGGA
AGAGTACCTCTGGTGGATAAGATTAGTAGCTTAGCTGAAAGACACCCCGGATTAATGTCA
TTGAGAAGCGTAGATCTTTCACCAGCTAGTTGGATGTCAGTTGCTTGGTACCCGATATAT
CACATTCCCATGGGAAGAACCATTAAGGACTTGTCGACCTGCTTTCTCACATTCCACACC
CTTTCTTCTTCTTTTCAAGATATGGACCTTGAAGATAACACAGAGAAAGGTATTAGGAAA
CGTAACGAAGGGGAAGCAATCCCACTTCCACCTTTCGGTTTGGGAACTTACAAGATGCAG
GGTAATGTTTGGATTTCAGACAGAAGTGGGAGGGACCAAGAGAGGATGGTGTCACTATTA
AGCGTGGCCGACTCTTGGCTAAAGCAATTAGGGGTCCAGCACCATGACTTTAACTACTTC
TTGGGCATTCGTCATGGCTAAAAACTCCAATGATGACATACTCTTTATACCCCTCCAATA
GACCGATACTGGAGTTGCCCTTTCTTGGCACCGGGGTCATGTCTTTTTTTAAGCTCGGAA
GCATGAATATCCTCGAAAGAGGGTCATAGTAATGTCTTCGTTGCAAAAGCGTTAGGCTTT
TTTTCTTTCGTGATCCCCTCACCTTGACTACCAAAAGGAGGTATGTAGTAACGCAGTCTC
TTTAACATCAGACCTATGTGATTTCTTATGTATAGAGATTAGCTTAGTTTTGAAGGGGTA
AATTTTGAGGTGAAGTGAGAGATTAGCGTGGACGCGTCGTATAACTGTGGATGAATGATC
ATAAAATGACTATTATTAAGACCTTCATATTGTGAGCAGTTCTTGCAAGCTTCTGCAAAA
AAGCTCCTTATATTGTATGATTTTGTACAAGTTCAACTCTTTTTTTTTTGTACATTTTAT
GTAAATGTCTTTAGATATTACATTCCATTTAAAAGTGGAGAAACAGCTAATATGATGTAA
TGTTTATAAGCAA