Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g010390.2.1
CDS Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** M1AD53_SOLTU)
Sequence	ATGGTGTCTTTTGATAAATTGAAGATTTGGGTTTTGTGTATCTGTTTGGTTTCTGAATTG GGTTATGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTATCCTCACAAATATGGGGTTGGTGATTTCTTG AATGTTAAGGTTAATTCGTTGACTTCAATTGACACTGAATTGCCTTATAGTTATTATAGT TTGCCTTTCTGTAAGCCTGAGGAGGGTGTGAAGGATAGTGCAGAAAATCTAGGTGAGCTT CTTATGGGTGATAGGATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT GAGGTTTTCTTATGTCAAACTAAACCTTTGTCTGCTGATGAATTTAAGCTTTTGAAAGAG AGGATTGATGAGATGTATCAGGTGAATTTGATTCTTGATAACTTGCCTGCTATTCGTTAT ACCAAGAAGGAGAATTACTTCTTGCGTTGGACGGGGTATCCTGTTGGGATTAAGGTGCAA GATGCATATTATGTGTTTAATCATTTAAAGTTTACGGTTCTCGTTCATAAATTTGAGGAG ACCAATGTGGCTCGTGTGATGGGTACCGGGGATGGATCAGAGGTGATTTCGACAGTAGGA AATGAAGGATCTGATGCACCTGGATATATGGTTGTTGGATTTGAGGTTGTACCTTGTAGT TTCCAGCATACGCCTGATTCGTTGAAGAATCTAAAAATGTACAATAAGCTCCCATCTCCA ATCAAGTGTGACCCGACGACTGTGTCCATGGCTATTAAAGAAAATGAACCTGTGAGTTTT ACTTATGAGGTGAACTTTGTGGAGAGTGACATCAAGTGGCCGTCGAGATGGGATGCTTAT TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCATTGGTTCTCAATACTCAATTCCCTTATGGTTATC ACTTTCTTGGCTGGTATTGTGCTTGTGATCTTTTTGAGAACAATCCGCCGGGATCTGGCA AGGTATGATGAACTAGACAAAGAAGCTCAAGCTCAGATGAACGAGGAGTTATCTGGGTGG AAGCTTGTTGTTGGTGATGTTTTCCGTGCCCCTAGTAACCCTGGCCTTCTCTGCGCGATG GTTGGGGATGGAGTTCAAATCTTGGGGATGGCTGTAGTGACTATTATGTTTGCTGCCCTT GGATTCATGTCCCCAGCATCTCGTGGAACATTGATTACAGGTATGCTATTCTTTTACATG ATTCTTGGTGTTGCAGCTGGCTATGTTTCCGTTCGTCTTTGGAGGACAATCTTCTGTGGT GATCACAAGGGATGGGTTGGAGTTGCATGGAAGGCTGCATGTTTCTTCCCTGGACTTTCT TTCCTAATTCTTACTGTATTGAACTTCTTGTTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATT CCCTTTTCTTTGTTTGTCGTTCTCATTTTACTTTGGTTCTGTATCTCCGTCCCCCTAACC CTGATCGGTGGCTACCTTGGGGCAAAGGCACCTCACATTGAATATCCAGTCCGAACCAAC CAGATCCCACGTGAAATTCCAGCACAGAAATATCCATCTTGGCTTTTGGTTCTCGGGGCA GGAACCCTTCCTTTTGGCACTCTGTTCATTGAGCTCTTTTTTATCATGTCCAGTCTCTGG ATGGGTCGTGTGTACTACGTCTTCGGTTTCCTCCTCATCGTTATGATTCTCCTCGTCGTC GTTTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTAACCTACATGCATCTTTGTGTGGAGGACTGGAAA TGGTGGTGGAAGTCATTCTTTGCTTCTGGTTCAGTCGCGATATACATTTTCCTGTACTCC ATCAACTATCTAATATTCGACCTCAAGAGCTTAAGCGGCCCTGTTTCCGCCACCCTTTAC CTCGGATACTCCCTCTTCATGGTCTTGGCTATTATGTTTGCAACAGGCACTGTCGGGTTC CTTTCGTCTTTCTGGTTTGTACATTATTTGTTCTCTTCAGTGAAGCTAGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g010390.2.1
PEP Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** M1AD53_SOLTU)
Sequence	MVSFDKLKIWVLCICLVSELGYGFYLPGSYPHKYGVGDFLNVKVNSLTSIDTELPYSYYS LPFCKPEEGVKDSAENLGELLMGDRIENSPYRFKMYTNETEVFLCQTKPLSADEFKLLKE RIDEMYQVNLILDNLPAIRYTKKENYFLRWTGYPVGIKVQDAYYVFNHLKFTVLVHKFEE TNVARVMGTGDGSEVISTVGNEGSDAPGYMVVGFEVVPCSFQHTPDSLKNLKMYNKLPSP IKCDPTTVSMAIKENEPVSFTYEVNFVESDIKWPSRWDAYLKMEGAKVHWFSILNSLMVI TFLAGIVLVIFLRTIRRDLARYDELDKEAQAQMNEELSGWKLVVGDVFRAPSNPGLLCAM VGDGVQILGMAVVTIMFAALGFMSPASRGTLITGMLFFYMILGVAAGYVSVRLWRTIFCG DHKGWVGVAWKAACFFPGLSFLILTVLNFLLWGSHSTGAIPFSLFVVLILLWFCISVPLT LIGGYLGAKAPHIEYPVRTNQIPREIPAQKYPSWLLVLGAGTLPFGTLFIELFFIMSSLW MGRVYYVFGFLLIVMILLVVVCAEVSLVLTYMHLCVEDWKWWWKSFFASGSVAIYIFLYS INYLIFDLKSLSGPVSATLYLGYSLFMVLAIMFATGTVGFLSSFWFVHYLFSSVKLD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g010390.2.1
Transcript Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** M1AD53_SOLTU)
Sequence	ATGGTGTCTTTTGATAAATTGAAGATTTGGGTTTTGTGTATCTGTTTGGTTTCTGAATTG GGTTATGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTATCCTCACAAATATGGGGTTGGTGATTTCTTG AATGTTAAGGTTAATTCGTTGACTTCAATTGACACTGAATTGCCTTATAGTTATTATAGT TTGCCTTTCTGTAAGCCTGAGGAGGGTGTGAAGGATAGTGCAGAAAATCTAGGTGAGCTT CTTATGGGTGATAGGATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT GAGGTTTTCTTATGTCAAACTAAACCTTTGTCTGCTGATGAATTTAAGCTTTTGAAAGAG AGGATTGATGAGATGTATCAGGTGAATTTGATTCTTGATAACTTGCCTGCTATTCGTTAT ACCAAGAAGGAGAATTACTTCTTGCGTTGGACGGGGTATCCTGTTGGGATTAAGGTGCAA GATGCATATTATGTGTTTAATCATTTAAAGTTTACGGTTCTCGTTCATAAATTTGAGGAG ACCAATGTGGCTCGTGTGATGGGTACCGGGGATGGATCAGAGGTGATTTCGACAGTAGGA AATGAAGGATCTGATGCACCTGGATATATGGTTGTTGGATTTGAGGTTGTACCTTGTAGT TTCCAGCATACGCCTGATTCGTTGAAGAATCTAAAAATGTACAATAAGCTCCCATCTCCA ATCAAGTGTGACCCGACGACTGTGTCCATGGCTATTAAAGAAAATGAACCTGTGAGTTTT ACTTATGAGGTGAACTTTGTGGAGAGTGACATCAAGTGGCCGTCGAGATGGGATGCTTAT TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCATTGGTTCTCAATACTCAATTCCCTTATGGTTATC ACTTTCTTGGCTGGTATTGTGCTTGTGATCTTTTTGAGAACAATCCGCCGGGATCTGGCA AGGTATGATGAACTAGACAAAGAAGCTCAAGCTCAGATGAACGAGGAGTTATCTGGGTGG AAGCTTGTTGTTGGTGATGTTTTCCGTGCCCCTAGTAACCCTGGCCTTCTCTGCGCGATG GTTGGGGATGGAGTTCAAATCTTGGGGATGGCTGTAGTGACTATTATGTTTGCTGCCCTT GGATTCATGTCCCCAGCATCTCGTGGAACATTGATTACAGGTATGCTATTCTTTTACATG ATTCTTGGTGTTGCAGCTGGCTATGTTTCCGTTCGTCTTTGGAGGACAATCTTCTGTGGT GATCACAAGGGATGGGTTGGAGTTGCATGGAAGGCTGCATGTTTCTTCCCTGGACTTTCT TTCCTAATTCTTACTGTATTGAACTTCTTGTTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATT CCCTTTTCTTTGTTTGTCGTTCTCATTTTACTTTGGTTCTGTATCTCCGTCCCCCTAACC CTGATCGGTGGCTACCTTGGGGCAAAGGCACCTCACATTGAATATCCAGTCCGAACCAAC CAGATCCCACGTGAAATTCCAGCACAGAAATATCCATCTTGGCTTTTGGTTCTCGGGGCA GGAACCCTTCCTTTTGGCACTCTGTTCATTGAGCTCTTTTTTATCATGTCCAGTCTCTGG ATGGGTCGTGTGTACTACGTCTTCGGTTTCCTCCTCATCGTTATGATTCTCCTCGTCGTC GTTTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTAACCTACATGCATCTTTGTGTGGAGGACTGGAAA TGGTGGTGGAAGTCATTCTTTGCTTCTGGTTCAGTCGCGATATACATTTTCCTGTACTCC ATCAACTATCTAATATTCGACCTCAAGAGCTTAAGCGGCCCTGTTTCCGCCACCCTTTAC CTCGGATACTCCCTCTTCATGGTCTTGGCTATTATGTTTGCAACAGGCACTGTCGGGTTC CTTTCGTCTTTCTGGTTTGTACATTATTTGTTCTCTTCAGTGAAGCTAGATTGA