Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g009640.1.1
CDS Infomation	BED zinc finger,hAT family dimerization domain (AHRD V3.3 *** A0A061G8Z6_THECC)
Sequence	ATGGCAACCCCAGAAACCGCAGCTCCTCCAGCAACCCCTACTGAGAATAATGAGATGGTG CCGAAAAATGAGATGATACATGAGCATGGTGATGAGATGGTGCCGCAAAATGAGATGATA CATGAGCATGGTGATGAGATGGTGCCGCAAAATGAGATGATACATGAGCAAAGCCATGAG ATTGTGCCGGAAAATGAGATGCAAAATGAGATGATACATGAGATTGTGCCGGAAAATGAG ATGCAAAATGAGATGATACATGAGCACAGCCATGACATTGTGCCTGAAAATGAGATGCAA AATGAGCACAGCCATGAGATTATGCCGGAAAATGAGATGATACGTGAGCACAGCCATGAG ATTGTGCGGGAAAATGAGATGATACCTGAGCACAATCATGAGATAGTGCCGGAAAATGAG ATGATACATGAGTGCAGTCACGAGACAGTGCCACAAAATGAGATGGTACATGAGCATAGT CATGAAATGGTGCCAGATAATGAGATGACACATGAGCACACTCACGAGATGGTGCCGGAA AATGAGATGACACATGATCATAATCACGAGATGGTGCAGGAAAATGAGATGACACATGAG CATAATCACGAGATGGTGCCGGAAAATGAGATGATGCATGAACATGGTCATGAGATGGTG CCGGAACATGAGATGATGCATGAACATAGTCATGAGATGATGCCGGAACATGAGATGATG CATGAACATCATATGGTGCTTGGGCATGAGATAGTCCCTAGCAATGAGATGGTCCCGGAT GATGAGATGATCCCACTAAATGAGATGGTCCTTGCTGAACCACAACCCAACTATATAGAA ACACCTCCAAACAATCCAGAAACACAGCCCAGCAAGCGTAGGAAGAAGAAGTCAATAGTT TGGGAACACTTCACCATTGAAAATGTCGGCGGTGGAACTAGAAGGGCACAATGTAAGCAG TGCAAGCAATCATTTGCATATAGTACAGGTTCAAAAGTAGCTGGCACTAGTCACCTGAAA CGCCATATTGCAAAAGGAACCTGTCCAGTTGTCCTACGTAACCAACAGAATAATCAATTG AGCCCATATAGTACACCTCCTAAGATGAGTGGATATGGTGGTAGTACTGATGCACCAAAA CGGCGTTATAGGACTGCATCTTCTCCTTACCTTGCTTTTGATCCTGACCGGTGCCGTCAA GAGATCTCTAAGATGATCATCATGCACGACTATCCCCTTCACATGGTTGAGCATCCAGGC TTTCTTGCTTTTGTGCAGAATCTTCAACCTCGTTTTGATATGGTGAGCTTCAACACTGTG CAAGGAGATTGTGTGGCAACTTATCTTAGAGAGAAGCAAGCCATTCAGAAGGTCATTGAG GGAGTGCCTGGGCGTATCTGCTTAACGCTAGATATGTGGTCCTCCTGCTACACTGTGGGC TATGTGTTCATAACCGGGCAGTATATTGACAGTGAGTGGAAAATTCACAGGAAAATACTC AATATCATTATGGAACCATATCCAGATTCTGACACGGCTTTCAGCCATGCTGTTGCTGCT TGCCTTTCTGACTGGAGTATGGAAGGTAAGTTGTTTTCTGTCACTATTAATCAACCGTTG GGTGATGCTTCTGTTGATAATCTTAGAGCTTTACTATCTGTGAAGAACCCTCTTGTGCTC AACGGTCAGTTGTTGGTCGGAAGTTGTCTTGCTCGAACTTTAAGCAGCATTGCCCAAGGT GCATTTAATTTTTTGCATGAAACTGTTAAGAAAGTAAGAGATAGCGTCAAGTACGTGAAA ACATCAGAATTTCACGAGGAAAAGTTTATTGAGCTCAAACAGCAGCTTCAAGTGCCAAGC ACAAAGACTTTGGCTCTTGATGACCAGACTCAATGGAACACCACATATGAGATGTTGTTA GCTGCATCAGAGTTAAAGGAAGTGTTTTCATGCTTGGATACATCTGATCCCGATTACAAG GATGCCCTGTCAATGGATGATTGGAAGCAAGTTGAGGTTCTTTGTACTTACTTGAAGATC CTCTTTGACACTGCCAATCTTCTGACTGCACCAACAATTCCAACAACCAACACATTCTTC CATGAAGCATGGAAGATTCAATTGGAACTGGCTCGTGCTGCAGCAAGTGAAGATCCATCC ATAAGCGGTCTTACCAAAACAATGCAAGAGGAGTTTGATAAATACTGGAAGAGTTGTTGT CTAATATTAGCTATTGCCGTTGTAATGGATCCACGCTTCAAAATGAAACTTGTAGAATTC AGCTTTACAAAAATATATGGTGAAGAAGCTGCCACCTTTGTGAAGTTCGTTGAGGAGGGA ATCCACGAGCTCTTCCTTGAATACGTGGCACTTCCTCTGCCTCTGACCCCAGCTTATGCT GAAGAGGTAGATGATGGAGCTTTGAAGCAGGAGAATGGTGGGGGCGGACTTACAGATTTT GATGCCTATATTATGGAGACAACAAGCCAGCAGTCAAGGTCAGAACTTGATCAATATTTG GATGAGTCCTTGTTGCCTCGTGTTCATGAGTTTGACGTTGTTGGGTGGTGGAAACTGAAC AGAATGAAGTACCCAACTCTGTCAAAAATGGCTCGTGACATCTTGTCTGTTCCAGTTTCT ACTGTAACAGCTGATTCTGTGTTTAGCACGGTAGGCAAAGAGATGGATCGCTACAGGTGT TCCTTGCGACCTGAGACCGTGGAGGCCCTCATTTGCGCCAAGGATTGGCTTCAAAATGCA TCAGTAAATACCTTACATGCACCAATAAAAATGGAAGTCCCCATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g009640.1.1
PEP Infomation	BED zinc finger,hAT family dimerization domain (AHRD V3.3 *** A0A061G8Z6_THECC)
Sequence	MATPETAAPPATPTENNEMVPKNEMIHEHGDEMVPQNEMIHEHGDEMVPQNEMIHEQSHE IVPENEMQNEMIHEIVPENEMQNEMIHEHSHDIVPENEMQNEHSHEIMPENEMIREHSHE IVRENEMIPEHNHEIVPENEMIHECSHETVPQNEMVHEHSHEMVPDNEMTHEHTHEMVPE NEMTHDHNHEMVQENEMTHEHNHEMVPENEMMHEHGHEMVPEHEMMHEHSHEMMPEHEMM HEHHMVLGHEIVPSNEMVPDDEMIPLNEMVLAEPQPNYIETPPNNPETQPSKRRKKKSIV WEHFTIENVGGGTRRAQCKQCKQSFAYSTGSKVAGTSHLKRHIAKGTCPVVLRNQQNNQL SPYSTPPKMSGYGGSTDAPKRRYRTASSPYLAFDPDRCRQEISKMIIMHDYPLHMVEHPG FLAFVQNLQPRFDMVSFNTVQGDCVATYLREKQAIQKVIEGVPGRICLTLDMWSSCYTVG YVFITGQYIDSEWKIHRKILNIIMEPYPDSDTAFSHAVAACLSDWSMEGKLFSVTINQPL GDASVDNLRALLSVKNPLVLNGQLLVGSCLARTLSSIAQGAFNFLHETVKKVRDSVKYVK TSEFHEEKFIELKQQLQVPSTKTLALDDQTQWNTTYEMLLAASELKEVFSCLDTSDPDYK DALSMDDWKQVEVLCTYLKILFDTANLLTAPTIPTTNTFFHEAWKIQLELARAAASEDPS ISGLTKTMQEEFDKYWKSCCLILAIAVVMDPRFKMKLVEFSFTKIYGEEAATFVKFVEEG IHELFLEYVALPLPLTPAYAEEVDDGALKQENGGGGLTDFDAYIMETTSQQSRSELDQYL DESLLPRVHEFDVVGWWKLNRMKYPTLSKMARDILSVPVSTVTADSVFSTVGKEMDRYRC SLRPETVEALICAKDWLQNASVNTLHAPIKMEVPI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g009640.1.1
Transcript Infomation	BED zinc finger,hAT family dimerization domain (AHRD V3.3 *** A0A061G8Z6_THECC)
Sequence	ATGGCAACCCCAGAAACCGCAGCTCCTCCAGCAACCCCTACTGAGAATAATGAGATGGTG CCGAAAAATGAGATGATACATGAGCATGGTGATGAGATGGTGCCGCAAAATGAGATGATA CATGAGCATGGTGATGAGATGGTGCCGCAAAATGAGATGATACATGAGCAAAGCCATGAG ATTGTGCCGGAAAATGAGATGCAAAATGAGATGATACATGAGATTGTGCCGGAAAATGAG ATGCAAAATGAGATGATACATGAGCACAGCCATGACATTGTGCCTGAAAATGAGATGCAA AATGAGCACAGCCATGAGATTATGCCGGAAAATGAGATGATACGTGAGCACAGCCATGAG ATTGTGCGGGAAAATGAGATGATACCTGAGCACAATCATGAGATAGTGCCGGAAAATGAG ATGATACATGAGTGCAGTCACGAGACAGTGCCACAAAATGAGATGGTACATGAGCATAGT CATGAAATGGTGCCAGATAATGAGATGACACATGAGCACACTCACGAGATGGTGCCGGAA AATGAGATGACACATGATCATAATCACGAGATGGTGCAGGAAAATGAGATGACACATGAG CATAATCACGAGATGGTGCCGGAAAATGAGATGATGCATGAACATGGTCATGAGATGGTG CCGGAACATGAGATGATGCATGAACATAGTCATGAGATGATGCCGGAACATGAGATGATG CATGAACATCATATGGTGCTTGGGCATGAGATAGTCCCTAGCAATGAGATGGTCCCGGAT GATGAGATGATCCCACTAAATGAGATGGTCCTTGCTGAACCACAACCCAACTATATAGAA ACACCTCCAAACAATCCAGAAACACAGCCCAGCAAGCGTAGGAAGAAGAAGTCAATAGTT TGGGAACACTTCACCATTGAAAATGTCGGCGGTGGAACTAGAAGGGCACAATGTAAGCAG TGCAAGCAATCATTTGCATATAGTACAGGTTCAAAAGTAGCTGGCACTAGTCACCTGAAA CGCCATATTGCAAAAGGAACCTGTCCAGTTGTCCTACGTAACCAACAGAATAATCAATTG AGCCCATATAGTACACCTCCTAAGATGAGTGGATATGGTGGTAGTACTGATGCACCAAAA CGGCGTTATAGGACTGCATCTTCTCCTTACCTTGCTTTTGATCCTGACCGGTGCCGTCAA GAGATCTCTAAGATGATCATCATGCACGACTATCCCCTTCACATGGTTGAGCATCCAGGC TTTCTTGCTTTTGTGCAGAATCTTCAACCTCGTTTTGATATGGTGAGCTTCAACACTGTG CAAGGAGATTGTGTGGCAACTTATCTTAGAGAGAAGCAAGCCATTCAGAAGGTCATTGAG GGAGTGCCTGGGCGTATCTGCTTAACGCTAGATATGTGGTCCTCCTGCTACACTGTGGGC TATGTGTTCATAACCGGGCAGTATATTGACAGTGAGTGGAAAATTCACAGGAAAATACTC AATATCATTATGGAACCATATCCAGATTCTGACACGGCTTTCAGCCATGCTGTTGCTGCT TGCCTTTCTGACTGGAGTATGGAAGGTAAGTTGTTTTCTGTCACTATTAATCAACCGTTG GGTGATGCTTCTGTTGATAATCTTAGAGCTTTACTATCTGTGAAGAACCCTCTTGTGCTC AACGGTCAGTTGTTGGTCGGAAGTTGTCTTGCTCGAACTTTAAGCAGCATTGCCCAAGGT GCATTTAATTTTTTGCATGAAACTGTTAAGAAAGTAAGAGATAGCGTCAAGTACGTGAAA ACATCAGAATTTCACGAGGAAAAGTTTATTGAGCTCAAACAGCAGCTTCAAGTGCCAAGC ACAAAGACTTTGGCTCTTGATGACCAGACTCAATGGAACACCACATATGAGATGTTGTTA GCTGCATCAGAGTTAAAGGAAGTGTTTTCATGCTTGGATACATCTGATCCCGATTACAAG GATGCCCTGTCAATGGATGATTGGAAGCAAGTTGAGGTTCTTTGTACTTACTTGAAGATC CTCTTTGACACTGCCAATCTTCTGACTGCACCAACAATTCCAACAACCAACACATTCTTC CATGAAGCATGGAAGATTCAATTGGAACTGGCTCGTGCTGCAGCAAGTGAAGATCCATCC ATAAGCGGTCTTACCAAAACAATGCAAGAGGAGTTTGATAAATACTGGAAGAGTTGTTGT CTAATATTAGCTATTGCCGTTGTAATGGATCCACGCTTCAAAATGAAACTTGTAGAATTC AGCTTTACAAAAATATATGGTGAAGAAGCTGCCACCTTTGTGAAGTTCGTTGAGGAGGGA ATCCACGAGCTCTTCCTTGAATACGTGGCACTTCCTCTGCCTCTGACCCCAGCTTATGCT GAAGAGGTAGATGATGGAGCTTTGAAGCAGGAGAATGGTGGGGGCGGACTTACAGATTTT GATGCCTATATTATGGAGACAACAAGCCAGCAGTCAAGGTCAGAACTTGATCAATATTTG GATGAGTCCTTGTTGCCTCGTGTTCATGAGTTTGACGTTGTTGGGTGGTGGAAACTGAAC AGAATGAAGTACCCAACTCTGTCAAAAATGGCTCGTGACATCTTGTCTGTTCCAGTTTCT ACTGTAACAGCTGATTCTGTGTTTAGCACGGTAGGCAAAGAGATGGATCGCTACAGGTGT TCCTTGCGACCTGAGACCGTGGAGGCCCTCATTTGCGCCAAGGATTGGCTTCAAAATGCA TCAGTAAATACCTTACATGCACCAATAAAAATGGAAGTCCCCATTTAG