Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g006980.1.1
CDS Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 - A0A0K9PTR8_ZOSMR)
Sequence	ATGAAGGAGAAAACTCAAACACCCATTTGTTCTCTGTTTTTTCTTGTGCTCTGTTTTTTG TGTTGTTCAGTCTTTACTGAACACACAAATGCTGAGTTTACTGTTTCTGAAAATGGTCCT TTAACTGATTCTGAAGCTCAGTTCATCAAACACAGGCAGCTTTTGTATTACAGAGATGAG TTTGGTGATAGAGGTGAAAATGTGAAAATTGATCCATCTATGGTGTTTGAGAACGATAGA ATCAAGAATGCTTATATTGCTTTACAAGCATGGAAACAAGCTATCATTTCAGATCCCTTT AATATCACTATGAATTGGGTTGGTCCTAATGTATGCAGCTACACCGGAGTCTTCTGTGCT CCGGCGTTGGATAATCCGAAAATCCGTACAGTTGCCGGCATTGACCTTAACCATGGCGAC ATTGCAGGGTATCTCCCGGAAGAGCTTGGTCTTCTTACAGATCTTGGGATTTTCCATATC AATTCCAATCGTTTCTGTGGTACAATACCGAGAAAGTTGAACAAGTTGAAGATACTGTTC GAGCTGGATCTGAGTAATAACAGGTTTGCCGGGAAGTTTCCTTATGTTGTTTTGAGTTTA CCCAAGTTGATATTTTTGGATATTAGGTTCAATGAATTTGAAGGTAATGTACCTTCGCAG CTTTTTGATAAGCCACTAGACGCCATTTTTATTAATCATAATCGTTTTGCGTTTGAGCTG CCGGAGAATTTTGGGAATTCGCCGGTTTCTGTGATAGTACTTGCGAGTAACAGTTTTCAT GGGTGTCTTCCGGCGAGTATTGGGAATATGAGTAATCTTAATGAAGCGATTTTAATGAAT AATGGGTTGCGTTCTTGTTTGCCGGCGGAGATTGGGTTGTTGAAAAATTTAACTGTATTT GATGTGAGCTTTAATGAGTTGATGGGTCCGTTGCCGGAGAATTTTGGTGGTTTGGTGAAT TTGGAGCAATTGAATGTCGCACATAATATGCTTTCTGGTACGATTCCTAAAAGTATTTGT CAGCTTCCTAAGCTTGAGAATTTTACCTATTCGTATAATTTCTTCACCGGTGAACCGCCG GTATGTTTGGCGTTGCCGGAGTTTCATGATCAACGGAATTGTTTGCCCAACAGACCGGTG CAACGGTCTCCGGGACAGTGTAAGGCGTTTTTGTCTAAAAAAATTCATTGTAGTGCTTTT AAGTGTCATAAATTTGTTCCTGTTTTGCCACCTCCACCACCACTTTCACCACCGCTGCCT GCCCCTCCTCCGCCGCCTGTTTATTCGCCTCCGCCACCAGTTTATAATCCTCCTTCACCA CCTCCACCACCACCACCCTCTCCACCTCCTCCATCACCTCCACCACCAGTCTATTCACCA CCACCTCCATCTCCTCCTCCACCACCACCAGTCTATTCACCACCACCACCACCTCCATCT CCTCCTCCACCATCACCTCCACCCCCACCACCACCATCTCCACCTCCACCATCACCCCCA CCACCAGTTTATTCACCACCACCTCCCCCTCCACCTCCTCCCCCACCAGTTTATTCACCA CCGCCATTGCCTTATTGTGTACGCTCACCTCCACCTCCACCTCCACCACCAAATTCTCCA CCTCCTAATTCACCACCTCCACCGCTTGCTCACTCGCCTCCACCCCCTTCACCTTACTAT TACAATTCACCACCACCTCCGCCCCCAAATTCGCCACCTCCTCCACCAAATTCGCCTCCT CCACCACCACCAACATACATTTACTCATCACCTCCGCCACCAAATTCACCACCTCCTCCA CCACCACCATACGTATACTCTTCACCTCCACCACCTCATTCCCCTCCACCTCCGTCCCCA TTACCTTGTATAGAACCCCCTCCACCCCCTCCTCCATGCATTGAACCACCCCCACCACCT TCCCCTTCACCATCTCCTCCACCACCACCAATGTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCA TCTCCATCACCTCCTCCCCCACCGGTATATCACTACAATTCTCCACCCCCACCATCACCA TCACCTCCTCCACCACCAGTATATTACTACAATTCTCCACCCCCACCTCCACCATCACCA CCGCCTACTCCAGTATACGAAGGGCCATTGCCACCAGTAATAGGAGTTCAATATGCTTCA CCACCTCCACCACCCTTTTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g006980.1.1
PEP Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 - A0A0K9PTR8_ZOSMR)
Sequence	MKEKTQTPICSLFFLVLCFLCCSVFTEHTNAEFTVSENGPLTDSEAQFIKHRQLLYYRDE FGDRGENVKIDPSMVFENDRIKNAYIALQAWKQAIISDPFNITMNWVGPNVCSYTGVFCA PALDNPKIRTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLTDLGIFHINSNRFCGTIPRKLNKLKILF ELDLSNNRFAGKFPYVVLSLPKLIFLDIRFNEFEGNVPSQLFDKPLDAIFINHNRFAFEL PENFGNSPVSVIVLASNSFHGCLPASIGNMSNLNEAILMNNGLRSCLPAEIGLLKNLTVF DVSFNELMGPLPENFGGLVNLEQLNVAHNMLSGTIPKSICQLPKLENFTYSYNFFTGEPP VCLALPEFHDQRNCLPNRPVQRSPGQCKAFLSKKIHCSAFKCHKFVPVLPPPPPLSPPLP APPPPPVYSPPPPVYNPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPVYSPPPPSPPPPPPVYSPPPPPPS PPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPVYSPPPPPPPPPPPVYSPPPLPYCVRSPPPPPPPPNSP PPNSPPPPLAHSPPPPSPYYYNSPPPPPPNSPPPPPNSPPPPPPTYIYSSPPPPNSPPPP PPPYVYSSPPPPHSPPPPSPLPCIEPPPPPPPCIEPPPPPSPSPSPPPPPMYHYNSPPPP SPSPPPPPVYHYNSPPPPSPSPPPPPVYYYNSPPPPPPSPPPTPVYEGPLPPVIGVQYAS PPPPPFY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g006980.1.1
Transcript Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 - A0A0K9PTR8_ZOSMR)
Sequence	ATGAAGGAGAAAACTCAAACACCCATTTGTTCTCTGTTTTTTCTTGTGCTCTGTTTTTTG TGTTGTTCAGTCTTTACTGAACACACAAATGCTGAGTTTACTGTTTCTGAAAATGGTCCT TTAACTGATTCTGAAGCTCAGTTCATCAAACACAGGCAGCTTTTGTATTACAGAGATGAG TTTGGTGATAGAGGTGAAAATGTGAAAATTGATCCATCTATGGTGTTTGAGAACGATAGA ATCAAGAATGCTTATATTGCTTTACAAGCATGGAAACAAGCTATCATTTCAGATCCCTTT AATATCACTATGAATTGGGTTGGTCCTAATGTATGCAGCTACACCGGAGTCTTCTGTGCT CCGGCGTTGGATAATCCGAAAATCCGTACAGTTGCCGGCATTGACCTTAACCATGGCGAC ATTGCAGGGTATCTCCCGGAAGAGCTTGGTCTTCTTACAGATCTTGGGATTTTCCATATC AATTCCAATCGTTTCTGTGGTACAATACCGAGAAAGTTGAACAAGTTGAAGATACTGTTC GAGCTGGATCTGAGTAATAACAGGTTTGCCGGGAAGTTTCCTTATGTTGTTTTGAGTTTA CCCAAGTTGATATTTTTGGATATTAGGTTCAATGAATTTGAAGGTAATGTACCTTCGCAG CTTTTTGATAAGCCACTAGACGCCATTTTTATTAATCATAATCGTTTTGCGTTTGAGCTG CCGGAGAATTTTGGGAATTCGCCGGTTTCTGTGATAGTACTTGCGAGTAACAGTTTTCAT GGGTGTCTTCCGGCGAGTATTGGGAATATGAGTAATCTTAATGAAGCGATTTTAATGAAT AATGGGTTGCGTTCTTGTTTGCCGGCGGAGATTGGGTTGTTGAAAAATTTAACTGTATTT GATGTGAGCTTTAATGAGTTGATGGGTCCGTTGCCGGAGAATTTTGGTGGTTTGGTGAAT TTGGAGCAATTGAATGTCGCACATAATATGCTTTCTGGTACGATTCCTAAAAGTATTTGT CAGCTTCCTAAGCTTGAGAATTTTACCTATTCGTATAATTTCTTCACCGGTGAACCGCCG GTATGTTTGGCGTTGCCGGAGTTTCATGATCAACGGAATTGTTTGCCCAACAGACCGGTG CAACGGTCTCCGGGACAGTGTAAGGCGTTTTTGTCTAAAAAAATTCATTGTAGTGCTTTT AAGTGTCATAAATTTGTTCCTGTTTTGCCACCTCCACCACCACTTTCACCACCGCTGCCT GCCCCTCCTCCGCCGCCTGTTTATTCGCCTCCGCCACCAGTTTATAATCCTCCTTCACCA CCTCCACCACCACCACCCTCTCCACCTCCTCCATCACCTCCACCACCAGTCTATTCACCA CCACCTCCATCTCCTCCTCCACCACCACCAGTCTATTCACCACCACCACCACCTCCATCT CCTCCTCCACCATCACCTCCACCCCCACCACCACCATCTCCACCTCCACCATCACCCCCA CCACCAGTTTATTCACCACCACCTCCCCCTCCACCTCCTCCCCCACCAGTTTATTCACCA CCGCCATTGCCTTATTGTGTACGCTCACCTCCACCTCCACCTCCACCACCAAATTCTCCA CCTCCTAATTCACCACCTCCACCGCTTGCTCACTCGCCTCCACCCCCTTCACCTTACTAT TACAATTCACCACCACCTCCGCCCCCAAATTCGCCACCTCCTCCACCAAATTCGCCTCCT CCACCACCACCAACATACATTTACTCATCACCTCCGCCACCAAATTCACCACCTCCTCCA CCACCACCATACGTATACTCTTCACCTCCACCACCTCATTCCCCTCCACCTCCGTCCCCA TTACCTTGTATAGAACCCCCTCCACCCCCTCCTCCATGCATTGAACCACCCCCACCACCT TCCCCTTCACCATCTCCTCCACCACCACCAATGTATCATTACAATTCTCCGCCCCCACCA TCTCCATCACCTCCTCCCCCACCGGTATATCACTACAATTCTCCACCCCCACCATCACCA TCACCTCCTCCACCACCAGTATATTACTACAATTCTCCACCCCCACCTCCACCATCACCA CCGCCTACTCCAGTATACGAAGGGCCATTGCCACCAGTAATAGGAGTTCAATATGCTTCA CCACCTCCACCACCCTTTTATTAA