Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc12g006360.2.1
CDS Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4DBH3_SOLLC)
Sequence	ATGGAGAACCAACATCCATTGCTACCTAGTATACTTCACTCAACAGTTAAGTTATCAGAC ATGTCATCAGGCGAAATCGAAGAGTTCTTGGGGCACAAAAATGTGTCTTTCAAGGTGTAT CTGAAGTTGTTTGCTTGGGAATCAAGGCTACTTTGGCTTCTTTCTGGAGCTGTTATTACA GTCTTGATTTTTAACTATATGCTTGGCTTTGTCACACTTGTGTTTGTTGGACATTTAGGT TCATTGGAGTTAGCTGGTGCTTCCATTGCTAGTGTTGGAATTCAAGGCCTTGCTTATGGT GTTATGTTGGGGATGGCAAGTGCTGTTGAGACAGTTTGTGGCCAAGCATATGGAGCAAAA AGATATGAAGTTATGGGAGTGATATGCCAAAGAGCAATTTTACTTCACCTTGGAGCAGCT TTTATCCTCTCATTTCCTTACTGGTTTTCAGGGCCATTGCTTAAAGCAATAGGACAATCA GAGACCATATCTGAGCAAGGGGAAATATTCGCGCGCGGATTGATCCTTCAGCTATATGGA TTAGCTATAAGTTGTCCAATGCAGAGGTTTCTGCAGGCTCAGAACATTGTTAACCCGTTG GCTTATATCGCGGTTTCTGTGTTCATTGTGCATGTTGTGATCACTTGGCTTGTGGTTGAT GTCTTGGAATATGGTTTATTCGGAGCTGCGATGGCACAGAGCTTCTCGTGGTGGCTGTTG GTCATCGCGCAAGGTGTTTACGTCGTTTTTAGTCCCCTGTGCAAAGAAACTTGGACTGGT TTCTCTATGAATGCTTTCAATAGCATTTGGCCTTACTTCAAGCTAACTGTTGCCTCAGCT GTCATGTTATGCTTGGAGATATGGTACTTCCAAGGCCTAGTGCTTGTATCAGGGCTACTT CCCTATGCTACAATCTCACTTGACTCCATCTCTATGCTCACAACTTTTAGTGACAATAAC AGCATGAATTACTGGAACTGGGATATGCAATTTATGTTGGGACTAGCAGCAGCAGCCAGT GTTCGAGTTAGTAATGAGCTTGGAGCAGGACATCCGAGGGTAGCTAAAATGTCGATAATT GTAGTGAACATGACGAGCATCATGTTCAGTACAATTATCTGCATTATTGTGCTGATATTC AGAGTTGGATTAAGTAAACTCTTTACAAGTGACTCTGAAGTCATTGAAGCTGTTTCTCAT TTGACTCCATTACTTGCCATTTCTGTTTGGTTGAATGGCATTCAGCCTATTCTCTCTGGT GTGGCTGTTGGAAGTGGATGGCAAGCTGTGGTGGCATATGTCAATCTAGCTACTTACTAT TGTATTGGTCTACCAATTGGATGTATTCTTGGCTTCAAAACAAGTTTGCAAGCAGCAGGA ATATGGTGGGGGATGATTGTTGGAGTTGTCCTACAAACAGTCAGCTTGTTTATTTTAACA GCCAGAACAAACTGGAATACTGAGGTCGCGAAAGCAGCTGATCGTTTGAAGGAAGCTGGA AATAGAGAAGATGAAGATCCTGTAGACAGGCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc12g006360.2.1
PEP Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4DBH3_SOLLC)
Sequence	MENQHPLLPSILHSTVKLSDMSSGEIEEFLGHKNVSFKVYLKLFAWESRLLWLLSGAVIT VLIFNYMLGFVTLVFVGHLGSLELAGASIASVGIQGLAYGVMLGMASAVETVCGQAYGAK RYEVMGVICQRAILLHLGAAFILSFPYWFSGPLLKAIGQSETISEQGEIFARGLILQLYG LAISCPMQRFLQAQNIVNPLAYIAVSVFIVHVVITWLVVDVLEYGLFGAAMAQSFSWWLL VIAQGVYVVFSPLCKETWTGFSMNAFNSIWPYFKLTVASAVMLCLEIWYFQGLVLVSGLL PYATISLDSISMLTTFSDNNSMNYWNWDMQFMLGLAAAASVRVSNELGAGHPRVAKMSII VVNMTSIMFSTIICIIVLIFRVGLSKLFTSDSEVIEAVSHLTPLLAISVWLNGIQPILSG VAVGSGWQAVVAYVNLATYYCIGLPIGCILGFKTSLQAAGIWWGMIVGVVLQTVSLFILT ARTNWNTEVAKAADRLKEAGNREDEDPVDRP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc12g006360.2.1
Transcript Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4DBH3_SOLLC)
Sequence	CCTAACTTTTTCACCACTCAGTGATAAACCACACCTAAGCTTCTTACTGATCTACAAAGC TAAACAAGACTGGTAGTTGCACCTGTTCTGTTCACCCTAGTGAATTTTGTACAAACATAT TCACATTTTGTTCCTCTCAATGCATATAAGGTTGCATTGTTGTTTAAGAGACAAAAGATA ACAATGGAGAACCAACATCCATTGCTACCTAGTATACTTCACTCAACAGTTAAGTTATCA GACATGTCATCAGGCGAAATCGAAGAGTTCTTGGGGCACAAAAATGTGTCTTTCAAGGTG TATCTGAAGTTGTTTGCTTGGGAATCAAGGCTACTTTGGCTTCTTTCTGGAGCTGTTATT ACAGTCTTGATTTTTAACTATATGCTTGGCTTTGTCACACTTGTGTTTGTTGGACATTTA GGTTCATTGGAGTTAGCTGGTGCTTCCATTGCTAGTGTTGGAATTCAAGGCCTTGCTTAT GGTGTTATGTTGGGGATGGCAAGTGCTGTTGAGACAGTTTGTGGCCAAGCATATGGAGCA AAAAGATATGAAGTTATGGGAGTGATATGCCAAAGAGCAATTTTACTTCACCTTGGAGCA GCTTTTATCCTCTCATTTCCTTACTGGTTTTCAGGGCCATTGCTTAAAGCAATAGGACAA TCAGAGACCATATCTGAGCAAGGGGAAATATTCGCGCGCGGATTGATCCTTCAGCTATAT GGATTAGCTATAAGTTGTCCAATGCAGAGGTTTCTGCAGGCTCAGAACATTGTTAACCCG TTGGCTTATATCGCGGTTTCTGTGTTCATTGTGCATGTTGTGATCACTTGGCTTGTGGTT GATGTCTTGGAATATGGTTTATTCGGAGCTGCGATGGCACAGAGCTTCTCGTGGTGGCTG TTGGTCATCGCGCAAGGTGTTTACGTCGTTTTTAGTCCCCTGTGCAAAGAAACTTGGACT GGTTTCTCTATGAATGCTTTCAATAGCATTTGGCCTTACTTCAAGCTAACTGTTGCCTCA GCTGTCATGTTATGCTTGGAGATATGGTACTTCCAAGGCCTAGTGCTTGTATCAGGGCTA CTTCCCTATGCTACAATCTCACTTGACTCCATCTCTATGCTCACAACTTTTAGTGACAAT AACAGCATGAATTACTGGAACTGGGATATGCAATTTATGTTGGGACTAGCAGCAGCAGCC AGTGTTCGAGTTAGTAATGAGCTTGGAGCAGGACATCCGAGGGTAGCTAAAATGTCGATA ATTGTAGTGAACATGACGAGCATCATGTTCAGTACAATTATCTGCATTATTGTGCTGATA TTCAGAGTTGGATTAAGTAAACTCTTTACAAGTGACTCTGAAGTCATTGAAGCTGTTTCT CATTTGACTCCATTACTTGCCATTTCTGTTTGGTTGAATGGCATTCAGCCTATTCTCTCT GGTGTGGCTGTTGGAAGTGGATGGCAAGCTGTGGTGGCATATGTCAATCTAGCTACTTAC TATTGTATTGGTCTACCAATTGGATGTATTCTTGGCTTCAAAACAAGTTTGCAAGCAGCA GGAATATGGTGGGGGATGATTGTTGGAGTTGTCCTACAAACAGTCAGCTTGTTTATTTTA ACAGCCAGAACAAACTGGAATACTGAGGTCGCGAAAGCAGCTGATCGTTTGAAGGAAGCT GGAAATAGAGAAGATGAAGATCCTGTAGACAGGCCTTGAAGAGAGTAACGAAATAATACT ATAATCGAAGTTCAAGAAACAACAGATAATTACAGAAATCGAACAACAAGAAACTACTAG TATGAAAGGATAAGTGAGATAACTCTTGACTACCTTCTAACCATAATCCTTGTACTTCCC CAGATACCTATCTATGAAAATTTCTTCAAAAAGGCAAAAGAATAGCAAGTATTTGGTAGT TAAAAGGACACTAGAAGATCAACAAAGCATACAGCTATATGTTTGTGTTGAGAAATGATT CAGTAATGCATCTGCCAAAATAAAAAGAAAACGAATACTCATGATTACGCGAAAATAAGG TGATCTATGAGATAATTTTTCTTAAACACAACAATTCGCGGAGGTATTATGAACCAGTAT CACCACATGCTGCAATTCACAGCTTTGTATTTTACAAGAAAAATGCCCTCCACTGCTAAA TTTACCTGGAAATGCTAAATCTTCGACCAGGAATGGCTATCCACCCAGTTTTAGCTGCTG CTGAAAACACATTTAGAAACCTTGTGGTTTCAACGATTCTTTGCTAAGCAGCAAGCCAAA CTGTGATGGCTCAATCCCATGTATCGACTAAATTAAAATGTTTCTGTGTAAAGAAACCTA AGAGTTACATTCTGGATATCAAAATGGGAATAAGTGTTTCCTCATCCATGGCTGGCTGGA AAATATCCAACTCTCCATGTCGCTCCAGGACACGCATCCTGCAGTCCTCGGCAGCCAGCA ATCCGGTTGAATATGCACCATGTACAGAACCTGGGTAATCAGCACTCGTTGCCTCCCCAG CAAAGAATAGGAGCAGTTGCATTGGGAAGAATCCTCTTAAGTTGAGTAAATGCAAAATTA GCAGCAGCTTCATCAGACAGTTCTCCAATGTCACGGGCCAGTTGCCCAGCAGGCATATAA ACAAGGACAGAATGGCCAGTGGCTTTGTGAAGATTAAGAAAGTAACTGCACTCATATGAG CTTTCTGCAACTACTCCCAAGAACTCAACATTTGGCCAGAACACGTCTTGAAAGTGCAGA ATAATCTTGTTCTCAATTCCTACACCAAGTTCTTTAATGGCAGCCTCTTTCCACTCAGGT AATCTAGGTTCAAACTTGATACAATTTGATTTCAGAACACCAAGAGGAACAGCAATAATG GCAGCATCGGCTACAAAAGTACTCCCATCCTCAACTGTTACCTTCACACCATTATAACGT CTAACAATTTCTGTAACCCTGAAGAATGATTCCAAAAATAAATGAGGGAGTGTCCCTTGT TTCGGGGGATGAGATGTCAGGAAGGTATTCCTTACCTGTGACCTAAGCGAATGTCAAGCC CTTTTGCTAGTGTGTTGATGACAGGCTTATATCCCCGAACCATAAGACCATGCCCACCAG GAAGCAATTCTTCCTGTATAGCACAAACACAAATCTTAAGGAGAAACTTCAAACAACATT TCCAAGGTCAATAAACTGCACTAACTCTAGTTGATATTTTTCCTGTCACACTTTACTTAT AGGAAAGCAATTATTACAATCACACATATTTTATACAAGGGCATTTACAGAGCTTCGAAC ATCTTAGATGATCATTTTGATAAACGTATTAGCCTATTAGGAGATCTAGACTTCCCTGAG CTGATGTAATCCCTTCACATATTCACACCGGCTACAAGTAAAACTCAAATGTTAAATAAA CAATCAATAGATTGTCTTTTGGCCTATTTTATGTGACGTAATTTGCTTAGGCATAGAGCT TACTAAAGTAACTTGACTTATTGTATTAGTAAAAATAGAAGAAAATACTATAGTAGTTGA TAAGTTAGTGTTAAACGGAAACATCATACCACTGTTTAACTTAGTTCGAATCCATGAAAG AAGTGAGACTTGTATGGAACAGTACTATAAACATGAGCCAGACATCTTAAACATCCCAAC ATGACGAGTTTGTGGGATTGAAGGAGTATCTGGAATGAAAGCTTCTGAAAAAAGATAACA CTGGCTAAAGGCATAAAACTGATGGCATAATTCTTCAGAACTAGTAACCAAGTGTCCTTC ATTGTCAAGAGTTTTTTTTTTTCTCATTCCCAAGATATCTTTACTTACTACGTAATTAGA GCTATGCTAGACAAATGACACATCCCATTTGGTAACAGGAAAGACAGAATGAGATTCTCT TTTTGAACAAGCTGTTCTTTCAGGTGTATACTATGGTGAGACCTAGAAACAGTCCAAATG TCTCTGGAAGACAATAGTCAAAGAGAATATAAGCATTCTCCAACAAGTAAGCAATGAAGA AAAAGAGTCAAAAGGAAATTAACCTGGTCCCAACACTTGAGTGATATGGTATCTGCATCC GCAGCAAACCAGCCTTCCATTCTGCATAGGTACCACTGCAACACCTTATGACCAAGGCCG TTCAACCTGTATTTACAGTTACTCAGTGAAAAATTATTCTCTTTTTTCCTCTTTAATTGA TTTGGGAAGAGGTGATCAATGTTCTGGAAAAACAGAAGTAAGTAGGACCTTAAATCAGGT CTCCTTTCAAAAACCATTGATATAGCACAACCGATAGACATGTCTTCACTGTTTTCTTTC CTAATTAGATCAGTCTGCAGCCAAAGCAAGTCAGCTTATAGTCAGAAAATGTTCAAAATA CTAGATACTATAAAATACAGATCCTTTCCTTACAGAAAGAATTAGATATTTCACAAAAAT GGTTCACAGAGATTTAAGGTGGATAGAGAAAGGAAAACATGCCTCCTTCAAAATGCTCTC AAAAGTCTCGCCAACCTTTGAGACTAAGTCCTGGGGAACTTGATTACCCTCCATGTCAAA AAGTCCATAACTGGAGAATCAAAAGACAAGCCAGTTAGTTTTCTTAAATGCTTAGAAAGG TCACTTCAGAGAACTAGCAATCTCTAATTTTTCCAGATTTCCACATAATGACATGCAGAA GCATATAAACTTGATATGTAGAATTTTATGCATTAATGTGATGCATTTTTAGAAAGTGGA CATATGATAGGTAAGGACAACTTTGAATATTAACCTTTCCAGATCATGGTCATACAAAAC TGAATTGTCACCACTTGTACGATAGAGAGGCAGTCCTAGTTTTCCAATTAGAGGTGCCAA AGGATTCTCATTGCCGACGCCGTGCAACCTAAACCAGTTAAAACTTCAATATCCATTGGA AGCAAAAATGCATCTGTTTACTGTATAATAAACAAATTCCAAAAAGCAAAAATTCGCTAC CATGATGCACCCAAGTCAACAGGAAAACCAAAAGAATAATCAGTGTGAACTCGGCCTCCA ATTCTATCTCGTGATTCTAGCACAACCACCTGCAAGAAAATATCAACTAGATGAAATATA TCCACCGTAACCATTACAGCAAGTAAAAAGTTATAAGATAGTCATATTTCTACTAATACA TATTTCCAGGGCATACCTGAAATGATGCATCATAAAGTGTCCGAGCAGCTGCAAGGCCTG CAAATCCACCTCCTATTACAATGACAGATGGTGAAGCCGCATTCCTCCGTCTAACATTTG AGAAGCAAGGAGCTAGGGAGAAAACAGCTCACTTTAGTAAAGTTTTTTCACTTGAAAGAA ATGATAAGCATCCATAATGTTAGACACAGAAATGTACATGATCATGTCTGAAGTGATCAT ATAGACAGCCAAATCGCTAGGTGAATTTTTTTTGTATTAGTATAGGCAATATACAAAATG GCCTAAACTTTACCTTGCTCAAAAAAAAACAAAAAACAAAATGGCCCAATGGGTTTTATT AGGTTGCTCTATTTTTCTTCATGTGCTTCTGATTCCAAACACATGAAAGTACTGTAATTA TCATTTATCGGGTGTCTTGTCCCTAGATCTAATTATAATCAAGGACTCATTTGTACTAAA TTAGCAAACTTGGCATCTTCGATAAGCAGGATAGCTCGTTATTCTAGAAACAAAAAGGGA TAAAACACCTACTAAATGGAGGCTAACCAGTAAAAAGTTTAATTCATATGTTACCACTTA CCAGCATACACAATCTATTAGTAACCCATTATTATGTTAGAAATAAACAATGAAAAATAT GCAGTGTCAAACTGACAGAAACCCATCATATTCTGTATAAGTTAAAAACTTCAAAGCGAT TTTTATAATACCAAATTGCTGTTTGCTGACATGTTCCAAAAATTCTACTAATAACATGTT ATTGATATAGAGGATGAAAACAGGTAACATCACTGACAGTTGAAAAAGCATATTCCTTGC AAGTTGAAAACTTTAAAAGTCTCTCTTTTTAATACAGGAACAAAATAAACCAAATGTCTC CATTCTGATGCTGCAGTACACACATTTTATATGAACAACATAAAAATCAAACAGCAAACA TCTTAATTCAGCTCAAATAAATTCAAATTTAATCGATCATACAAACTAACAGATGACATT ACTTGTGCGACTATACAGTGTATGTTGTAGTTGTTGTTCTTGTGTAGCGTAG