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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g073270.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XPT2_CYNCS)

Sequence

ATGAACCCTTCCCTTCGCCGGAGCTGGCACATTCGCCACCGGCGAACTATTTCCACAACG
CGCAAATTCAACAACCAAGGAAACGACAAAAACTTCATAGCAACTCTAAATGAAATCGTT
CGGAGCAAACGGAGCTGGAATATAGCACTGAACAGCACCATTTCCACCAGACTGAAAAGC
CATCACGTAGAGCAAATTCTACTTCAAACCCTTGATGATTCTCGGCTGGCTTTACGGTTC
TTCAATTTTCTTGGCCTTCACAAGAACTTTTATCATTCAACAATGTCGTTTTGCATTCTA
ATACATTCCCTTGTTCAGTCCAATCTTTATTGGCCTGCTACTTCACTTTTGCAGACACTA
TTGCAAAGAAAAGTGAACCCGAGTTTTGTTTTTGACAATTTGTTAGATGTGTATAAAAGA
TTCAATTTTGGTCACACTTTGGGTTTTGATTTGCTAATCCAAAATTATGTTCAGGATAGG
AGAGTAATGGATTCTGTGTTGATTGTTCGGCTTATGATGGAGCATTCATTAGTACCAGAA
TTAAAGACTTTAAGCTCTGTGCTAAATGGCTTGATTCGAATAAGACGGTTTGATTTGGTT
TTGCAATTGTTTGATAATGCATTAACTTCGGGTGTTAAGCCTGATGAGTATATTTATACA
GCTGTGCTTAAAAGTTTGTGTGAGTTGAAAGATTTTGAAAAGGCTAAGGAAGTGATGAAT
TGGGTTGAGAGAAGTGGGATTAAAGTGAGTGTTATTTTATACAACATATTGATTCATGGG
CTCTGTAAGGGTGGAAGAGTTTGGGAAGCTGTTGGAATTAAAAGTTTGTTGCTTACCAAA
GGATTGAATGCTGATACTGTCACATATTGTTCTTTGATTTTGGGGCTGTGTAAAGTGAAT
GAATTTCAGCTTGCTCGAAGGTTAGTGGATGAGATGTTGGGGCTGCTTTTGGTTCCTCGC
GAGGCTGTAGTGTCGAGTGTTGTTGACGGGTTGAGGAGAGAGGGTGATTGTGTAGCTGCT
TATAGATTAGTTGATATGACAGGGAAAGTTGGAGTTGTGCCCAATTTATTTGTTTATAAT
GCATTGCTTAATTCTTTGTGTAAAGGTCGTGGGAAGTTGGATGAAGCAGAGTCTCTTTTT
AATAGTATGGAGGATAAAGGGTTGTGCCCAAATAGTGTAACTTACTCCATCATGATCGAC
TCTTTCTGCAAACAAGGGAGATTAGATGCTGCAGTTCTTCTTTATAATAGAATGCTTGAT
AATGAGGTAGAATTAACCATATACCCTTACAATTCTCTCATCAATGGCTATTGCAAGGCT
GGAAAATGCAGTGTGGCGGAATCTATCTTTAATGAGATGATTGATAAAGGATTGACCCCA
ACTGTTGTAACCTATACTTCATTGATAGATGGTTACTGCAAGGAAAGAGAAGTGCAGAAG
GCCTTTAGGCTTTACCATGAGATGACTGGCAAAGGAATTTCACCTAATACTTTCACTTTC
ACTGCACTAATCTCTGGATTTTGCCGTGCACACATGATGGTAGAAGCAAGTAAGATATTT
GATGAGATGGTGAAAATGAATGTAACTCCTACTGAGGTCACTTATAATGTCTTGATTGAA
GGACATTGTAAAGATGGGAACACCATAAAGGCTTTTGAATTGCTAGATGAAATGTTGAAA
AAGGGTCTTATTCCTGACACATATACATACAGATCTCTGATAACTGGACTTTGTACGAAA
GGTCAAGTATCTGAAGCAAAAGAGTTTGTTGATGACCTTCAAAACCAGCGTCATTATCTG
AATGAAATGTGTTTCTCTGCTCTCTTACATGGTTATTGCAAGGAAGGAAGATTAAAGGAT
GCACTAACCACTACTGATGAGATGATAGAAAAGGGAATAAACATGGACCTTGTGTGCTAC
GGTGTACTCATAAATGGAACTCTAAAGCATCATGATTGGAAATATTTATTAAATATAATG
AAGGAGATGCACGACCGAGGAATGAAGCCTGATGAAGTAATATACACTAGCATGCTTGAT
GCATATGGAAAAGTTGGTGATCTTAAAAAAGCTTTTAAATGCTGGGATATAATGGTCAGT
GAAGGATGCTTCCCAAATGTGGTGACGTATACTGTGATGATAAATAACTTGTGCAAGGCT
GGATTAGTAGATAAAGCAGAGGTATTCTACAAGGAAATGTTAGCTAAAGGGTTGACACCT
AACCAGTTCACATATAGTTGTTTCCTTGATTATCTCACTAGTGAAGGGTACATGGTAGAA
GCTAAACAGCTTCATGATGCAATGCTGAAAGGGTACCTTGCAAATACTGTGACATACAAT
ATTATTATACGGGGTTTGTGCAGATTAGACCAAATTCAGGAAGCGATGGATATTTTGCTT
GAAATGGAGGACAACGGTATCTTCCCAGATTGCGTAAGTTACTCAACTATCATTTATGAA
TTCTGTAGGAGGGGTGATCTGTTAGGAGCAAGAGGCTTGTGGGAATCCATGTTGACTAAT
GGTCTGAAGCCTGATGCAGTGGCTTATAACCTTTTCATTTATGGTTGCTGCATTGCTGGA
GAAATGTCTAAGGCGTTTGAATTGCGTGATGAGATGATAGCAAGTGGTCTGAAGGTGACT
CGTGCAACATATGCTTCTTTAATCCATGGAACCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g073270.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XPT2_CYNCS)

Sequence

MNPSLRRSWHIRHRRTISTTRKFNNQGNDKNFIATLNEIVRSKRSWNIALNSTISTRLKS
HHVEQILLQTLDDSRLALRFFNFLGLHKNFYHSTMSFCILIHSLVQSNLYWPATSLLQTL
LQRKVNPSFVFDNLLDVYKRFNFGHTLGFDLLIQNYVQDRRVMDSVLIVRLMMEHSLVPE
LKTLSSVLNGLIRIRRFDLVLQLFDNALTSGVKPDEYIYTAVLKSLCELKDFEKAKEVMN
WVERSGIKVSVILYNILIHGLCKGGRVWEAVGIKSLLLTKGLNADTVTYCSLILGLCKVN
EFQLARRLVDEMLGLLLVPREAVVSSVVDGLRREGDCVAAYRLVDMTGKVGVVPNLFVYN
ALLNSLCKGRGKLDEAESLFNSMEDKGLCPNSVTYSIMIDSFCKQGRLDAAVLLYNRMLD
NEVELTIYPYNSLINGYCKAGKCSVAESIFNEMIDKGLTPTVVTYTSLIDGYCKEREVQK
AFRLYHEMTGKGISPNTFTFTALISGFCRAHMMVEASKIFDEMVKMNVTPTEVTYNVLIE
GHCKDGNTIKAFELLDEMLKKGLIPDTYTYRSLITGLCTKGQVSEAKEFVDDLQNQRHYL
NEMCFSALLHGYCKEGRLKDALTTTDEMIEKGINMDLVCYGVLINGTLKHHDWKYLLNIM
KEMHDRGMKPDEVIYTSMLDAYGKVGDLKKAFKCWDIMVSEGCFPNVVTYTVMINNLCKA
GLVDKAEVFYKEMLAKGLTPNQFTYSCFLDYLTSEGYMVEAKQLHDAMLKGYLANTVTYN
IIIRGLCRLDQIQEAMDILLEMEDNGIFPDCVSYSTIIYEFCRRGDLLGARGLWESMLTN
GLKPDAVAYNLFIYGCCIAGEMSKAFELRDEMIASGLKVTRATYASLIHGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g073270.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XPT2_CYNCS)

Sequence

ATGAACCCTTCCCTTCGCCGGAGCTGGCACATTCGCCACCGGCGAACTATTTCCACAACG
CGCAAATTCAACAACCAAGGAAACGACAAAAACTTCATAGCAACTCTAAATGAAATCGTT
CGGAGCAAACGGAGCTGGAATATAGCACTGAACAGCACCATTTCCACCAGACTGAAAAGC
CATCACGTAGAGCAAATTCTACTTCAAACCCTTGATGATTCTCGGCTGGCTTTACGGTTC
TTCAATTTTCTTGGCCTTCACAAGAACTTTTATCATTCAACAATGTCGTTTTGCATTCTA
ATACATTCCCTTGTTCAGTCCAATCTTTATTGGCCTGCTACTTCACTTTTGCAGACACTA
TTGCAAAGAAAAGTGAACCCGAGTTTTGTTTTTGACAATTTGTTAGATGTGTATAAAAGA
TTCAATTTTGGTCACACTTTGGGTTTTGATTTGCTAATCCAAAATTATGTTCAGGATAGG
AGAGTAATGGATTCTGTGTTGATTGTTCGGCTTATGATGGAGCATTCATTAGTACCAGAA
TTAAAGACTTTAAGCTCTGTGCTAAATGGCTTGATTCGAATAAGACGGTTTGATTTGGTT
TTGCAATTGTTTGATAATGCATTAACTTCGGGTGTTAAGCCTGATGAGTATATTTATACA
GCTGTGCTTAAAAGTTTGTGTGAGTTGAAAGATTTTGAAAAGGCTAAGGAAGTGATGAAT
TGGGTTGAGAGAAGTGGGATTAAAGTGAGTGTTATTTTATACAACATATTGATTCATGGG
CTCTGTAAGGGTGGAAGAGTTTGGGAAGCTGTTGGAATTAAAAGTTTGTTGCTTACCAAA
GGATTGAATGCTGATACTGTCACATATTGTTCTTTGATTTTGGGGCTGTGTAAAGTGAAT
GAATTTCAGCTTGCTCGAAGGTTAGTGGATGAGATGTTGGGGCTGCTTTTGGTTCCTCGC
GAGGCTGTAGTGTCGAGTGTTGTTGACGGGTTGAGGAGAGAGGGTGATTGTGTAGCTGCT
TATAGATTAGTTGATATGACAGGGAAAGTTGGAGTTGTGCCCAATTTATTTGTTTATAAT
GCATTGCTTAATTCTTTGTGTAAAGGTCGTGGGAAGTTGGATGAAGCAGAGTCTCTTTTT
AATAGTATGGAGGATAAAGGGTTGTGCCCAAATAGTGTAACTTACTCCATCATGATCGAC
TCTTTCTGCAAACAAGGGAGATTAGATGCTGCAGTTCTTCTTTATAATAGAATGCTTGAT
AATGAGGTAGAATTAACCATATACCCTTACAATTCTCTCATCAATGGCTATTGCAAGGCT
GGAAAATGCAGTGTGGCGGAATCTATCTTTAATGAGATGATTGATAAAGGATTGACCCCA
ACTGTTGTAACCTATACTTCATTGATAGATGGTTACTGCAAGGAAAGAGAAGTGCAGAAG
GCCTTTAGGCTTTACCATGAGATGACTGGCAAAGGAATTTCACCTAATACTTTCACTTTC
ACTGCACTAATCTCTGGATTTTGCCGTGCACACATGATGGTAGAAGCAAGTAAGATATTT
GATGAGATGGTGAAAATGAATGTAACTCCTACTGAGGTCACTTATAATGTCTTGATTGAA
GGACATTGTAAAGATGGGAACACCATAAAGGCTTTTGAATTGCTAGATGAAATGTTGAAA
AAGGGTCTTATTCCTGACACATATACATACAGATCTCTGATAACTGGACTTTGTACGAAA
GGTCAAGTATCTGAAGCAAAAGAGTTTGTTGATGACCTTCAAAACCAGCGTCATTATCTG
AATGAAATGTGTTTCTCTGCTCTCTTACATGGTTATTGCAAGGAAGGAAGATTAAAGGAT
GCACTAACCACTACTGATGAGATGATAGAAAAGGGAATAAACATGGACCTTGTGTGCTAC
GGTGTACTCATAAATGGAACTCTAAAGCATCATGATTGGAAATATTTATTAAATATAATG
AAGGAGATGCACGACCGAGGAATGAAGCCTGATGAAGTAATATACACTAGCATGCTTGAT
GCATATGGAAAAGTTGGTGATCTTAAAAAAGCTTTTAAATGCTGGGATATAATGGTCAGT
GAAGGATGCTTCCCAAATGTGGTGACGTATACTGTGATGATAAATAACTTGTGCAAGGCT
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AACCAGTTCACATATAGTTGTTTCCTTGATTATCTCACTAGTGAAGGGTACATGGTAGAA
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ATTATTATACGGGGTTTGTGCAGATTAGACCAAATTCAGGAAGCGATGGATATTTTGCTT
GAAATGGAGGACAACGGTATCTTCCCAGATTGCGTAAGTTACTCAACTATCATTTATGAA
TTCTGTAGGAGGGGTGATCTGTTAGGAGCAAGAGGCTTGTGGGAATCCATGTTGACTAAT
GGTCTGAAGCCTGATGCAGTGGCTTATAACCTTTTCATTTATGGTTGCTGCATTGCTGGA
GAAATGTCTAAGGCGTTTGAATTGCGTGATGAGATGATAGCAAGTGGTCTGAAGGTGACT
CGTGCAACATATGCTTCTTTAATCCATGGAACCTGA