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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g073230.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K7B7_CYNCS)

Sequence

ATGATCAATTCAAGAGTTAAACAAGCTACCATAACTCTTCCAACACTCAGAATTCACAAT
CTTGCACGATTCAGAATCCCAATTTTCCAGTCCCAACCATACCACAGTCATCATCGTTTT
CACAGACACAATTCAAAATCTTCAGCTGAAACTCAAAAGCCTCATAACACCACAAGAAAC
CTTCTTCGCAAACCAATACCACTCCTTGCAGACCTCAAACAAATCCAAGATCCTGATGAA
GCTATTTCACTCTTCCATTATTATCAACAAATGGGGTTCAAACATGACTACCCAACTTAT
TCTTGTCTTGTTTATAAGCTCGCAAAGTCTCAAAATTTTGAAGTTGTTGAAACCCTTCTT
GGATATCTCCAAACTCATCATATTCGATGTAAAGAAACACTTTTTATTGGGTTAATTCAA
CACTATGGGAGAGCCCAGTTAGTTGATAAAGCTGTTGAGCTTTTTCACAAAATTGGGTCG
TTTAATTGTTCGCCTAGTGTGCAGTCTTTTAATGCAATTCTGAATGTGCTTGTTGATAGT
GGACGTTCTGAAGCTGCTAATGAGATGTTAAGGAGTTGTTCGAAAATGGGTATCTGGTTA
AATTCTGTTTCGTTTAACATTATTATCAAGATGTGGCTGAAGAAGGGTGATTGGGAAATG
GCTCGCCAACTGTTTGATGAAATGCTTGAAAGAGGGGTTGAGCCAACAGTGGTTACTTAC
AATTGTCAAATTGGGTTTTTGTGTAAGAAGGGGGATGTTGAAGATGCTAAAAGTCTGTTT
CAGGATATGGTTAGAAAGGGAAAGAAGGCAAATGCAGTGTCGTATGCTTTGCTGATGGAA
GGTTTATGTTCTTTAGGGAAGTATAAGGAGGCTAAGAAGTTGATGTTTGATATGGAATAC
CAAGGATGTAAGCTGAAAATAGTCAATTATGGTGTTTTGATGACTGATCTTTTGAAACGA
GGGGAAATTGGTGAAGCAAACAGTTTACTTGTGGAGATGAAAAAAAGGGGCATTAAATTT
GACATTGTGATCTATAACATGTTGATTAATTATTTTTGTAAAGAAGGTAAAACCGCTGAG
GCCTATAGGATGTTAGTTGATATGCAAATTGCAGGCTGCTGTCCTATTGCAATTACATAC
AGAATGGTGGTTGATGGATTTTGTAAAACAGGAGAATTTGAGGAAGGTTTGAAAGTTTTG
AATGCAATGTTGATGAGCAGGCATTTTCCACGTATGGAAACAGTAAGGTGTTTGATTCTT
GGTCTGCTTGATAAAGGGAAGGTTGAAGATGCTTGCTTTGTTTTGGAGGAGATGGAGAAG
AGGAAGAAAAAGTTCAATTTTGATTCATGGGAAGTCATTGTCAAGGATTCTTGCACTAGT
GATAGGAGTGTAAGCCAGCTCTTAGATGAGCTTGTATTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g073230.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K7B7_CYNCS)

Sequence

MINSRVKQATITLPTLRIHNLARFRIPIFQSQPYHSHHRFHRHNSKSSAETQKPHNTTRN
LLRKPIPLLADLKQIQDPDEAISLFHYYQQMGFKHDYPTYSCLVYKLAKSQNFEVVETLL
GYLQTHHIRCKETLFIGLIQHYGRAQLVDKAVELFHKIGSFNCSPSVQSFNAILNVLVDS
GRSEAANEMLRSCSKMGIWLNSVSFNIIIKMWLKKGDWEMARQLFDEMLERGVEPTVVTY
NCQIGFLCKKGDVEDAKSLFQDMVRKGKKANAVSYALLMEGLCSLGKYKEAKKLMFDMEY
QGCKLKIVNYGVLMTDLLKRGEIGEANSLLVEMKKRGIKFDIVIYNMLINYFCKEGKTAE
AYRMLVDMQIAGCCPIAITYRMVVDGFCKTGEFEEGLKVLNAMLMSRHFPRMETVRCLIL
GLLDKGKVEDACFVLEEMEKRKKKFNFDSWEVIVKDSCTSDRSVSQLLDELVF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g073230.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K7B7_CYNCS)

Sequence

ATGATCAATTCAAGAGTTAAACAAGCTACCATAACTCTTCCAACACTCAGAATTCACAAT
CTTGCACGATTCAGAATCCCAATTTTCCAGTCCCAACCATACCACAGTCATCATCGTTTT
CACAGACACAATTCAAAATCTTCAGCTGAAACTCAAAAGCCTCATAACACCACAAGAAAC
CTTCTTCGCAAACCAATACCACTCCTTGCAGACCTCAAACAAATCCAAGATCCTGATGAA
GCTATTTCACTCTTCCATTATTATCAACAAATGGGGTTCAAACATGACTACCCAACTTAT
TCTTGTCTTGTTTATAAGCTCGCAAAGTCTCAAAATTTTGAAGTTGTTGAAACCCTTCTT
GGATATCTCCAAACTCATCATATTCGATGTAAAGAAACACTTTTTATTGGGTTAATTCAA
CACTATGGGAGAGCCCAGTTAGTTGATAAAGCTGTTGAGCTTTTTCACAAAATTGGGTCG
TTTAATTGTTCGCCTAGTGTGCAGTCTTTTAATGCAATTCTGAATGTGCTTGTTGATAGT
GGACGTTCTGAAGCTGCTAATGAGATGTTAAGGAGTTGTTCGAAAATGGGTATCTGGTTA
AATTCTGTTTCGTTTAACATTATTATCAAGATGTGGCTGAAGAAGGGTGATTGGGAAATG
GCTCGCCAACTGTTTGATGAAATGCTTGAAAGAGGGGTTGAGCCAACAGTGGTTACTTAC
AATTGTCAAATTGGGTTTTTGTGTAAGAAGGGGGATGTTGAAGATGCTAAAAGTCTGTTT
CAGGATATGGTTAGAAAGGGAAAGAAGGCAAATGCAGTGTCGTATGCTTTGCTGATGGAA
GGTTTATGTTCTTTAGGGAAGTATAAGGAGGCTAAGAAGTTGATGTTTGATATGGAATAC
CAAGGATGTAAGCTGAAAATAGTCAATTATGGTGTTTTGATGACTGATCTTTTGAAACGA
GGGGAAATTGGTGAAGCAAACAGTTTACTTGTGGAGATGAAAAAAAGGGGCATTAAATTT
GACATTGTGATCTATAACATGTTGATTAATTATTTTTGTAAAGAAGGTAAAACCGCTGAG
GCCTATAGGATGTTAGTTGATATGCAAATTGCAGGCTGCTGTCCTATTGCAATTACATAC
AGAATGGTGGTTGATGGATTTTGTAAAACAGGAGAATTTGAGGAAGGTTTGAAAGTTTTG
AATGCAATGTTGATGAGCAGGCATTTTCCACGTATGGAAACAGTAAGGTGTTTGATTCTT
GGTCTGCTTGATAAAGGGAAGGTTGAAGATGCTTGCTTTGTTTTGGAGGAGATGGAGAAG
AGGAAGAAAAAGTTCAATTTTGATTCATGGGAAGTCATTGTCAAGGATTCTTGCACTAGT
GATAGGAGTGTAAGCCAGCTCTTAGATGAGCTTGTATTTTAG