Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g072880.2.1
CDS Infomation	Calcium-transporting ATPase (AHRD V3.3 *** A0A103XD00_CYNCS)
Sequence	ATGGGAAAAGGAGGTGAAAATTATGGGAAAAGGGAGAATTTAGGTGGTAAGAGTGTGTCG GATAAAGAGATGTTTCCGGCCTGGTCGAAAGATGTGAAGGAGTGTGAGGAGAAGTTTGAG GTGAAAAGAGATTATGGATTATCTGAGGATGAGGTTGTTAAAAGGAGGCAGATCTATGGT TTAAATGAATTGGAGAAGCATGAAGGGCAGTCGATTTTGAGGTTGATTTTAGATCAGTTT AATGATACGTTAGTTAGGATTTTGCTTGGTGCTGCGGTGATTTCGTTTGTTTTGGCTTGG TTAGATGGAGAGGAAGGTGGTGAGAAGGAGATCACAGCTTTCGTGGAGCCTTTGGTGATT TTCTTAATCTTAATTGTCAATGCTGCTGTTGGTGTGTGGCAAGAGAGTAATGCCGAAAAG GCTTTGGAGGCATTGAAGGAAATCCAGTCAGAGACTGCATGTGTTATACGTGACGGTAAA AGAATTTCTAGTTTACCTGCTAAAGAGCTTGTACCTGGGGATATTGTTGAGTTGAAAGTT GGAGATAAAGTACCAGCTGATATGAGGGTTCTGCGTTTGATCAGTTCGACTCTCCGGCTT GAACAGGGATCACTGACTGGTGAGAGTGAAGCAGTTAGTAAGACCACTAAAGCTGTAGCG GAGGATGTTGATATCCAAGGGAAGAAATGTATGGTATTTGCTGGAACGACTGTGGTGAAT GGAAATTGTATTTGTTTGGTAACTCAAATAGGGATGGATACCGAGATAGGGAAGGTGCAC GCACAGATTCATGAAGCAGCACAAGAAGAGGAAGACACCCCGTTGAAGAAAAAGCTAAAT GAGTTTGGAGAAGCTTTGACTGTCATAATTGGTATCATCTGCGCGTTAGTTTGGCTGATC AACGTGAAATATTTCCTCACTTGGGAGTTTGTTGATGGGTGGCCCAGGAATTTTAAGTTT TCATTTGAGAAGTGCACATATTATTTTGAAATTGCAGTGGCACTGGCAGTTGCTGCCATT CCGGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACAACTTGTTTGGCACTTGGCACACGGAAGATGGCT GCTAAGAATGCACTTGTTCGAAAATTGCCTAGTGTAGAAACTCTTGGTTGTACCACTGTT ATTTGCTCAGACAAAACAGGAACATTGACAACTAATCAGATGGCTGTGTCTAAGCTTGTC GCTATGGGTGCCAAGGCTAACACATTGCGATCATTCAATGTTGAAGGGACCTCATATGAT CCCTATGATGGAAAGATACAAGATTGGTCAATGGGTCGTATGGACTCTAACCTAGAAATG ATAGCAAAAGTTGCTGCTGTCTGCAATGATTCTGGAGTTGAAAAATCTGGTCAGCACTAT GTTGCCAGCGGACTGCCCACTGAAGCAGCACTAAAGGTTCTGGTCGAGAAAATGGGACTT CCTGATGGAATCAGCTCCATATCCTCTTCAAGTGATAAAGATGGCCTCCGTTGCTCTTAC ACATGGAACAATATTGAAAAGCGTATTGGTACTCTTGAATTTGACCGTGATAGGAAATCC ATGGGTGTCATTACATCTTCCACCTCTGGAAAAAAGTCATTACTTGTGAAGGGTGCGGTT GAAAATCTGTTGGAAAGAAGCTCCTATGTGCAACTGCAAGACGGTTCTGTTGTAGAATTG GATAATTCTTCCAGAAATCATATATTGCAAAGCCTTCATGAAATGTCCTCGAAAGCTTTA CGTGTCCTTGGTTTTGCATACAAGGAGGATCTACAGGAACTTGCAACCTATAATGGTGAT GAAGACCATCCAGCCCATCAGCTTTTACTCAATCCTGCTAATTACCCTTCCATTGAGAGT AAACTCATATTTGTTGGCTTGGCTGGGATAAGGGATCCTCCTAGAAAAGAGGTACGTCGT GCAATTGAGGATTGCAGAGAAGCTGGCATTCGAGTTATGGTTATTACAGGAGATAACAAG AATACAGCAGAAGCTATCTGCCGTGAGATAGGTGTCTTTGGAAGCCATGAAGATATCAAG TCGAGGAGCTTAACTGGAAAAGAATTTATGGAGCTTGCGAACCCCAAAGCACATATAAGG CAAAGTGGAGGTCTCTTATTCTCCAGAGCTGAGCCAAGGCATAAACAAGATATAGTGAGA TTGCTTAAAGATGATGGTGAGGTGGTTGCAATGACTGGGGATGGAGTGAATGATGCACCT GCTTTAAAATTGGCTGATATTGGGATTGCAATGGGAATCGCTGGAACTGAGGTGGCAAAG GAAGCATCTGACATGGTTTTGGCAGATGATAATTTTAGTACAATTGTAGCTGCTGTGGGT GAAGGCAGGTCCATTTATAACAATATGAAGGCTTTCATCAGGTACATGATTTCCTCCAAC ATTGGTGAGGTCGCCTCTATTTTCCTTACTGCTGCCCTAGGCATTCCTGAAGGTCTTATT CCAGTTCAGCTTCTGTGGGTCAACCTGGTCACTGATGGACCACCTGCTACAGCATTGGGA TTTAATCCACCGGATAAAGATATAATGAAGAAACAACCAAGGAGAAGTGATGATTCATTG ATCAGTGCATGGATTTTATTTCGCTATCTGGTAATTGGGTTGTATGTTGGTGTAGCAACT GTGGGTATTTTTATCATCTGGTTCACTCATGACTCCTTCCTTGGCATTGATTTAAGTAAA GATGGGCACAGTCTTGTCACCTATTCCCAGCTTGCTAATTGGGGTCAGTGCAAAACCTGG AACAATTTCACCGCGTCACCTTTCACTGCCGGATCAGAAGTGATCAGGTTTGATAACCCG TGCGATTACTTTGTGGAAGGCAAGGTCAAAGCCATGACCCTTTCCCTCTCTGTATTGGTT GCAATTGAGATGTTCAACTCCCTTAATGCCCTTTCGGAAGATGGAAGCCTCTTGTCAATG CCACCATGGGTCAACCCATGGCTTCTTTTAGCCATGTCGGTCTCATTTGGGCTGCACTTT TTGATCCTCTACGTGCCTTTCCTTGCTCAAATATTTGGTATCGTTCCACTGAGCCTAAAC GAGTGGCTGTTAGTATTGGCTGTTGCATTACCCGTCATATTGATCGATGAGATTTTGAAG TTTATTGGAAGGTGCACAAGTGGTACCAGAAGTGGAAGGAGTCCTACAAAGCAGAAGGAA GAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g072880.2.1
PEP Infomation	Calcium-transporting ATPase (AHRD V3.3 *** A0A103XD00_CYNCS)
Sequence	MGKGGENYGKRENLGGKSVSDKEMFPAWSKDVKECEEKFEVKRDYGLSEDEVVKRRQIYG LNELEKHEGQSILRLILDQFNDTLVRILLGAAVISFVLAWLDGEEGGEKEITAFVEPLVI FLILIVNAAVGVWQESNAEKALEALKEIQSETACVIRDGKRISSLPAKELVPGDIVELKV GDKVPADMRVLRLISSTLRLEQGSLTGESEAVSKTTKAVAEDVDIQGKKCMVFAGTTVVN GNCICLVTQIGMDTEIGKVHAQIHEAAQEEEDTPLKKKLNEFGEALTVIIGIICALVWLI NVKYFLTWEFVDGWPRNFKFSFEKCTYYFEIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRKMA AKNALVRKLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNQMAVSKLVAMGAKANTLRSFNVEGTSYD PYDGKIQDWSMGRMDSNLEMIAKVAAVCNDSGVEKSGQHYVASGLPTEAALKVLVEKMGL PDGISSISSSSDKDGLRCSYTWNNIEKRIGTLEFDRDRKSMGVITSSTSGKKSLLVKGAV ENLLERSSYVQLQDGSVVELDNSSRNHILQSLHEMSSKALRVLGFAYKEDLQELATYNGD EDHPAHQLLLNPANYPSIESKLIFVGLAGIRDPPRKEVRRAIEDCREAGIRVMVITGDNK NTAEAICREIGVFGSHEDIKSRSLTGKEFMELANPKAHIRQSGGLLFSRAEPRHKQDIVR LLKDDGEVVAMTGDGVNDAPALKLADIGIAMGIAGTEVAKEASDMVLADDNFSTIVAAVG EGRSIYNNMKAFIRYMISSNIGEVASIFLTAALGIPEGLIPVQLLWVNLVTDGPPATALG FNPPDKDIMKKQPRRSDDSLISAWILFRYLVIGLYVGVATVGIFIIWFTHDSFLGIDLSK DGHSLVTYSQLANWGQCKTWNNFTASPFTAGSEVIRFDNPCDYFVEGKVKAMTLSLSVLV AIEMFNSLNALSEDGSLLSMPPWVNPWLLLAMSVSFGLHFLILYVPFLAQIFGIVPLSLN EWLLVLAVALPVILIDEILKFIGRCTSGTRSGRSPTKQKEE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g072880.2.1
Transcript Infomation	Calcium-transporting ATPase (AHRD V3.3 *** A0A103XD00_CYNCS)
Sequence	TTATAATTAATTTTTGTTTATAATAAAGTAATAAAGAGGCAGAGATCTCTTTATTTTTCG ATTCTCTCACTCTACAGTTTCCCGAGAGAGATAGAGAGATAGAGGGAGAGACGCACAATA ACTATCCAAAGTTCCGCTGCAGACGAATAACTTTCCTTCTCTCGTATTCTTCTTCTCCAA CACGACGAACGAATCTCCACTTCTCTGGAGATTTTTTATCATATTAGGAGATTTTGACTG GTTTTTTAATTAGATTTGGTTGATTCTGGAGGTTTTAAATGGGAAAAGGAGGTGAAAATT ATGGGAAAAGGGAGAATTTAGGTGGTAAGAGTGTGTCGGATAAAGAGATGTTTCCGGCCT GGTCGAAAGATGTGAAGGAGTGTGAGGAGAAGTTTGAGGTGAAAAGAGATTATGGATTAT CTGAGGATGAGGTTGTTAAAAGGAGGCAGATCTATGGTTTAAATGAATTGGAGAAGCATG AAGGGCAGTCGATTTTGAGGTTGATTTTAGATCAGTTTAATGATACGTTAGTTAGGATTT TGCTTGGTGCTGCGGTGATTTCGTTTGTTTTGGCTTGGTTAGATGGAGAGGAAGGTGGTG AGAAGGAGATCACAGCTTTCGTGGAGCCTTTGGTGATTTTCTTAATCTTAATTGTCAATG CTGCTGTTGGTGTGTGGCAAGAGAGTAATGCCGAAAAGGCTTTGGAGGCATTGAAGGAAA TCCAGTCAGAGACTGCATGTGTTATACGTGACGGTAAAAGAATTTCTAGTTTACCTGCTA AAGAGCTTGTACCTGGGGATATTGTTGAGTTGAAAGTTGGAGATAAAGTACCAGCTGATA TGAGGGTTCTGCGTTTGATCAGTTCGACTCTCCGGCTTGAACAGGGATCACTGACTGGTG AGAGTGAAGCAGTTAGTAAGACCACTAAAGCTGTAGCGGAGGATGTTGATATCCAAGGGA AGAAATGTATGGTATTTGCTGGAACGACTGTGGTGAATGGAAATTGTATTTGTTTGGTAA CTCAAATAGGGATGGATACCGAGATAGGGAAGGTGCACGCACAGATTCATGAAGCAGCAC AAGAAGAGGAAGACACCCCGTTGAAGAAAAAGCTAAATGAGTTTGGAGAAGCTTTGACTG TCATAATTGGTATCATCTGCGCGTTAGTTTGGCTGATCAACGTGAAATATTTCCTCACTT GGGAGTTTGTTGATGGGTGGCCCAGGAATTTTAAGTTTTCATTTGAGAAGTGCACATATT ATTTTGAAATTGCAGTGGCACTGGCAGTTGCTGCCATTCCGGAAGGTCTGCCAGCAGTTA TTACAACTTGTTTGGCACTTGGCACACGGAAGATGGCTGCTAAGAATGCACTTGTTCGAA AATTGCCTAGTGTAGAAACTCTTGGTTGTACCACTGTTATTTGCTCAGACAAAACAGGAA CATTGACAACTAATCAGATGGCTGTGTCTAAGCTTGTCGCTATGGGTGCCAAGGCTAACA CATTGCGATCATTCAATGTTGAAGGGACCTCATATGATCCCTATGATGGAAAGATACAAG ATTGGTCAATGGGTCGTATGGACTCTAACCTAGAAATGATAGCAAAAGTTGCTGCTGTCT GCAATGATTCTGGAGTTGAAAAATCTGGTCAGCACTATGTTGCCAGCGGACTGCCCACTG AAGCAGCACTAAAGGTTCTGGTCGAGAAAATGGGACTTCCTGATGGAATCAGCTCCATAT CCTCTTCAAGTGATAAAGATGGCCTCCGTTGCTCTTACACATGGAACAATATTGAAAAGC GTATTGGTACTCTTGAATTTGACCGTGATAGGAAATCCATGGGTGTCATTACATCTTCCA CCTCTGGAAAAAAGTCATTACTTGTGAAGGGTGCGGTTGAAAATCTGTTGGAAAGAAGCT CCTATGTGCAACTGCAAGACGGTTCTGTTGTAGAATTGGATAATTCTTCCAGAAATCATA TATTGCAAAGCCTTCATGAAATGTCCTCGAAAGCTTTACGTGTCCTTGGTTTTGCATACA AGGAGGATCTACAGGAACTTGCAACCTATAATGGTGATGAAGACCATCCAGCCCATCAGC TTTTACTCAATCCTGCTAATTACCCTTCCATTGAGAGTAAACTCATATTTGTTGGCTTGG CTGGGATAAGGGATCCTCCTAGAAAAGAGGTACGTCGTGCAATTGAGGATTGCAGAGAAG CTGGCATTCGAGTTATGGTTATTACAGGAGATAACAAGAATACAGCAGAAGCTATCTGCC GTGAGATAGGTGTCTTTGGAAGCCATGAAGATATCAAGTCGAGGAGCTTAACTGGAAAAG AATTTATGGAGCTTGCGAACCCCAAAGCACATATAAGGCAAAGTGGAGGTCTCTTATTCT CCAGAGCTGAGCCAAGGCATAAACAAGATATAGTGAGATTGCTTAAAGATGATGGTGAGG TGGTTGCAATGACTGGGGATGGAGTGAATGATGCACCTGCTTTAAAATTGGCTGATATTG GGATTGCAATGGGAATCGCTGGAACTGAGGTGGCAAAGGAAGCATCTGACATGGTTTTGG CAGATGATAATTTTAGTACAATTGTAGCTGCTGTGGGTGAAGGCAGGTCCATTTATAACA ATATGAAGGCTTTCATCAGGTACATGATTTCCTCCAACATTGGTGAGGTCGCCTCTATTT TCCTTACTGCTGCCCTAGGCATTCCTGAAGGTCTTATTCCAGTTCAGCTTCTGTGGGTCA ACCTGGTCACTGATGGACCACCTGCTACAGCATTGGGATTTAATCCACCGGATAAAGATA TAATGAAGAAACAACCAAGGAGAAGTGATGATTCATTGATCAGTGCATGGATTTTATTTC GCTATCTGGTAATTGGGTTGTATGTTGGTGTAGCAACTGTGGGTATTTTTATCATCTGGT TCACTCATGACTCCTTCCTTGGCATTGATTTAAGTAAAGATGGGCACAGTCTTGTCACCT ATTCCCAGCTTGCTAATTGGGGTCAGTGCAAAACCTGGAACAATTTCACCGCGTCACCTT TCACTGCCGGATCAGAAGTGATCAGGTTTGATAACCCGTGCGATTACTTTGTGGAAGGCA AGGTCAAAGCCATGACCCTTTCCCTCTCTGTATTGGTTGCAATTGAGATGTTCAACTCCC TTAATGCCCTTTCGGAAGATGGAAGCCTCTTGTCAATGCCACCATGGGTCAACCCATGGC TTCTTTTAGCCATGTCGGTCTCATTTGGGCTGCACTTTTTGATCCTCTACGTGCCTTTCC TTGCTCAAATATTTGGTATCGTTCCACTGAGCCTAAACGAGTGGCTGTTAGTATTGGCTG TTGCATTACCCGTCATATTGATCGATGAGATTTTGAAGTTTATTGGAAGGTGCACAAGTG GTACCAGAAGTGGAAGGAGTCCTACAAAGCAGAAGGAAGAGTAGAGGCAAAACATTGTCA TAAATGTGTTGAACTTATCATTATTGACAGAGCTTATGTTATTCATACCCGCAAGTGGGG TTTGATTAGCCTATTCTCTTTAACCCAACCCAGTCGCTGTTAATTGATGAGGGTTGGTGG CGGATTTAATTAGATTCATTTAGACATTTTCTGAAACTCCTCAGATGATAGAATTAGTTT TGATATTTAAGTTTTTTTTACCTTTCCCTTGTCTGACAGGACGATAGCTTTTATACTGAT CCTCTCAATTTTATCTTTGGCATTCT