Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc11g069050.2.1

CDS Infomation

4-coumarate:CoA ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A089WWI7_BETPN)

Sequence

ATGGAGAAATCTGGTTATGGCCGTGATGGGGTATACAGATCTCTTAGACCACCTGTATTT
TATCCAAAAGATGAAAATTTATCTATGGTTTCTTTTTTATTCAGAAAGATTTCATCTTAC
CCTGAAAAACCTGCGTTTTTTGATGCTGATAATGGTGGAACTTTATCTTTTTCTCAGTTC
AAATCTATGGTGTCAAGAATCTCTCATGGACTTATTCACCAAATGGGTATCAAGAAAAAT
GACGTTGTTTTGATATTTGCCCCAAATTCTGTTCAATTTCCTTTAAGTTTCTTTGGGGTT
ATTGCTATTGGTGCTATTGCTACAACTGTTAATCCTATGTATACTGTTGCTGAACTTTCT
AAGCAAATTAAAGATTGTAAACCAAGCCTTATTATTACTTCTCCTGAATTGTTTGATAAA
GTTAATAGTTTTAATTTGCCTATTTTGCTTTTGGGAAATTCGAATTCGAATAATGCAGGT
GTTGTAAGGTTTACTGAGCTAGTGGATAAAGCTGGGTGTTTTGATTTGGATAAAACTGTG
GTGAAACAAACTGATACTGCTGTACTGTTGTATTCTTCGGGTACAACGGGGGTTAGTAAA
GGTGTTGTGTTAACTCATAGGAATTTCATATCGGCGGCTTTAATGGTATCTAGTGATCAA
GATTTGGCTGGGGAAATGCATAATGTGTATATGTGTGTTTTGCCTATGTTTCATGTGTTT
GGTCTTGCTGTTATCATGTACTCACAGTTGCAAAGGGGTAATGCTATTGTATCTATGGCG
AAATTTGATTTGGAAACGCTTTTGAAGAATATTGATAAGTATAGAGTGAGTCATTTATGG
ATTGTACCTCCGATTGTTTTAGCATTGGCTAAGAATCCTGTGGTGAAGAAGTATGATTTA
ACGTCGATAAAGCAAATTGGATCCGGGGCTGCGCCTTTAGGGAAGGATTTGATGGAGGAT
TGCGCTAAGAACTTCCCTCAGGCTGTTGTTATGCAGGGATACGGTATGACAGAAACCTGT
GGAATTGTTTCAGTGGAGAATATGTGTGTAGGTCCTAGACATACAGGATCAGCAGGGTCT
TTAGCTCCTGGAATTGAAGCTCAAATAGTTAGTGTTGATAAATCGAAGCCTCTTCCTCCT
GGGCAATTAGGTGAAATATGGGTCCGTGGTCCCAATATGATGAAAGGCTATTTCAACAAT
CCACAGGCCACAATGCTCACTATAGATAATCAGGGCTGGGTTCATACAGGAGATCTTGGG
TACTTTACTGAGGATGGATTGCTTTATGTCGTTGACAGGATCAAAGAGCTCATCAAGTAC
AAAGGTTTTCAGGTTGCACCAGCAGAGCTTGAAGGTCTACTTGTTTCTCATCCTGAAATA
TTAGATGCTGTTGTTATCCCGTTTCCTGATGCTGAGGCTGGTGAGGTTCCGGTTGCATAT
GTTGTTCGCTCTCCCAATAGCTCTCTGACTGAAGAAGATGTTCAAAAGTTCATTGCGGAT
CAGGTTGCACCTTTCAAAAGATTGAAGAAGGTGACATTCATAAACAGTGTTCCCAAGTCA
GCTTCTGGGAAAATCCTAAGAAGAGAACTAATCGATAAGGTTCGTTCAAAAATATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc11g069050.2.1

PEP Infomation

4-coumarate:CoA ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A089WWI7_BETPN)

Sequence

MEKSGYGRDGVYRSLRPPVFYPKDENLSMVSFLFRKISSYPEKPAFFDADNGGTLSFSQF
KSMVSRISHGLIHQMGIKKNDVVLIFAPNSVQFPLSFFGVIAIGAIATTVNPMYTVAELS
KQIKDCKPSLIITSPELFDKVNSFNLPILLLGNSNSNNAGVVRFTELVDKAGCFDLDKTV
VKQTDTAVLLYSSGTTGVSKGVVLTHRNFISAALMVSSDQDLAGEMHNVYMCVLPMFHVF
GLAVIMYSQLQRGNAIVSMAKFDLETLLKNIDKYRVSHLWIVPPIVLALAKNPVVKKYDL
TSIKQIGSGAAPLGKDLMEDCAKNFPQAVVMQGYGMTETCGIVSVENMCVGPRHTGSAGS
LAPGIEAQIVSVDKSKPLPPGQLGEIWVRGPNMMKGYFNNPQATMLTIDNQGWVHTGDLG
YFTEDGLLYVVDRIKELIKYKGFQVAPAELEGLLVSHPEILDAVVIPFPDAEAGEVPVAY
VVRSPNSSLTEEDVQKFIADQVAPFKRLKKVTFINSVPKSASGKILRRELIDKVRSKI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc11g069050.2.1

Transcript Infomation

4-coumarate:CoA ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A089WWI7_BETPN)

Sequence

TAAATCATTATAAATGGTCCAAAGAAAAATAATACATAAATAATCTTGACTTTTTCTCTC
ATATATTTGAATAGTGTACTCTACAATGGCAAGGATGATGTGTATATCATTGTCATGTTG
ATTTTTATATCTGTTTTTACAAATACCCATTTCAATTTTGTCACTGAAAAATCCAAAATC
TAAAAAGAATCAAGAAAAGCAAAAAAAAAATTTGATTTTTGATTGTTATGGAGAAATCTG
GTTATGGCCGTGATGGGGTATACAGATCTCTTAGACCACCTGTATTTTATCCAAAAGATG
AAAATTTATCTATGGTTTCTTTTTTATTCAGAAAGATTTCATCTTACCCTGAAAAACCTG
CGTTTTTTGATGCTGATAATGGTGGAACTTTATCTTTTTCTCAGTTCAAATCTATGGTGT
CAAGAATCTCTCATGGACTTATTCACCAAATGGGTATCAAGAAAAATGACGTTGTTTTGA
TATTTGCCCCAAATTCTGTTCAATTTCCTTTAAGTTTCTTTGGGGTTATTGCTATTGGTG
CTATTGCTACAACTGTTAATCCTATGTATACTGTTGCTGAACTTTCTAAGCAAATTAAAG
ATTGTAAACCAAGCCTTATTATTACTTCTCCTGAATTGTTTGATAAAGTTAATAGTTTTA
ATTTGCCTATTTTGCTTTTGGGAAATTCGAATTCGAATAATGCAGGTGTTGTAAGGTTTA
CTGAGCTAGTGGATAAAGCTGGGTGTTTTGATTTGGATAAAACTGTGGTGAAACAAACTG
ATACTGCTGTACTGTTGTATTCTTCGGGTACAACGGGGGTTAGTAAAGGTGTTGTGTTAA
CTCATAGGAATTTCATATCGGCGGCTTTAATGGTATCTAGTGATCAAGATTTGGCTGGGG
AAATGCATAATGTGTATATGTGTGTTTTGCCTATGTTTCATGTGTTTGGTCTTGCTGTTA
TCATGTACTCACAGTTGCAAAGGGGTAATGCTATTGTATCTATGGCGAAATTTGATTTGG
AAACGCTTTTGAAGAATATTGATAAGTATAGAGTGAGTCATTTATGGATTGTACCTCCGA
TTGTTTTAGCATTGGCTAAGAATCCTGTGGTGAAGAAGTATGATTTAACGTCGATAAAGC
AAATTGGATCCGGGGCTGCGCCTTTAGGGAAGGATTTGATGGAGGATTGCGCTAAGAACT
TCCCTCAGGCTGTTGTTATGCAGGGATACGGTATGACAGAAACCTGTGGAATTGTTTCAG
TGGAGAATATGTGTGTAGGTCCTAGACATACAGGATCAGCAGGGTCTTTAGCTCCTGGAA
TTGAAGCTCAAATAGTTAGTGTTGATAAATCGAAGCCTCTTCCTCCTGGGCAATTAGGTG
AAATATGGGTCCGTGGTCCCAATATGATGAAAGGCTATTTCAACAATCCACAGGCCACAA
TGCTCACTATAGATAATCAGGGCTGGGTTCATACAGGAGATCTTGGGTACTTTACTGAGG
ATGGATTGCTTTATGTCGTTGACAGGATCAAAGAGCTCATCAAGTACAAAGGTTTTCAGG
TTGCACCAGCAGAGCTTGAAGGTCTACTTGTTTCTCATCCTGAAATATTAGATGCTGTTG
TTATCCCGTTTCCTGATGCTGAGGCTGGTGAGGTTCCGGTTGCATATGTTGTTCGCTCTC
CCAATAGCTCTCTGACTGAAGAAGATGTTCAAAAGTTCATTGCGGATCAGGTTGCACCTT
TCAAAAGATTGAAGAAGGTGACATTCATAAACAGTGTTCCCAAGTCAGCTTCTGGGAAAA
TCCTAAGAAGAGAACTAATCGATAAGGTTCGTTCAAAAATATAAGATTTTTACC