Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g068640.2.1
CDS Infomation	Protein TPLATE (AHRD V3.3 *** TPLAT_ARATH)
Sequence	ATGGATATACTTTTCGCTCAGATCCAAGCCGATCTCCGTTCAAATGACGCACTCCGTCAA TCAGGAGCTCTTTTACAAGCTCTACAACAATCCGCAGCCGGAAGAGACATCTCCGTCATC GCTAAATCCGCTGTTGAAGAGATCGTCGCGTCACCAGCTTCCGCCATTTCGAAAAAGCTA GCATTTGACCTAATTAGATCCACTCGTCTTACTGCTGACCTTTGGGAAACTGTTTGTACC GGAATTCGTAACGATCTCGACTTTCCTGACCCGGACGTTACTGCTGCTGCTGTATCTATA CTTGCTGCTATTCCTTCTTACCGTCTTGGTAAGCTTATTTCTGACTGTAACAAGCAGATC TCTAGCTGTTTTGATTCTCCCAGTGATAATCTCCGTTTTGCTATTACTGAAACTCTTGGT TGTATCCTTGCACGTGATGATCTGGTGACATTGTGTGAGAATAATATGAATTTGTTGGAT AGGGTTTCTAATTGGTGGAATAGGATAGGGCAGAACATGCTTGATAAATCTGATGCTGTT GCGAAAGTGGCATTTGAGTCTGTAGGGAGATTGTTTCAGGAGTTTGAATCGAAAAGGATG AGTCGTTTGGCTGGTGATAAGCTAGTGGATAGTGAAAATTCTGTTGCTATTAGGTCTAAT TGGGTTTCTTCTATGGTGGATTTTGTTTGGAGAAGAAGGAATGCGTTAATGGCGCGGTCA TTGGTTCTCCCCATAGAGAATTTTCGAGCTACAGTTTGTCCGCTTGTGTATGCTGTAAAG GCAGTAGCTTCGGGTTCGTTAGAGGTGATCAAGAAGTTATCGAGGTCTTCCAAGAATGGG AATGCAAGTTCATTAGACACTGTGAATGTGGAGAAGTTTGTGGGTGTGTCTGATGTTGTT TCACATTTGGCACCTTTTCTAGCATCATCACTGGATCCATCATTGATATTTGAGGTGGGG ATTAACATGTTATACTTGGCTGATGTTCCTGGAGGGAAACCCGAGTGGGCATCCACATCC ATCATTGCAATTCTCACTCTTTGGGATAGACAAGAGTTTTCTTCTGCAAGAGAGAGTATC GTTAGAGCTGTTGTCACCAATTTGCATCTTCTTGATCTCAGTATGCAGGTTTCTTTATTT AATAAGCTGCTTCTTATGGTGAGAAACCTGAGAGCAGAGTCAGATCGCATGCATGCATTA GCATGCATTTGTCGAACCGCTCTCTGTGTTGATCTTTTTGCAAAAGAGAGTGTTAGAAGA GGGCAAAAACCTGTTCCTGGAACCGATATTGCTTCACTTTTTGAGAATGCAAGAATAAAA GAGGACCTCCATAGTGTAACAAGTAAAACCTTGTTTAGAGAAGAACTAGTTGCAATGCTG GTGGAGAGCTGCTTTCAGTTATCACTGCCACTTCCTGAACAAAAAAATTCAGGTATGGAG AGCAGAGTTATTGGAGCTTTAGCATATGGAACTGGTTATGGTGCATTAAACTGGACAGAA CCAGCTTTGGAAGTGGTGGAAGTTTGTAGACCATGTGTCAAATGGGATTGTGAAGGTCGA ACATATGCTATTGACTGCTATTTGAAGTTGCTTGTCAGGCTTTGTCACATTTATGATACA AGAGGAGGTGTGAAAAGAGTCAAAGATGGGGCTTCTCAGGACCAGATTCTGAATGAAACG CGGTTGCAGAATTTGCAAAGGGATCTTGTCAAAGATCTACGTGAGGTGAACACTCCTAGA ATATGTACTCGACTTATTTGGGCTATCTCAGAGCATATTGATCTAGAAGGTTTGGATCCA CTTCTGGCTGATGATCCAGAAGATCCCCTGAATATAATAATATCAAATATCCACAAAGTT CTCTTCAATATAGATTCGTCTGCCAGCAGCACAAATCGCCTTCAAGATGTTCAAGCAGTT CTTCTGTGTGCTCAGAGGTTGGGATCACGTAATCCCAGGGCAGGGCAATTGCTAATAAAA GAACTTGAAGAGTTTAGGACCAATGCATTAGCTGACTCAGTGAACAAACATCAGTGTCGG TTAATACTGCAGAGGATCAAATATGTCACCAACCACTCGGAAAGCAAGTGGGCTGGGGTT GGTGAAGCAAGAGGAGATTATCCATTTAGCCATCACAAGTTAACAGTTCAGTTTTATGAC GCATCTGCTGCTCAGGACCGAAAACTGGAAGGATTGGTGCACAAGGCTATTTTAGAGCTT TGGAGGCCTGATCCTAGTGAGCTAGCTCTATTGCTGGCTAAACGAGTAGATTCTACTTTA CTCAAGGTTCCTCCTAGTGCATATACTTTGACTGGCAGCAGTGATCCTTGTTATGTTGAA GCATATCATTTGACTGATCCAAGTGATGGAAGATTTACTCTGCACTTAAAGGTTTTGAAT TTGACCGAGATAGAACTTAACCGGGTGGATTTAAGAGTTGGACTTTCTGGTGGATTGTAT TTCATGGATGGATCTCCTCAAGCCGTACGCCAGCTGCGGAATCTTAATTCACAGGAACCA GTACTCACCAGTGTTACTGTGGGTGTTTCCCATTTTGAGCGTTGTGACCTTTGGGTTCAA GTACTTTACTATCCTTTCTATGGTTCTGGTCCTTCTGATTATGAAGACTCTGAAGAGGAT CCACAAGTTATGAGACAAAAGAAAAGCATGAGACCTGAATTAGGGGAACCTGTCATTTTG AGATGTCAGCCATACAAAATTCCTCTGACCGAGCTTCTTTTGCCACACAAAATTTCACCA GTTGAATATTTTCGTCTATGGCCTAGTTTACCTGCAATAGTTGAGTGTACTGGCACCTAT ACATATGAAGGAAGTGGATTCATGGCCACTGCTGCTCAGCAATATGGGGAGTCTCCATTT CTAAGTGGCCTGAAATCACTGTCGTCCAAACCTTTCCATCGAGTTTGCTCGCACATCATC CGTACAGTTGCTGGATTTGAGCTCTGTTTTGCTGCTAAAACCTGGTACGGAGGGTTTTTA GGCATGATGGTTTTTGGTGCAAGTGAAGTGAGCAGAAATGTGGACCTTGGCGACGAGACA ACCACAATGATGTGCAAATTTGTTATCCGAGCATCAGACGAATCCATTACCAAGGAGATT GCTTCAGATTTTCAGGGTTGGTTGGATGACCTAACTGATGGCGGTGTTGAATACATGCCT GAAGATGAAGTGAAGGTAACTGCTGCTGAAAATCTAAAGATTTCAATGGAACGAATAGCC TTACTAAAGGCTGCAAGACCTCGCCCAAAGTCTCCAAAATCCGAGGATGAAGAAGAGGAG GAAGAAGAAGAAGACGATGATAACAATAAGAACGATGACATACTTAACGTTGAAGGTGGT AAAACTAAGGGACCAACTACTTTATTCAAGTTGACAGCAGAAGAAGCCGAGCATCGAGCA CTTCAAGCAGCTATTATTCAAGAATGGCATATGCTCTGTAAAGATAGAAACACCAAAGTA AACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g068640.2.1
PEP Infomation	Protein TPLATE (AHRD V3.3 *** TPLAT_ARATH)
Sequence	MDILFAQIQADLRSNDALRQSGALLQALQQSAAGRDISVIAKSAVEEIVASPASAISKKL AFDLIRSTRLTADLWETVCTGIRNDLDFPDPDVTAAAVSILAAIPSYRLGKLISDCNKQI SSCFDSPSDNLRFAITETLGCILARDDLVTLCENNMNLLDRVSNWWNRIGQNMLDKSDAV AKVAFESVGRLFQEFESKRMSRLAGDKLVDSENSVAIRSNWVSSMVDFVWRRRNALMARS LVLPIENFRATVCPLVYAVKAVASGSLEVIKKLSRSSKNGNASSLDTVNVEKFVGVSDVV SHLAPFLASSLDPSLIFEVGINMLYLADVPGGKPEWASTSIIAILTLWDRQEFSSARESI VRAVVTNLHLLDLSMQVSLFNKLLLMVRNLRAESDRMHALACICRTALCVDLFAKESVRR GQKPVPGTDIASLFENARIKEDLHSVTSKTLFREELVAMLVESCFQLSLPLPEQKNSGME SRVIGALAYGTGYGALNWTEPALEVVEVCRPCVKWDCEGRTYAIDCYLKLLVRLCHIYDT RGGVKRVKDGASQDQILNETRLQNLQRDLVKDLREVNTPRICTRLIWAISEHIDLEGLDP LLADDPEDPLNIIISNIHKVLFNIDSSASSTNRLQDVQAVLLCAQRLGSRNPRAGQLLIK ELEEFRTNALADSVNKHQCRLILQRIKYVTNHSESKWAGVGEARGDYPFSHHKLTVQFYD ASAAQDRKLEGLVHKAILELWRPDPSELALLLAKRVDSTLLKVPPSAYTLTGSSDPCYVE AYHLTDPSDGRFTLHLKVLNLTEIELNRVDLRVGLSGGLYFMDGSPQAVRQLRNLNSQEP VLTSVTVGVSHFERCDLWVQVLYYPFYGSGPSDYEDSEEDPQVMRQKKSMRPELGEPVIL RCQPYKIPLTELLLPHKISPVEYFRLWPSLPAIVECTGTYTYEGSGFMATAAQQYGESPF LSGLKSLSSKPFHRVCSHIIRTVAGFELCFAAKTWYGGFLGMMVFGASEVSRNVDLGDET TTMMCKFVIRASDESITKEIASDFQGWLDDLTDGGVEYMPEDEVKVTAAENLKISMERIA LLKAARPRPKSPKSEDEEEEEEEEDDDNNKNDDILNVEGGKTKGPTTLFKLTAEEAEHRA LQAAIIQEWHMLCKDRNTKVN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g068640.2.1
Transcript Infomation	Protein TPLATE (AHRD V3.3 *** TPLAT_ARATH)
Sequence	TGGTAAAAATTCACTTTTGAGCGTCAAATAAGGACTATATTTGCAAAATCCTTAGATAAA GCTCCCCGTTAAAACGATCCACCGGCCCGCCGGAAACTTCCCTCCGTGATCAGAAAAAGC TACATATGGCAACTCACAGTTGAGTGACCTTTCCTCCATTAGAGCTCCGAAGCAGCATCC TACTACTACTGGTGTGATTTTGCTTCAGAGCAAAACATACTAATCTCTACTGTTTCGCTC ACTTCCACGGCTACAAATGGATATACTTTTCGCTCAGATCCAAGCCGATCTCCGTTCAAA TGACGCACTCCGTCAATCAGGAGCTCTTTTACAAGCTCTACAACAATCCGCAGCCGGAAG AGACATCTCCGTCATCGCTAAATCCGCTGTTGAAGAGATCGTCGCGTCACCAGCTTCCGC CATTTCGAAAAAGCTAGCATTTGACCTAATTAGATCCACTCGTCTTACTGCTGACCTTTG GGAAACTGTTTGTACCGGAATTCGTAACGATCTCGACTTTCCTGACCCGGACGTTACTGC TGCTGCTGTATCTATACTTGCTGCTATTCCTTCTTACCGTCTTGGTAAGCTTATTTCTGA CTGTAACAAGCAGATCTCTAGCTGTTTTGATTCTCCCAGTGATAATCTCCGTTTTGCTAT TACTGAAACTCTTGGTTGTATCCTTGCACGTGATGATCTGGTGACATTGTGTGAGAATAA TATGAATTTGTTGGATAGGGTTTCTAATTGGTGGAATAGGATAGGGCAGAACATGCTTGA TAAATCTGATGCTGTTGCGAAAGTGGCATTTGAGTCTGTAGGGAGATTGTTTCAGGAGTT TGAATCGAAAAGGATGAGTCGTTTGGCTGGTGATAAGCTAGTGGATAGTGAAAATTCTGT TGCTATTAGGTCTAATTGGGTTTCTTCTATGGTGGATTTTGTTTGGAGAAGAAGGAATGC GTTAATGGCGCGGTCATTGGTTCTCCCCATAGAGAATTTTCGAGCTACAGTTTGTCCGCT TGTGTATGCTGTAAAGGCAGTAGCTTCGGGTTCGTTAGAGGTGATCAAGAAGTTATCGAG GTCTTCCAAGAATGGGAATGCAAGTTCATTAGACACTGTGAATGTGGAGAAGTTTGTGGG TGTGTCTGATGTTGTTTCACATTTGGCACCTTTTCTAGCATCATCACTGGATCCATCATT GATATTTGAGGTGGGGATTAACATGTTATACTTGGCTGATGTTCCTGGAGGGAAACCCGA GTGGGCATCCACATCCATCATTGCAATTCTCACTCTTTGGGATAGACAAGAGTTTTCTTC TGCAAGAGAGAGTATCGTTAGAGCTGTTGTCACCAATTTGCATCTTCTTGATCTCAGTAT GCAGGTTTCTTTATTTAATAAGCTGCTTCTTATGGTGAGAAACCTGAGAGCAGAGTCAGA TCGCATGCATGCATTAGCATGCATTTGTCGAACCGCTCTCTGTGTTGATCTTTTTGCAAA AGAGAGTGTTAGAAGAGGGCAAAAACCTGTTCCTGGAACCGATATTGCTTCACTTTTTGA GAATGCAAGAATAAAAGAGGACCTCCATAGTGTAACAAGTAAAACCTTGTTTAGAGAAGA ACTAGTTGCAATGCTGGTGGAGAGCTGCTTTCAGTTATCACTGCCACTTCCTGAACAAAA AAATTCAGGTATGGAGAGCAGAGTTATTGGAGCTTTAGCATATGGAACTGGTTATGGTGC ATTAAACTGGACAGAACCAGCTTTGGAAGTGGTGGAAGTTTGTAGACCATGTGTCAAATG GGATTGTGAAGGTCGAACATATGCTATTGACTGCTATTTGAAGTTGCTTGTCAGGCTTTG TCACATTTATGATACAAGAGGAGGTGTGAAAAGAGTCAAAGATGGGGCTTCTCAGGACCA GATTCTGAATGAAACGCGGTTGCAGAATTTGCAAAGGGATCTTGTCAAAGATCTACGTGA GGTGAACACTCCTAGAATATGTACTCGACTTATTTGGGCTATCTCAGAGCATATTGATCT AGAAGGTTTGGATCCACTTCTGGCTGATGATCCAGAAGATCCCCTGAATATAATAATATC AAATATCCACAAAGTTCTCTTCAATATAGATTCGTCTGCCAGCAGCACAAATCGCCTTCA AGATGTTCAAGCAGTTCTTCTGTGTGCTCAGAGGTTGGGATCACGTAATCCCAGGGCAGG GCAATTGCTAATAAAAGAACTTGAAGAGTTTAGGACCAATGCATTAGCTGACTCAGTGAA CAAACATCAGTGTCGGTTAATACTGCAGAGGATCAAATATGTCACCAACCACTCGGAAAG CAAGTGGGCTGGGGTTGGTGAAGCAAGAGGAGATTATCCATTTAGCCATCACAAGTTAAC AGTTCAGTTTTATGACGCATCTGCTGCTCAGGACCGAAAACTGGAAGGATTGGTGCACAA GGCTATTTTAGAGCTTTGGAGGCCTGATCCTAGTGAGCTAGCTCTATTGCTGGCTAAACG AGTAGATTCTACTTTACTCAAGGTTCCTCCTAGTGCATATACTTTGACTGGCAGCAGTGA TCCTTGTTATGTTGAAGCATATCATTTGACTGATCCAAGTGATGGAAGATTTACTCTGCA CTTAAAGGTTTTGAATTTGACCGAGATAGAACTTAACCGGGTGGATTTAAGAGTTGGACT TTCTGGTGGATTGTATTTCATGGATGGATCTCCTCAAGCCGTACGCCAGCTGCGGAATCT TAATTCACAGGAACCAGTACTCACCAGTGTTACTGTGGGTGTTTCCCATTTTGAGCGTTG TGACCTTTGGGTTCAAGTACTTTACTATCCTTTCTATGGTTCTGGTCCTTCTGATTATGA AGACTCTGAAGAGGATCCACAAGTTATGAGACAAAAGAAAAGCATGAGACCTGAATTAGG GGAACCTGTCATTTTGAGATGTCAGCCATACAAAATTCCTCTGACCGAGCTTCTTTTGCC ACACAAAATTTCACCAGTTGAATATTTTCGTCTATGGCCTAGTTTACCTGCAATAGTTGA GTGTACTGGCACCTATACATATGAAGGAAGTGGATTCATGGCCACTGCTGCTCAGCAATA TGGGGAGTCTCCATTTCTAAGTGGCCTGAAATCACTGTCGTCCAAACCTTTCCATCGAGT TTGCTCGCACATCATCCGTACAGTTGCTGGATTTGAGCTCTGTTTTGCTGCTAAAACCTG GTACGGAGGGTTTTTAGGCATGATGGTTTTTGGTGCAAGTGAAGTGAGCAGAAATGTGGA CCTTGGCGACGAGACAACCACAATGATGTGCAAATTTGTTATCCGAGCATCAGACGAATC CATTACCAAGGAGATTGCTTCAGATTTTCAGGGTTGGTTGGATGACCTAACTGATGGCGG TGTTGAATACATGCCTGAAGATGAAGTGAAGGTAACTGCTGCTGAAAATCTAAAGATTTC AATGGAACGAATAGCCTTACTAAAGGCTGCAAGACCTCGCCCAAAGTCTCCAAAATCCGA GGATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGACGATGATAACAATAAGAACGATGACATACT TAACGTTGAAGGTGGTAAAACTAAGGGACCAACTACTTTATTCAAGTTGACAGCAGAAGA AGCCGAGCATCGAGCACTTCAAGCAGCTATTATTCAAGAATGGCATATGCTCTGTAAAGA TAGAAACACCAAAGTAAACTAATTTTTTTTGCTTATTTTCTTTTGATATATTTTGGTTTG ATAATTGATTTAGAAGTTAGTTGATTGAAATGAGTTTCAAGTTTGTTTTTATGTAATTCT AGTTTATTTCTTTTCTCCCAGTTTTGTAATTTCTATGTACCTTTTTGAAGCCTGTAAATT AATTCTATTACTACTACATTTTTTGTCTGTTCAAATGAACTTTTTATCTACCCTTTGTTT TCATAATTTAATTTCTTCTTCATAGTTCATGTTAGGATATTGTGAAATATTGACAGTTTG ATAGCCAAAAAAATAATTTACTTCATAATATTAGATTAACAAATATCATTATATTATACA TGTATATCCCAAATACTTGCTGCATACATCAAAATA