Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc11g068440.2.1
CDS Infomation	Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SCU1_RICCO)
Sequence	ATGGCCATCCTATTCTTCAAGGCTCTTCCCCTGCTTCTTCTTCTTTCTTTTACAGATTTA TTTGCAAGCACACTCAGCCTTGGAATTGGAATTAACTATGGCCAAATTGCAAACAATTTG CCAACACCCTCACGAGTCTCGTTTCTCCTCAGATCACTCAATGTTACGAGAGTAAAACTC TATGACGCTGATCCAAACGTGTTAACCGCTTTCGCTAACACGAATGTTGAATTTGTTATC GGACTTGGGAATGAGTACCTACAAAGAATGTCTGATCCTCAACAAGCTCAGGCTTGGATT CAACAACATGTTCAACCTTACCATACTCAGACTAAAATCACTTGTATTACTGTTGGTAAT GAGGTCTTGACAGGTACTGATACGCAGCTGAAGTCTTACCTCCTACCAGCAATGCAGGGT GTGTACCGTGCTCTTGTTAATCTTGGACTTAGTAATGAAATATATGTGGCACATCCCCAC TCGGCGGGGATCTTGGAGAACTCTTTTCCGCCTTCTTCTTGTTCATTTCGACAAGATCTT AGTGAATACATTCATGGCATGCTCAATTTCCATGTCCAAACTAAGTCGCCGTTCCTTATA AATTTCTATCCATTCTTTGCATACAAAGACAAACCCAACGAAGTTCCGCTTGATTATGTA CTTTTCCAGCCTAACCAAGGTACGACTGACCCGATCACGAATTTGAAGTATGACAACATG TTGTATGCACAAATTGATGCAGTTTATTCAGCAATTAAGGCAATGGGCCACACAGACATT CCAGTTAAGGTTTCCGAAACTGGCTGGCCATCAAAGGGAGACCCGAATGAGTTTGGAGCA ACACCTGAAAATGCTGCACTATATAACGGTAATTTGTTTCAGCGTATGCAGCAAAATCAA GGGACTCCAGCAAAGCCATCAGAGCCCATCGATGTTTACGTGTTTGCACTTTTTAACGAA AATTTAAAGCCTGGTCCAGCATCAGAGAGGAATTATGGTCTCTACTACCCTGATGGAACT CCAGTTTATAACATCGGGTTACGAGGGTTTCTTCCACGTATGGACTATTCAGCTGCTAAG AAAAATGCCTTCTTTATTTCTGCTTTTCTTCTGCTTATGATGATTTTCTTGATACACTTC TGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc11g068440.2.1
PEP Infomation	Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SCU1_RICCO)
Sequence	MAILFFKALPLLLLLSFTDLFASTLSLGIGINYGQIANNLPTPSRVSFLLRSLNVTRVKL YDADPNVLTAFANTNVEFVIGLGNEYLQRMSDPQQAQAWIQQHVQPYHTQTKITCITVGN EVLTGTDTQLKSYLLPAMQGVYRALVNLGLSNEIYVAHPHSAGILENSFPPSSCSFRQDL SEYIHGMLNFHVQTKSPFLINFYPFFAYKDKPNEVPLDYVLFQPNQGTTDPITNLKYDNM LYAQIDAVYSAIKAMGHTDIPVKVSETGWPSKGDPNEFGATPENAALYNGNLFQRMQQNQ GTPAKPSEPIDVYVFALFNENLKPGPASERNYGLYYPDGTPVYNIGLRGFLPRMDYSAAK KNAFFISAFLLLMMIFLIHF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc11g068440.2.1
Transcript Infomation	Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SCU1_RICCO)
Sequence	AGAGTAAGTATATATAATAAGAAAAATATGGGAAGTTGCATGTTGATTGTTTTGTGTGTA TATTATATAAGGGGAGGGGGATCAATTAAGAGGCTTCGTGGCTTGAGATTTAGCAAGGCT GGCAAAAGGGGCAATGGCCATCCTATTCTTCAAGGCTCTTCCCCTGCTTCTTCTTCTTTC TTTTACAGATTTATTTGCAAGCACACTCAGCCTTGGAATTGGAATTAACTATGGCCAAAT TGCAAACAATTTGCCAACACCCTCACGAGTCTCGTTTCTCCTCAGATCACTCAATGTTAC GAGAGTAAAACTCTATGACGCTGATCCAAACGTGTTAACCGCTTTCGCTAACACGAATGT TGAATTTGTTATCGGACTTGGGAATGAGTACCTACAAAGAATGTCTGATCCTCAACAAGC TCAGGCTTGGATTCAACAACATGTTCAACCTTACCATACTCAGACTAAAATCACTTGTAT TACTGTTGGTAATGAGGTCTTGACAGGTACTGATACGCAGCTGAAGTCTTACCTCCTACC AGCAATGCAGGGTGTGTACCGTGCTCTTGTTAATCTTGGACTTAGTAATGAAATATATGT GGCACATCCCCACTCGGCGGGGATCTTGGAGAACTCTTTTCCGCCTTCTTCTTGTTCATT TCGACAAGATCTTAGTGAATACATTCATGGCATGCTCAATTTCCATGTCCAAACTAAGTC GCCGTTCCTTATAAATTTCTATCCATTCTTTGCATACAAAGACAAACCCAACGAAGTTCC GCTTGATTATGTACTTTTCCAGCCTAACCAAGGTACGACTGACCCGATCACGAATTTGAA GTATGACAACATGTTGTATGCACAAATTGATGCAGTTTATTCAGCAATTAAGGCAATGGG CCACACAGACATTCCAGTTAAGGTTTCCGAAACTGGCTGGCCATCAAAGGGAGACCCGAA TGAGTTTGGAGCAACACCTGAAAATGCTGCACTATATAACGGTAATTTGTTTCAGCGTAT GCAGCAAAATCAAGGGACTCCAGCAAAGCCATCAGAGCCCATCGATGTTTACGTGTTTGC ACTTTTTAACGAAAATTTAAAGCCTGGTCCAGCATCAGAGAGGAATTATGGTCTCTACTA CCCTGATGGAACTCCAGTTTATAACATCGGGTTACGAGGGTTTCTTCCACGTATGGACTA TTCAGCTGCTAAGAAAAATGCCTTCTTTATTTCTGCTTTTCTTCTGCTTATGATGATTTT CTTGATACACTTCTGAACGCTGTACGATAGATAAAATATGGAGATTAGAGATGATTCAAT TTTTTCAGGAACTTCCACTGATATATATTAGACGGTAGTCGTAGACGACGCAGTTTTTAT TATCTTCTGTTTCACATTTTGCTAACTCTGCTGGAAAAATTTGCTTATTGGAGATGAAGG TCATGATCAATAGAGACATTGTGTATTCATACCAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAATAGA ATTTATAGAGACTCAGAAAAAAAAGAAAAAAAAGTAGTTTGTTTAACTACTTTTATTAGT TGAATAGTTGATTCATTTTACAAAATTTTAATAATAAGAACAGAAATATATTTGTCTGGC AATAGTTGTCATCCCATTATTATTATTTGAATTATAATAAGGGAAATATTATTGTGCTGA TGTATATGATTGATTATGACTTATATTTGCTGTTTTTTAATCAACTTGTAAGCTTGTAGG GCTACTTCTGATTCAAAAGAATTTATCGAGAGTTAATTTAATTAATTTTTAAAATAAATT TTTACTATTGTATTGTTGGTTCAAAATTGAGTTTAGTTCAATTATCTACAGAACACATGC AAATT